RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000567639.1

RAB27A-210, Transcript of RAB27A, member RAS oncogene family, humanhuman

TSL 4

Gene RAB27A, Length 592 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB27A-210ENST00000567639 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa37.04■■■■□ 3.52
RAB27A-210ENST00000567639 RAPGEF3O95398 923 aa37.03■■■■□ 3.52
RAB27A-210ENST00000567639 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa37.02■■■■□ 3.52
RAB27A-210ENST00000567639 RICTORQ6R327 1708 aa37■■■■□ 3.51
RAB27A-210ENST00000567639 SCAPERQ9BY12 1400 aa36.96■■■■□ 3.51
RAB27A-210ENST00000567639 MAP3K1Q13233 1512 aa36.95■■■■□ 3.5
RAB27A-210ENST00000567639 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP36.93■■■■□ 3.5
RAB27A-210ENST00000567639 POGZQ7Z3K3 1410 aa36.92■■■■□ 3.5
RAB27A-210ENST00000567639 CCNB3Q8WWL7 1395 aa36.91■■■■□ 3.5
RAB27A-210ENST00000567639 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP36.9■■■■□ 3.5
RAB27A-210ENST00000567639 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa36.89■■■■□ 3.5
RAB27A-210ENST00000567639 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa36.88■■■■□ 3.5
RAB27A-210ENST00000567639 ABCC1P33527 1531 aa36.85■■■■□ 3.49
RAB27A-210ENST00000567639 ITSN2Q9NZM3 1697 aa36.84■■■■□ 3.49
RAB27A-210ENST00000567639 NCOA2Q15596 1464 aa36.82■■■■□ 3.49
RAB27A-210ENST00000567639 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa36.82■■■■□ 3.48
RAB27A-210ENST00000567639 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa36.82■■■■□ 3.48
RAB27A-210ENST00000567639 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa36.8■■■■□ 3.48
RAB27A-210ENST00000567639 APLP2Q06481 763 aa36.79■■■■□ 3.48
RAB27A-210ENST00000567639 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP36.79■■■■□ 3.48
RAB27A-210ENST00000567639 MAGI2Q86UL8 1455 aa36.79■■■■□ 3.48
RAB27A-210ENST00000567639 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa36.77■■■■□ 3.48
RAB27A-210ENST00000567639 KDM5CP41229 1560 aa36.76■■■■□ 3.48
RAB27A-210ENST00000567639 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP36.76■■■■□ 3.48
RAB27A-210ENST00000567639 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa36.75■■■■□ 3.47
RAB27A-210ENST00000567639 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP36.74■■■■□ 3.47
RAB27A-210ENST00000567639 SYCP2Q9BX26 1530 aa36.71■■■■□ 3.47
RAB27A-210ENST00000567639 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa36.71■■■■□ 3.47
RAB27A-210ENST00000567639 YEATS2Q9ULM3 1422 aa36.7■■■■□ 3.47
RAB27A-210ENST00000567639 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa36.7■■■■□ 3.47
RAB27A-210ENST00000567639 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa36.69■■■■□ 3.46
RAB27A-210ENST00000567639 AFAP1Q8N556 730 aa36.69■■■■□ 3.46
RAB27A-210ENST00000567639 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP36.68■■■■□ 3.46
RAB27A-210ENST00000567639 HECW2Q9P2P5 1572 aa36.68■■■■□ 3.46
RAB27A-210ENST00000567639 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa36.67■■■■□ 3.46
RAB27A-210ENST00000567639 MLH3Q9UHC1 1453 aa36.61■■■■□ 3.45
RAB27A-210ENST00000567639 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP36.58■■■■□ 3.459e-6■■■■□ 20.2
RAB27A-210ENST00000567639 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP36.58■■■■□ 3.45
RAB27A-210ENST00000567639 MYT1LQ9UL68 1186 aa36.57■■■■□ 3.44
RAB27A-210ENST00000567639 ATP10AO60312 1499 aa36.56■■■■□ 3.44
RAB27A-210ENST00000567639 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa36.56■■■■□ 3.44
RAB27A-210ENST00000567639 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP36.55■■■■□ 3.44
RAB27A-210ENST00000567639 C9orf84Q5VXU9 1444 aa36.54■■■■□ 3.44
RAB27A-210ENST00000567639 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa36.53■■■■□ 3.44
RAB27A-210ENST00000567639 MYOM3Q5VTT5 1437 aa36.53■■■■□ 3.44
RAB27A-210ENST00000567639 ABCA6Q8N139 1617 aa36.52■■■■□ 3.44
RAB27A-210ENST00000567639 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa36.51■■■■□ 3.44
RAB27A-210ENST00000567639 BCORL1Q5H9F3 1711 aa36.51■■■■□ 3.43
RAB27A-210ENST00000567639 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa36.51■■■■□ 3.43
RAB27A-210ENST00000567639 MBD5Q9P267 1494 aa36.5■■■■□ 3.43
RAB27A-210ENST00000567639 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP36.47■■■■□ 3.43
RAB27A-210ENST00000567639 MIA2Q96PC5 1412 aa36.47■■■■□ 3.43
RAB27A-210ENST00000567639 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP36.46■■■■□ 3.43
RAB27A-210ENST00000567639 ADAMTSL3P82987 1691 aa36.45■■■■□ 3.43
RAB27A-210ENST00000567639 REREQ9P2R6 1566 aa36.45■■■■□ 3.43
RAB27A-210ENST00000567639 ATP7AQ04656 1500 aa36.45■■■■□ 3.43
RAB27A-210ENST00000567639 CCDC141Q6ZP82 1450 aa36.42■■■■□ 3.42
RAB27A-210ENST00000567639 ARHGEF5Q12774 1597 aa36.4■■■■□ 3.42
RAB27A-210ENST00000567639 RSPH4AQ5TD94 716 aa36.37■■■■□ 3.41
RAB27A-210ENST00000567639 MADDQ8WXG6 1647 aa36.36■■■■□ 3.41
RAB27A-210ENST00000567639 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa36.33■■■■□ 3.41
RAB27A-210ENST00000567639 PTPN23Q9H3S7 1636 aa36.32■■■■□ 3.4
RAB27A-210ENST00000567639 AGLP35573 1532 aa36.32■■■■□ 3.4
RAB27A-210ENST00000567639 FGD6Q6ZV73 1430 aa36.31■■■■□ 3.4
RAB27A-210ENST00000567639 MLECQ14165 292 aa36.29■■■■□ 3.4
RAB27A-210ENST00000567639 ADGBQ8N7X0 1667 aa36.27■■■■□ 3.4
RAB27A-210ENST00000567639 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP36.26■■■■□ 3.39
RAB27A-210ENST00000567639 PTPRMP28827 1452 aa36.25■■■■□ 3.39
RAB27A-210ENST00000567639 PLXNC1O60486 1568 aa36.25■■■■□ 3.39
RAB27A-210ENST00000567639 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa36.25■■■■□ 3.39
RAB27A-210ENST00000567639 A2MP01023 1474 aa36.24■■■■□ 3.39
RAB27A-210ENST00000567639 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP36.24■■■■□ 3.39
RAB27A-210ENST00000567639 TSPY4P0CV99 314 aa36.22■■■■□ 3.39
RAB27A-210ENST00000567639 TSPY10P0CW01 314 aa36.22■■■■□ 3.39
RAB27A-210ENST00000567639 MAST1Q9Y2H9 1570 aa36.2■■■■□ 3.39
RAB27A-210ENST00000567639 CROCC2H7BZ55 1655 aa36.15■■■■□ 3.38
RAB27A-210ENST00000567639 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP36.13■■■■□ 3.37
RAB27A-210ENST00000567639 SHANK2Q9UPX8 1470 aa36.11■■■■□ 3.37
RAB27A-210ENST00000567639 ABCC5O15440 1437 aa36.1■■■■□ 3.37
RAB27A-210ENST00000567639 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP36.1■■■■□ 3.37
RAB27A-210ENST00000567639 DAPK1P53355 1430 aa36.09■■■■□ 3.37
RAB27A-210ENST00000567639 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP36.09■■■■□ 3.37
RAB27A-210ENST00000567639 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP36.03■■■■□ 3.36
RAB27A-210ENST00000567639 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP36.01■■■■□ 3.36
RAB27A-210ENST00000567639 CNTLNQ9NXG0 1405 aa35.99■■■■□ 3.35
RAB27A-210ENST00000567639 PLPPR3Q6T4P5 718 aa35.97■■■■□ 3.35
RAB27A-210ENST00000567639 GGT6Q6P531 493 aa35.95■■■■□ 3.35
RAB27A-210ENST00000567639 DUOX2Q9NRD8 1548 aa35.94■■■■□ 3.34
RAB27A-210ENST00000567639 KIF3BO15066 747 aa35.93■■■■□ 3.34
RAB27A-210ENST00000567639 KIF15Q9NS87 1388 aa35.92■■■■□ 3.34
RAB27A-210ENST00000567639 MROH2AA6NES4 1674 aa35.92■■■■□ 3.34
RAB27A-210ENST00000567639 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP35.92■■■■□ 3.34
RAB27A-210ENST00000567639 C3P01024 1663 aa35.91■■■■□ 3.34
RAB27A-210ENST00000567639 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP35.9■■■■□ 3.34
RAB27A-210ENST00000567639 PPP6R1Q9UPN7 881 aa35.89■■■■□ 3.34
RAB27A-210ENST00000567639 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa35.89■■■■□ 3.34
RAB27A-210ENST00000567639 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP35.88■■■■□ 3.33
RAB27A-210ENST00000567639 CHIC2Q9UKJ5 165 aa35.87■■■■□ 3.33
RAB27A-210ENST00000567639 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP35.86■■■■□ 3.33
RAB27A-210ENST00000567639 ADGRL2O95490 1459 aa35.86■■■■□ 3.33
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 44 ms