RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000567180.2

SCX-201, Transcript of scleraxis bHLH transcription factor, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SCX, Length 999 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCX-201ENST00000567180 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa41.37■■■■■ 4.21
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SCX-201ENST00000567180 AKNAQ7Z591 1439 aa41.35■■■■■ 4.21
SCX-201ENST00000567180 ITSN2Q9NZM3 1697 aa41.34■■■■■ 4.21
SCX-201ENST00000567180 NCOA2Q15596 1464 aa41.29■■■■■ 4.2
SCX-201ENST00000567180 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP41.28■■■■■ 4.2
SCX-201ENST00000567180 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP41.28■■■■■ 4.2
SCX-201ENST00000567180 ADGRL1O94910 1474 aa41.27■■■■■ 4.2
SCX-201ENST00000567180 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP41.25■■■■■ 4.19
SCX-201ENST00000567180 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP41.22■■■■■ 4.19
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SCX-201ENST00000567180 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP41.13■■■■■ 4.17
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SCX-201ENST00000567180 ABCC1P33527 1531 aa41.11■■■■■ 4.17
SCX-201ENST00000567180 RAPGEF3O95398 923 aa41.1■■■■■ 4.17
SCX-201ENST00000567180 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa41.08■■■■■ 4.17
SCX-201ENST00000567180 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa41.08■■■■■ 4.17
SCX-201ENST00000567180 POGZQ7Z3K3 1410 aa41.08■■■■■ 4.17
SCX-201ENST00000567180 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa41.04■■■■■ 4.16
SCX-201ENST00000567180 MYOM3Q5VTT5 1437 aa41.02■■■■■ 4.16
SCX-201ENST00000567180 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa41.01■■■■■ 4.16
SCX-201ENST00000567180 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa41■■■■■ 4.15
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SCX-201ENST00000567180 MIA2Q96PC5 1412 aa40.97■■■■■ 4.15
SCX-201ENST00000567180 MAGI2Q86UL8 1455 aa40.95■■■■■ 4.15
SCX-201ENST00000567180 KDM5CP41229 1560 aa40.92■■■■■ 4.14
SCX-201ENST00000567180 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa40.92■■■■■ 4.14
SCX-201ENST00000567180 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa40.92■■■■■ 4.14
SCX-201ENST00000567180 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa40.88■■■■■ 4.14
SCX-201ENST00000567180 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa40.88■■■■■ 4.13
SCX-201ENST00000567180 HECW2Q9P2P5 1572 aa40.87■■■■■ 4.13
SCX-201ENST00000567180 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa40.87■■■■■ 4.13
SCX-201ENST00000567180 AFAP1Q8N556 730 aa40.87■■■■■ 4.13
SCX-201ENST00000567180 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP40.86■■■■■ 4.13
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SCX-201ENST00000567180 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP40.85■■■■■ 4.13
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SCX-201ENST00000567180 PTPN23Q9H3S7 1636 aa40.79■■■■■ 4.12
SCX-201ENST00000567180 MLH3Q9UHC1 1453 aa40.79■■■■■ 4.12
SCX-201ENST00000567180 FGD6Q6ZV73 1430 aa40.79■■■■■ 4.12
SCX-201ENST00000567180 MBD5Q9P267 1494 aa40.77■■■■■ 4.12
SCX-201ENST00000567180 ARHGEF5Q12774 1597 aa40.76■■■■■ 4.12
SCX-201ENST00000567180 CCDC141Q6ZP82 1450 aa40.76■■■■■ 4.12
SCX-201ENST00000567180 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP40.74■■■■■ 4.11
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SCX-201ENST00000567180 YEATS2Q9ULM3 1422 aa40.72■■■■■ 4.11
SCX-201ENST00000567180 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa40.69■■■■■ 4.1
SCX-201ENST00000567180 ATP7AQ04656 1500 aa40.68■■■■■ 4.1
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SCX-201ENST00000567180 ATP10AO60312 1499 aa40.67■■■■■ 4.1
SCX-201ENST00000567180 C9orf84Q5VXU9 1444 aa40.65■■■■■ 4.1
SCX-201ENST00000567180 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa40.65■■■■■ 4.1
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SCX-201ENST00000567180 PTPRKQ15262 1439 aa40.08■■■■■ 4.01
SCX-201ENST00000567180 PPP6R1Q9UPN7 881 aa40.08■■■■■ 4.01
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