RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000565922.1

CMTM3-211, Transcript of CKLF like MARVEL transmembrane domain containing 3, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene CMTM3, Length 615 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMTM3-211ENST00000565922 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa31.68■■■□□ 2.66
CMTM3-211ENST00000565922 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa31.65■■■□□ 2.66
CMTM3-211ENST00000565922 MTUS2Q5JR59 1369 aa31.64■■■□□ 2.66
CMTM3-211ENST00000565922 VPS8Q8N3P4 1428 aa31.63■■■□□ 2.65
CMTM3-211ENST00000565922 SCAPERQ9BY12 1400 aa31.63■■■□□ 2.65
CMTM3-211ENST00000565922 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa31.63■■■□□ 2.65
CMTM3-211ENST00000565922 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa31.62■■■□□ 2.65
CMTM3-211ENST00000565922 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa31.61■■■□□ 2.65
CMTM3-211ENST00000565922 POGZQ7Z3K3 1410 aa31.6■■■□□ 2.65
CMTM3-211ENST00000565922 MAGI2Q86UL8 1455 aa31.58■■■□□ 2.65
CMTM3-211ENST00000565922 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa31.54■■■□□ 2.64
CMTM3-211ENST00000565922 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa31.54■■■□□ 2.64
CMTM3-211ENST00000565922 TIAM1Q13009 1591 aa31.53■■■□□ 2.64
CMTM3-211ENST00000565922 ITSN2Q9NZM3 1697 aa31.52■■■□□ 2.64
CMTM3-211ENST00000565922 ABCC1P33527 1531 aa31.52■■■□□ 2.64
CMTM3-211ENST00000565922 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP31.5■■■□□ 2.63
CMTM3-211ENST00000565922 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP31.49■■■□□ 2.63
CMTM3-211ENST00000565922 KDM5CP41229 1560 aa31.48■■■□□ 2.63
CMTM3-211ENST00000565922 CCNB3Q8WWL7 1395 aa31.48■■■□□ 2.63
CMTM3-211ENST00000565922 HECW2Q9P2P5 1572 aa31.44■■■□□ 2.62
CMTM3-211ENST00000565922 MAP3K1Q13233 1512 aa31.44■■■□□ 2.62
CMTM3-211ENST00000565922 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa31.43■■■□□ 2.62
CMTM3-211ENST00000565922 BCORL1Q5H9F3 1711 aa31.43■■■□□ 2.62
CMTM3-211ENST00000565922 YEATS2Q9ULM3 1422 aa31.41■■■□□ 2.62
CMTM3-211ENST00000565922 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa31.4■■■□□ 2.62
CMTM3-211ENST00000565922 ADAMTSL3P82987 1691 aa31.39■■■□□ 2.62
CMTM3-211ENST00000565922 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP31.39■■■□□ 2.62
CMTM3-211ENST00000565922 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP31.38■■■□□ 2.61
CMTM3-211ENST00000565922 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa31.37■■■□□ 2.61
CMTM3-211ENST00000565922 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa31.36■■■□□ 2.61
CMTM3-211ENST00000565922 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP31.36■■■□□ 2.61
CMTM3-211ENST00000565922 SYCP2Q9BX26 1530 aa31.35■■■□□ 2.61
CMTM3-211ENST00000565922 NCOA2Q15596 1464 aa31.35■■■□□ 2.61
CMTM3-211ENST00000565922 AFAP1Q8N556 730 aa31.35■■■□□ 2.61
CMTM3-211ENST00000565922 ATP10AO60312 1499 aa31.34■■■□□ 2.61
CMTM3-211ENST00000565922 MLH3Q9UHC1 1453 aa31.34■■■□□ 2.61
CMTM3-211ENST00000565922 C9orf84Q5VXU9 1444 aa31.34■■■□□ 2.61
CMTM3-211ENST00000565922 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa31.33■■■□□ 2.61
CMTM3-211ENST00000565922 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa31.33■■■□□ 2.61
CMTM3-211ENST00000565922 MYT1LQ9UL68 1186 aa31.31■■■□□ 2.6
CMTM3-211ENST00000565922 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa31.3■■■□□ 2.6
CMTM3-211ENST00000565922 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa31.3■■■□□ 2.6
CMTM3-211ENST00000565922 APLP2Q06481 763 aa31.29■■■□□ 2.6
CMTM3-211ENST00000565922 ABCA6Q8N139 1617 aa31.28■■■□□ 2.6
CMTM3-211ENST00000565922 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa31.28■■■□□ 2.6
CMTM3-211ENST00000565922 REREQ9P2R6 1566 aa31.28■■■□□ 2.6
CMTM3-211ENST00000565922 MADDQ8WXG6 1647 aa31.27■■■□□ 2.6
CMTM3-211ENST00000565922 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa31.21■■■□□ 2.59
CMTM3-211ENST00000565922 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP31.21■■■□□ 2.59
CMTM3-211ENST00000565922 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP31.21■■■□□ 2.59
CMTM3-211ENST00000565922 PTPRMP28827 1452 aa31.2■■■□□ 2.58
CMTM3-211ENST00000565922 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP31.19■■■□□ 2.58
CMTM3-211ENST00000565922 ATP7AQ04656 1500 aa31.19■■■□□ 2.58
CMTM3-211ENST00000565922 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP31.18■■■□□ 2.58
CMTM3-211ENST00000565922 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa31.16■■■□□ 2.58
CMTM3-211ENST00000565922 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP31.16■■■□□ 2.58
CMTM3-211ENST00000565922 MBD5Q9P267 1494 aa31.14■■■□□ 2.57
CMTM3-211ENST00000565922 AGLP35573 1532 aa31.14■■■□□ 2.57
CMTM3-211ENST00000565922 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP31.13■■■□□ 2.57
CMTM3-211ENST00000565922 ADGBQ8N7X0 1667 aa31.1■■■□□ 2.57
CMTM3-211ENST00000565922 MLECQ14165 292 aa31.1■■■□□ 2.57
CMTM3-211ENST00000565922 CCDC141Q6ZP82 1450 aa31.09■■■□□ 2.57
CMTM3-211ENST00000565922 MYOM3Q5VTT5 1437 aa31.09■■■□□ 2.57
CMTM3-211ENST00000565922 RSPH4AQ5TD94 716 aa31.09■■■□□ 2.57
CMTM3-211ENST00000565922 ARHGEF5Q12774 1597 aa31.09■■■□□ 2.57
CMTM3-211ENST00000565922 MIA2Q96PC5 1412 aa31.08■■■□□ 2.57
CMTM3-211ENST00000565922 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa31.06■■■□□ 2.56
CMTM3-211ENST00000565922 PLXNC1O60486 1568 aa31.02■■■□□ 2.56
CMTM3-211ENST00000565922 A2MP01023 1474 aa31.01■■■□□ 2.55
CMTM3-211ENST00000565922 PTPN23Q9H3S7 1636 aa30.95■■■□□ 2.54
CMTM3-211ENST00000565922 MAST1Q9Y2H9 1570 aa30.93■■■□□ 2.54
CMTM3-211ENST00000565922 TSPY4P0CV99 314 aa30.93■■■□□ 2.54
CMTM3-211ENST00000565922 TSPY10P0CW01 314 aa30.93■■■□□ 2.54
CMTM3-211ENST00000565922 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP30.93■■■□□ 2.54
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CMTM3-211ENST00000565922 MROH2AA6NES4 1674 aa30.89■■■□□ 2.54
CMTM3-211ENST00000565922 CROCC2H7BZ55 1655 aa30.87■■■□□ 2.53
CMTM3-211ENST00000565922 C3P01024 1663 aa30.87■■■□□ 2.53
CMTM3-211ENST00000565922 FGD6Q6ZV73 1430 aa30.87■■■□□ 2.53
CMTM3-211ENST00000565922 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP30.85■■■□□ 2.53
CMTM3-211ENST00000565922 PLPPR3Q6T4P5 718 aa30.85■■■□□ 2.53
CMTM3-211ENST00000565922 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP30.85■■■□□ 2.53
CMTM3-211ENST00000565922 PREX1Q8TCU6 1659 aa30.84■■■□□ 2.53
CMTM3-211ENST00000565922 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP30.83■■■□□ 2.53
CMTM3-211ENST00000565922 LMTK3Q96Q04 1460 aa30.81■■■□□ 2.52
CMTM3-211ENST00000565922 SHANK2Q9UPX8 1470 aa30.81■■■□□ 2.52
CMTM3-211ENST00000565922 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP30.8■■■□□ 2.52
CMTM3-211ENST00000565922 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP30.8■■■□□ 2.52
CMTM3-211ENST00000565922 PPP6R1Q9UPN7 881 aa30.78■■■□□ 2.52
CMTM3-211ENST00000565922 FAM135AQ9P2D6 1515 aa30.76■■■□□ 2.51
CMTM3-211ENST00000565922 GGT6Q6P531 493 aa30.75■■■□□ 2.51
CMTM3-211ENST00000565922 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP30.75■■■□□ 2.51
CMTM3-211ENST00000565922 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP30.74■■■□□ 2.51
CMTM3-211ENST00000565922 DAPK1P53355 1430 aa30.73■■■□□ 2.51
CMTM3-211ENST00000565922 ABCC5O15440 1437 aa30.72■■■□□ 2.51
CMTM3-211ENST00000565922 DUOX2Q9NRD8 1548 aa30.7■■■□□ 2.51
CMTM3-211ENST00000565922 KIF3BO15066 747 aa30.7■■■□□ 2.51
CMTM3-211ENST00000565922 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa30.68■■■□□ 2.5
CMTM3-211ENST00000565922 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP30.68■■■□□ 2.5
CMTM3-211ENST00000565922 ZMYM3Q14202 1370 aa30.67■■■□□ 2.5
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