RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000562652.1

ITGAL-205, Transcript of integrin subunit alpha L, humanhuman

TSL 4

Gene ITGAL, Length 561 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAL-205ENST00000562652 MAGI2Q86UL8 1455 aa30■■■□□ 2.39
ITGAL-205ENST00000562652 YEATS2Q9ULM3 1422 aa30■■■□□ 2.39
ITGAL-205ENST00000562652 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP30■■■□□ 2.39
ITGAL-205ENST00000562652 SCAPERQ9BY12 1400 aa29.99■■■□□ 2.39
ITGAL-205ENST00000562652 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP29.99■■■□□ 2.39
ITGAL-205ENST00000562652 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP29.98■■■□□ 2.39
ITGAL-205ENST00000562652 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP29.96■■■□□ 2.39
ITGAL-205ENST00000562652 CLIP1P30622 1438 aa29.96■■■□□ 2.39
ITGAL-205ENST00000562652 ARHGAP5Q13017 1502 aa29.92■■■□□ 2.38
ITGAL-205ENST00000562652 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa29.9■■■□□ 2.38
ITGAL-205ENST00000562652 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa29.9■■■□□ 2.38
ITGAL-205ENST00000562652 CCDC18Q5T9S5 1454 aa29.88■■■□□ 2.37
ITGAL-205ENST00000562652 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa29.87■■■□□ 2.37
ITGAL-205ENST00000562652 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa29.87■■■□□ 2.37
ITGAL-205ENST00000562652 LMTK3Q96Q04 1460 aa29.87■■■□□ 2.37
ITGAL-205ENST00000562652 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa29.85■■■□□ 2.37
ITGAL-205ENST00000562652 PREX2Q70Z35 1606 aa29.85■■■□□ 2.37
ITGAL-205ENST00000562652 KDM5CP41229 1560 aa29.83■■■□□ 2.37
ITGAL-205ENST00000562652 C9orf84Q5VXU9 1444 aa29.83■■■□□ 2.37
ITGAL-205ENST00000562652 ATP10AO60312 1499 aa29.82■■■□□ 2.36
ITGAL-205ENST00000562652 MLECQ14165 292 aa29.79■■■□□ 2.36
ITGAL-205ENST00000562652 FYCO1Q9BQS8 1478 aa29.79■■■□□ 2.36
ITGAL-205ENST00000562652 PLPPR3Q6T4P5 718 aa29.77■■■□□ 2.36
ITGAL-205ENST00000562652 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa29.76■■■□□ 2.36
ITGAL-205ENST00000562652 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa29.76■■■□□ 2.35
ITGAL-205ENST00000562652 ITSN2Q9NZM3 1697 aa29.75■■■□□ 2.35
ITGAL-205ENST00000562652 ABCC1P33527 1531 aa29.75■■■□□ 2.35
ITGAL-205ENST00000562652 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa29.74■■■□□ 2.35
ITGAL-205ENST00000562652 ABCA6Q8N139 1617 aa29.71■■■□□ 2.35
ITGAL-205ENST00000562652 AFAP1Q8N556 730 aa29.71■■■□□ 2.35
ITGAL-205ENST00000562652 REREQ9P2R6 1566 aa29.69■■■□□ 2.34
ITGAL-205ENST00000562652 MYT1LQ9UL68 1186 aa29.67■■■□□ 2.34
ITGAL-205ENST00000562652 MLH3Q9UHC1 1453 aa29.66■■■□□ 2.34
ITGAL-205ENST00000562652 PREX1Q8TCU6 1659 aa29.65■■■□□ 2.34
ITGAL-205ENST00000562652 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa29.64■■■□□ 2.34
ITGAL-205ENST00000562652 HSPA2P54652 639 aa29.63■■■□□ 2.33
ITGAL-205ENST00000562652 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa29.6■■■□□ 2.33
ITGAL-205ENST00000562652 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa29.59■■■□□ 2.33
ITGAL-205ENST00000562652 FBXO41Q8TF61 875 aa29.56■■■□□ 2.32
ITGAL-205ENST00000562652 AGLP35573 1532 aa29.55■■■□□ 2.32
ITGAL-205ENST00000562652 SYCP2Q9BX26 1530 aa29.55■■■□□ 2.32
ITGAL-205ENST00000562652 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP29.53■■■□□ 2.32
ITGAL-205ENST00000562652 C3P01024 1663 aa29.53■■■□□ 2.32
ITGAL-205ENST00000562652 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP29.52■■■□□ 2.32
ITGAL-205ENST00000562652 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP29.5■■■□□ 2.31
ITGAL-205ENST00000562652 MTUS2Q5JR59 1369 aa29.46■■■□□ 2.31
ITGAL-205ENST00000562652 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa29.45■■■□□ 2.3
ITGAL-205ENST00000562652 CCNB3Q8WWL7 1395 aa29.44■■■□□ 2.3
ITGAL-205ENST00000562652 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP29.44■■■□□ 2.3
ITGAL-205ENST00000562652 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP29.43■■■□□ 2.3
ITGAL-205ENST00000562652 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa29.43■■■□□ 2.3
ITGAL-205ENST00000562652 ATP7AQ04656 1500 aa29.43■■■□□ 2.3
ITGAL-205ENST00000562652 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa29.42■■■□□ 2.3
ITGAL-205ENST00000562652 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP29.42■■■□□ 2.3
ITGAL-205ENST00000562652 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP29.41■■■□□ 2.3
ITGAL-205ENST00000562652 TIAM1Q13009 1591 aa29.4■■■□□ 2.3
ITGAL-205ENST00000562652 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa29.4■■■□□ 2.3
ITGAL-205ENST00000562652 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP29.4■■■□□ 2.3
ITGAL-205ENST00000562652 STRCQ7RTU9 1775 aa29.39■■■□□ 2.3
ITGAL-205ENST00000562652 CEP162Q5TB80 1403 aa29.39■■■□□ 2.3
ITGAL-205ENST00000562652 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP29.39■■■□□ 2.3
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ITGAL-205ENST00000562652 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP29.38■■■□□ 2.29
ITGAL-205ENST00000562652 CNTLNQ9NXG0 1405 aa29.37■■■□□ 2.29
ITGAL-205ENST00000562652 PLXNC1O60486 1568 aa29.35■■■□□ 2.29
ITGAL-205ENST00000562652 ADGBQ8N7X0 1667 aa29.31■■■□□ 2.28
ITGAL-205ENST00000562652 A2MP01023 1474 aa29.29■■■□□ 2.28
ITGAL-205ENST00000562652 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP29.29■■■□□ 2.28
ITGAL-205ENST00000562652 CERKQ8TCT0 537 aa29.26■■■□□ 2.27
ITGAL-205ENST00000562652 DMRT2Q9Y5R5 561 aa29.24■■■□□ 2.27
ITGAL-205ENST00000562652 NPATQ14207 1427 aa29.23■■■□□ 2.27
ITGAL-205ENST00000562652 MBD5Q9P267 1494 aa29.23■■■□□ 2.27
ITGAL-205ENST00000562652 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP29.22■■■□□ 2.27
ITGAL-205ENST00000562652 NCOA2Q15596 1464 aa29.19■■■□□ 2.26
ITGAL-205ENST00000562652 ZMYM3Q14202 1370 aa29.19■■■□□ 2.26
ITGAL-205ENST00000562652 MYO3AQ8NEV4 1616 aa29.18■■■□□ 2.26
ITGAL-205ENST00000562652 PTPRTO14522 1441 aa29.17■■■□□ 2.26
ITGAL-205ENST00000562652 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP29.16■■■□□ 2.26
ITGAL-205ENST00000562652 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa29.16■■■□□ 2.26
ITGAL-205ENST00000562652 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa29.15■■■□□ 2.26
ITGAL-205ENST00000562652 NCOA1Q15788 1441 aa29.15■■■□□ 2.26
ITGAL-205ENST00000562652 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa29.14■■■□□ 2.26
ITGAL-205ENST00000562652 CCDC141Q6ZP82 1450 aa29.14■■■□□ 2.26
ITGAL-205ENST00000562652 GGT6Q6P531 493 aa29.13■■■□□ 2.25
ITGAL-205ENST00000562652 PTPRKQ15262 1439 aa29.09■■■□□ 2.25
ITGAL-205ENST00000562652 VPS8Q8N3P4 1428 aa29.09■■■□□ 2.25
ITGAL-205ENST00000562652 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP29.09■■■□□ 2.25
ITGAL-205ENST00000562652 ARHGEF5Q12774 1597 aa29.05■■■□□ 2.24
ITGAL-205ENST00000562652 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP29.05■■■□□ 2.24
ITGAL-205ENST00000562652 PPP6R1Q9UPN7 881 aa29.04■■■□□ 2.24
ITGAL-205ENST00000562652 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa29.04■■■□□ 2.24
ITGAL-205ENST00000562652 LTBP4Q8N2S1 1624 aa29.02■■■□□ 2.24
ITGAL-205ENST00000562652 KDM5DQ9BY66 1539 aa28.99■■■□□ 2.23
ITGAL-205ENST00000562652 FAM135AQ9P2D6 1515 aa28.99■■■□□ 2.23
ITGAL-205ENST00000562652 PLA2R1Q13018 1463 aa28.99■■■□□ 2.23
ITGAL-205ENST00000562652 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa28.99■■■□□ 2.23
ITGAL-205ENST00000562652 RSPH4AQ5TD94 716 aa28.98■■■□□ 2.23
ITGAL-205ENST00000562652 KIF3BO15066 747 aa28.96■■■□□ 2.23
ITGAL-205ENST00000562652 MAP3K1Q13233 1512 aa28.94■■■□□ 2.22
ITGAL-205ENST00000562652 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa28.94■■■□□ 2.22
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