RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000561610.1

PPP4C-202, Transcript of protein phosphatase 4 catalytic subunit, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PPP4C, Length 1,333 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP4C-202ENST00000561610 LMTK3Q96Q04 1460 aa29.15■■■□□ 2.26
PPP4C-202ENST00000561610 CCNB3Q8WWL7 1395 aa29.15■■■□□ 2.26
PPP4C-202ENST00000561610 MAP3K1Q13233 1512 aa29.15■■■□□ 2.26
PPP4C-202ENST00000561610 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP29.15■■■□□ 2.26
PPP4C-202ENST00000561610 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa29.15■■■□□ 2.26
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PPP4C-202ENST00000561610 AKNAQ7Z591 1439 aa29.13■■■□□ 2.25
PPP4C-202ENST00000561610 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP29.12■■■□□ 2.25
PPP4C-202ENST00000561610 PHLDB1Q86UU1 1377 aa29.12■■■□□ 2.25
PPP4C-202ENST00000561610 PTPRMP28827 1452 aa29.11■■■□□ 2.25
PPP4C-202ENST00000561610 PREX2Q70Z35 1606 aa29.11■■■□□ 2.25
PPP4C-202ENST00000561610 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa29.1■■■□□ 2.25
PPP4C-202ENST00000561610 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa29.09■■■□□ 2.25
PPP4C-202ENST00000561610 NCOA2Q15596 1464 aa29.08■■■□□ 2.25
PPP4C-202ENST00000561610 ARAP3Q8WWN8 1544 aa29.07■■■□□ 2.24
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PPP4C-202ENST00000561610 RAPGEF3O95398 923 aa29.04■■■□□ 2.24
PPP4C-202ENST00000561610 ADAMTSL3P82987 1691 aa29.03■■■□□ 2.24
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PPP4C-202ENST00000561610 ITSN2Q9NZM3 1697 aa29.02■■■□□ 2.24
PPP4C-202ENST00000561610 SCAPERQ9BY12 1400 aa29.01■■■□□ 2.24
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PPP4C-202ENST00000561610 MYT1LQ9UL68 1186 aa28.96■■■□□ 2.23
PPP4C-202ENST00000561610 MADDQ8WXG6 1647 aa28.94■■■□□ 2.22
PPP4C-202ENST00000561610 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa28.92■■■□□ 2.22
PPP4C-202ENST00000561610 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP28.91■■■□□ 2.22
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PPP4C-202ENST00000561610 ABCC1P33527 1531 aa28.9■■■□□ 2.22
PPP4C-202ENST00000561610 BCORL1Q5H9F3 1711 aa28.9■■■□□ 2.22
PPP4C-202ENST00000561610 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa28.89■■■□□ 2.22
PPP4C-202ENST00000561610 POGZQ7Z3K3 1410 aa28.89■■■□□ 2.21
PPP4C-202ENST00000561610 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP28.88■■■□□ 2.21
PPP4C-202ENST00000561610 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP28.88■■■□□ 2.21
PPP4C-202ENST00000561610 SYCP2Q9BX26 1530 aa28.87■■■□□ 2.21
PPP4C-202ENST00000561610 AFAP1Q8N556 730 aa28.86■■■□□ 2.21
PPP4C-202ENST00000561610 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa28.85■■■□□ 2.21
PPP4C-202ENST00000561610 MYOM3Q5VTT5 1437 aa28.85■■■□□ 2.21
PPP4C-202ENST00000561610 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa28.84■■■□□ 2.21
PPP4C-202ENST00000561610 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP28.84■■■□□ 2.21
PPP4C-202ENST00000561610 DISP3Q9P2K9 1392 aa28.83■■■□□ 2.21
PPP4C-202ENST00000561610 PLPPR3Q6T4P5 718 aa28.83■■■□□ 2.21
PPP4C-202ENST00000561610 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa28.83■■■□□ 2.21
PPP4C-202ENST00000561610 HSPA2P54652 639 aa28.82■■■□□ 2.2
PPP4C-202ENST00000561610 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa28.82■■■□□ 2.2
PPP4C-202ENST00000561610 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa28.81■■■□□ 2.2
PPP4C-202ENST00000561610 ILDR2Q71H61 639 aa28.78■■■□□ 2.2
PPP4C-202ENST00000561610 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa28.77■■■□□ 2.2
PPP4C-202ENST00000561610 CERKQ8TCT0 537 aa28.77■■■□□ 2.2
PPP4C-202ENST00000561610 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa28.77■■■□□ 2.2
PPP4C-202ENST00000561610 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa28.77■■■□□ 2.2
PPP4C-202ENST00000561610 MIA2Q96PC5 1412 aa28.76■■■□□ 2.19
PPP4C-202ENST00000561610 SOCS7O14512 581 aa28.75■■■□□ 2.19
PPP4C-202ENST00000561610 YEATS2Q9ULM3 1422 aa28.73■■■□□ 2.19
PPP4C-202ENST00000561610 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP28.72■■■□□ 2.19
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PPP4C-202ENST00000561610 KDM5CP41229 1560 aa28.72■■■□□ 2.19
PPP4C-202ENST00000561610 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa28.71■■■□□ 2.19
PPP4C-202ENST00000561610 PTPN23Q9H3S7 1636 aa28.71■■■□□ 2.19
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PPP4C-202ENST00000561610 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP28.69■■■□□ 2.18
PPP4C-202ENST00000561610 CCDC141Q6ZP82 1450 aa28.66■■■□□ 2.18
PPP4C-202ENST00000561610 MBD5Q9P267 1494 aa28.66■■■□□ 2.18
PPP4C-202ENST00000561610 MLH3Q9UHC1 1453 aa28.65■■■□□ 2.18
PPP4C-202ENST00000561610 TSPY4P0CV99 314 aa28.65■■■□□ 2.18
PPP4C-202ENST00000561610 TSPY10P0CW01 314 aa28.65■■■□□ 2.18
PPP4C-202ENST00000561610 RSPH4AQ5TD94 716 aa28.65■■■□□ 2.18
PPP4C-202ENST00000561610 ATP10AO60312 1499 aa28.62■■■□□ 2.17
PPP4C-202ENST00000561610 ATP7AQ04656 1500 aa28.62■■■□□ 2.17
PPP4C-202ENST00000561610 ARHGEF5Q12774 1597 aa28.61■■■□□ 2.17
PPP4C-202ENST00000561610 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa28.61■■■□□ 2.17
PPP4C-202ENST00000561610 ABCA6Q8N139 1617 aa28.61■■■□□ 2.17
PPP4C-202ENST00000561610 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa28.6■■■□□ 2.17
PPP4C-202ENST00000561610 C9orf84Q5VXU9 1444 aa28.59■■■□□ 2.17
PPP4C-202ENST00000561610 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa28.59■■■□□ 2.17
PPP4C-202ENST00000561610 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP28.57■■■□□ 2.16
PPP4C-202ENST00000561610 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP28.57■■■□□ 2.16
PPP4C-202ENST00000561610 MLECQ14165 292 aa28.56■■■□□ 2.16
PPP4C-202ENST00000561610 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa28.51■■■□□ 2.15
PPP4C-202ENST00000561610 DAPK1P53355 1430 aa28.5■■■□□ 2.15
PPP4C-202ENST00000561610 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP28.49■■■□□ 2.15
PPP4C-202ENST00000561610 ITGAEP38570 1179 aa28.49■■■□□ 2.15
PPP4C-202ENST00000561610 CHIC2Q9UKJ5 165 aa28.49■■■□□ 2.15
PPP4C-202ENST00000561610 ABCC5O15440 1437 aa28.49■■■□□ 2.15
PPP4C-202ENST00000561610 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa28.48■■■□□ 2.15
PPP4C-202ENST00000561610 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa28.48■■■□□ 2.15
PPP4C-202ENST00000561610 CROCC2H7BZ55 1655 aa28.47■■■□□ 2.15
PPP4C-202ENST00000561610 A2MP01023 1474 aa28.46■■■□□ 2.15
PPP4C-202ENST00000561610 ADGBQ8N7X0 1667 aa28.46■■■□□ 2.15
PPP4C-202ENST00000561610 MAST1Q9Y2H9 1570 aa28.44■■■□□ 2.14
PPP4C-202ENST00000561610 REREQ9P2R6 1566 aa28.43■■■□□ 2.14
PPP4C-202ENST00000561610 SHANK2Q9UPX8 1470 aa28.41■■■□□ 2.14
PPP4C-202ENST00000561610 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa28.4■■■□□ 2.14
PPP4C-202ENST00000561610 PREX1Q8TCU6 1659 aa28.39■■■□□ 2.14
PPP4C-202ENST00000561610 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP28.37■■■□□ 2.13
PPP4C-202ENST00000561610 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP28.37■■■□□ 2.13
PPP4C-202ENST00000561610 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP28.37■■■□□ 2.13
PPP4C-202ENST00000561610 AGLP35573 1532 aa28.36■■■□□ 2.13
PPP4C-202ENST00000561610 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa28.36■■■□□ 2.13
PPP4C-202ENST00000561610 GGT6Q6P531 493 aa28.35■■■□□ 2.13
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