RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560152.1

LHX6-211, Transcript of LIM homeobox 6, humanhuman

TSL 3

Gene LHX6, Length 582 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX6-211ENST00000560152 CCDC18Q5T9S5 1454 aa21.8■■□□□ 1.08
LHX6-211ENST00000560152 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa21.8■■□□□ 1.08
LHX6-211ENST00000560152 PREX2Q70Z35 1606 aa21.8■■□□□ 1.08
LHX6-211ENST00000560152 HECW2Q9P2P5 1572 aa21.78■■□□□ 1.08
LHX6-211ENST00000560152 MADDQ8WXG6 1647 aa21.78■■□□□ 1.08
LHX6-211ENST00000560152 SCAPERQ9BY12 1400 aa21.77■■□□□ 1.08
LHX6-211ENST00000560152 KDM5CP41229 1560 aa21.77■■□□□ 1.08
LHX6-211ENST00000560152 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa21.76■■□□□ 1.07
LHX6-211ENST00000560152 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP21.75■■□□□ 1.07
LHX6-211ENST00000560152 MAGI2Q86UL8 1455 aa21.74■■□□□ 1.07
LHX6-211ENST00000560152 PTPRMP28827 1452 aa21.73■■□□□ 1.07
LHX6-211ENST00000560152 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa21.73■■□□□ 1.07
LHX6-211ENST00000560152 ABCC1P33527 1531 aa21.71■■□□□ 1.07
LHX6-211ENST00000560152 ARHGAP5Q13017 1502 aa21.71■■□□□ 1.07
LHX6-211ENST00000560152 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP21.71■■□□□ 1.07
LHX6-211ENST00000560152 ITSN2Q9NZM3 1697 aa21.7■■□□□ 1.06
LHX6-211ENST00000560152 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP21.69■■□□□ 1.06
LHX6-211ENST00000560152 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa21.67■■□□□ 1.06
LHX6-211ENST00000560152 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa21.66■■□□□ 1.06
LHX6-211ENST00000560152 CEP162Q5TB80 1403 aa21.66■■□□□ 1.06
LHX6-211ENST00000560152 ABCA6Q8N139 1617 aa21.66■■□□□ 1.06
LHX6-211ENST00000560152 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa21.65■■□□□ 1.06
LHX6-211ENST00000560152 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa21.65■■□□□ 1.06
LHX6-211ENST00000560152 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP21.64■■□□□ 1.05
LHX6-211ENST00000560152 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa21.63■■□□□ 1.05
LHX6-211ENST00000560152 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa21.63■■□□□ 1.05
LHX6-211ENST00000560152 REREQ9P2R6 1566 aa21.62■■□□□ 1.05
LHX6-211ENST00000560152 ATP10AO60312 1499 aa21.62■■□□□ 1.05
LHX6-211ENST00000560152 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa21.61■■□□□ 1.05
LHX6-211ENST00000560152 MLH3Q9UHC1 1453 aa21.6■■□□□ 1.05
LHX6-211ENST00000560152 AFAP1Q8N556 730 aa21.6■■□□□ 1.05
LHX6-211ENST00000560152 C9orf84Q5VXU9 1444 aa21.59■■□□□ 1.05
LHX6-211ENST00000560152 TIAM1Q13009 1591 aa21.57■■□□□ 1.04
LHX6-211ENST00000560152 LMTK3Q96Q04 1460 aa21.55■■□□□ 1.04
LHX6-211ENST00000560152 SYCP2Q9BX26 1530 aa21.55■■□□□ 1.04
LHX6-211ENST00000560152 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa21.54■■□□□ 1.04
LHX6-211ENST00000560152 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP21.54■■□□□ 1.04
LHX6-211ENST00000560152 AGLP35573 1532 aa21.51■■□□□ 1.03
LHX6-211ENST00000560152 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP21.51■■□□□ 1.03
LHX6-211ENST00000560152 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa21.5■■□□□ 1.03
LHX6-211ENST00000560152 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa21.47■■□□□ 1.03
LHX6-211ENST00000560152 MTUS2Q5JR59 1369 aa21.46■■□□□ 1.03
LHX6-211ENST00000560152 PLXNC1O60486 1568 aa21.45■■□□□ 1.02
LHX6-211ENST00000560152 MBD5Q9P267 1494 aa21.45■■□□□ 1.02
LHX6-211ENST00000560152 VPS8Q8N3P4 1428 aa21.43■■□□□ 1.02
LHX6-211ENST00000560152 ATP7AQ04656 1500 aa21.43■■□□□ 1.02
LHX6-211ENST00000560152 C3P01024 1663 aa21.42■■□□□ 1.02
LHX6-211ENST00000560152 MLECQ14165 292 aa21.42■■□□□ 1.02
LHX6-211ENST00000560152 CCNB3Q8WWL7 1395 aa21.42■■□□□ 1.02
LHX6-211ENST00000560152 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP21.41■■□□□ 1.02
LHX6-211ENST00000560152 NCOA2Q15596 1464 aa21.4■■□□□ 1.02
LHX6-211ENST00000560152 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa21.4■■□□□ 1.02
LHX6-211ENST00000560152 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP21.4■■□□□ 1.02
LHX6-211ENST00000560152 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP21.39■■□□□ 1.01
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LHX6-211ENST00000560152 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP21.37■■□□□ 1.01
LHX6-211ENST00000560152 ADGBQ8N7X0 1667 aa21.36■■□□□ 1.01
LHX6-211ENST00000560152 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP21.36■■□□□ 1.01
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LHX6-211ENST00000560152 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa21.35■■□□□ 1.01
LHX6-211ENST00000560152 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP21.33■■□□□ 1.01
LHX6-211ENST00000560152 MROH2AA6NES4 1674 aa21.33■■□□□ 1
LHX6-211ENST00000560152 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa21.32■■□□□ 1
LHX6-211ENST00000560152 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP21.31■■□□□ 1
LHX6-211ENST00000560152 STRCQ7RTU9 1775 aa21.31■■□□□ 1
LHX6-211ENST00000560152 HSPA2P54652 639 aa21.3■■□□□ 1
LHX6-211ENST00000560152 A2MP01023 1474 aa21.3■■□□□ 1
LHX6-211ENST00000560152 ARHGEF5Q12774 1597 aa21.28■■□□□ 1
LHX6-211ENST00000560152 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP21.27■■□□□ 1
LHX6-211ENST00000560152 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP21.27■■□□□ 1
LHX6-211ENST00000560152 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa21.27■■□□□ 1
LHX6-211ENST00000560152 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP21.26■□□□□ 0.99
LHX6-211ENST00000560152 PLPPR3Q6T4P5 718 aa21.26■□□□□ 0.99
LHX6-211ENST00000560152 CCDC141Q6ZP82 1450 aa21.25■□□□□ 0.99
LHX6-211ENST00000560152 MYT1LQ9UL68 1186 aa21.24■□□□□ 0.99
LHX6-211ENST00000560152 CNTLNQ9NXG0 1405 aa21.22■□□□□ 0.99
LHX6-211ENST00000560152 MAST1Q9Y2H9 1570 aa21.2■□□□□ 0.98
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LHX6-211ENST00000560152 MYOM3Q5VTT5 1437 aa21.17■□□□□ 0.98
LHX6-211ENST00000560152 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP21.16■□□□□ 0.98
LHX6-211ENST00000560152 NPATQ14207 1427 aa21.16■□□□□ 0.98
LHX6-211ENST00000560152 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa21.16■□□□□ 0.98
LHX6-211ENST00000560152 ZMYM3Q14202 1370 aa21.15■□□□□ 0.98
LHX6-211ENST00000560152 MYO3AQ8NEV4 1616 aa21.15■□□□□ 0.98
LHX6-211ENST00000560152 PTPRKQ15262 1439 aa21.14■□□□□ 0.98
LHX6-211ENST00000560152 MIA2Q96PC5 1412 aa21.14■□□□□ 0.98
LHX6-211ENST00000560152 CROCC2H7BZ55 1655 aa21.12■□□□□ 0.97
LHX6-211ENST00000560152 MROH1Q8NDA8 1641 aa21.11■□□□□ 0.97
LHX6-211ENST00000560152 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP21.11■□□□□ 0.97
LHX6-211ENST00000560152 FAM135AQ9P2D6 1515 aa21.09■□□□□ 0.97
LHX6-211ENST00000560152 RSPH4AQ5TD94 716 aa21.08■□□□□ 0.97
LHX6-211ENST00000560152 PTPN23Q9H3S7 1636 aa21.07■□□□□ 0.96
LHX6-211ENST00000560152 NCOA1Q15788 1441 aa21.07■□□□□ 0.96
LHX6-211ENST00000560152 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP21.06■□□□□ 0.96
LHX6-211ENST00000560152 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP21.06■□□□□ 0.96
LHX6-211ENST00000560152 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP21.06■□□□□ 0.96
LHX6-211ENST00000560152 KDM5DQ9BY66 1539 aa21.05■□□□□ 0.96
LHX6-211ENST00000560152 GGT6Q6P531 493 aa21.05■□□□□ 0.96
LHX6-211ENST00000560152 PPP6R1Q9UPN7 881 aa21.05■□□□□ 0.96
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