RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000555806.5

NEDD1-208, Transcript of neural precursor cell expressed, developmentally down-regulated 1, humanhuman

TSL 4

Gene NEDD1, Length 565 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD1-208ENST00000555806 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa29.55■■■□□ 2.32
NEDD1-208ENST00000555806 POGZQ7Z3K3 1410 aa29.54■■■□□ 2.32
NEDD1-208ENST00000555806 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa29.52■■■□□ 2.32
NEDD1-208ENST00000555806 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa29.51■■■□□ 2.32
NEDD1-208ENST00000555806 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP29.51■■■□□ 2.32
NEDD1-208ENST00000555806 PREX2Q70Z35 1606 aa29.51■■■□□ 2.31
NEDD1-208ENST00000555806 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa29.51■■■□□ 2.31
NEDD1-208ENST00000555806 MAGI2Q86UL8 1455 aa29.48■■■□□ 2.31
NEDD1-208ENST00000555806 YEATS2Q9ULM3 1422 aa29.46■■■□□ 2.31
NEDD1-208ENST00000555806 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa29.45■■■□□ 2.3
NEDD1-208ENST00000555806 MTUS2Q5JR59 1369 aa29.44■■■□□ 2.3
NEDD1-208ENST00000555806 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa29.43■■■□□ 2.3
NEDD1-208ENST00000555806 BCORL1Q5H9F3 1711 aa29.43■■■□□ 2.3
NEDD1-208ENST00000555806 ADAMTSL3P82987 1691 aa29.42■■■□□ 2.3
NEDD1-208ENST00000555806 ABCC1P33527 1531 aa29.39■■■□□ 2.3
NEDD1-208ENST00000555806 AFAP1Q8N556 730 aa29.37■■■□□ 2.29
NEDD1-208ENST00000555806 KDM5CP41229 1560 aa29.36■■■□□ 2.29
NEDD1-208ENST00000555806 MYT1LQ9UL68 1186 aa29.36■■■□□ 2.29
NEDD1-208ENST00000555806 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa29.35■■■□□ 2.29
NEDD1-208ENST00000555806 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP29.35■■■□□ 2.29
NEDD1-208ENST00000555806 MADDQ8WXG6 1647 aa29.35■■■□□ 2.29
NEDD1-208ENST00000555806 ITSN2Q9NZM3 1697 aa29.35■■■□□ 2.29
NEDD1-208ENST00000555806 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP29.35■■■□□ 2.29
NEDD1-208ENST00000555806 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa29.34■■■□□ 2.29
NEDD1-208ENST00000555806 CCNB3Q8WWL7 1395 aa29.33■■■□□ 2.29
NEDD1-208ENST00000555806 ATP10AO60312 1499 aa29.33■■■□□ 2.29
NEDD1-208ENST00000555806 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa29.33■■■□□ 2.29
NEDD1-208ENST00000555806 HECW2Q9P2P5 1572 aa29.33■■■□□ 2.29
NEDD1-208ENST00000555806 PTPRMP28827 1452 aa29.32■■■□□ 2.28
NEDD1-208ENST00000555806 C9orf84Q5VXU9 1444 aa29.31■■■□□ 2.28
NEDD1-208ENST00000555806 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa29.31■■■□□ 2.28
NEDD1-208ENST00000555806 VPS8Q8N3P4 1428 aa29.3■■■□□ 2.28
NEDD1-208ENST00000555806 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa29.3■■■□□ 2.28
NEDD1-208ENST00000555806 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP29.28■■■□□ 2.28
NEDD1-208ENST00000555806 MLECQ14165 292 aa29.27■■■□□ 2.28
NEDD1-208ENST00000555806 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP29.27■■■□□ 2.28
NEDD1-208ENST00000555806 SYCP2Q9BX26 1530 aa29.25■■■□□ 2.27
NEDD1-208ENST00000555806 MLH3Q9UHC1 1453 aa29.25■■■□□ 2.27
NEDD1-208ENST00000555806 TIAM1Q13009 1591 aa29.24■■■□□ 2.27
NEDD1-208ENST00000555806 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa29.24■■■□□ 2.27
NEDD1-208ENST00000555806 ABCA6Q8N139 1617 aa29.22■■■□□ 2.27
NEDD1-208ENST00000555806 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa29.21■■■□□ 2.27
NEDD1-208ENST00000555806 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP29.2■■■□□ 2.26
NEDD1-208ENST00000555806 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP29.19■■■□□ 2.26
NEDD1-208ENST00000555806 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa29.18■■■□□ 2.26
NEDD1-208ENST00000555806 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa29.17■■■□□ 2.26
NEDD1-208ENST00000555806 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa29.17■■■□□ 2.26
NEDD1-208ENST00000555806 REREQ9P2R6 1566 aa29.16■■■□□ 2.26
NEDD1-208ENST00000555806 NCOA2Q15596 1464 aa29.16■■■□□ 2.26
NEDD1-208ENST00000555806 PLPPR3Q6T4P5 718 aa29.15■■■□□ 2.26
NEDD1-208ENST00000555806 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP29.13■■■□□ 2.25
NEDD1-208ENST00000555806 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa29.11■■■□□ 2.25
NEDD1-208ENST00000555806 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP29.1■■■□□ 2.25
NEDD1-208ENST00000555806 ATP7AQ04656 1500 aa29.08■■■□□ 2.25
NEDD1-208ENST00000555806 AGLP35573 1532 aa29.06■■■□□ 2.24
NEDD1-208ENST00000555806 MAP3K1Q13233 1512 aa29.06■■■□□ 2.24
NEDD1-208ENST00000555806 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP29.05■■■□□ 2.24
NEDD1-208ENST00000555806 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa29.02■■■□□ 2.24
NEDD1-208ENST00000555806 MBD5Q9P267 1494 aa29.02■■■□□ 2.24
NEDD1-208ENST00000555806 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP29.01■■■□□ 2.23
NEDD1-208ENST00000555806 APLP2Q06481 763 aa28.99■■■□□ 2.23
NEDD1-208ENST00000555806 LMTK3Q96Q04 1460 aa28.98■■■□□ 2.23
NEDD1-208ENST00000555806 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP28.97■■■□□ 2.23
NEDD1-208ENST00000555806 A2MP01023 1474 aa28.96■■■□□ 2.23
NEDD1-208ENST00000555806 CCDC141Q6ZP82 1450 aa28.95■■■□□ 2.22
NEDD1-208ENST00000555806 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP28.94■■■□□ 2.22
NEDD1-208ENST00000555806 ADGBQ8N7X0 1667 aa28.93■■■□□ 2.22
NEDD1-208ENST00000555806 PLXNC1O60486 1568 aa28.92■■■□□ 2.22
NEDD1-208ENST00000555806 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa28.91■■■□□ 2.22
NEDD1-208ENST00000555806 RSPH4AQ5TD94 716 aa28.89■■■□□ 2.22
NEDD1-208ENST00000555806 MYOM3Q5VTT5 1437 aa28.88■■■□□ 2.21
NEDD1-208ENST00000555806 ARHGEF5Q12774 1597 aa28.88■■■□□ 2.21
NEDD1-208ENST00000555806 C3P01024 1663 aa28.86■■■□□ 2.21
NEDD1-208ENST00000555806 CNTLNQ9NXG0 1405 aa28.86■■■□□ 2.21
NEDD1-208ENST00000555806 HSPA2P54652 639 aa28.85■■■□□ 2.21
NEDD1-208ENST00000555806 PREX1Q8TCU6 1659 aa28.85■■■□□ 2.21
NEDD1-208ENST00000555806 MIA2Q96PC5 1412 aa28.84■■■□□ 2.21
NEDD1-208ENST00000555806 TSPY4P0CV99 314 aa28.81■■■□□ 2.2
NEDD1-208ENST00000555806 TSPY10P0CW01 314 aa28.81■■■□□ 2.2
NEDD1-208ENST00000555806 GGT6Q6P531 493 aa28.81■■■□□ 2.2
NEDD1-208ENST00000555806 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP28.79■■■□□ 2.2
NEDD1-208ENST00000555806 MROH2AA6NES4 1674 aa28.79■■■□□ 2.2
NEDD1-208ENST00000555806 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa28.77■■■□□ 2.2
NEDD1-208ENST00000555806 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP28.77■■■□□ 2.2
NEDD1-208ENST00000555806 ZMYM3Q14202 1370 aa28.74■■■□□ 2.19
NEDD1-208ENST00000555806 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP28.73■■■□□ 2.19
NEDD1-208ENST00000555806 MAST1Q9Y2H9 1570 aa28.72■■■□□ 2.19
NEDD1-208ENST00000555806 PTPN23Q9H3S7 1636 aa28.72■■■□□ 2.19
NEDD1-208ENST00000555806 KIF3BO15066 747 aa28.71■■■□□ 2.19
NEDD1-208ENST00000555806 PPP6R1Q9UPN7 881 aa28.69■■■□□ 2.18
NEDD1-208ENST00000555806 NPATQ14207 1427 aa28.67■■■□□ 2.18
NEDD1-208ENST00000555806 FGD6Q6ZV73 1430 aa28.67■■■□□ 2.18
NEDD1-208ENST00000555806 CROCC2H7BZ55 1655 aa28.61■■■□□ 2.17
NEDD1-208ENST00000555806 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP28.61■■■□□ 2.17
NEDD1-208ENST00000555806 KDM5DQ9BY66 1539 aa28.6■■■□□ 2.17
NEDD1-208ENST00000555806 ABCC5O15440 1437 aa28.6■■■□□ 2.17
NEDD1-208ENST00000555806 PTPRKQ15262 1439 aa28.6■■■□□ 2.17
NEDD1-208ENST00000555806 SHANK2Q9UPX8 1470 aa28.59■■■□□ 2.17
NEDD1-208ENST00000555806 FAM135AQ9P2D6 1515 aa28.59■■■□□ 2.17
NEDD1-208ENST00000555806 DAPK1P53355 1430 aa28.58■■■□□ 2.17
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