RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000549940.5

GNPTAB-206, Transcript of N-acetylglucosamine-1-phosphate transferase subunits alpha and beta, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene GNPTAB, Length 1,678 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNPTAB-206ENST00000549940 MAPKBP1O60336 1514 aa41.53■■■■■ 4.24
GNPTAB-206ENST00000549940 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa41.52■■■■■ 4.24
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GNPTAB-206ENST00000549940 PLCH2O75038 1416 aa41.5■■■■■ 4.23
GNPTAB-206ENST00000549940 ABCA9Q8IUA7 1624 aa41.48■■■■■ 4.23
GNPTAB-206ENST00000549940 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa41.42■■■■■ 4.22
GNPTAB-206ENST00000549940 PTPRKQ15262 1439 aa41.42■■■■■ 4.22
GNPTAB-206ENST00000549940 DAPK1P53355 1430 aa41.41■■■■■ 4.22
GNPTAB-206ENST00000549940 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP41.41■■■■■ 4.22
GNPTAB-206ENST00000549940 ARAP3Q8WWN8 1544 aa41.39■■■■■ 4.22
GNPTAB-206ENST00000549940 ABCC5O15440 1437 aa41.37■■■■■ 4.21
GNPTAB-206ENST00000549940 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa41.37■■■■■ 4.21
GNPTAB-206ENST00000549940 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa41.34■■■■■ 4.21
GNPTAB-206ENST00000549940 CHIC2Q9UKJ5 165 aa41.33■■■■■ 4.21
GNPTAB-206ENST00000549940 SETD5Q9C0A6 1442 aa41.33■■■■■ 4.21
GNPTAB-206ENST00000549940 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP41.29■■■■■ 4.2
GNPTAB-206ENST00000549940 RSPH4AQ5TD94 716 aa41.29■■■■■ 4.2
GNPTAB-206ENST00000549940 CD109Q6YHK3 1445 aa41.29■■■■■ 4.2
GNPTAB-206ENST00000549940 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa41.27■■■■■ 4.2
GNPTAB-206ENST00000549940 ARHGEF5Q12774 1597 aa41.25■■■■■ 4.19
GNPTAB-206ENST00000549940 FANCAO15360 1455 aa41.25■■■■■ 4.19
GNPTAB-206ENST00000549940 HFM1A2PYH4 1435 aa41.25■■■■■ 4.19
GNPTAB-206ENST00000549940 MBD5Q9P267 1494 aa41.24■■■■■ 4.19
GNPTAB-206ENST00000549940 TSPY4P0CV99 314 aa41.23■■■■■ 4.19
GNPTAB-206ENST00000549940 TSPY10P0CW01 314 aa41.23■■■■■ 4.19
GNPTAB-206ENST00000549940 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa41.23■■■■■ 4.19
GNPTAB-206ENST00000549940 SYCP2Q9BX26 1530 aa41.22■■■■■ 4.19
GNPTAB-206ENST00000549940 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP41.22■■■■■ 4.19
GNPTAB-206ENST00000549940 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa41.22■■■■■ 4.19
GNPTAB-206ENST00000549940 AKNAQ7Z591 1439 aa41.22■■■■■ 4.19
GNPTAB-206ENST00000549940 ROCK1Q13464 1354 aa41.21■■■■■ 4.19
GNPTAB-206ENST00000549940 CROCC2H7BZ55 1655 aa41.2■■■■■ 4.19
GNPTAB-206ENST00000549940 CCDC141Q6ZP82 1450 aa41.2■■■■■ 4.19
GNPTAB-206ENST00000549940 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa41.2■■■■■ 4.19
GNPTAB-206ENST00000549940 GLI2P10070 1586 aa41.19■■■■■ 4.18
GNPTAB-206ENST00000549940 SHANK2Q9UPX8 1470 aa41.17■■■■■ 4.18
GNPTAB-206ENST00000549940 NAIPQ13075 1403 aa41.16■■■■■ 4.18
GNPTAB-206ENST00000549940 FAM69CQ0P6D2 419 aa41.16■■■■■ 4.18
GNPTAB-206ENST00000549940 ABCC1P33527 1531 aa41.16■■■■■ 4.18
GNPTAB-206ENST00000549940 HRCP23327 699 aa41.15■■■■■ 4.18
GNPTAB-206ENST00000549940 DIP2BQ9P265 1576 aa41.13■■■■■ 4.17
GNPTAB-206ENST00000549940 C9orf84Q5VXU9 1444 aa41.12■■■■■ 4.17
GNPTAB-206ENST00000549940 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa41.11■■■■■ 4.17
GNPTAB-206ENST00000549940 ADGBQ8N7X0 1667 aa41.1■■■■■ 4.17
GNPTAB-206ENST00000549940 CFAP74Q9C0B2 1584 aa41.1■■■■■ 4.17
GNPTAB-206ENST00000549940 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa41.09■■■■■ 4.17
GNPTAB-206ENST00000549940 ADGRL2O95490 1459 aa41.09■■■■■ 4.17
GNPTAB-206ENST00000549940 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa41.08■■■■■ 4.17
GNPTAB-206ENST00000549940 GCC2Q8IWJ2 1684 aa41.07■■■■■ 4.17
GNPTAB-206ENST00000549940 NCOA1Q15788 1441 aa41.07■■■■■ 4.16
GNPTAB-206ENST00000549940 ADGRL1O94910 1474 aa41.06■■■■■ 4.16
GNPTAB-206ENST00000549940 SCAPERQ9BY12 1400 aa41.01■■■■■ 4.16
GNPTAB-206ENST00000549940 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa40.99■■■■■ 4.15
GNPTAB-206ENST00000549940 NEO1Q92859 1461 aa40.99■■■■■ 4.15
GNPTAB-206ENST00000549940 MAST1Q9Y2H9 1570 aa40.97■■■■■ 4.15
GNPTAB-206ENST00000549940 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP40.92■■■■■ 4.14
GNPTAB-206ENST00000549940 AFAP1Q8N556 730 aa40.92■■■■■ 4.14
GNPTAB-206ENST00000549940 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP40.92■■■■■ 4.14
GNPTAB-206ENST00000549940 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP40.9■■■■■ 4.14
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GNPTAB-206ENST00000549940 KIF15Q9NS87 1388 aa40.9■■■■■ 4.14
GNPTAB-206ENST00000549940 KIF13AQ9H1H9 1805 aa40.85■■■■■ 4.13
GNPTAB-206ENST00000549940 TEX14Q8IWB6 1497 aa40.84■■■■■ 4.13
GNPTAB-206ENST00000549940 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa40.84■■■■■ 4.13
GNPTAB-206ENST00000549940 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa40.83■■■■■ 4.13
GNPTAB-206ENST00000549940 KDM6BO15054 1643 aa40.83■■■■■ 4.13
GNPTAB-206ENST00000549940 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa40.83■■■■■ 4.13
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GNPTAB-206ENST00000549940 PLXNC1O60486 1568 aa40.81■■■■■ 4.12
GNPTAB-206ENST00000549940 TRIM52Q96A61 297 aa40.8■■■■■ 4.12
GNPTAB-206ENST00000549940 MYT1LQ9UL68 1186 aa40.79■■■■■ 4.12
GNPTAB-206ENST00000549940 POGZQ7Z3K3 1410 aa40.78■■■■■ 4.12
GNPTAB-206ENST00000549940 CLSPNQ9HAW4 1339 aa40.78■■■■■ 4.12
GNPTAB-206ENST00000549940 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP40.77■■■■■ 4.12
GNPTAB-206ENST00000549940 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa40.75■■■■■ 4.11
GNPTAB-206ENST00000549940 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP40.73■■■■■ 4.11
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GNPTAB-206ENST00000549940 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP40.7■■■■■ 4.11
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GNPTAB-206ENST00000549940 KDM5CP41229 1560 aa40.68■■■■■ 4.1
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GNPTAB-206ENST00000549940 TRHP20396 242 aaPredicted RBP40.6■■■■■ 4.09
GNPTAB-206ENST00000549940 HECW2Q9P2P5 1572 aa40.58■■■■■ 4.09
GNPTAB-206ENST00000549940 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa40.58■■■■■ 4.09
GNPTAB-206ENST00000549940 RICTORQ6R327 1708 aa40.57■■■■■ 4.09
GNPTAB-206ENST00000549940 MPHOSPH9Q99550 1183 aa40.56■■■■■ 4.08
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GNPTAB-206ENST00000549940 NUP155O75694 1391 aa40.51■■■■■ 4.08
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GNPTAB-206ENST00000549940 PZPP20742 1482 aa40.43■■■■■ 4.06
GNPTAB-206ENST00000549940 KDM5DQ9BY66 1539 aa40.42■■■■■ 4.06
GNPTAB-206ENST00000549940 A2MP01023 1474 aa40.42■■■■■ 4.06
GNPTAB-206ENST00000549940 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa40.42■■■■■ 4.06
GNPTAB-206ENST00000549940 UNC13BO14795 1591 aa40.41■■■■■ 4.06
GNPTAB-206ENST00000549940 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP40.4■■■■■ 4.06
GNPTAB-206ENST00000549940 MAGI2Q86UL8 1455 aa40.37■■■■■ 4.05
GNPTAB-206ENST00000549940 ABCA6Q8N139 1617 aa40.37■■■■■ 4.05
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