RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000547701.5

CTDSP2-203, Transcript of CTD small phosphatase 2, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene CTDSP2, Length 988 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSP2-203ENST00000547701 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa37.05■■■■□ 3.52
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CTDSP2-203ENST00000547701 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa37.04■■■■□ 3.52
CTDSP2-203ENST00000547701 MAP3K1Q13233 1512 aa37.03■■■■□ 3.52
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CTDSP2-203ENST00000547701 MAGI2Q86UL8 1455 aa37.01■■■■□ 3.51
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CTDSP2-203ENST00000547701 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa36.8■■■■□ 3.48
CTDSP2-203ENST00000547701 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa36.8■■■■□ 3.48
CTDSP2-203ENST00000547701 NCOA2Q15596 1464 aa36.78■■■■□ 3.48
CTDSP2-203ENST00000547701 MLH3Q9UHC1 1453 aa36.78■■■■□ 3.48
CTDSP2-203ENST00000547701 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP36.78■■■■□ 3.48
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CTDSP2-203ENST00000547701 SYCP2Q9BX26 1530 aa36.65■■■■□ 3.46
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CTDSP2-203ENST00000547701 C9orf84Q5VXU9 1444 aa36.64■■■■□ 3.46
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CTDSP2-203ENST00000547701 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa36.61■■■■□ 3.45
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CTDSP2-203ENST00000547701 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa36.59■■■■□ 3.45
CTDSP2-203ENST00000547701 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa36.59■■■■□ 3.45
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CTDSP2-203ENST00000547701 MIA2Q96PC5 1412 aa36.54■■■■□ 3.44
CTDSP2-203ENST00000547701 ABCA6Q8N139 1617 aa36.54■■■■□ 3.44
CTDSP2-203ENST00000547701 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP36.54■■■■□ 3.44
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CTDSP2-203ENST00000547701 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP36.5■■■■□ 3.43
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CTDSP2-203ENST00000547701 MYT1LQ9UL68 1186 aa36.42■■■■□ 3.42
CTDSP2-203ENST00000547701 CCDC141Q6ZP82 1450 aa36.42■■■■□ 3.42
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CTDSP2-203ENST00000547701 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa36.31■■■■□ 3.4
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CTDSP2-203ENST00000547701 MAST1Q9Y2H9 1570 aa36.27■■■■□ 3.4
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CTDSP2-203ENST00000547701 TSPY10P0CW01 314 aa36.24■■■■□ 3.39
CTDSP2-203ENST00000547701 PTPN23Q9H3S7 1636 aa36.23■■■■□ 3.39
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CTDSP2-203ENST00000547701 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP36.22■■■■□ 3.39
CTDSP2-203ENST00000547701 PPP6R1Q9UPN7 881 aa36.18■■■■□ 3.38
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CTDSP2-203ENST00000547701 SHANK2Q9UPX8 1470 aa36.14■■■■□ 3.38
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CTDSP2-203ENST00000547701 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP36.1■■■■□ 3.37
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CTDSP2-203ENST00000547701 MROH2AA6NES4 1674 aa36.08■■■■□ 3.37
CTDSP2-203ENST00000547701 FAM135AQ9P2D6 1515 aa36.05■■■■□ 3.36
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CTDSP2-203ENST00000547701 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP35.94■■■■□ 3.346e-9■■■■■ 82.2
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CTDSP2-203ENST00000547701 GGT6Q6P531 493 aa35.94■■■■□ 3.34
CTDSP2-203ENST00000547701 ZMYM3Q14202 1370 aa35.93■■■■□ 3.34
CTDSP2-203ENST00000547701 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP35.93■■■■□ 3.34
CTDSP2-203ENST00000547701 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP35.92■■■■□ 3.34
CTDSP2-203ENST00000547701 NPATQ14207 1427 aa35.91■■■■□ 3.34
CTDSP2-203ENST00000547701 ADGRL2O95490 1459 aa35.91■■■■□ 3.34
CTDSP2-203ENST00000547701 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP35.9■■■■□ 3.34
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