RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000547052.1

BRF1-209, Transcript of BRF1, RNA polymerase III transcription initiation factor subunit, humanhuman

TSL 5

Gene BRF1, Length 771 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRF1-209ENST00000547052 FANCAO15360 1455 aa27.89■■■□□ 2.05
BRF1-209ENST00000547052 PLCH2O75038 1416 aa27.88■■■□□ 2.05
BRF1-209ENST00000547052 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa27.84■■■□□ 2.05
BRF1-209ENST00000547052 NCOA2Q15596 1464 aa27.83■■■□□ 2.04
BRF1-209ENST00000547052 AKNAQ7Z591 1439 aa27.78■■■□□ 2.04
BRF1-209ENST00000547052 ADGRL1O94910 1474 aa27.76■■■□□ 2.04
BRF1-209ENST00000547052 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP27.76■■■□□ 2.03
BRF1-209ENST00000547052 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP27.75■■■□□ 2.03
BRF1-209ENST00000547052 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP27.75■■■□□ 2.03
BRF1-209ENST00000547052 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa27.72■■■□□ 2.03
BRF1-209ENST00000547052 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP27.7■■■□□ 2.03
BRF1-209ENST00000547052 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP27.7■■■□□ 2.02
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BRF1-209ENST00000547052 ABCC1P33527 1531 aa27.67■■■□□ 2.02
BRF1-209ENST00000547052 MYOM3Q5VTT5 1437 aa27.67■■■□□ 2.02
BRF1-209ENST00000547052 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa27.66■■■□□ 2.02
BRF1-209ENST00000547052 SCAPERQ9BY12 1400 aa27.66■■■□□ 2.02
BRF1-209ENST00000547052 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa27.63■■■□□ 2.01
BRF1-209ENST00000547052 MIA2Q96PC5 1412 aa27.61■■■□□ 2.01
BRF1-209ENST00000547052 POGZQ7Z3K3 1410 aa27.6■■■□□ 2.01
BRF1-209ENST00000547052 SYCP2Q9BX26 1530 aa27.6■■■□□ 2.01
BRF1-209ENST00000547052 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa27.58■■■□□ 2.01
BRF1-209ENST00000547052 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP27.58■■■□□ 2.01
BRF1-209ENST00000547052 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa27.58■■■□□ 2
BRF1-209ENST00000547052 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa27.57■■■□□ 2
BRF1-209ENST00000547052 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa27.57■■■□□ 2
BRF1-209ENST00000547052 PTPN23Q9H3S7 1636 aa27.56■■■□□ 2
BRF1-209ENST00000547052 MYT1LQ9UL68 1186 aa27.56■■■□□ 2
BRF1-209ENST00000547052 RAPGEF3O95398 923 aa27.55■■■□□ 2
BRF1-209ENST00000547052 HECW2Q9P2P5 1572 aa27.54■■■□□ 2
BRF1-209ENST00000547052 MAGI2Q86UL8 1455 aa27.52■■■□□ 2
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BRF1-209ENST00000547052 FGD6Q6ZV73 1430 aa27.51■■□□□ 1.99
BRF1-209ENST00000547052 RSPH4AQ5TD94 716 aa27.51■■□□□ 1.99
BRF1-209ENST00000547052 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa27.5■■□□□ 1.99
BRF1-209ENST00000547052 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa27.49■■□□□ 1.99
BRF1-209ENST00000547052 ARHGEF5Q12774 1597 aa27.48■■□□□ 1.99
BRF1-209ENST00000547052 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP27.48■■□□□ 1.99
BRF1-209ENST00000547052 CCDC141Q6ZP82 1450 aa27.47■■□□□ 1.99
BRF1-209ENST00000547052 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP27.46■■□□□ 1.99
BRF1-209ENST00000547052 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa27.46■■□□□ 1.99
BRF1-209ENST00000547052 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa27.44■■□□□ 1.98
BRF1-209ENST00000547052 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP27.43■■□□□ 1.98
BRF1-209ENST00000547052 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP27.42■■□□□ 1.98
BRF1-209ENST00000547052 AFAP1Q8N556 730 aa27.42■■□□□ 1.98
BRF1-209ENST00000547052 CROCC2H7BZ55 1655 aa27.42■■□□□ 1.98
BRF1-209ENST00000547052 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP27.41■■□□□ 1.98
BRF1-209ENST00000547052 MLH3Q9UHC1 1453 aa27.41■■□□□ 1.98
BRF1-209ENST00000547052 ATP7AQ04656 1500 aa27.41■■□□□ 1.98
BRF1-209ENST00000547052 TSPY4P0CV99 314 aa27.4■■□□□ 1.98
BRF1-209ENST00000547052 TSPY10P0CW01 314 aa27.4■■□□□ 1.98
BRF1-209ENST00000547052 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa27.4■■□□□ 1.98
BRF1-209ENST00000547052 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP27.39■■□□□ 1.98
BRF1-209ENST00000547052 ADGBQ8N7X0 1667 aa27.39■■□□□ 1.97
BRF1-209ENST00000547052 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP27.39■■□□□ 1.97
BRF1-209ENST00000547052 MBD5Q9P267 1494 aa27.38■■□□□ 1.97
BRF1-209ENST00000547052 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP27.38■■□□□ 1.97
BRF1-209ENST00000547052 ABCA6Q8N139 1617 aa27.34■■□□□ 1.97
BRF1-209ENST00000547052 ATP10AO60312 1499 aa27.33■■□□□ 1.97
BRF1-209ENST00000547052 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa27.33■■□□□ 1.97
BRF1-209ENST00000547052 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa27.33■■□□□ 1.96
BRF1-209ENST00000547052 C9orf84Q5VXU9 1444 aa27.33■■□□□ 1.96
BRF1-209ENST00000547052 MAST1Q9Y2H9 1570 aa27.32■■□□□ 1.96
BRF1-209ENST00000547052 SHANK2Q9UPX8 1470 aa27.31■■□□□ 1.96
BRF1-209ENST00000547052 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP27.3■■□□□ 1.96
BRF1-209ENST00000547052 YEATS2Q9ULM3 1422 aa27.3■■□□□ 1.96
BRF1-209ENST00000547052 REREQ9P2R6 1566 aa27.28■■□□□ 1.96
BRF1-209ENST00000547052 DAPK1P53355 1430 aa27.28■■□□□ 1.96
BRF1-209ENST00000547052 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP27.27■■□□□ 1.96
BRF1-209ENST00000547052 PLXNC1O60486 1568 aa27.26■■□□□ 1.95
BRF1-209ENST00000547052 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP27.24■■□□□ 1.95
BRF1-209ENST00000547052 ABCC5O15440 1437 aa27.22■■□□□ 1.95
BRF1-209ENST00000547052 A2MP01023 1474 aa27.19■■□□□ 1.94
BRF1-209ENST00000547052 BCORL1Q5H9F3 1711 aa27.19■■□□□ 1.94
BRF1-209ENST00000547052 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa27.19■■□□□ 1.94
BRF1-209ENST00000547052 AGLP35573 1532 aa27.16■■□□□ 1.94
BRF1-209ENST00000547052 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa27.14■■□□□ 1.94
BRF1-209ENST00000547052 DUOX2Q9NRD8 1548 aa27.14■■□□□ 1.94
BRF1-209ENST00000547052 ITGAEP38570 1179 aa27.13■■□□□ 1.93
BRF1-209ENST00000547052 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP27.12■■□□□ 1.93
BRF1-209ENST00000547052 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa27.11■■□□□ 1.93
BRF1-209ENST00000547052 CHIC2Q9UKJ5 165 aa27.11■■□□□ 1.93
BRF1-209ENST00000547052 KIF15Q9NS87 1388 aa27.1■■□□□ 1.93
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BRF1-209ENST00000547052 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP27.09■■□□□ 1.93
BRF1-209ENST00000547052 ADAMTSL3P82987 1691 aa27.07■■□□□ 1.92
BRF1-209ENST00000547052 MLECQ14165 292 aa27.05■■□□□ 1.92
BRF1-209ENST00000547052 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa27.05■■□□□ 1.92
BRF1-209ENST00000547052 ROCK1Q13464 1354 aa27.05■■□□□ 1.92
BRF1-209ENST00000547052 ERBINQ96RT1 1412 aa27.05■■□□□ 1.92
BRF1-209ENST00000547052 NCOA1Q15788 1441 aa27.04■■□□□ 1.92
BRF1-209ENST00000547052 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP27.04■■□□□ 1.92
BRF1-209ENST00000547052 MADDQ8WXG6 1647 aa27.03■■□□□ 1.92
BRF1-209ENST00000547052 KIF3BO15066 747 aa27■■□□□ 1.91
BRF1-209ENST00000547052 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP26.99■■□□□ 1.91
BRF1-209ENST00000547052 GCC2Q8IWJ2 1684 aa26.98■■□□□ 1.91
BRF1-209ENST00000547052 FAM135AQ9P2D6 1515 aa26.98■■□□□ 1.91
BRF1-209ENST00000547052 GGT6Q6P531 493 aa26.96■■□□□ 1.91
BRF1-209ENST00000547052 PPP6R1Q9UPN7 881 aa26.96■■□□□ 1.91
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