RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000534617.5

BRMS1-209, Transcript of BRMS1, transcriptional repressor and anoikis regulator, humanhuman

TSL 2

Gene BRMS1, Length 905 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRMS1-209ENST00000534617 SCAPERQ9BY12 1400 aa22.55■■□□□ 1.2
BRMS1-209ENST00000534617 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa22.54■■□□□ 1.2
BRMS1-209ENST00000534617 POGZQ7Z3K3 1410 aa22.54■■□□□ 1.2
BRMS1-209ENST00000534617 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa22.54■■□□□ 1.2
BRMS1-209ENST00000534617 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa22.52■■□□□ 1.2
BRMS1-209ENST00000534617 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa22.51■■□□□ 1.19
BRMS1-209ENST00000534617 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa22.5■■□□□ 1.19
BRMS1-209ENST00000534617 YEATS2Q9ULM3 1422 aa22.47■■□□□ 1.19
BRMS1-209ENST00000534617 MAGI2Q86UL8 1455 aa22.46■■□□□ 1.19
BRMS1-209ENST00000534617 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP22.45■■□□□ 1.18
BRMS1-209ENST00000534617 MTUS2Q5JR59 1369 aa22.45■■□□□ 1.18
BRMS1-209ENST00000534617 ABCC1P33527 1531 aa22.44■■□□□ 1.18
BRMS1-209ENST00000534617 BCORL1Q5H9F3 1711 aa22.44■■□□□ 1.18
BRMS1-209ENST00000534617 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa22.44■■□□□ 1.18
BRMS1-209ENST00000534617 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa22.43■■□□□ 1.18
BRMS1-209ENST00000534617 ADAMTSL3P82987 1691 aa22.42■■□□□ 1.18
BRMS1-209ENST00000534617 ITSN2Q9NZM3 1697 aa22.42■■□□□ 1.18
BRMS1-209ENST00000534617 KDM5CP41229 1560 aa22.42■■□□□ 1.18
BRMS1-209ENST00000534617 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa22.4■■□□□ 1.18
BRMS1-209ENST00000534617 HECW2Q9P2P5 1572 aa22.39■■□□□ 1.18
BRMS1-209ENST00000534617 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP22.39■■□□□ 1.17
BRMS1-209ENST00000534617 VPS8Q8N3P4 1428 aa22.39■■□□□ 1.17
BRMS1-209ENST00000534617 MADDQ8WXG6 1647 aa22.39■■□□□ 1.17
BRMS1-209ENST00000534617 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa22.38■■□□□ 1.17
BRMS1-209ENST00000534617 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa22.37■■□□□ 1.17
BRMS1-209ENST00000534617 CCNB3Q8WWL7 1395 aa22.37■■□□□ 1.17
BRMS1-209ENST00000534617 AFAP1Q8N556 730 aa22.36■■□□□ 1.17
BRMS1-209ENST00000534617 TIAM1Q13009 1591 aa22.35■■□□□ 1.17
BRMS1-209ENST00000534617 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa22.35■■□□□ 1.17
BRMS1-209ENST00000534617 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP22.35■■□□□ 1.17
BRMS1-209ENST00000534617 C9orf84Q5VXU9 1444 aa22.34■■□□□ 1.17
BRMS1-209ENST00000534617 MYT1LQ9UL68 1186 aa22.34■■□□□ 1.17
BRMS1-209ENST00000534617 SYCP2Q9BX26 1530 aa22.34■■□□□ 1.17
BRMS1-209ENST00000534617 ATP10AO60312 1499 aa22.34■■□□□ 1.17
BRMS1-209ENST00000534617 PTPRMP28827 1452 aa22.33■■□□□ 1.16
BRMS1-209ENST00000534617 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa22.33■■□□□ 1.16
BRMS1-209ENST00000534617 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP22.33■■□□□ 1.16
BRMS1-209ENST00000534617 ABCA6Q8N139 1617 aa22.31■■□□□ 1.16
BRMS1-209ENST00000534617 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP22.31■■□□□ 1.16
BRMS1-209ENST00000534617 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP22.3■■□□□ 1.16
BRMS1-209ENST00000534617 MLH3Q9UHC1 1453 aa22.29■■□□□ 1.16
BRMS1-209ENST00000534617 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa22.28■■□□□ 1.16
BRMS1-209ENST00000534617 MLECQ14165 292 aa22.27■■□□□ 1.16
BRMS1-209ENST00000534617 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa22.27■■□□□ 1.16
BRMS1-209ENST00000534617 NCOA2Q15596 1464 aa22.27■■□□□ 1.16
BRMS1-209ENST00000534617 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa22.26■■□□□ 1.15
BRMS1-209ENST00000534617 REREQ9P2R6 1566 aa22.25■■□□□ 1.15
BRMS1-209ENST00000534617 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa22.23■■□□□ 1.15
BRMS1-209ENST00000534617 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa22.23■■□□□ 1.15
BRMS1-209ENST00000534617 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP22.23■■□□□ 1.15
BRMS1-209ENST00000534617 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP22.21■■□□□ 1.15
BRMS1-209ENST00000534617 ATP7AQ04656 1500 aa22.2■■□□□ 1.14
BRMS1-209ENST00000534617 MAP3K1Q13233 1512 aa22.2■■□□□ 1.14
BRMS1-209ENST00000534617 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP22.19■■□□□ 1.14
BRMS1-209ENST00000534617 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP22.18■■□□□ 1.14
BRMS1-209ENST00000534617 PLPPR3Q6T4P5 718 aa22.18■■□□□ 1.14
BRMS1-209ENST00000534617 AGLP35573 1532 aa22.16■■□□□ 1.14
BRMS1-209ENST00000534617 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa22.15■■□□□ 1.14
BRMS1-209ENST00000534617 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP22.13■■□□□ 1.13
BRMS1-209ENST00000534617 MBD5Q9P267 1494 aa22.13■■□□□ 1.13
BRMS1-209ENST00000534617 CCDC141Q6ZP82 1450 aa22.09■■□□□ 1.13
BRMS1-209ENST00000534617 PLXNC1O60486 1568 aa22.09■■□□□ 1.13
BRMS1-209ENST00000534617 APLP2Q06481 763 aa22.09■■□□□ 1.13
BRMS1-209ENST00000534617 ADGBQ8N7X0 1667 aa22.08■■□□□ 1.13
BRMS1-209ENST00000534617 A2MP01023 1474 aa22.08■■□□□ 1.12
BRMS1-209ENST00000534617 LMTK3Q96Q04 1460 aa22.08■■□□□ 1.12
BRMS1-209ENST00000534617 ARHGEF5Q12774 1597 aa22.05■■□□□ 1.12
BRMS1-209ENST00000534617 MYOM3Q5VTT5 1437 aa22.05■■□□□ 1.12
BRMS1-209ENST00000534617 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP22.03■■□□□ 1.12
BRMS1-209ENST00000534617 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa22.03■■□□□ 1.12
BRMS1-209ENST00000534617 C3P01024 1663 aa22.02■■□□□ 1.12
BRMS1-209ENST00000534617 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP22.02■■□□□ 1.12
BRMS1-209ENST00000534617 PREX1Q8TCU6 1659 aa22.01■■□□□ 1.11
BRMS1-209ENST00000534617 MIA2Q96PC5 1412 aa22■■□□□ 1.11
BRMS1-209ENST00000534617 CNTLNQ9NXG0 1405 aa21.98■■□□□ 1.11
BRMS1-209ENST00000534617 RSPH4AQ5TD94 716 aa21.97■■□□□ 1.11
BRMS1-209ENST00000534617 MROH2AA6NES4 1674 aa21.97■■□□□ 1.11
BRMS1-209ENST00000534617 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP21.96■■□□□ 1.11
BRMS1-209ENST00000534617 HSPA2P54652 639 aa21.95■■□□□ 1.1
BRMS1-209ENST00000534617 MAST1Q9Y2H9 1570 aa21.94■■□□□ 1.1
BRMS1-209ENST00000534617 PTPN23Q9H3S7 1636 aa21.94■■□□□ 1.1
BRMS1-209ENST00000534617 TSPY4P0CV99 314 aa21.93■■□□□ 1.1
BRMS1-209ENST00000534617 TSPY10P0CW01 314 aa21.93■■□□□ 1.1
BRMS1-209ENST00000534617 GGT6Q6P531 493 aa21.93■■□□□ 1.1
BRMS1-209ENST00000534617 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP21.93■■□□□ 1.1
BRMS1-209ENST00000534617 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa21.91■■□□□ 1.1
BRMS1-209ENST00000534617 CROCC2H7BZ55 1655 aa21.9■■□□□ 1.1
BRMS1-209ENST00000534617 FGD6Q6ZV73 1430 aa21.89■■□□□ 1.1
BRMS1-209ENST00000534617 ZMYM3Q14202 1370 aa21.87■■□□□ 1.09
BRMS1-209ENST00000534617 KIF3BO15066 747 aa21.86■■□□□ 1.09
BRMS1-209ENST00000534617 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP21.85■■□□□ 1.09
BRMS1-209ENST00000534617 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP21.85■■□□□ 1.09
BRMS1-209ENST00000534617 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP21.84■■□□□ 1.09
BRMS1-209ENST00000534617 SHANK2Q9UPX8 1470 aa21.84■■□□□ 1.09
BRMS1-209ENST00000534617 NPATQ14207 1427 aa21.84■■□□□ 1.09
BRMS1-209ENST00000534617 KDM5DQ9BY66 1539 aa21.83■■□□□ 1.09
BRMS1-209ENST00000534617 ABCC5O15440 1437 aa21.82■■□□□ 1.08
BRMS1-209ENST00000534617 PPP6R1Q9UPN7 881 aa21.82■■□□□ 1.08
BRMS1-209ENST00000534617 DAPK1P53355 1430 aa21.81■■□□□ 1.08
BRMS1-209ENST00000534617 FAM135AQ9P2D6 1515 aa21.81■■□□□ 1.08
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