RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000524778.1

USP33-212, Transcript of ubiquitin specific peptidase 33, humanhuman

TSL 5

Gene USP33, Length 389 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP33-212ENST00000524778 PHLDB1Q86UU1 1377 aa30.5■■■□□ 2.47
USP33-212ENST00000524778 FANCAO15360 1455 aa30.5■■■□□ 2.47
USP33-212ENST00000524778 NEO1Q92859 1461 aa30.5■■■□□ 2.47
USP33-212ENST00000524778 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP30.49■■■□□ 2.47
USP33-212ENST00000524778 ARHGAP5Q13017 1502 aa30.47■■■□□ 2.47
USP33-212ENST00000524778 ITSN2Q9NZM3 1697 aa30.47■■■□□ 2.47
USP33-212ENST00000524778 AKNAQ7Z591 1439 aa30.45■■■□□ 2.46
USP33-212ENST00000524778 CFAP74Q9C0B2 1584 aa30.45■■■□□ 2.46
USP33-212ENST00000524778 MYOM3Q5VTT5 1437 aa30.43■■■□□ 2.46
USP33-212ENST00000524778 MIA2Q96PC5 1412 aa30.39■■■□□ 2.46
USP33-212ENST00000524778 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP30.39■■■□□ 2.46
USP33-212ENST00000524778 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP30.35■■■□□ 2.45
USP33-212ENST00000524778 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa30.34■■■□□ 2.45
USP33-212ENST00000524778 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP30.34■■■□□ 2.45
USP33-212ENST00000524778 ADGRL1O94910 1474 aa30.32■■■□□ 2.44
USP33-212ENST00000524778 SCAPERQ9BY12 1400 aa30.32■■■□□ 2.44
USP33-212ENST00000524778 FGD6Q6ZV73 1430 aa30.3■■■□□ 2.44
USP33-212ENST00000524778 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa30.3■■■□□ 2.44
USP33-212ENST00000524778 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa30.3■■■□□ 2.44
USP33-212ENST00000524778 KDM6BO15054 1643 aa30.29■■■□□ 2.44
USP33-212ENST00000524778 ABCC1P33527 1531 aa30.28■■■□□ 2.44
USP33-212ENST00000524778 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa30.28■■■□□ 2.44
USP33-212ENST00000524778 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP30.27■■■□□ 2.44
USP33-212ENST00000524778 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP30.27■■■□□ 2.443e-7■■■■□ 22
USP33-212ENST00000524778 RAPGEF3O95398 923 aa30.26■■■□□ 2.43
USP33-212ENST00000524778 PTPN23Q9H3S7 1636 aa30.25■■■□□ 2.43
USP33-212ENST00000524778 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa30.25■■■□□ 2.43
USP33-212ENST00000524778 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP30.23■■■□□ 2.43
USP33-212ENST00000524778 RICTORQ6R327 1708 aa30.22■■■□□ 2.43
USP33-212ENST00000524778 RSPH4AQ5TD94 716 aa30.22■■■□□ 2.43
USP33-212ENST00000524778 MBD5Q9P267 1494 aa30.22■■■□□ 2.43
USP33-212ENST00000524778 AFAP1Q8N556 730 aa30.21■■■□□ 2.43
USP33-212ENST00000524778 SYCP2Q9BX26 1530 aa30.21■■■□□ 2.43
USP33-212ENST00000524778 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa30.2■■■□□ 2.42
USP33-212ENST00000524778 POGZQ7Z3K3 1410 aa30.19■■■□□ 2.42
USP33-212ENST00000524778 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa30.17■■■□□ 2.42
USP33-212ENST00000524778 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa30.17■■■□□ 2.42
USP33-212ENST00000524778 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP30.16■■■□□ 2.42
USP33-212ENST00000524778 ARHGEF5Q12774 1597 aa30.15■■■□□ 2.42
USP33-212ENST00000524778 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP30.15■■■□□ 2.42
USP33-212ENST00000524778 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP30.13■■■□□ 2.41
USP33-212ENST00000524778 KDM5CP41229 1560 aa30.11■■■□□ 2.41
USP33-212ENST00000524778 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa30.09■■■□□ 2.41
USP33-212ENST00000524778 CCDC141Q6ZP82 1450 aa30.09■■■□□ 2.41
USP33-212ENST00000524778 MAGI2Q86UL8 1455 aa30.06■■■□□ 2.4
USP33-212ENST00000524778 MLH3Q9UHC1 1453 aa30.06■■■□□ 2.4
USP33-212ENST00000524778 TSPY4P0CV99 314 aa30.06■■■□□ 2.4
USP33-212ENST00000524778 TSPY10P0CW01 314 aa30.06■■■□□ 2.4
USP33-212ENST00000524778 ABCC5O15440 1437 aa30.05■■■□□ 2.4
USP33-212ENST00000524778 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP30.05■■■□□ 2.4
USP33-212ENST00000524778 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP30.04■■■□□ 2.4
USP33-212ENST00000524778 DAPK1P53355 1430 aa30.02■■■□□ 2.4
USP33-212ENST00000524778 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa30.01■■■□□ 2.39
USP33-212ENST00000524778 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa30.01■■■□□ 2.39
USP33-212ENST00000524778 HECW2Q9P2P5 1572 aa30■■■□□ 2.39
USP33-212ENST00000524778 MYT1LQ9UL68 1186 aa29.98■■■□□ 2.39
USP33-212ENST00000524778 MAST1Q9Y2H9 1570 aa29.98■■■□□ 2.39
USP33-212ENST00000524778 CROCC2H7BZ55 1655 aa29.98■■■□□ 2.39
USP33-212ENST00000524778 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP29.96■■■□□ 2.39
USP33-212ENST00000524778 ATP7AQ04656 1500 aa29.96■■■□□ 2.39
USP33-212ENST00000524778 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa29.96■■■□□ 2.39
USP33-212ENST00000524778 YEATS2Q9ULM3 1422 aa29.96■■■□□ 2.39
USP33-212ENST00000524778 SHANK2Q9UPX8 1470 aa29.94■■■□□ 2.38
USP33-212ENST00000524778 C9orf84Q5VXU9 1444 aa29.94■■■□□ 2.38
USP33-212ENST00000524778 PTPRKQ15262 1439 aa29.92■■■□□ 2.38
USP33-212ENST00000524778 CHIC2Q9UKJ5 165 aa29.9■■■□□ 2.38
USP33-212ENST00000524778 ATP10AO60312 1499 aa29.9■■■□□ 2.38
USP33-212ENST00000524778 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa29.9■■■□□ 2.38
USP33-212ENST00000524778 ITGAEP38570 1179 aa29.89■■■□□ 2.38
USP33-212ENST00000524778 ABCA6Q8N139 1617 aa29.89■■■□□ 2.37
USP33-212ENST00000524778 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa29.88■■■□□ 2.37
USP33-212ENST00000524778 NCOA1Q15788 1441 aa29.85■■■□□ 2.37
USP33-212ENST00000524778 ADGRL2O95490 1459 aa29.84■■■□□ 2.37
USP33-212ENST00000524778 ADGBQ8N7X0 1667 aa29.83■■■□□ 2.37
USP33-212ENST00000524778 PLXNC1O60486 1568 aa29.83■■■□□ 2.37
USP33-212ENST00000524778 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa29.83■■■□□ 2.37
USP33-212ENST00000524778 ROCK1Q13464 1354 aa29.81■■■□□ 2.36
USP33-212ENST00000524778 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa29.81■■■□□ 2.36
USP33-212ENST00000524778 REREQ9P2R6 1566 aa29.81■■■□□ 2.36
USP33-212ENST00000524778 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP29.8■■■□□ 2.36
USP33-212ENST00000524778 A2MP01023 1474 aa29.79■■■□□ 2.36
USP33-212ENST00000524778 KIF15Q9NS87 1388 aa29.76■■■□□ 2.35
USP33-212ENST00000524778 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa29.75■■■□□ 2.35
USP33-212ENST00000524778 DUOX2Q9NRD8 1548 aa29.74■■■□□ 2.35
USP33-212ENST00000524778 AGLP35573 1532 aa29.72■■■□□ 2.35
USP33-212ENST00000524778 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP29.71■■■□□ 2.35
USP33-212ENST00000524778 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP29.69■■■□□ 2.34
USP33-212ENST00000524778 ERBINQ96RT1 1412 aa29.64■■■□□ 2.34
USP33-212ENST00000524778 BCORL1Q5H9F3 1711 aa29.64■■■□□ 2.34
USP33-212ENST00000524778 KIF3BO15066 747 aa29.63■■■□□ 2.33
USP33-212ENST00000524778 NAIPQ13075 1403 aa29.62■■■□□ 2.33
USP33-212ENST00000524778 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa29.62■■■□□ 2.33
USP33-212ENST00000524778 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP29.62■■■□□ 2.33
USP33-212ENST00000524778 HFM1A2PYH4 1435 aa29.61■■■□□ 2.33
USP33-212ENST00000524778 MLECQ14165 292 aa29.57■■■□□ 2.32
USP33-212ENST00000524778 GCC2Q8IWJ2 1684 aa29.56■■■□□ 2.32
USP33-212ENST00000524778 GGT6Q6P531 493 aa29.56■■■□□ 2.32
USP33-212ENST00000524778 PPP6R1Q9UPN7 881 aa29.55■■■□□ 2.32
USP33-212ENST00000524778 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP29.52■■■□□ 2.32
USP33-212ENST00000524778 ADAMTSL3P82987 1691 aa29.51■■■□□ 2.31
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 83.9 ms