RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000522193.1

HOXA-AS2-208, HOXA cluster antisense RNA 2, humanhuman

TSL 2

Gene HOXA-AS2, Length 339 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA-AS2-208ENST00000522193 TIAM1Q13009 1591 aa23.86■■□□□ 1.41
HOXA-AS2-208ENST00000522193 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP23.83■■□□□ 1.41
HOXA-AS2-208ENST00000522193 ADGRL1O94910 1474 aa23.83■■□□□ 1.41
HOXA-AS2-208ENST00000522193 RAPGEF3O95398 923 aa23.82■■□□□ 1.4
HOXA-AS2-208ENST00000522193 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa23.8■■□□□ 1.4
HOXA-AS2-208ENST00000522193 SCAPERQ9BY12 1400 aa23.77■■□□□ 1.4
HOXA-AS2-208ENST00000522193 POGZQ7Z3K3 1410 aa23.76■■□□□ 1.39
HOXA-AS2-208ENST00000522193 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP23.76■■□□□ 1.39
HOXA-AS2-208ENST00000522193 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa23.75■■□□□ 1.39
HOXA-AS2-208ENST00000522193 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP23.75■■□□□ 1.39
HOXA-AS2-208ENST00000522193 MAP3K1Q13233 1512 aa23.74■■□□□ 1.39
HOXA-AS2-208ENST00000522193 ABCC1P33527 1531 aa23.74■■□□□ 1.39
HOXA-AS2-208ENST00000522193 CCNB3Q8WWL7 1395 aa23.73■■□□□ 1.39
HOXA-AS2-208ENST00000522193 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa23.73■■□□□ 1.39
HOXA-AS2-208ENST00000522193 ITSN2Q9NZM3 1697 aa23.73■■□□□ 1.39
HOXA-AS2-208ENST00000522193 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa23.72■■□□□ 1.39
HOXA-AS2-208ENST00000522193 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa23.71■■□□□ 1.39
HOXA-AS2-208ENST00000522193 NCOA2Q15596 1464 aa23.69■■□□□ 1.38
HOXA-AS2-208ENST00000522193 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa23.68■■□□□ 1.38
HOXA-AS2-208ENST00000522193 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa23.68■■□□□ 1.38
HOXA-AS2-208ENST00000522193 KDM5CP41229 1560 aa23.67■■□□□ 1.38
HOXA-AS2-208ENST00000522193 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa23.67■■□□□ 1.38
HOXA-AS2-208ENST00000522193 MAGI2Q86UL8 1455 aa23.65■■□□□ 1.38
HOXA-AS2-208ENST00000522193 SYCP2Q9BX26 1530 aa23.64■■□□□ 1.38
HOXA-AS2-208ENST00000522193 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP23.64■■□□□ 1.37
HOXA-AS2-208ENST00000522193 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa23.63■■□□□ 1.37
HOXA-AS2-208ENST00000522193 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP23.63■■□□□ 1.37
HOXA-AS2-208ENST00000522193 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP23.63■■□□□ 1.37
HOXA-AS2-208ENST00000522193 YEATS2Q9ULM3 1422 aa23.63■■□□□ 1.37
HOXA-AS2-208ENST00000522193 HECW2Q9P2P5 1572 aa23.62■■□□□ 1.37
HOXA-AS2-208ENST00000522193 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa23.62■■□□□ 1.37
HOXA-AS2-208ENST00000522193 AFAP1Q8N556 730 aa23.6■■□□□ 1.37
HOXA-AS2-208ENST00000522193 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa23.6■■□□□ 1.37
HOXA-AS2-208ENST00000522193 APLP2Q06481 763 aa23.59■■□□□ 1.37
HOXA-AS2-208ENST00000522193 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa23.58■■□□□ 1.37
HOXA-AS2-208ENST00000522193 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa23.57■■□□□ 1.36
HOXA-AS2-208ENST00000522193 MLH3Q9UHC1 1453 aa23.55■■□□□ 1.36
HOXA-AS2-208ENST00000522193 ABCA6Q8N139 1617 aa23.55■■□□□ 1.36
HOXA-AS2-208ENST00000522193 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa23.54■■□□□ 1.36
HOXA-AS2-208ENST00000522193 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP23.54■■□□□ 1.36
HOXA-AS2-208ENST00000522193 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP23.53■■□□□ 1.36
HOXA-AS2-208ENST00000522193 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa23.53■■□□□ 1.36
HOXA-AS2-208ENST00000522193 BCORL1Q5H9F3 1711 aa23.53■■□□□ 1.36
HOXA-AS2-208ENST00000522193 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa23.52■■□□□ 1.36
HOXA-AS2-208ENST00000522193 ATP10AO60312 1499 aa23.52■■□□□ 1.36
HOXA-AS2-208ENST00000522193 C9orf84Q5VXU9 1444 aa23.51■■□□□ 1.35
HOXA-AS2-208ENST00000522193 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP23.5■■□□□ 1.35
HOXA-AS2-208ENST00000522193 MYT1LQ9UL68 1186 aa23.5■■□□□ 1.35
HOXA-AS2-208ENST00000522193 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP23.5■■□□□ 1.35
HOXA-AS2-208ENST00000522193 ADAMTSL3P82987 1691 aa23.5■■□□□ 1.35
HOXA-AS2-208ENST00000522193 MYOM3Q5VTT5 1437 aa23.49■■□□□ 1.35
HOXA-AS2-208ENST00000522193 MBD5Q9P267 1494 aa23.49■■□□□ 1.35
HOXA-AS2-208ENST00000522193 ATP7AQ04656 1500 aa23.47■■□□□ 1.35
HOXA-AS2-208ENST00000522193 REREQ9P2R6 1566 aa23.47■■□□□ 1.35
HOXA-AS2-208ENST00000522193 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP23.45■■□□□ 1.34
HOXA-AS2-208ENST00000522193 MADDQ8WXG6 1647 aa23.44■■□□□ 1.34
HOXA-AS2-208ENST00000522193 MIA2Q96PC5 1412 aa23.43■■□□□ 1.34
HOXA-AS2-208ENST00000522193 CCDC141Q6ZP82 1450 aa23.43■■□□□ 1.34
HOXA-AS2-208ENST00000522193 ARHGEF5Q12774 1597 aa23.42■■□□□ 1.34
HOXA-AS2-208ENST00000522193 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP23.38■■□□□ 1.33
HOXA-AS2-208ENST00000522193 PTPN23Q9H3S7 1636 aa23.38■■□□□ 1.33
HOXA-AS2-208ENST00000522193 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa23.37■■□□□ 1.33
HOXA-AS2-208ENST00000522193 ADGBQ8N7X0 1667 aa23.37■■□□□ 1.33
HOXA-AS2-208ENST00000522193 AGLP35573 1532 aa23.37■■□□□ 1.33
HOXA-AS2-208ENST00000522193 FGD6Q6ZV73 1430 aa23.35■■□□□ 1.33
HOXA-AS2-208ENST00000522193 MLECQ14165 292 aa23.35■■□□□ 1.33
HOXA-AS2-208ENST00000522193 PLXNC1O60486 1568 aa23.35■■□□□ 1.33
HOXA-AS2-208ENST00000522193 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa23.34■■□□□ 1.33
HOXA-AS2-208ENST00000522193 PTPRMP28827 1452 aa23.34■■□□□ 1.33
HOXA-AS2-208ENST00000522193 A2MP01023 1474 aa23.32■■□□□ 1.32
HOXA-AS2-208ENST00000522193 RSPH4AQ5TD94 716 aa23.32■■□□□ 1.32
HOXA-AS2-208ENST00000522193 CROCC2H7BZ55 1655 aa23.32■■□□□ 1.32
HOXA-AS2-208ENST00000522193 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP23.31■■□□□ 1.32
HOXA-AS2-208ENST00000522193 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP23.31■■□□□ 1.32
HOXA-AS2-208ENST00000522193 MAST1Q9Y2H9 1570 aa23.31■■□□□ 1.32
HOXA-AS2-208ENST00000522193 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP23.26■■□□□ 1.31
HOXA-AS2-208ENST00000522193 TSPY4P0CV99 314 aa23.25■■□□□ 1.31
HOXA-AS2-208ENST00000522193 TSPY10P0CW01 314 aa23.25■■□□□ 1.31
HOXA-AS2-208ENST00000522193 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP23.23■■□□□ 1.31
HOXA-AS2-208ENST00000522193 ABCC5O15440 1437 aa23.23■■□□□ 1.31
HOXA-AS2-208ENST00000522193 SHANK2Q9UPX8 1470 aa23.23■■□□□ 1.31
HOXA-AS2-208ENST00000522193 DAPK1P53355 1430 aa23.22■■□□□ 1.31
HOXA-AS2-208ENST00000522193 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP23.2■■□□□ 1.3
HOXA-AS2-208ENST00000522193 PLPPR3Q6T4P5 718 aa23.16■■□□□ 1.3
HOXA-AS2-208ENST00000522193 C3P01024 1663 aa23.16■■□□□ 1.3
HOXA-AS2-208ENST00000522193 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP23.15■■□□□ 1.3
HOXA-AS2-208ENST00000522193 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP23.15■■□□□ 1.3
HOXA-AS2-208ENST00000522193 MROH2AA6NES4 1674 aa23.14■■□□□ 1.29
HOXA-AS2-208ENST00000522193 CNTLNQ9NXG0 1405 aa23.14■■□□□ 1.29
HOXA-AS2-208ENST00000522193 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP23.13■■□□□ 1.29
HOXA-AS2-208ENST00000522193 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP23.12■■□□□ 1.29
HOXA-AS2-208ENST00000522193 DUOX2Q9NRD8 1548 aa23.12■■□□□ 1.29
HOXA-AS2-208ENST00000522193 GGT6Q6P531 493 aa23.11■■□□□ 1.29
HOXA-AS2-208ENST00000522193 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP23.1■■□□□ 1.29
HOXA-AS2-208ENST00000522193 KIF15Q9NS87 1388 aa23.1■■□□□ 1.29
HOXA-AS2-208ENST00000522193 KIF3BO15066 747 aa23.09■■□□□ 1.29
HOXA-AS2-208ENST00000522193 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP23.09■■□□□ 1.29
HOXA-AS2-208ENST00000522193 ADGRL2O95490 1459 aa23.06■■□□□ 1.28
HOXA-AS2-208ENST00000522193 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa23.06■■□□□ 1.28
HOXA-AS2-208ENST00000522193 CHIC2Q9UKJ5 165 aa23.06■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 15.8 ms