RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000521825.1

TSNARE1-207, Transcript of t-SNARE domain containing 1, humanhuman

TSL 3

Gene TSNARE1, Length 346 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSNARE1-207ENST00000521825 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa28.47■■■□□ 2.15
TSNARE1-207ENST00000521825 SCAPERQ9BY12 1400 aa28.46■■■□□ 2.15
TSNARE1-207ENST00000521825 ARHGAP5Q13017 1502 aa28.46■■■□□ 2.15
TSNARE1-207ENST00000521825 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa28.45■■■□□ 2.15
TSNARE1-207ENST00000521825 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa28.43■■■□□ 2.14
TSNARE1-207ENST00000521825 POGZQ7Z3K3 1410 aa28.42■■■□□ 2.14
TSNARE1-207ENST00000521825 MAGI2Q86UL8 1455 aa28.36■■■□□ 2.13
TSNARE1-207ENST00000521825 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa28.35■■■□□ 2.13
TSNARE1-207ENST00000521825 MTUS2Q5JR59 1369 aa28.34■■■□□ 2.13
TSNARE1-207ENST00000521825 YEATS2Q9ULM3 1422 aa28.34■■■□□ 2.13
TSNARE1-207ENST00000521825 VPS8Q8N3P4 1428 aa28.33■■■□□ 2.13
TSNARE1-207ENST00000521825 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP28.33■■■□□ 2.13
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TSNARE1-207ENST00000521825 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa28.32■■■□□ 2.12
TSNARE1-207ENST00000521825 BCORL1Q5H9F3 1711 aa28.32■■■□□ 2.12
TSNARE1-207ENST00000521825 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa28.31■■■□□ 2.12
TSNARE1-207ENST00000521825 KDM5CP41229 1560 aa28.31■■■□□ 2.12
TSNARE1-207ENST00000521825 ADAMTSL3P82987 1691 aa28.31■■■□□ 2.12
TSNARE1-207ENST00000521825 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa28.31■■■□□ 2.12
TSNARE1-207ENST00000521825 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa28.29■■■□□ 2.12
TSNARE1-207ENST00000521825 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa28.28■■■□□ 2.12
TSNARE1-207ENST00000521825 TIAM1Q13009 1591 aa28.27■■■□□ 2.12
TSNARE1-207ENST00000521825 AFAP1Q8N556 730 aa28.26■■■□□ 2.11
TSNARE1-207ENST00000521825 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa28.24■■■□□ 2.11
TSNARE1-207ENST00000521825 HECW2Q9P2P5 1572 aa28.24■■■□□ 2.11
TSNARE1-207ENST00000521825 CCNB3Q8WWL7 1395 aa28.24■■■□□ 2.11
TSNARE1-207ENST00000521825 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP28.22■■■□□ 2.11
TSNARE1-207ENST00000521825 ATP10AO60312 1499 aa28.21■■■□□ 2.11
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TSNARE1-207ENST00000521825 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP28.19■■■□□ 2.1
TSNARE1-207ENST00000521825 MLH3Q9UHC1 1453 aa28.18■■■□□ 2.1
TSNARE1-207ENST00000521825 SYCP2Q9BX26 1530 aa28.18■■■□□ 2.1
TSNARE1-207ENST00000521825 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP28.17■■■□□ 2.1
TSNARE1-207ENST00000521825 C9orf84Q5VXU9 1444 aa28.17■■■□□ 2.1
TSNARE1-207ENST00000521825 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa28.16■■■□□ 2.1
TSNARE1-207ENST00000521825 ABCA6Q8N139 1617 aa28.16■■■□□ 2.1
TSNARE1-207ENST00000521825 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa28.15■■■□□ 2.1
TSNARE1-207ENST00000521825 MAP3K1Q13233 1512 aa28.15■■■□□ 2.1
TSNARE1-207ENST00000521825 NCOA2Q15596 1464 aa28.15■■■□□ 2.1
TSNARE1-207ENST00000521825 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa28.14■■■□□ 2.09
TSNARE1-207ENST00000521825 PTPRMP28827 1452 aa28.13■■■□□ 2.09
TSNARE1-207ENST00000521825 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa28.12■■■□□ 2.09
TSNARE1-207ENST00000521825 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa28.12■■■□□ 2.09
TSNARE1-207ENST00000521825 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP28.12■■■□□ 2.09
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TSNARE1-207ENST00000521825 MYT1LQ9UL68 1186 aa28.1■■■□□ 2.09
TSNARE1-207ENST00000521825 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa28.06■■■□□ 2.08
TSNARE1-207ENST00000521825 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP28.06■■■□□ 2.08
TSNARE1-207ENST00000521825 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP28.05■■■□□ 2.08
TSNARE1-207ENST00000521825 MLECQ14165 292 aa28.03■■■□□ 2.08
TSNARE1-207ENST00000521825 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP28.03■■■□□ 2.08
TSNARE1-207ENST00000521825 MBD5Q9P267 1494 aa28.02■■■□□ 2.08
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TSNARE1-207ENST00000521825 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa27.88■■■□□ 2.05
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TSNARE1-207ENST00000521825 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP27.72■■■□□ 2.03
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TSNARE1-207ENST00000521825 ABCC5O15440 1437 aa27.61■■■□□ 2.01
TSNARE1-207ENST00000521825 KIF3BO15066 747 aa27.6■■■□□ 2.01
TSNARE1-207ENST00000521825 SHANK2Q9UPX8 1470 aa27.59■■■□□ 2.01
TSNARE1-207ENST00000521825 DAPK1P53355 1430 aa27.58■■■□□ 2
TSNARE1-207ENST00000521825 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa27.57■■■□□ 2
TSNARE1-207ENST00000521825 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP27.56■■■□□ 2
TSNARE1-207ENST00000521825 NPATQ14207 1427 aa27.55■■■□□ 2
TSNARE1-207ENST00000521825 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP27.55■■■□□ 2
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