RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000520804.1

PABPC1-215, Transcript of poly(A) binding protein cytoplasmic 1, human

TSL 2

Gene PABPC1, Length 493 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PABPC1-215	ENST00000520804	EFCAB2	Q5VUJ9	269 aa		32.13	■■■□□ 2.73
PABPC1-215	ENST00000520804	POGZ	Q7Z3K3	1410 aa		32.13	■■■□□ 2.73
PABPC1-215	ENST00000520804	MADD	Q8WXG6	1647 aa		32.13	■■■□□ 2.73
PABPC1-215	ENST00000520804	CLIP1	P30622	1438 aa		32.12	■■■□□ 2.73
PABPC1-215	ENST00000520804	YEATS2	Q9ULM3	1422 aa		32.11	■■■□□ 2.73
PABPC1-215	ENST00000520804	CASKIN1	Q8WXD9	1431 aa		32.1	■■■□□ 2.73
PABPC1-215	ENST00000520804	PCF11	O94913	1555 aa	Known RBP	32.09	■■■□□ 2.73
PABPC1-215	ENST00000520804	CCDC18	Q5T9S5	1454 aa		32.05	■■■□□ 2.72
PABPC1-215	ENST00000520804	SIGLEC1	Q9BZZ2	1709 aa		32.04	■■■□□ 2.72
PABPC1-215	ENST00000520804	ARHGAP5	Q13017	1502 aa		32.04	■■■□□ 2.72
PABPC1-215	ENST00000520804	RIMS1	Q86UR5	1692 aa	Known RBP	32.02	■■■□□ 2.72
PABPC1-215	ENST00000520804	FYCO1	Q9BQS8	1478 aa		31.97	■■■□□ 2.71
PABPC1-215	ENST00000520804	ZNF518A	Q6AHZ1	1483 aa		31.97	■■■□□ 2.71
PABPC1-215	ENST00000520804	CDC42BPB	Q9Y5S2	1711 aa		31.96	■■■□□ 2.71
PABPC1-215	ENST00000520804	ATP10A	O60312	1499 aa		31.96	■■■□□ 2.71
PABPC1-215	ENST00000520804	ILDR1	Q86SU0	546 aa	Predicted RBP	31.93	■■■□□ 2.7
PABPC1-215	ENST00000520804	KDM5C	P41229	1560 aa		31.93	■■■□□ 2.7
PABPC1-215	ENST00000520804	PREX2	Q70Z35	1606 aa		31.93	■■■□□ 2.7
PABPC1-215	ENST00000520804	C9orf84	Q5VXU9	1444 aa		31.92	■■■□□ 2.7
PABPC1-215	ENST00000520804	AFAP1	Q8N556	730 aa		31.91	■■■□□ 2.7
PABPC1-215	ENST00000520804	MLEC	Q14165	292 aa		31.9	■■■□□ 2.7
PABPC1-215	ENST00000520804	LMTK3	Q96Q04	1460 aa		31.88	■■■□□ 2.69
PABPC1-215	ENST00000520804	FER1L4	A9Z1Z3	1794 aa		31.86	■■■□□ 2.69
PABPC1-215	ENST00000520804	ABCC1	P33527	1531 aa		31.85	■■■□□ 2.69
PABPC1-215	ENST00000520804	ARHGEF12	Q9NZN5	1544 aa		31.84	■■■□□ 2.69
PABPC1-215	ENST00000520804	CDC42BPA	Q5VT25	1732 aa		31.83	■■■□□ 2.69
PABPC1-215	ENST00000520804	PLPPR3	Q6T4P5	718 aa		31.81	■■■□□ 2.68
PABPC1-215	ENST00000520804	MLH3	Q9UHC1	1453 aa		31.8	■■■□□ 2.68
PABPC1-215	ENST00000520804	MYT1L	Q9UL68	1186 aa		31.8	■■■□□ 2.68
PABPC1-215	ENST00000520804	DIP2C	Q9Y2E4	1556 aa		31.8	■■■□□ 2.68
PABPC1-215	ENST00000520804	ITSN2	Q9NZM3	1697 aa		31.8	■■■□□ 2.68
PABPC1-215	ENST00000520804	TRAPPC8	Q9Y2L5	1435 aa		31.79	■■■□□ 2.68
PABPC1-215	ENST00000520804	RERE	Q9P2R6	1566 aa		31.77	■■■□□ 2.68
PABPC1-215	ENST00000520804	ABCA6	Q8N139	1617 aa		31.75	■■■□□ 2.67
PABPC1-215	ENST00000520804	GPATCH8	Q9UKJ3	1502 aa	Known RBP	31.73	■■■□□ 2.67
PABPC1-215	ENST00000520804	SAMD9L	Q8IVG5	1584 aa		31.69	■■■□□ 2.66
PABPC1-215	ENST00000520804	ZNF777	Q9ULD5	760 aa	Predicted RBP	31.68	■■■□□ 2.66
PABPC1-215	ENST00000520804	KIDINS220	Q9ULH0	1771 aa		31.67	■■■□□ 2.66
PABPC1-215	ENST00000520804	HSPA2	P54652	639 aa		31.67	■■■□□ 2.66
PABPC1-215	ENST00000520804	AGL	P35573	1532 aa		31.65	■■■□□ 2.66
PABPC1-215	ENST00000520804	MTUS2	Q5JR59	1369 aa		31.65	■■■□□ 2.66
PABPC1-215	ENST00000520804	SYCP2	Q9BX26	1530 aa		31.64	■■■□□ 2.66
PABPC1-215	ENST00000520804	CEP162	Q5TB80	1403 aa		31.63	■■■□□ 2.65
PABPC1-215	ENST00000520804	CEBPA	P49715	358 aa	Predicted RBP	31.62	■■■□□ 2.65
PABPC1-215	ENST00000520804	CCNB3	Q8WWL7	1395 aa		31.62	■■■□□ 2.65
PABPC1-215	ENST00000520804	CFDP1	Q9UEE9	299 aa	Predicted RBP	31.6	■■■□□ 2.65
PABPC1-215	ENST00000520804	HNRNPM	P52272	730 aa	Known RBP eCLIP	31.59	■■■□□ 2.65
PABPC1-215	ENST00000520804	PREX1	Q8TCU6	1659 aa		31.59	■■■□□ 2.65
PABPC1-215	ENST00000520804	KIAA1107	Q9UPP5	1409 aa		31.58	■■■□□ 2.65
PABPC1-215	ENST00000520804	PLEKHH2	Q8IVE3	1493 aa		31.58	■■■□□ 2.65
PABPC1-215	ENST00000520804	EHBP1L1	Q8N3D4	1523 aa		31.55	■■■□□ 2.64
PABPC1-215	ENST00000520804	SPAG9	O60271	1321 aa	Known RBP	31.55	■■■□□ 2.64
PABPC1-215	ENST00000520804	TIAM1	Q13009	1591 aa		31.51	■■■□□ 2.64
PABPC1-215	ENST00000520804	FBXO41	Q8TF61	875 aa		31.51	■■■□□ 2.63
PABPC1-215	ENST00000520804	C3	P01024	1663 aa		31.51	■■■□□ 2.63
PABPC1-215	ENST00000520804	ESF1	Q9H501	851 aa	Known RBP	31.5	■■■□□ 2.63
PABPC1-215	ENST00000520804	ATP7A	Q04656	1500 aa		31.49	■■■□□ 2.63
PABPC1-215	ENST00000520804	INO80	Q9ULG1	1556 aa	Predicted RBP	31.48	■■■□□ 2.63
PABPC1-215	ENST00000520804	SETD1B	Q9UPS6	1966 aa	Known RBP	31.47	■■■□□ 2.63
PABPC1-215	ENST00000520804	UHRF1BP1	Q6BDS2	1440 aa		31.47	■■■□□ 2.63
PABPC1-215	ENST00000520804	CNTLN	Q9NXG0	1405 aa		31.46	■■■□□ 2.63
PABPC1-215	ENST00000520804	SUPT6H	Q7KZ85	1726 aa	Known RBP	31.43	■■■□□ 2.62
PABPC1-215	ENST00000520804	ZNF644	Q9H582	1327 aa	Predicted RBP	31.43	■■■□□ 2.62
PABPC1-215	ENST00000520804	PLXNC1	O60486	1568 aa		31.42	■■■□□ 2.62
PABPC1-215	ENST00000520804	A2M	P01023	1474 aa		31.41	■■■□□ 2.62
PABPC1-215	ENST00000520804	MBD5	Q9P267	1494 aa		31.4	■■■□□ 2.62
PABPC1-215	ENST00000520804	MROH2A	A6NES4	1674 aa		31.37	■■■□□ 2.61
PABPC1-215	ENST00000520804	LOC105371045	A0A1W2PR82	267 aa		31.36	■■■□□ 2.61
PABPC1-215	ENST00000520804	STRC	Q7RTU9	1775 aa		31.35	■■■□□ 2.61
PABPC1-215	ENST00000520804	NCOA2	Q15596	1464 aa		31.35	■■■□□ 2.61
PABPC1-215	ENST00000520804	ADGB	Q8N7X0	1667 aa		31.34	■■■□□ 2.61
PABPC1-215	ENST00000520804	VPS8	Q8N3P4	1428 aa		31.32	■■■□□ 2.6
PABPC1-215	ENST00000520804	ZMYM3	Q14202	1370 aa		31.31	■■■□□ 2.6
PABPC1-215	ENST00000520804	RTEL1-TNFRSF6B	F6WH68	1400 aa		31.31	■■■□□ 2.6
PABPC1-215	ENST00000520804	DMRT2	Q9Y5R5	561 aa		31.3	■■■□□ 2.6
PABPC1-215	ENST00000520804	NPAT	Q14207	1427 aa		31.3	■■■□□ 2.6
PABPC1-215	ENST00000520804	CLTC	Q00610	1675 aa	Known RBP	31.29	■■■□□ 2.6
PABPC1-215	ENST00000520804	CERK	Q8TCT0	537 aa		31.27	■■■□□ 2.6
PABPC1-215	ENST00000520804	CAMSAP2	Q08AD1	1489 aa		31.27	■■■□□ 2.6
PABPC1-215	ENST00000520804	GGT6	Q6P531	493 aa		31.26	■■■□□ 2.59
PABPC1-215	ENST00000520804	CCDC141	Q6ZP82	1450 aa		31.25	■■■□□ 2.59
PABPC1-215	ENST00000520804	LRRC9	Q6ZRR7	1453 aa		31.23	■■■□□ 2.59
PABPC1-215	ENST00000520804	RSPH4A	Q5TD94	716 aa		31.22	■■■□□ 2.59
PABPC1-215	ENST00000520804	PPP6R1	Q9UPN7	881 aa		31.22	■■■□□ 2.59
PABPC1-215	ENST00000520804	DHX29	Q7Z478	1369 aa	Known RBP	31.21	■■■□□ 2.59
PABPC1-215	ENST00000520804	PTPRT	O14522	1441 aa		31.19	■■■□□ 2.58
PABPC1-215	ENST00000520804	NCOA1	Q15788	1441 aa		31.17	■■■□□ 2.58
PABPC1-215	ENST00000520804	PTPRK	Q15262	1439 aa		31.16	■■■□□ 2.58
PABPC1-215	ENST00000520804	MAP3K1	Q13233	1512 aa		31.16	■■■□□ 2.58
PABPC1-215	ENST00000520804	ARHGEF5	Q12774	1597 aa		31.16	■■■□□ 2.58
PABPC1-215	ENST00000520804	CAMSAP1	Q5T5Y3	1602 aa		31.13	■■■□□ 2.57
PABPC1-215	ENST00000520804	MYO3A	Q8NEV4	1616 aa		31.12	■■■□□ 2.57
PABPC1-215	ENST00000520804	KANK4	Q5T7N3	995 aa	Predicted RBP	31.11	■■■□□ 2.57
PABPC1-215	ENST00000520804	KIF3B	O15066	747 aa		31.1	■■■□□ 2.57
PABPC1-215	ENST00000520804	ZNF142	P52746	1687 aa	Predicted RBP	31.09	■■■□□ 2.57
PABPC1-215	ENST00000520804	TSPY4	P0CV99	314 aa		31.08	■■■□□ 2.57
PABPC1-215	ENST00000520804	TSPY10	P0CW01	314 aa		31.08	■■■□□ 2.57
PABPC1-215	ENST00000520804	CEP170B	Q9Y4F5	1589 aa	Predicted RBP	31.06	■■■□□ 2.56
PABPC1-215	ENST00000520804	FAM135A	Q9P2D6	1515 aa		31.04	■■■□□ 2.56
PABPC1-215	ENST00000520804	KDM5D	Q9BY66	1539 aa		31.03	■■■□□ 2.56

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