RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000520717.1

SNTB1-205, Transcript of syntrophin beta 1, humanhuman

TSL 2

Gene SNTB1, Length 559 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNTB1-205ENST00000520717 ARHGAP5Q13017 1502 aa47.27■■■■■ 5.16
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SNTB1-205ENST00000520717 ADAMTSL3P82987 1691 aa47.21■■■■■ 5.15
SNTB1-205ENST00000520717 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP47.19■■■■■ 5.14
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SNTB1-205ENST00000520717 CEP162Q5TB80 1403 aa47.17■■■■■ 5.14
SNTB1-205ENST00000520717 YEATS2Q9ULM3 1422 aa47.17■■■■■ 5.14
SNTB1-205ENST00000520717 PREX2Q70Z35 1606 aa47.16■■■■■ 5.14
SNTB1-205ENST00000520717 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa47.15■■■■■ 5.14
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SNTB1-205ENST00000520717 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa47.02■■■■■ 5.12
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SNTB1-205ENST00000520717 C9orf84Q5VXU9 1444 aa46.93■■■■■ 5.1
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SNTB1-205ENST00000520717 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa46.81■■■■■ 5.08
SNTB1-205ENST00000520717 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa46.8■■■■■ 5.08
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SNTB1-205ENST00000520717 ABCA6Q8N139 1617 aa46.75■■■■■ 5.07
SNTB1-205ENST00000520717 SYCP2Q9BX26 1530 aa46.73■■■■■ 5.07
SNTB1-205ENST00000520717 REREQ9P2R6 1566 aa46.73■■■■■ 5.07
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SNTB1-205ENST00000520717 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa46.69■■■■■ 5.06
SNTB1-205ENST00000520717 TIAM1Q13009 1591 aa46.68■■■■■ 5.06
SNTB1-205ENST00000520717 VPS8Q8N3P4 1428 aa46.66■■■■■ 5.06
SNTB1-205ENST00000520717 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa46.65■■■■■ 5.06
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SNTB1-205ENST00000520717 CCDC141Q6ZP82 1450 aa46.23■■■■■ 4.99
SNTB1-205ENST00000520717 ADGBQ8N7X0 1667 aa46.23■■■■■ 4.99
SNTB1-205ENST00000520717 C3P01024 1663 aa46.21■■■■■ 4.99
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SNTB1-205ENST00000520717 APLP2Q06481 763 aa46.05■■■■■ 4.96
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SNTB1-205ENST00000520717 KIF3BO15066 747 aa45.84■■■■■ 4.93
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SNTB1-205ENST00000520717 SHANK2Q9UPX8 1470 aa45.67■■■■■ 4.9
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