RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000520023.1

EXTL3-AS1-203, EXTL3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene EXTL3-AS1, Length 780 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXTL3-AS1-203ENST00000520023 HECW2Q9P2P5 1572 aa21.48■■□□□ 1.03
EXTL3-AS1-203ENST00000520023 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP21.46■■□□□ 1.03
EXTL3-AS1-203ENST00000520023 MADDQ8WXG6 1647 aa21.45■■□□□ 1.02
EXTL3-AS1-203ENST00000520023 POGZQ7Z3K3 1410 aa21.45■■□□□ 1.02
EXTL3-AS1-203ENST00000520023 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa21.44■■□□□ 1.02
EXTL3-AS1-203ENST00000520023 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP21.43■■□□□ 1.02
EXTL3-AS1-203ENST00000520023 FYCO1Q9BQS8 1478 aa21.43■■□□□ 1.02
EXTL3-AS1-203ENST00000520023 ARHGAP5Q13017 1502 aa21.43■■□□□ 1.02
EXTL3-AS1-203ENST00000520023 CCDC18Q5T9S5 1454 aa21.42■■□□□ 1.02
EXTL3-AS1-203ENST00000520023 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa21.42■■□□□ 1.02
EXTL3-AS1-203ENST00000520023 PTPRMP28827 1452 aa21.41■■□□□ 1.02
EXTL3-AS1-203ENST00000520023 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa21.41■■□□□ 1.02
EXTL3-AS1-203ENST00000520023 PREX2Q70Z35 1606 aa21.4■■□□□ 1.02
EXTL3-AS1-203ENST00000520023 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa21.39■■□□□ 1.02
EXTL3-AS1-203ENST00000520023 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP21.38■■□□□ 1.01
EXTL3-AS1-203ENST00000520023 AFAP1Q8N556 730 aa21.38■■□□□ 1.01
EXTL3-AS1-203ENST00000520023 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa21.37■■□□□ 1.01
EXTL3-AS1-203ENST00000520023 CEP162Q5TB80 1403 aa21.35■■□□□ 1.01
EXTL3-AS1-203ENST00000520023 MAGI2Q86UL8 1455 aa21.34■■□□□ 1.01
EXTL3-AS1-203ENST00000520023 MLECQ14165 292 aa21.34■■□□□ 1.01
EXTL3-AS1-203ENST00000520023 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa21.34■■□□□ 1.01
EXTL3-AS1-203ENST00000520023 KDM5CP41229 1560 aa21.34■■□□□ 1.01
EXTL3-AS1-203ENST00000520023 ITSN2Q9NZM3 1697 aa21.33■■□□□ 1
EXTL3-AS1-203ENST00000520023 ABCC1P33527 1531 aa21.33■■□□□ 1
EXTL3-AS1-203ENST00000520023 PLPPR3Q6T4P5 718 aa21.3■■□□□ 1
EXTL3-AS1-203ENST00000520023 ATP10AO60312 1499 aa21.3■■□□□ 1
EXTL3-AS1-203ENST00000520023 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa21.3■■□□□ 1
EXTL3-AS1-203ENST00000520023 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP21.29■■□□□ 1
EXTL3-AS1-203ENST00000520023 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa21.29■■□□□ 1
EXTL3-AS1-203ENST00000520023 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa21.29■■□□□ 1
EXTL3-AS1-203ENST00000520023 ABCA6Q8N139 1617 aa21.29■■□□□ 1
EXTL3-AS1-203ENST00000520023 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa21.27■■□□□ 1
EXTL3-AS1-203ENST00000520023 C9orf84Q5VXU9 1444 aa21.27■■□□□ 1
EXTL3-AS1-203ENST00000520023 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP21.25■□□□□ 0.99
EXTL3-AS1-203ENST00000520023 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa21.25■□□□□ 0.99
EXTL3-AS1-203ENST00000520023 SYCP2Q9BX26 1530 aa21.23■□□□□ 0.99
EXTL3-AS1-203ENST00000520023 MYT1LQ9UL68 1186 aa21.22■□□□□ 0.99
EXTL3-AS1-203ENST00000520023 MTUS2Q5JR59 1369 aa21.22■□□□□ 0.99
EXTL3-AS1-203ENST00000520023 MLH3Q9UHC1 1453 aa21.21■□□□□ 0.99
EXTL3-AS1-203ENST00000520023 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP21.21■□□□□ 0.99
EXTL3-AS1-203ENST00000520023 LMTK3Q96Q04 1460 aa21.2■□□□□ 0.98
EXTL3-AS1-203ENST00000520023 TIAM1Q13009 1591 aa21.2■□□□□ 0.98
EXTL3-AS1-203ENST00000520023 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP21.18■□□□□ 0.98
EXTL3-AS1-203ENST00000520023 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP21.18■□□□□ 0.98
EXTL3-AS1-203ENST00000520023 CCNB3Q8WWL7 1395 aa21.17■□□□□ 0.98
EXTL3-AS1-203ENST00000520023 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa21.17■□□□□ 0.98
EXTL3-AS1-203ENST00000520023 REREQ9P2R6 1566 aa21.16■□□□□ 0.98
EXTL3-AS1-203ENST00000520023 HSPA2P54652 639 aa21.15■□□□□ 0.98
EXTL3-AS1-203ENST00000520023 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP21.15■□□□□ 0.98
EXTL3-AS1-203ENST00000520023 AGLP35573 1532 aa21.1■□□□□ 0.97
EXTL3-AS1-203ENST00000520023 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP21.1■□□□□ 0.97
EXTL3-AS1-203ENST00000520023 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP21.1■□□□□ 0.97
EXTL3-AS1-203ENST00000520023 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP21.09■□□□□ 0.97
EXTL3-AS1-203ENST00000520023 VPS8Q8N3P4 1428 aa21.09■□□□□ 0.97
EXTL3-AS1-203ENST00000520023 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa21.09■□□□□ 0.97
EXTL3-AS1-203ENST00000520023 NCOA2Q15596 1464 aa21.08■□□□□ 0.97
EXTL3-AS1-203ENST00000520023 ATP7AQ04656 1500 aa21.08■□□□□ 0.96
EXTL3-AS1-203ENST00000520023 MBD5Q9P267 1494 aa21.07■□□□□ 0.96
EXTL3-AS1-203ENST00000520023 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP21.07■□□□□ 0.96
EXTL3-AS1-203ENST00000520023 C3P01024 1663 aa21.07■□□□□ 0.96
EXTL3-AS1-203ENST00000520023 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP21.05■□□□□ 0.96
EXTL3-AS1-203ENST00000520023 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa21.04■□□□□ 0.96
EXTL3-AS1-203ENST00000520023 PREX1Q8TCU6 1659 aa21.02■□□□□ 0.95
EXTL3-AS1-203ENST00000520023 PLXNC1O60486 1568 aa21.02■□□□□ 0.95
EXTL3-AS1-203ENST00000520023 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa21.01■□□□□ 0.95
EXTL3-AS1-203ENST00000520023 A2MP01023 1474 aa21■□□□□ 0.95
EXTL3-AS1-203ENST00000520023 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa21■□□□□ 0.95
EXTL3-AS1-203ENST00000520023 ADGBQ8N7X0 1667 aa20.98■□□□□ 0.95
EXTL3-AS1-203ENST00000520023 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP20.96■□□□□ 0.95
EXTL3-AS1-203ENST00000520023 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP20.96■□□□□ 0.95
EXTL3-AS1-203ENST00000520023 STRCQ7RTU9 1775 aa20.95■□□□□ 0.94
EXTL3-AS1-203ENST00000520023 MROH2AA6NES4 1674 aa20.91■□□□□ 0.94
EXTL3-AS1-203ENST00000520023 MAP3K1Q13233 1512 aa20.91■□□□□ 0.94
EXTL3-AS1-203ENST00000520023 GGT6Q6P531 493 aa20.91■□□□□ 0.94
EXTL3-AS1-203ENST00000520023 CCDC141Q6ZP82 1450 aa20.91■□□□□ 0.94
EXTL3-AS1-203ENST00000520023 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa20.9■□□□□ 0.94
EXTL3-AS1-203ENST00000520023 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa20.89■□□□□ 0.94
EXTL3-AS1-203ENST00000520023 ZMYM3Q14202 1370 aa20.89■□□□□ 0.93
EXTL3-AS1-203ENST00000520023 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP20.89■□□□□ 0.93
EXTL3-AS1-203ENST00000520023 CNTLNQ9NXG0 1405 aa20.88■□□□□ 0.93
EXTL3-AS1-203ENST00000520023 ARHGEF5Q12774 1597 aa20.87■□□□□ 0.93
EXTL3-AS1-203ENST00000520023 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP20.86■□□□□ 0.93
EXTL3-AS1-203ENST00000520023 MYOM3Q5VTT5 1437 aa20.84■□□□□ 0.93
EXTL3-AS1-203ENST00000520023 PTPRKQ15262 1439 aa20.82■□□□□ 0.92
EXTL3-AS1-203ENST00000520023 KIF3BO15066 747 aa20.82■□□□□ 0.92
EXTL3-AS1-203ENST00000520023 NPATQ14207 1427 aa20.78■□□□□ 0.92
EXTL3-AS1-203ENST00000520023 MYO3AQ8NEV4 1616 aa20.78■□□□□ 0.92
EXTL3-AS1-203ENST00000520023 MAST1Q9Y2H9 1570 aa20.78■□□□□ 0.92
EXTL3-AS1-203ENST00000520023 RSPH4AQ5TD94 716 aa20.78■□□□□ 0.92
EXTL3-AS1-203ENST00000520023 FBXO41Q8TF61 875 aa20.77■□□□□ 0.92
EXTL3-AS1-203ENST00000520023 MIA2Q96PC5 1412 aa20.77■□□□□ 0.91
EXTL3-AS1-203ENST00000520023 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP20.76■□□□□ 0.91
EXTL3-AS1-203ENST00000520023 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa20.75■□□□□ 0.91
EXTL3-AS1-203ENST00000520023 PTPN23Q9H3S7 1636 aa20.75■□□□□ 0.91
EXTL3-AS1-203ENST00000520023 TSPY4P0CV99 314 aa20.75■□□□□ 0.91
EXTL3-AS1-203ENST00000520023 TSPY10P0CW01 314 aa20.75■□□□□ 0.91
EXTL3-AS1-203ENST00000520023 NCOA1Q15788 1441 aa20.74■□□□□ 0.91
EXTL3-AS1-203ENST00000520023 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP20.73■□□□□ 0.91
EXTL3-AS1-203ENST00000520023 CERKQ8TCT0 537 aa20.72■□□□□ 0.91
EXTL3-AS1-203ENST00000520023 CROCC2H7BZ55 1655 aa20.72■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.2 ms