RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000519363.1

PABPC1-210, Transcript of poly(A) binding protein cytoplasmic 1, humanhuman

TSL 4

Gene PABPC1, Length 453 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PABPC1-210ENST00000519363 CROCC2H7BZ55 1655 aa22.56■■□□□ 1.2
PABPC1-210ENST00000519363 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP22.56■■□□□ 1.2
PABPC1-210ENST00000519363 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa22.55■■□□□ 1.2
PABPC1-210ENST00000519363 ARHGAP5Q13017 1502 aa22.54■■□□□ 1.2
PABPC1-210ENST00000519363 PLCH2O75038 1416 aa22.54■■□□□ 1.2
PABPC1-210ENST00000519363 ARHGEF5Q12774 1597 aa22.53■■□□□ 1.2
PABPC1-210ENST00000519363 DAPK1P53355 1430 aa22.5■■□□□ 1.19
PABPC1-210ENST00000519363 AKNAQ7Z591 1439 aa22.5■■□□□ 1.19
PABPC1-210ENST00000519363 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa22.5■■□□□ 1.19
PABPC1-210ENST00000519363 KCNH8Q96L42 1107 aa22.5■■□□□ 1.19
PABPC1-210ENST00000519363 PTPRKQ15262 1439 aa22.49■■□□□ 1.19
PABPC1-210ENST00000519363 GLI2P10070 1586 aa22.49■■□□□ 1.19
PABPC1-210ENST00000519363 ADGBQ8N7X0 1667 aa22.49■■□□□ 1.19
PABPC1-210ENST00000519363 SHANK2Q9UPX8 1470 aa22.47■■□□□ 1.19
PABPC1-210ENST00000519363 GCC2Q8IWJ2 1684 aa22.47■■□□□ 1.19
PABPC1-210ENST00000519363 ABCC5O15440 1437 aa22.47■■□□□ 1.19
PABPC1-210ENST00000519363 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP22.46■■□□□ 1.19
PABPC1-210ENST00000519363 CFAP74Q9C0B2 1584 aa22.46■■□□□ 1.19
PABPC1-210ENST00000519363 ITGAEP38570 1179 aa22.45■■□□□ 1.18
PABPC1-210ENST00000519363 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa22.45■■□□□ 1.18
PABPC1-210ENST00000519363 ABCC1P33527 1531 aa22.45■■□□□ 1.18
PABPC1-210ENST00000519363 HFM1A2PYH4 1435 aa22.44■■□□□ 1.18
PABPC1-210ENST00000519363 DIP2BQ9P265 1576 aa22.44■■□□□ 1.18
PABPC1-210ENST00000519363 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa22.44■■□□□ 1.18
PABPC1-210ENST00000519363 SYCP2Q9BX26 1530 aa22.43■■□□□ 1.18
PABPC1-210ENST00000519363 MBD5Q9P267 1494 aa22.43■■□□□ 1.18
PABPC1-210ENST00000519363 ROCK1Q13464 1354 aa22.42■■□□□ 1.18
PABPC1-210ENST00000519363 ADGRL2O95490 1459 aa22.41■■□□□ 1.18
PABPC1-210ENST00000519363 CCDC141Q6ZP82 1450 aa22.41■■□□□ 1.18
PABPC1-210ENST00000519363 SETD5Q9C0A6 1442 aa22.4■■□□□ 1.18
PABPC1-210ENST00000519363 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa22.4■■□□□ 1.18
PABPC1-210ENST00000519363 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP22.4■■□□□ 1.18
PABPC1-210ENST00000519363 MAST1Q9Y2H9 1570 aa22.4■■□□□ 1.18
PABPC1-210ENST00000519363 FANCAO15360 1455 aa22.39■■□□□ 1.17
PABPC1-210ENST00000519363 NAIPQ13075 1403 aa22.37■■□□□ 1.17
PABPC1-210ENST00000519363 CD109Q6YHK3 1445 aa22.37■■□□□ 1.17
PABPC1-210ENST00000519363 RSPH4AQ5TD94 716 aa22.35■■□□□ 1.17
PABPC1-210ENST00000519363 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa22.35■■□□□ 1.17
PABPC1-210ENST00000519363 C9orf84Q5VXU9 1444 aa22.34■■□□□ 1.17
PABPC1-210ENST00000519363 HRCP23327 699 aa22.34■■□□□ 1.17
PABPC1-210ENST00000519363 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa22.34■■□□□ 1.17
PABPC1-210ENST00000519363 KIF13AQ9H1H9 1805 aa22.33■■□□□ 1.16
PABPC1-210ENST00000519363 NEO1Q92859 1461 aa22.32■■□□□ 1.16
PABPC1-210ENST00000519363 PLXNC1O60486 1568 aa22.31■■□□□ 1.16
PABPC1-210ENST00000519363 NCOA1Q15788 1441 aa22.3■■□□□ 1.16
PABPC1-210ENST00000519363 ADGRL1O94910 1474 aa22.29■■□□□ 1.16
PABPC1-210ENST00000519363 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa22.28■■□□□ 1.16
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PABPC1-210ENST00000519363 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP22.27■■□□□ 1.16
PABPC1-210ENST00000519363 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa22.27■■□□□ 1.16
PABPC1-210ENST00000519363 CHIC2Q9UKJ5 165 aa22.25■■□□□ 1.15
PABPC1-210ENST00000519363 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP22.25■■□□□ 1.15
PABPC1-210ENST00000519363 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa22.24■■□□□ 1.15
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PABPC1-210ENST00000519363 TSPY10P0CW01 314 aa22.24■■□□□ 1.15
PABPC1-210ENST00000519363 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa22.24■■□□□ 1.15
PABPC1-210ENST00000519363 KDM6BO15054 1643 aa22.24■■□□□ 1.15
PABPC1-210ENST00000519363 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP22.23■■□□□ 1.15
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PABPC1-210ENST00000519363 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa22.22■■□□□ 1.15
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PABPC1-210ENST00000519363 KDM5CP41229 1560 aa22.21■■□□□ 1.15
PABPC1-210ENST00000519363 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa22.21■■□□□ 1.15
PABPC1-210ENST00000519363 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa22.21■■□□□ 1.15
PABPC1-210ENST00000519363 TEX14Q8IWB6 1497 aa22.21■■□□□ 1.15
PABPC1-210ENST00000519363 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP22.2■■□□□ 1.14
PABPC1-210ENST00000519363 FAM69CQ0P6D2 419 aa22.19■■□□□ 1.14
PABPC1-210ENST00000519363 POGZQ7Z3K3 1410 aa22.19■■□□□ 1.14
PABPC1-210ENST00000519363 ATP7AQ04656 1500 aa22.18■■□□□ 1.14
PABPC1-210ENST00000519363 TSPOAP1O95153 1857 aa22.17■■□□□ 1.14
PABPC1-210ENST00000519363 KIF15Q9NS87 1388 aa22.17■■□□□ 1.14
PABPC1-210ENST00000519363 RICTORQ6R327 1708 aa22.17■■□□□ 1.14
PABPC1-210ENST00000519363 CLSPNQ9HAW4 1339 aa22.16■■□□□ 1.14
PABPC1-210ENST00000519363 DUOX2Q9NRD8 1548 aa22.16■■□□□ 1.14
PABPC1-210ENST00000519363 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa22.14■■□□□ 1.14
PABPC1-210ENST00000519363 HECW2Q9P2P5 1572 aa22.13■■□□□ 1.13
PABPC1-210ENST00000519363 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa22.13■■□□□ 1.13
PABPC1-210ENST00000519363 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP22.13■■□□□ 1.13
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PABPC1-210ENST00000519363 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP22.12■■□□□ 1.13
PABPC1-210ENST00000519363 ERBINQ96RT1 1412 aa22.11■■□□□ 1.13
PABPC1-210ENST00000519363 MLH3Q9UHC1 1453 aa22.1■■□□□ 1.13
PABPC1-210ENST00000519363 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa22.1■■□□□ 1.13
PABPC1-210ENST00000519363 KDM5DQ9BY66 1539 aa22.1■■□□□ 1.13
PABPC1-210ENST00000519363 UNC13BO14795 1591 aa22.09■■□□□ 1.13
PABPC1-210ENST00000519363 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa22.09■■□□□ 1.13
PABPC1-210ENST00000519363 AFAP1Q8N556 730 aa22.08■■□□□ 1.13
PABPC1-210ENST00000519363 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP22.07■■□□□ 1.12
PABPC1-210ENST00000519363 MAGI2Q86UL8 1455 aa22.04■■□□□ 1.12
PABPC1-210ENST00000519363 DEPDC5O75140 1603 aa22.02■■□□□ 1.12
PABPC1-210ENST00000519363 ABCA6Q8N139 1617 aa22.02■■□□□ 1.12
PABPC1-210ENST00000519363 PZPP20742 1482 aa22.01■■□□□ 1.11
PABPC1-210ENST00000519363 BCORL1Q5H9F3 1711 aa22■■□□□ 1.11
PABPC1-210ENST00000519363 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa21.99■■□□□ 1.11
PABPC1-210ENST00000519363 IQGAP3Q86VI3 1631 aa21.98■■□□□ 1.11
PABPC1-210ENST00000519363 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP21.96■■□□□ 1.11
PABPC1-210ENST00000519363 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP21.95■■□□□ 1.1
PABPC1-210ENST00000519363 TRIM52Q96A61 297 aa21.95■■□□□ 1.1
PABPC1-210ENST00000519363 A2MP01023 1474 aa21.95■■□□□ 1.1
PABPC1-210ENST00000519363 RAPGEF3O95398 923 aa21.93■■□□□ 1.1
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