RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000517100.1

RNU6-201P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 201, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-201P, Length 61 nt, Biotype snRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-201P-201ENST00000517100 L3MBTL3Q96JM7 780 aaPredicted RBP8.67□□□□□ -1.02
RNU6-201P-201ENST00000517100 TMEM92Q6UXU6 159 aa8.64□□□□□ -1.03
RNU6-201P-201ENST00000517100 POTEB2H3BUK9 544 aa8.63□□□□□ -1.03
RNU6-201P-201ENST00000517100 C2orf72A6NCS6 295 aa8.62□□□□□ -1.03
RNU6-201P-201ENST00000517100 MFSD10Q14728 455 aa8.62□□□□□ -1.03
RNU6-201P-201ENST00000517100 KCNV2Q8TDN2 545 aa8.62□□□□□ -1.03
RNU6-201P-201ENST00000517100 DDX27Q96GQ7 796 aaKnown RBP8.62□□□□□ -1.03
RNU6-201P-201ENST00000517100 GPHNQ9NQX3 736 aaPredicted RBP8.62□□□□□ -1.03
RNU6-201P-201ENST00000517100 POTEJP0CG39 1038 aa8.61□□□□□ -1.03
RNU6-201P-201ENST00000517100 DSG2Q14126 1118 aa8.61□□□□□ -1.03
RNU6-201P-201ENST00000517100 TMC2Q8TDI7 906 aa8.61□□□□□ -1.03
RNU6-201P-201ENST00000517100 E2F4Q16254 413 aa8.6□□□□□ -1.03
RNU6-201P-201ENST00000517100 BCANQ96GW7 911 aa8.6□□□□□ -1.03
RNU6-201P-201ENST00000517100 PPP1R15BQ5SWA1 713 aa8.59□□□□□ -1.03
RNU6-201P-201ENST00000517100 KIF3CO14782 793 aa8.58□□□□□ -1.04
RNU6-201P-201ENST00000517100 C3orf67Q6ZVT6 689 aa8.58□□□□□ -1.04
RNU6-201P-201ENST00000517100 PLPP6Q8IY26 295 aa8.56□□□□□ -1.04
RNU6-201P-201ENST00000517100 FOXK1P85037 733 aa8.55□□□□□ -1.04
RNU6-201P-201ENST00000517100 NBR1Q14596 966 aa8.55□□□□□ -1.04
RNU6-201P-201ENST00000517100 P3H3Q8IVL6 736 aa8.55□□□□□ -1.04
RNU6-201P-201ENST00000517100 EIF2AK3Q9NZJ5 1116 aaKnown RBP8.54□□□□□ -1.04
RNU6-201P-201ENST00000517100 EMILIN3Q9NT22 766 aa8.53□□□□□ -1.04
RNU6-201P-201ENST00000517100 CAMK2BQ13554 666 aa8.52□□□□□ -1.05
RNU6-201P-201ENST00000517100 ARHGEF1Q92888 912 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
RNU6-201P-201ENST00000517100 UPF1Q92900 1129 aaKnown RBP eCLIP8.49□□□□□ -1.05
RNU6-201P-201ENST00000517100 DPYSL4O14531 572 aa8.48□□□□□ -1.05
RNU6-201P-201ENST00000517100 SEMA3EO15041 775 aa8.47□□□□□ -1.05
RNU6-201P-201ENST00000517100 SLAIN1Q8ND83 568 aa8.47□□□□□ -1.05
RNU6-201P-201ENST00000517100 SCUBE2Q9NQ36 999 aa8.45□□□□□ -1.06
RNU6-201P-201ENST00000517100 MAP3K9P80192 1104 aa8.43□□□□□ -1.06
RNU6-201P-201ENST00000517100 ARIH1Q9Y4X5 557 aaPredicted RBP8.43□□□□□ -1.06
RNU6-201P-201ENST00000517100 PRKCSHP14314 528 aaPredicted RBP8.42□□□□□ -1.06
RNU6-201P-201ENST00000517100 LHX8Q68G74 356 aa8.42□□□□□ -1.06
RNU6-201P-201ENST00000517100 MAMSTRQ6ZN01 415 aa8.42□□□□□ -1.06
RNU6-201P-201ENST00000517100 OXER1Q8TDS5 423 aa8.42□□□□□ -1.06
RNU6-201P-201ENST00000517100 OTUD5Q96G74 571 aa8.42□□□□□ -1.06
RNU6-201P-201ENST00000517100 MLLT3P42568 568 aaPredicted RBP8.4□□□□□ -1.06
RNU6-201P-201ENST00000517100 TESPA1A2RU30 521 aaPredicted RBP8.39□□□□□ -1.07
RNU6-201P-201ENST00000517100 PDIA6Q15084 440 aa8.38□□□□□ -1.07
RNU6-201P-201ENST00000517100 PTCD2Q8WV60 388 aaKnown RBP8.38□□□□□ -1.07
RNU6-201P-201ENST00000517100 HOXB3P14651 431 aaPredicted RBP8.37□□□□□ -1.07
RNU6-201P-201ENST00000517100 TPRNQ4KMQ1 711 aa8.37□□□□□ -1.07
RNU6-201P-201ENST00000517100 KHSRPQ92945 711 aaKnown RBP eCLIP8.37□□□□□ -1.07
RNU6-201P-201ENST00000517100 EVI5O60447 810 aa8.36□□□□□ -1.07
RNU6-201P-201ENST00000517100 SLC34A2O95436 690 aa8.36□□□□□ -1.07
RNU6-201P-201ENST00000517100 DHX30Q7L2E3 1194 aaKnown RBP eCLIP8.36□□□□□ -1.07
RNU6-201P-201ENST00000517100 PCDHGA4Q9Y5G9 962 aa8.36□□□□□ -1.07
RNU6-201P-201ENST00000517100 SPDYE16A6NNV3 312 aaPredicted RBP8.35□□□□□ -1.07
RNU6-201P-201ENST00000517100 TBC1D12O60347 775 aa8.35□□□□□ -1.07
RNU6-201P-201ENST00000517100 GRXCR2A6NFK2 248 aa8.34□□□□□ -1.07
RNU6-201P-201ENST00000517100 ARSIQ5FYB1 569 aa8.34□□□□□ -1.07
RNU6-201P-201ENST00000517100 LMOD2Q6P5Q4 547 aa8.34□□□□□ -1.07
RNU6-201P-201ENST00000517100 DDX12PQ92771 950 aa8.33□□□□□ -1.08
RNU6-201P-201ENST00000517100 DOK7Q18PE1 504 aa8.32□□□□□ -1.08
RNU6-201P-201ENST00000517100 NUDT7P0C024 238 aa8.31□□□□□ -1.08
RNU6-201P-201ENST00000517100 RBM26Q5T8P6 1007 aaKnown RBP8.3□□□□□ -1.08
RNU6-201P-201ENST00000517100 ZNF710Q8N1W2 664 aa8.3□□□□□ -1.08
RNU6-201P-201ENST00000517100 TULP1O00294 542 aaPredicted RBP8.29□□□□□ -1.08
RNU6-201P-201ENST00000517100 SMYD5Q6GMV2 418 aa8.29□□□□□ -1.08
RNU6-201P-201ENST00000517100 GPR153Q6NV75 609 aa8.29□□□□□ -1.08
RNU6-201P-201ENST00000517100 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa8.28□□□□□ -1.08
RNU6-201P-201ENST00000517100 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP8.28□□□□□ -1.08
RNU6-201P-201ENST00000517100 RIMBP2O15034 1052 aa8.27□□□□□ -1.09
RNU6-201P-201ENST00000517100 PTGER2P43116 358 aa8.27□□□□□ -1.09
RNU6-201P-201ENST00000517100 PRIM1P49642 420 aaKnown RBP8.27□□□□□ -1.09
RNU6-201P-201ENST00000517100 OSBPP22059 807 aa8.26□□□□□ -1.09
RNU6-201P-201ENST00000517100 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP8.25□□□□□ -1.09
RNU6-201P-201ENST00000517100 SNPHO15079 494 aa8.25□□□□□ -1.09
RNU6-201P-201ENST00000517100 ZC3H15Q8WU90 426 aaKnown RBP8.24□□□□□ -1.09
RNU6-201P-201ENST00000517100 ZSWIM6Q9HCJ5 1215 aa8.24□□□□□ -1.09
RNU6-201P-201ENST00000517100 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP8.23□□□□□ -1.09
RNU6-201P-201ENST00000517100 LHX6Q9UPM6 363 aa8.23□□□□□ -1.09
RNU6-201P-201ENST00000517100 PCDHGA10Q9Y5H3 936 aa8.23□□□□□ -1.09
RNU6-201P-201ENST00000517100 HOXB1P14653 301 aaPredicted RBP8.22□□□□□ -1.09
RNU6-201P-201ENST00000517100 PHF14O94880 888 aa8.21□□□□□ -1.1
RNU6-201P-201ENST00000517100 GPIHBP1Q8IV16 184 aa8.21□□□□□ -1.1
RNU6-201P-201ENST00000517100 ZNF454Q8N9F8 522 aa8.21□□□□□ -1.1
RNU6-201P-201ENST00000517100 NUTM2FA1L443 756 aa8.2□□□□□ -1.1
RNU6-201P-201ENST00000517100 ST18O60284 1047 aa8.19□□□□□ -1.1
RNU6-201P-201ENST00000517100 FOSBP53539 338 aa8.19□□□□□ -1.1
RNU6-201P-201ENST00000517100 FAM163AQ96GL9 167 aaPredicted RBP8.19□□□□□ -1.1
RNU6-201P-201ENST00000517100 TSR1Q2NL82 804 aaKnown RBP8.18□□□□□ -1.1
RNU6-201P-201ENST00000517100 TYW1BQ6NUM6 668 aa8.18□□□□□ -1.1
RNU6-201P-201ENST00000517100 JPH4Q96JJ6 628 aa8.18□□□□□ -1.1
RNU6-201P-201ENST00000517100 EPAS1Q99814 870 aa8.18□□□□□ -1.1
RNU6-201P-201ENST00000517100 CDHR5Q9HBB8 845 aa8.18□□□□□ -1.1
RNU6-201P-201ENST00000517100 MAP3K7O43318 606 aa8.17□□□□□ -1.1
RNU6-201P-201ENST00000517100 EN1Q05925 392 aaPredicted RBP8.17□□□□□ -1.1
RNU6-201P-201ENST00000517100 MARVELD3Q96A59 401 aa8.17□□□□□ -1.1
RNU6-201P-201ENST00000517100 GPR37O15354 613 aa8.16□□□□□ -1.1
RNU6-201P-201ENST00000517100 ADAM33Q9BZ11 813 aa8.16□□□□□ -1.1
RNU6-201P-201ENST00000517100 ZMYND10O75800 440 aa8.15□□□□□ -1.1
RNU6-201P-201ENST00000517100 ZDHHC16Q969W1 377 aa8.15□□□□□ -1.1
RNU6-201P-201ENST00000517100 SLC24A3Q9HC58 644 aa8.14□□□□□ -1.11
RNU6-201P-201ENST00000517100 FECHP22830 423 aa8.13□□□□□ -1.11
RNU6-201P-201ENST00000517100 ERBB3P21860 1342 aa8.12□□□□□ -1.11
RNU6-201P-201ENST00000517100 PTGDRQ13258 359 aa8.12□□□□□ -1.11
RNU6-201P-201ENST00000517100 PPP4R3BQ5MIZ7 849 aa8.12□□□□□ -1.11
RNU6-201P-201ENST00000517100 C6orf132Q5T0Z8 1188 aa8.12□□□□□ -1.11
RNU6-201P-201ENST00000517100 LCE2DQ5TA82 110 aaPredicted RBP8.12□□□□□ -1.11
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 12.2 ms