RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000516658.1

RNU6-347P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 347, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-347P, Length 105 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-347P-201ENST00000516658 PRR29P0C7W0 189 aa7.46□□□□□ -1.22
RNU6-347P-201ENST00000516658 SPDYE1Q8NFV5 336 aaPredicted RBP7.46□□□□□ -1.22
RNU6-347P-201ENST00000516658 FBXW7Q969H0 707 aa7.46□□□□□ -1.22
RNU6-347P-201ENST00000516658 CLUAP1Q96AJ1 413 aa7.46□□□□□ -1.22
RNU6-347P-201ENST00000516658 MFRPQ9BY79 579 aa7.46□□□□□ -1.22
RNU6-347P-201ENST00000516658 GZF1Q9H116 711 aaPredicted RBP7.46□□□□□ -1.22
RNU6-347P-201ENST00000516658 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP7.46□□□□□ -1.22
RNU6-347P-201ENST00000516658 MTMR7Q9Y216 660 aa7.46□□□□□ -1.22
RNU6-347P-201ENST00000516658 MFAP1P55081 439 aaKnown RBP7.45□□□□□ -1.22
RNU6-347P-201ENST00000516658 RGS22Q8NE09 1264 aa7.45□□□□□ -1.22
RNU6-347P-201ENST00000516658 DDX27Q96GQ7 796 aaKnown RBP7.45□□□□□ -1.22
RNU6-347P-201ENST00000516658 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP7.45□□□□□ -1.22
RNU6-347P-201ENST00000516658 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP7.45□□□□□ -1.22
RNU6-347P-201ENST00000516658 CDK11BP21127 795 aaKnown RBP7.44□□□□□ -1.22
RNU6-347P-201ENST00000516658 RNF39Q9H2S5 420 aa7.44□□□□□ -1.22
RNU6-347P-201ENST00000516658 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP7.44□□□□□ -1.22
RNU6-347P-201ENST00000516658 SOX12O15370 315 aa7.43□□□□□ -1.22
RNU6-347P-201ENST00000516658 HSP90B1P14625 803 aaKnown RBP7.43□□□□□ -1.22
RNU6-347P-201ENST00000516658 MYT1LQ9UL68 1186 aa7.43□□□□□ -1.22
RNU6-347P-201ENST00000516658 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP7.42□□□□□ -1.22
RNU6-347P-201ENST00000516658 PLEKHG3A1L390 1219 aa7.41□□□□□ -1.22
RNU6-347P-201ENST00000516658 PSEN1P49768 467 aa7.41□□□□□ -1.22
RNU6-347P-201ENST00000516658 PPP1R37O75864 691 aa7.4□□□□□ -1.22
RNU6-347P-201ENST00000516658 CREBZFQ9NS37 354 aa7.4□□□□□ -1.22
RNU6-347P-201ENST00000516658 MLLT3P42568 568 aaPredicted RBP7.39□□□□□ -1.23
RNU6-347P-201ENST00000516658 MFSD10Q14728 455 aa7.39□□□□□ -1.23
RNU6-347P-201ENST00000516658 CLEC11AQ9Y240 323 aa7.39□□□□□ -1.23
RNU6-347P-201ENST00000516658 SPDYE16A6NNV3 312 aaPredicted RBP7.38□□□□□ -1.23
RNU6-347P-201ENST00000516658 DSG3P32926 999 aa7.38□□□□□ -1.23
RNU6-347P-201ENST00000516658 TTLL12Q14166 644 aaPredicted RBP7.38□□□□□ -1.23
RNU6-347P-201ENST00000516658 IGSF3O75054 1194 aa7.37□□□□□ -1.23
RNU6-347P-201ENST00000516658 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP7.37□□□□□ -1.23
RNU6-347P-201ENST00000516658 FOXD4L5Q5VV16 416 aaPredicted RBP7.37□□□□□ -1.23
RNU6-347P-201ENST00000516658 WWC1Q8IX03 1113 aa7.37□□□□□ -1.23
RNU6-347P-201ENST00000516658 FOXD4L4Q8WXT5 416 aaPredicted RBP7.37□□□□□ -1.23
RNU6-347P-201ENST00000516658 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa7.36□□□□□ -1.23
RNU6-347P-201ENST00000516658 ONECUT3O60422 494 aaPredicted RBP7.36□□□□□ -1.23
RNU6-347P-201ENST00000516658 MNX1P50219 401 aaPredicted RBP7.36□□□□□ -1.23
RNU6-347P-201ENST00000516658 MAP2K5Q13163 448 aa7.36□□□□□ -1.23
RNU6-347P-201ENST00000516658 CAMK2BQ13554 666 aa7.36□□□□□ -1.23
RNU6-347P-201ENST00000516658 AMHR2Q16671 573 aa7.36□□□□□ -1.23
RNU6-347P-201ENST00000516658 NUTM2FA1L443 756 aa7.35□□□□□ -1.23
RNU6-347P-201ENST00000516658 RETREG2Q8NC44 543 aa7.35□□□□□ -1.23
RNU6-347P-201ENST00000516658 PCDHB8Q9UN66 801 aa7.35□□□□□ -1.23
RNU6-347P-201ENST00000516658 PCDHB13Q9Y5F0 798 aa7.35□□□□□ -1.23
RNU6-347P-201ENST00000516658 IRF6O14896 467 aa7.34□□□□□ -1.23
RNU6-347P-201ENST00000516658 MCM6Q14566 821 aa7.34□□□□□ -1.23
RNU6-347P-201ENST00000516658 PARP9Q8IXQ6 854 aa7.33□□□□□ -1.24
RNU6-347P-201ENST00000516658 EFCAB3Q8N7B9 438 aa7.33□□□□□ -1.24
RNU6-347P-201ENST00000516658 ZNF579Q8NAF0 562 aaKnown RBP7.33□□□□□ -1.24
RNU6-347P-201ENST00000516658 FBXO22Q8NEZ5 403 aa7.33□□□□□ -1.24
RNU6-347P-201ENST00000516658 CCDC102AQ96A19 550 aa7.33□□□□□ -1.24
RNU6-347P-201ENST00000516658 TSPYL2Q9H2G4 693 aaPredicted RBP7.32□□□□□ -1.24
RNU6-347P-201ENST00000516658 USP35Q9P2H5 1018 aa7.32□□□□□ -1.24
RNU6-347P-201ENST00000516658 PHF8Q9UPP1 1060 aa7.32□□□□□ -1.24
RNU6-347P-201ENST00000516658 ZNF330Q9Y3S2 320 aaPredicted RBP7.32□□□□□ -1.24
RNU6-347P-201ENST00000516658 PUS7Q96PZ0 661 aaKnown RBP7.31□□□□□ -1.24
RNU6-347P-201ENST00000516658 CRISPLD2Q9H0B8 497 aa7.31□□□□□ -1.24
RNU6-347P-201ENST00000516658 CABP2Q9NPB3 220 aa7.31□□□□□ -1.24
RNU6-347P-201ENST00000516658 EIF5BO60841 1220 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
RNU6-347P-201ENST00000516658 KCNA1Q09470 495 aa7.28□□□□□ -1.24
RNU6-347P-201ENST00000516658 SH3D19Q5HYK7 790 aa7.28□□□□□ -1.24
RNU6-347P-201ENST00000516658 PRM3Q9NNZ6 103 aa7.28□□□□□ -1.24
RNU6-347P-201ENST00000516658 GNPATO15228 680 aa7.27□□□□□ -1.25
RNU6-347P-201ENST00000516658 GOLGA2Q08379 1002 aa7.27□□□□□ -1.25
RNU6-347P-201ENST00000516658 FNBP4Q8N3X1 1017 aaPredicted RBP7.27□□□□□ -1.25
RNU6-347P-201ENST00000516658 ZNF428Q96B54 188 aa7.27□□□□□ -1.25
RNU6-347P-201ENST00000516658 PLSCR2Q9NRY7 297 aa7.27□□□□□ -1.25
RNU6-347P-201ENST00000516658 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa7.27□□□□□ -1.25
RNU6-347P-201ENST00000516658 FCHSD2O94868 740 aa7.26□□□□□ -1.25
RNU6-347P-201ENST00000516658 IRF5Q13568 498 aa7.26□□□□□ -1.25
RNU6-347P-201ENST00000516658 HIC1Q14526 733 aa7.26□□□□□ -1.25
RNU6-347P-201ENST00000516658 RSPH4AQ5TD94 716 aa7.26□□□□□ -1.25
RNU6-347P-201ENST00000516658 DPYSL4O14531 572 aa7.25□□□□□ -1.25
RNU6-347P-201ENST00000516658 SKIV2LQ15477 1246 aaKnown RBP7.25□□□□□ -1.25
RNU6-347P-201ENST00000516658 PPP1R15BQ5SWA1 713 aa7.25□□□□□ -1.25
RNU6-347P-201ENST00000516658 GIGYF2Q6Y7W6 1299 aaKnown RBP7.25□□□□□ -1.25
RNU6-347P-201ENST00000516658 SPDYE5A6NIY4 337 aa7.24□□□□□ -1.25
RNU6-347P-201ENST00000516658 BRD1O95696 1058 aa7.24□□□□□ -1.25
RNU6-347P-201ENST00000516658 PDIA6Q15084 440 aa7.24□□□□□ -1.25
RNU6-347P-201ENST00000516658 CCDC27Q2M243 656 aa7.24□□□□□ -1.25
RNU6-347P-201ENST00000516658 CALR3Q96L12 384 aaKnown RBP7.24□□□□□ -1.25
RNU6-347P-201ENST00000516658 GRXCR2A6NFK2 248 aa7.23□□□□□ -1.25
RNU6-347P-201ENST00000516658 CSB-PGBD3P0DP91 1061 aa7.23□□□□□ -1.25
RNU6-347P-201ENST00000516658 POM121Q96HA1 1249 aa7.23□□□□□ -1.25
RNU6-347P-201ENST00000516658 GPR37O15354 613 aa7.21□□□□□ -1.26
RNU6-347P-201ENST00000516658 CLCN1P35523 988 aa7.21□□□□□ -1.26
RNU6-347P-201ENST00000516658 AKT1S1Q96B36 256 aa7.21□□□□□ -1.26
RNU6-347P-201ENST00000516658 BANK1Q8NDB2 785 aa7.2□□□□□ -1.26
RNU6-347P-201ENST00000516658 COG6Q9Y2V7 657 aa7.2□□□□□ -1.26
RNU6-347P-201ENST00000516658 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP7.19□□□□□ -1.26
RNU6-347P-201ENST00000516658 MS4A1P11836 297 aa7.19□□□□□ -1.26
RNU6-347P-201ENST00000516658 GPHNQ9NQX3 736 aaPredicted RBP7.19□□□□□ -1.26
RNU6-347P-201ENST00000516658 USTQ9Y2C2 406 aa7.19□□□□□ -1.26
RNU6-347P-201ENST00000516658 RBM42Q9BTD8 480 aaKnown RBP7.18□□□□□ -1.26
RNU6-347P-201ENST00000516658 MAP3K9P80192 1104 aa7.17□□□□□ -1.26
RNU6-347P-201ENST00000516658 TMEM259Q4ZIN3 620 aa7.17□□□□□ -1.26
RNU6-347P-201ENST00000516658 PBXIP1Q96AQ6 731 aa7.16□□□□□ -1.26
RNU6-347P-201ENST00000516658 POLR3EQ9NVU0 708 aa7.16□□□□□ -1.26
RNU6-347P-201ENST00000516658 SSTR3P32745 418 aaPredicted RBP7.14□□□□□ -1.27
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 78.2 ms