RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000514472.1

FGFR4-216, Transcript of fibroblast growth factor receptor 4, humanhuman

TSL 4

Gene FGFR4, Length 552 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGFR4-216ENST00000514472 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa36.62■■■■□ 3.45
FGFR4-216ENST00000514472 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa36.61■■■■□ 3.45
FGFR4-216ENST00000514472 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP36.6■■■■□ 3.45
FGFR4-216ENST00000514472 POGZQ7Z3K3 1410 aa36.59■■■■□ 3.45
FGFR4-216ENST00000514472 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP36.58■■■■□ 3.45
FGFR4-216ENST00000514472 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa36.57■■■■□ 3.44
FGFR4-216ENST00000514472 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP36.56■■■■□ 3.44
FGFR4-216ENST00000514472 CLIP1P30622 1438 aa36.51■■■■□ 3.44
FGFR4-216ENST00000514472 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP36.5■■■■□ 3.43
FGFR4-216ENST00000514472 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa36.5■■■■□ 3.43
FGFR4-216ENST00000514472 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa36.47■■■■□ 3.43
FGFR4-216ENST00000514472 ARHGAP5Q13017 1502 aa36.45■■■■□ 3.43
FGFR4-216ENST00000514472 CCDC18Q5T9S5 1454 aa36.43■■■■□ 3.42
FGFR4-216ENST00000514472 ATP10AO60312 1499 aa36.42■■■■□ 3.42
FGFR4-216ENST00000514472 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa36.4■■■■□ 3.42
FGFR4-216ENST00000514472 LMTK3Q96Q04 1460 aa36.4■■■■□ 3.42
FGFR4-216ENST00000514472 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa36.39■■■■□ 3.42
FGFR4-216ENST00000514472 KDM5CP41229 1560 aa36.39■■■■□ 3.42
FGFR4-216ENST00000514472 PREX2Q70Z35 1606 aa36.37■■■■□ 3.41
FGFR4-216ENST00000514472 C9orf84Q5VXU9 1444 aa36.36■■■■□ 3.41
FGFR4-216ENST00000514472 FYCO1Q9BQS8 1478 aa36.35■■■■□ 3.41
FGFR4-216ENST00000514472 MLECQ14165 292 aa36.34■■■■□ 3.41
FGFR4-216ENST00000514472 AFAP1Q8N556 730 aa36.34■■■■□ 3.41
FGFR4-216ENST00000514472 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa36.31■■■■□ 3.4
FGFR4-216ENST00000514472 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa36.31■■■■□ 3.4
FGFR4-216ENST00000514472 ABCC1P33527 1531 aa36.25■■■■□ 3.39
FGFR4-216ENST00000514472 ITSN2Q9NZM3 1697 aa36.25■■■■□ 3.39
FGFR4-216ENST00000514472 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa36.24■■■■□ 3.39
FGFR4-216ENST00000514472 PLPPR3Q6T4P5 718 aa36.24■■■■□ 3.39
FGFR4-216ENST00000514472 MLH3Q9UHC1 1453 aa36.23■■■■□ 3.39
FGFR4-216ENST00000514472 REREQ9P2R6 1566 aa36.21■■■■□ 3.39
FGFR4-216ENST00000514472 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa36.21■■■■□ 3.39
FGFR4-216ENST00000514472 ABCA6Q8N139 1617 aa36.19■■■■□ 3.38
FGFR4-216ENST00000514472 HSPA2P54652 639 aa36.16■■■■□ 3.38
FGFR4-216ENST00000514472 MYT1LQ9UL68 1186 aa36.16■■■■□ 3.38
FGFR4-216ENST00000514472 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa36.13■■■■□ 3.37
FGFR4-216ENST00000514472 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP36.11■■■■□ 3.37
FGFR4-216ENST00000514472 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP36.09■■■■□ 3.37
FGFR4-216ENST00000514472 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa36.09■■■■□ 3.37
FGFR4-216ENST00000514472 PREX1Q8TCU6 1659 aa36.08■■■■□ 3.37
FGFR4-216ENST00000514472 AGLP35573 1532 aa36.08■■■■□ 3.37
FGFR4-216ENST00000514472 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP36.07■■■■□ 3.36
FGFR4-216ENST00000514472 FBXO41Q8TF61 875 aa36.04■■■■□ 3.36
FGFR4-216ENST00000514472 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP36.02■■■■□ 3.36
FGFR4-216ENST00000514472 SYCP2Q9BX26 1530 aa36.01■■■■□ 3.36
FGFR4-216ENST00000514472 C3P01024 1663 aa35.97■■■■□ 3.35
FGFR4-216ENST00000514472 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa35.95■■■■□ 3.35
FGFR4-216ENST00000514472 MTUS2Q5JR59 1369 aa35.95■■■■□ 3.35
FGFR4-216ENST00000514472 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP35.95■■■■□ 3.35
FGFR4-216ENST00000514472 CCNB3Q8WWL7 1395 aa35.94■■■■□ 3.34
FGFR4-216ENST00000514472 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP35.94■■■■□ 3.34
FGFR4-216ENST00000514472 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa35.92■■■■□ 3.34
FGFR4-216ENST00000514472 CEP162Q5TB80 1403 aa35.91■■■■□ 3.34
FGFR4-216ENST00000514472 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP35.9■■■■□ 3.34
FGFR4-216ENST00000514472 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa35.87■■■■□ 3.33
FGFR4-216ENST00000514472 ATP7AQ04656 1500 aa35.87■■■■□ 3.33
FGFR4-216ENST00000514472 STRCQ7RTU9 1775 aa35.87■■■■□ 3.33
FGFR4-216ENST00000514472 TIAM1Q13009 1591 aa35.86■■■■□ 3.33
FGFR4-216ENST00000514472 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP35.86■■■■□ 3.33
FGFR4-216ENST00000514472 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa35.86■■■■□ 3.33
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FGFR4-216ENST00000514472 CNTLNQ9NXG0 1405 aa35.83■■■■□ 3.33
FGFR4-216ENST00000514472 MROH2AA6NES4 1674 aa35.8■■■■□ 3.32
FGFR4-216ENST00000514472 PLXNC1O60486 1568 aa35.8■■■■□ 3.32
FGFR4-216ENST00000514472 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP35.77■■■■□ 3.32
FGFR4-216ENST00000514472 A2MP01023 1474 aa35.75■■■■□ 3.31
FGFR4-216ENST00000514472 MBD5Q9P267 1494 aa35.74■■■■□ 3.31
FGFR4-216ENST00000514472 ADGBQ8N7X0 1667 aa35.72■■■■□ 3.31
FGFR4-216ENST00000514472 CERKQ8TCT0 537 aa35.71■■■■□ 3.31
FGFR4-216ENST00000514472 DMRT2Q9Y5R5 561 aa35.71■■■■□ 3.31
FGFR4-216ENST00000514472 ZMYM3Q14202 1370 aa35.69■■■■□ 3.3
FGFR4-216ENST00000514472 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP35.68■■■■□ 3.3
FGFR4-216ENST00000514472 NPATQ14207 1427 aa35.66■■■■□ 3.3
FGFR4-216ENST00000514472 NCOA2Q15596 1464 aa35.65■■■■□ 3.3
FGFR4-216ENST00000514472 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa35.65■■■■□ 3.3
FGFR4-216ENST00000514472 PTPRTO14522 1441 aa35.6■■■■□ 3.29
FGFR4-216ENST00000514472 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa35.59■■■■□ 3.29
FGFR4-216ENST00000514472 GGT6Q6P531 493 aa35.59■■■■□ 3.29
FGFR4-216ENST00000514472 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa35.56■■■■□ 3.28
FGFR4-216ENST00000514472 PPP6R1Q9UPN7 881 aa35.56■■■■□ 3.28
FGFR4-216ENST00000514472 NCOA1Q15788 1441 aa35.56■■■■□ 3.28
FGFR4-216ENST00000514472 VPS8Q8N3P4 1428 aa35.55■■■■□ 3.28
FGFR4-216ENST00000514472 CCDC141Q6ZP82 1450 aa35.54■■■■□ 3.28
FGFR4-216ENST00000514472 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP35.53■■■■□ 3.28
FGFR4-216ENST00000514472 PTPRKQ15262 1439 aa35.52■■■■□ 3.28
FGFR4-216ENST00000514472 RSPH4AQ5TD94 716 aa35.51■■■■□ 3.28
FGFR4-216ENST00000514472 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa35.5■■■■□ 3.27
FGFR4-216ENST00000514472 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP35.5■■■■□ 3.27
FGFR4-216ENST00000514472 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa35.49■■■■□ 3.27
FGFR4-216ENST00000514472 MYO3AQ8NEV4 1616 aa35.49■■■■□ 3.27
FGFR4-216ENST00000514472 ARHGEF5Q12774 1597 aa35.47■■■■□ 3.27
FGFR4-216ENST00000514472 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP35.42■■■■□ 3.26
FGFR4-216ENST00000514472 LTBP4Q8N2S1 1624 aa35.42■■■■□ 3.26
FGFR4-216ENST00000514472 MAP3K1Q13233 1512 aa35.41■■■■□ 3.26
FGFR4-216ENST00000514472 KIF3BO15066 747 aa35.39■■■■□ 3.26
FGFR4-216ENST00000514472 PLA2R1Q13018 1463 aa35.36■■■■□ 3.25
FGFR4-216ENST00000514472 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP35.36■■■■□ 3.25
FGFR4-216ENST00000514472 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa35.35■■■■□ 3.25
FGFR4-216ENST00000514472 FAM135AQ9P2D6 1515 aa35.35■■■■□ 3.25
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