RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000514178.5

PGGT1B-205, Transcript of protein geranylgeranyltransferase type I subunit beta, humanhuman

TSL 4

Gene PGGT1B, Length 553 nt, Biotype processed transcript.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1B-205ENST00000514178 MLLT3P42568 568 aaPredicted RBP15.51■□□□□ 0.07
PGGT1B-205ENST00000514178 RBM26Q5T8P6 1007 aaKnown RBP15.49■□□□□ 0.07
PGGT1B-205ENST00000514178 BMP2KQ9NSY1 1161 aaPredicted RBP15.49■□□□□ 0.07
PGGT1B-205ENST00000514178 GPIHBP1Q8IV16 184 aa15.45■□□□□ 0.06
PGGT1B-205ENST00000514178 EMILIN3Q9NT22 766 aa15.44■□□□□ 0.06
PGGT1B-205ENST00000514178 TRIM35Q9UPQ4 493 aa15.44■□□□□ 0.06
PGGT1B-205ENST00000514178 DPYSL4O14531 572 aa15.43■□□□□ 0.06
PGGT1B-205ENST00000514178 DSG2Q14126 1118 aa15.42■□□□□ 0.06
PGGT1B-205ENST00000514178 DPY19L2Q6NUT2 758 aa15.42■□□□□ 0.06
PGGT1B-205ENST00000514178 MICALL2Q8IY33 904 aa15.4■□□□□ 0.06
PGGT1B-205ENST00000514178 AK7Q96M32 723 aa15.4■□□□□ 0.06
PGGT1B-205ENST00000514178 PDIA6Q15084 440 aa15.39■□□□□ 0.05
PGGT1B-205ENST00000514178 SPDYE16A6NNV3 312 aaPredicted RBP15.38■□□□□ 0.05
PGGT1B-205ENST00000514178 GALR2O43603 387 aaPredicted RBP15.37■□□□□ 0.05
PGGT1B-205ENST00000514178 TMC2Q8TDI7 906 aa15.36■□□□□ 0.05
PGGT1B-205ENST00000514178 KRI1Q8N9T8 703 aaKnown RBP15.35■□□□□ 0.05
PGGT1B-205ENST00000514178 FOXK1P85037 733 aa15.34■□□□□ 0.05
PGGT1B-205ENST00000514178 PDCD7Q8N8D1 485 aaKnown RBP15.34■□□□□ 0.05
PGGT1B-205ENST00000514178 GPBP1L1Q9HC44 474 aaPredicted RBP15.32■□□□□ 0.04
PGGT1B-205ENST00000514178 PLPP6Q8IY26 295 aa15.28■□□□□ 0.04
PGGT1B-205ENST00000514178 ARXQ96QS3 562 aa15.26■□□□□ 0.03
PGGT1B-205ENST00000514178 TMEM121BQ9BXQ6 578 aaPredicted RBP15.26■□□□□ 0.03
PGGT1B-205ENST00000514178 ATN1P54259 1190 aaPredicted RBP15.25■□□□□ 0.03
PGGT1B-205ENST00000514178 C2orf72A6NCS6 295 aa15.24■□□□□ 0.03
PGGT1B-205ENST00000514178 TRIM66O15016 1216 aa15.24■□□□□ 0.03
PGGT1B-205ENST00000514178 GPR37O15354 613 aa15.24■□□□□ 0.03
PGGT1B-205ENST00000514178 IRX5P78411 483 aaPredicted RBP15.24■□□□□ 0.03
PGGT1B-205ENST00000514178 BOLA1Q9Y3E2 137 aa15.24■□□□□ 0.03
PGGT1B-205ENST00000514178 KDM4CQ9H3R0 1056 aa15.23■□□□□ 0.03
PGGT1B-205ENST00000514178 KIF3CO14782 793 aa15.22■□□□□ 0.03
PGGT1B-205ENST00000514178 PDE4DQ08499 809 aa15.22■□□□□ 0.03
PGGT1B-205ENST00000514178 OCEL1Q9H607 264 aa15.22■□□□□ 0.03
PGGT1B-205ENST00000514178 DAXXQ9UER7 740 aaPredicted RBP15.2■□□□□ 0.02
PGGT1B-205ENST00000514178 CLCN6P51797 869 aa15.19■□□□□ 0.02
PGGT1B-205ENST00000514178 IL27Q8NEV9 243 aa15.19■□□□□ 0.02
PGGT1B-205ENST00000514178 G3V3G9 751 aa15.18■□□□□ 0.02
PGGT1B-205ENST00000514178 ATMINO43313 823 aaPredicted RBP15.18■□□□□ 0.02
PGGT1B-205ENST00000514178 IER5LQ5T953 404 aa15.18■□□□□ 0.02
PGGT1B-205ENST00000514178 GRXCR2A6NFK2 248 aa15.17■□□□□ 0.02
PGGT1B-205ENST00000514178 MAP3K9P80192 1104 aa15.17■□□□□ 0.02
PGGT1B-205ENST00000514178 ASTLQ6HA08 431 aaPredicted RBP15.15■□□□□ 0.02
PGGT1B-205ENST00000514178 NUTM2FA1L443 756 aa15.13■□□□□ 0.01
PGGT1B-205ENST00000514178 HAX1O00165 279 aa15.13■□□□□ 0.01
PGGT1B-205ENST00000514178 EVX2Q03828 476 aa15.13■□□□□ 0.01
PGGT1B-205ENST00000514178 UPF1Q92900 1129 aaKnown RBP eCLIP15.12■□□□□ 0.01
PGGT1B-205ENST00000514178 PLCG2P16885 1265 aa15.11■□□□□ 0.01
PGGT1B-205ENST00000514178 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP15.1■□□□□ 0.01
PGGT1B-205ENST00000514178 OSBPP22059 807 aa15.09■□□□□ 0.01
PGGT1B-205ENST00000514178 MAP2K5Q13163 448 aa15.09■□□□□ 0.01
PGGT1B-205ENST00000514178 TMEM92Q6UXU6 159 aa15.08■□□□□ 0
PGGT1B-205ENST00000514178 OXER1Q8TDS5 423 aa15.08■□□□□ 0
PGGT1B-205ENST00000514178 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP15.07■□□□□ 0
PGGT1B-205ENST00000514178 CCDC102AQ96A19 550 aa15.07■□□□□ 0
PGGT1B-205ENST00000514178 L3MBTL3Q96JM7 780 aaPredicted RBP15.07■□□□□ 0
PGGT1B-205ENST00000514178 PTGER2P43116 358 aa15.05■□□□□ -0
PGGT1B-205ENST00000514178 IRF6O14896 467 aa15.04■□□□□ -0
PGGT1B-205ENST00000514178 GNPATO15228 680 aa15.04■□□□□ -0
PGGT1B-205ENST00000514178 HOMEZQ8IX15 550 aa15.03■□□□□ -0
PGGT1B-205ENST00000514178 DDX12PQ92771 950 aa15.03■□□□□ -0
PGGT1B-205ENST00000514178 FAM117AQ9C073 453 aa15.03■□□□□ -0
PGGT1B-205ENST00000514178 FCHSD2O94868 740 aa15.01□□□□□ -0.01
PGGT1B-205ENST00000514178 HIC1Q14526 733 aa15.01□□□□□ -0.01
PGGT1B-205ENST00000514178 AMHR2Q16671 573 aa15□□□□□ -0.01
PGGT1B-205ENST00000514178 TBC1D12O60347 775 aa14.98□□□□□ -0.01
PGGT1B-205ENST00000514178 FECHP22830 423 aa14.98□□□□□ -0.01
PGGT1B-205ENST00000514178 PARP9Q8IXQ6 854 aa14.98□□□□□ -0.01
PGGT1B-205ENST00000514178 PRIM1P49642 420 aaKnown RBP14.97□□□□□ -0.01
PGGT1B-205ENST00000514178 EVI5O60447 810 aa14.96□□□□□ -0.01
PGGT1B-205ENST00000514178 PLEKHG3A1L390 1219 aa14.95□□□□□ -0.02
PGGT1B-205ENST00000514178 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP14.95□□□□□ -0.02
PGGT1B-205ENST00000514178 DDRGK1Q96HY6 314 aa14.95□□□□□ -0.02
PGGT1B-205ENST00000514178 COLQQ9Y215 455 aaPredicted RBP14.95□□□□□ -0.02
PGGT1B-205ENST00000514178 SEC24BO95487 1268 aa14.94□□□□□ -0.02
PGGT1B-205ENST00000514178 PTGDRQ13258 359 aa14.91□□□□□ -0.02
PGGT1B-205ENST00000514178 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP14.91□□□□□ -0.02
PGGT1B-205ENST00000514178 ZMYND15Q9H091 742 aa14.89□□□□□ -0.03
PGGT1B-205ENST00000514178 TTLL12Q14166 644 aaPredicted RBP14.87□□□□□ -0.03
PGGT1B-205ENST00000514178 PTCD2Q8WV60 388 aaKnown RBP14.87□□□□□ -0.03
PGGT1B-205ENST00000514178 GABBR2O75899 941 aa14.86□□□□□ -0.03
PGGT1B-205ENST00000514178 DCBLD2Q96PD2 775 aa14.83□□□□□ -0.04
PGGT1B-205ENST00000514178 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP14.83□□□□□ -0.04
PGGT1B-205ENST00000514178 POTEFA5A3E0 1075 aa14.82□□□□□ -0.04
PGGT1B-205ENST00000514178 SLC39A7Q92504 469 aa14.82□□□□□ -0.04
PGGT1B-205ENST00000514178 RSPH6AQ9H0K4 717 aa14.81□□□□□ -0.04
PGGT1B-205ENST00000514178 CDHR5Q9HBB8 845 aa14.81□□□□□ -0.04
PGGT1B-205ENST00000514178 SLC34A2O95436 690 aa14.8□□□□□ -0.04
PGGT1B-205ENST00000514178 GIGYF2Q6Y7W6 1299 aaKnown RBP14.8□□□□□ -0.04
PGGT1B-205ENST00000514178 C3orf67Q6ZVT6 689 aa14.8□□□□□ -0.04
PGGT1B-205ENST00000514178 EN1Q05925 392 aaPredicted RBP14.79□□□□□ -0.04
PGGT1B-205ENST00000514178 PHF14O94880 888 aa14.77□□□□□ -0.05
PGGT1B-205ENST00000514178 MS4A1P11836 297 aa14.77□□□□□ -0.05
PGGT1B-205ENST00000514178 GOPCQ9HD26 462 aa14.77□□□□□ -0.05
PGGT1B-205ENST00000514178 NPDC1Q9NQX5 325 aaPredicted RBP14.77□□□□□ -0.05
PGGT1B-205ENST00000514178 C7P10643 843 aa14.76□□□□□ -0.05
PGGT1B-205ENST00000514178 EPAS1Q99814 870 aa14.76□□□□□ -0.05
PGGT1B-205ENST00000514178 REPIN1Q9BWE0 567 aaKnown RBP14.76□□□□□ -0.05
PGGT1B-205ENST00000514178 MAP3K7O43318 606 aa14.75□□□□□ -0.05
PGGT1B-205ENST00000514178 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP14.72□□□□□ -0.05
PGGT1B-205ENST00000514178 METRNQ9UJH8 293 aa14.72□□□□□ -0.05
PGGT1B-205ENST00000514178 PCDHGA10Q9Y5H3 936 aa14.71□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.3 ms