RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000512780.2

STX18-209, Transcript of syntaxin 18, human

TSL 3

Gene STX18, Length 800 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
STX18-209	ENST00000512780	RIMS1	Q86UR5	1692 aa	Known RBP	33.36	■■■□□ 2.93
STX18-209	ENST00000512780	TRO	Q12816	1431 aa	Predicted RBP	33.35	■■■□□ 2.93
STX18-209	ENST00000512780	YEATS2	Q9ULM3	1422 aa		33.35	■■■□□ 2.93
STX18-209	ENST00000512780	EFCAB2	Q5VUJ9	269 aa		33.34	■■■□□ 2.93
STX18-209	ENST00000512780	POGZ	Q7Z3K3	1410 aa		33.34	■■■□□ 2.93
STX18-209	ENST00000512780	MAGI2	Q86UL8	1455 aa		33.31	■■■□□ 2.92
STX18-209	ENST00000512780	PCF11	O94913	1555 aa	Known RBP	33.31	■■■□□ 2.92
STX18-209	ENST00000512780	ILDR1	Q86SU0	546 aa	Predicted RBP	33.31	■■■□□ 2.92
STX18-209	ENST00000512780	ARHGAP5	Q13017	1502 aa		33.31	■■■□□ 2.92
STX18-209	ENST00000512780	PLPPR3	Q6T4P5	718 aa		33.29	■■■□□ 2.92
STX18-209	ENST00000512780	SIGLEC1	Q9BZZ2	1709 aa		33.28	■■■□□ 2.92
STX18-209	ENST00000512780	MLEC	Q14165	292 aa		33.26	■■■□□ 2.91
STX18-209	ENST00000512780	CASKIN1	Q8WXD9	1431 aa		33.25	■■■□□ 2.91
STX18-209	ENST00000512780	CCDC18	Q5T9S5	1454 aa		33.25	■■■□□ 2.91
STX18-209	ENST00000512780	MYT1L	Q9UL68	1186 aa		33.21	■■■□□ 2.91
STX18-209	ENST00000512780	CDC42BPB	Q9Y5S2	1711 aa		33.19	■■■□□ 2.9
STX18-209	ENST00000512780	FER1L4	A9Z1Z3	1794 aa		33.19	■■■□□ 2.9
STX18-209	ENST00000512780	ZNF518A	Q6AHZ1	1483 aa		33.18	■■■□□ 2.9
STX18-209	ENST00000512780	ATP10A	O60312	1499 aa		33.17	■■■□□ 2.9
STX18-209	ENST00000512780	C9orf84	Q5VXU9	1444 aa		33.16	■■■□□ 2.9
STX18-209	ENST00000512780	FYCO1	Q9BQS8	1478 aa		33.14	■■■□□ 2.9
STX18-209	ENST00000512780	PREX2	Q70Z35	1606 aa		33.13	■■■□□ 2.89
STX18-209	ENST00000512780	AFAP1	Q8N556	730 aa		33.13	■■■□□ 2.89
STX18-209	ENST00000512780	LMTK3	Q96Q04	1460 aa		33.12	■■■□□ 2.89
STX18-209	ENST00000512780	KDM5C	P41229	1560 aa		33.09	■■■□□ 2.89
STX18-209	ENST00000512780	CDC42BPA	Q5VT25	1732 aa		33.05	■■■□□ 2.88
STX18-209	ENST00000512780	ITSN2	Q9NZM3	1697 aa		33.04	■■■□□ 2.88
STX18-209	ENST00000512780	ABCC1	P33527	1531 aa		33.03	■■■□□ 2.88
STX18-209	ENST00000512780	ARHGEF12	Q9NZN5	1544 aa		33.02	■■■□□ 2.88
STX18-209	ENST00000512780	DIP2C	Q9Y2E4	1556 aa		33.01	■■■□□ 2.88
STX18-209	ENST00000512780	HSPA2	P54652	639 aa		33	■■■□□ 2.87
STX18-209	ENST00000512780	ZNF777	Q9ULD5	760 aa	Predicted RBP	32.99	■■■□□ 2.87
STX18-209	ENST00000512780	TRAPPC8	Q9Y2L5	1435 aa		32.99	■■■□□ 2.87
STX18-209	ENST00000512780	ABCA6	Q8N139	1617 aa		32.99	■■■□□ 2.87
STX18-209	ENST00000512780	MLH3	Q9UHC1	1453 aa		32.95	■■■□□ 2.87
STX18-209	ENST00000512780	CEBPA	P49715	358 aa	Predicted RBP	32.91	■■■□□ 2.86
STX18-209	ENST00000512780	RERE	Q9P2R6	1566 aa		32.9	■■■□□ 2.86
STX18-209	ENST00000512780	SAMD9L	Q8IVG5	1584 aa		32.88	■■■□□ 2.85
STX18-209	ENST00000512780	KIDINS220	Q9ULH0	1771 aa		32.88	■■■□□ 2.85
STX18-209	ENST00000512780	PREX1	Q8TCU6	1659 aa		32.88	■■■□□ 2.85
STX18-209	ENST00000512780	SYCP2	Q9BX26	1530 aa		32.87	■■■□□ 2.85
STX18-209	ENST00000512780	GPATCH8	Q9UKJ3	1502 aa	Known RBP	32.87	■■■□□ 2.85
STX18-209	ENST00000512780	MTUS2	Q5JR59	1369 aa		32.86	■■■□□ 2.85
STX18-209	ENST00000512780	ESF1	Q9H501	851 aa	Known RBP	32.85	■■■□□ 2.85
STX18-209	ENST00000512780	CCNB3	Q8WWL7	1395 aa		32.83	■■■□□ 2.85
STX18-209	ENST00000512780	FBXO41	Q8TF61	875 aa		32.82	■■■□□ 2.84
STX18-209	ENST00000512780	HNRNPM	P52272	730 aa	Known RBP eCLIP	32.81	■■■□□ 2.84
STX18-209	ENST00000512780	CFDP1	Q9UEE9	299 aa	Predicted RBP	32.81	■■■□□ 2.84
STX18-209	ENST00000512780	AGL	P35573	1532 aa		32.8	■■■□□ 2.84
STX18-209	ENST00000512780	SPAG9	O60271	1321 aa	Known RBP	32.78	■■■□□ 2.84
STX18-209	ENST00000512780	CEP162	Q5TB80	1403 aa		32.78	■■■□□ 2.84
STX18-209	ENST00000512780	C3	P01024	1663 aa		32.76	■■■□□ 2.84
STX18-209	ENST00000512780	PLEKHH2	Q8IVE3	1493 aa		32.74	■■■□□ 2.83
STX18-209	ENST00000512780	UHRF1BP1	Q6BDS2	1440 aa		32.73	■■■□□ 2.83
STX18-209	ENST00000512780	SUPT6H	Q7KZ85	1726 aa	Known RBP	32.73	■■■□□ 2.83
STX18-209	ENST00000512780	SETD1B	Q9UPS6	1966 aa	Known RBP	32.72	■■■□□ 2.83
STX18-209	ENST00000512780	EHBP1L1	Q8N3D4	1523 aa		32.72	■■■□□ 2.83
STX18-209	ENST00000512780	ATP7A	Q04656	1500 aa		32.71	■■■□□ 2.83
STX18-209	ENST00000512780	KIAA1107	Q9UPP5	1409 aa		32.69	■■■□□ 2.82
STX18-209	ENST00000512780	TIAM1	Q13009	1591 aa		32.68	■■■□□ 2.82
STX18-209	ENST00000512780	INO80	Q9ULG1	1556 aa	Predicted RBP	32.66	■■■□□ 2.82
STX18-209	ENST00000512780	CNTLN	Q9NXG0	1405 aa		32.64	■■■□□ 2.82
STX18-209	ENST00000512780	ZNF644	Q9H582	1327 aa	Predicted RBP	32.61	■■■□□ 2.81
STX18-209	ENST00000512780	STRC	Q7RTU9	1775 aa		32.6	■■■□□ 2.81
STX18-209	ENST00000512780	A2M	P01023	1474 aa		32.6	■■■□□ 2.81
STX18-209	ENST00000512780	LOC105371045	A0A1W2PR82	267 aa		32.59	■■■□□ 2.81
STX18-209	ENST00000512780	MROH2A	A6NES4	1674 aa		32.57	■■■□□ 2.8
STX18-209	ENST00000512780	CLTC	Q00610	1675 aa	Known RBP	32.56	■■■□□ 2.8
STX18-209	ENST00000512780	ADGB	Q8N7X0	1667 aa		32.56	■■■□□ 2.8
STX18-209	ENST00000512780	PLXNC1	O60486	1568 aa		32.55	■■■□□ 2.8
STX18-209	ENST00000512780	CERK	Q8TCT0	537 aa		32.55	■■■□□ 2.8
STX18-209	ENST00000512780	DMRT2	Q9Y5R5	561 aa		32.55	■■■□□ 2.8
STX18-209	ENST00000512780	GGT6	Q6P531	493 aa		32.53	■■■□□ 2.8
STX18-209	ENST00000512780	NCOA2	Q15596	1464 aa		32.51	■■■□□ 2.79
STX18-209	ENST00000512780	ZMYM3	Q14202	1370 aa		32.5	■■■□□ 2.79
STX18-209	ENST00000512780	MBD5	Q9P267	1494 aa		32.49	■■■□□ 2.79
STX18-209	ENST00000512780	NPAT	Q14207	1427 aa		32.45	■■■□□ 2.79
STX18-209	ENST00000512780	CAMSAP2	Q08AD1	1489 aa		32.45	■■■□□ 2.79
STX18-209	ENST00000512780	RTEL1-TNFRSF6B	F6WH68	1400 aa		32.42	■■■□□ 2.78
STX18-209	ENST00000512780	VPS8	Q8N3P4	1428 aa		32.42	■■■□□ 2.78
STX18-209	ENST00000512780	CCDC141	Q6ZP82	1450 aa		32.42	■■■□□ 2.78
STX18-209	ENST00000512780	CAMSAP1	Q5T5Y3	1602 aa		32.38	■■■□□ 2.77
STX18-209	ENST00000512780	PTPRT	O14522	1441 aa		32.37	■■■□□ 2.77
STX18-209	ENST00000512780	NCOA1	Q15788	1441 aa		32.37	■■■□□ 2.77
STX18-209	ENST00000512780	MYO3A	Q8NEV4	1616 aa		32.37	■■■□□ 2.77
STX18-209	ENST00000512780	DHX29	Q7Z478	1369 aa	Known RBP	32.35	■■■□□ 2.77
STX18-209	ENST00000512780	LRRC9	Q6ZRR7	1453 aa		32.35	■■■□□ 2.77
STX18-209	ENST00000512780	PPP6R1	Q9UPN7	881 aa		32.34	■■■□□ 2.77
STX18-209	ENST00000512780	RSPH4A	Q5TD94	716 aa		32.33	■■■□□ 2.77
STX18-209	ENST00000512780	PTPRK	Q15262	1439 aa		32.33	■■■□□ 2.77
STX18-209	ENST00000512780	KIF3B	O15066	747 aa		32.32	■■■□□ 2.76
STX18-209	ENST00000512780	ZNF142	P52746	1687 aa	Predicted RBP	32.31	■■■□□ 2.76
STX18-209	ENST00000512780	TSPY4	P0CV99	314 aa		32.29	■■■□□ 2.76
STX18-209	ENST00000512780	TSPY10	P0CW01	314 aa		32.29	■■■□□ 2.76
STX18-209	ENST00000512780	ARHGEF5	Q12774	1597 aa		32.28	■■■□□ 2.76
STX18-209	ENST00000512780	CEP170B	Q9Y4F5	1589 aa	Predicted RBP	32.28	■■■□□ 2.76
STX18-209	ENST00000512780	NCKAP5L	Q9HCH0	1330 aa		32.26	■■■□□ 2.76
STX18-209	ENST00000512780	KANK4	Q5T7N3	995 aa	Predicted RBP	32.23	■■■□□ 2.75
STX18-209	ENST00000512780	KDM5D	Q9BY66	1539 aa		32.21	■■■□□ 2.75
STX18-209	ENST00000512780	WASHC2C	Q9Y4E1	1318 aa		32.2	■■■□□ 2.74

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