RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000512014.5

SH3BP2-222, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

TSL 3

Gene SH3BP2, Length 688 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-222ENST00000512014 SCAPERQ9BY12 1400 aa20.52■□□□□ 0.87
SH3BP2-222ENST00000512014 POGZQ7Z3K3 1410 aa20.51■□□□□ 0.87
SH3BP2-222ENST00000512014 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa20.5■□□□□ 0.87
SH3BP2-222ENST00000512014 PREX2Q70Z35 1606 aa20.49■□□□□ 0.87
SH3BP2-222ENST00000512014 ARHGAP5Q13017 1502 aa20.49■□□□□ 0.87
SH3BP2-222ENST00000512014 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa20.48■□□□□ 0.87
SH3BP2-222ENST00000512014 YEATS2Q9ULM3 1422 aa20.48■□□□□ 0.87
SH3BP2-222ENST00000512014 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa20.47■□□□□ 0.87
SH3BP2-222ENST00000512014 ADAMTSL3P82987 1691 aa20.45■□□□□ 0.86
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SH3BP2-222ENST00000512014 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa20.44■□□□□ 0.86
SH3BP2-222ENST00000512014 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa20.43■□□□□ 0.86
SH3BP2-222ENST00000512014 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP20.43■□□□□ 0.86
SH3BP2-222ENST00000512014 KDM5CP41229 1560 aa20.42■□□□□ 0.86
SH3BP2-222ENST00000512014 BCORL1Q5H9F3 1711 aa20.42■□□□□ 0.86
SH3BP2-222ENST00000512014 ABCC1P33527 1531 aa20.42■□□□□ 0.86
SH3BP2-222ENST00000512014 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa20.4■□□□□ 0.86
SH3BP2-222ENST00000512014 AFAP1Q8N556 730 aa20.39■□□□□ 0.85
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SH3BP2-222ENST00000512014 ITSN2Q9NZM3 1697 aa20.38■□□□□ 0.85
SH3BP2-222ENST00000512014 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa20.38■□□□□ 0.85
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SH3BP2-222ENST00000512014 VPS8Q8N3P4 1428 aa20.36■□□□□ 0.85
SH3BP2-222ENST00000512014 MADDQ8WXG6 1647 aa20.35■□□□□ 0.85
SH3BP2-222ENST00000512014 ATP10AO60312 1499 aa20.34■□□□□ 0.85
SH3BP2-222ENST00000512014 TIAM1Q13009 1591 aa20.34■□□□□ 0.85
SH3BP2-222ENST00000512014 HECW2Q9P2P5 1572 aa20.34■□□□□ 0.85
SH3BP2-222ENST00000512014 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP20.33■□□□□ 0.85
SH3BP2-222ENST00000512014 PTPRMP28827 1452 aa20.33■□□□□ 0.85
SH3BP2-222ENST00000512014 MLH3Q9UHC1 1453 aa20.33■□□□□ 0.85
SH3BP2-222ENST00000512014 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa20.32■□□□□ 0.84
SH3BP2-222ENST00000512014 C9orf84Q5VXU9 1444 aa20.31■□□□□ 0.84
SH3BP2-222ENST00000512014 CCNB3Q8WWL7 1395 aa20.31■□□□□ 0.84
SH3BP2-222ENST00000512014 ABCA6Q8N139 1617 aa20.31■□□□□ 0.84
SH3BP2-222ENST00000512014 SYCP2Q9BX26 1530 aa20.3■□□□□ 0.84
SH3BP2-222ENST00000512014 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa20.29■□□□□ 0.84
SH3BP2-222ENST00000512014 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP20.28■□□□□ 0.84
SH3BP2-222ENST00000512014 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa20.27■□□□□ 0.84
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SH3BP2-222ENST00000512014 REREQ9P2R6 1566 aa20.27■□□□□ 0.84
SH3BP2-222ENST00000512014 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP20.27■□□□□ 0.84
SH3BP2-222ENST00000512014 NCOA2Q15596 1464 aa20.26■□□□□ 0.83
SH3BP2-222ENST00000512014 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP20.25■□□□□ 0.83
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SH3BP2-222ENST00000512014 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa20.24■□□□□ 0.83
SH3BP2-222ENST00000512014 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP20.24■□□□□ 0.83
SH3BP2-222ENST00000512014 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa20.24■□□□□ 0.83
SH3BP2-222ENST00000512014 MAP3K1Q13233 1512 aa20.23■□□□□ 0.83
SH3BP2-222ENST00000512014 MLECQ14165 292 aa20.22■□□□□ 0.83
SH3BP2-222ENST00000512014 MBD5Q9P267 1494 aa20.22■□□□□ 0.83
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SH3BP2-222ENST00000512014 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa20.21■□□□□ 0.83
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SH3BP2-222ENST00000512014 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP20.2■□□□□ 0.82
SH3BP2-222ENST00000512014 MYT1LQ9UL68 1186 aa20.18■□□□□ 0.82
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SH3BP2-222ENST00000512014 LMTK3Q96Q04 1460 aa20.12■□□□□ 0.81
SH3BP2-222ENST00000512014 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa20.09■□□□□ 0.81
SH3BP2-222ENST00000512014 A2MP01023 1474 aa20.08■□□□□ 0.81
SH3BP2-222ENST00000512014 CCDC141Q6ZP82 1450 aa20.08■□□□□ 0.81
SH3BP2-222ENST00000512014 PLPPR3Q6T4P5 718 aa20.07■□□□□ 0.8
SH3BP2-222ENST00000512014 ARHGEF5Q12774 1597 aa20.07■□□□□ 0.8
SH3BP2-222ENST00000512014 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP20.06■□□□□ 0.8
SH3BP2-222ENST00000512014 ADGBQ8N7X0 1667 aa20.06■□□□□ 0.8
SH3BP2-222ENST00000512014 MYOM3Q5VTT5 1437 aa20.05■□□□□ 0.8
SH3BP2-222ENST00000512014 C3P01024 1663 aa20.04■□□□□ 0.8
SH3BP2-222ENST00000512014 MIA2Q96PC5 1412 aa20.03■□□□□ 0.8
SH3BP2-222ENST00000512014 RSPH4AQ5TD94 716 aa20.01■□□□□ 0.79
SH3BP2-222ENST00000512014 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP19.99■□□□□ 0.79
SH3BP2-222ENST00000512014 CNTLNQ9NXG0 1405 aa19.99■□□□□ 0.79
SH3BP2-222ENST00000512014 PREX1Q8TCU6 1659 aa19.98■□□□□ 0.79
SH3BP2-222ENST00000512014 HSPA2P54652 639 aa19.98■□□□□ 0.79
SH3BP2-222ENST00000512014 MAST1Q9Y2H9 1570 aa19.98■□□□□ 0.79
SH3BP2-222ENST00000512014 MROH2AA6NES4 1674 aa19.97■□□□□ 0.79
SH3BP2-222ENST00000512014 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP19.96■□□□□ 0.79
SH3BP2-222ENST00000512014 APLP2Q06481 763 aa19.96■□□□□ 0.79
SH3BP2-222ENST00000512014 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP19.95■□□□□ 0.78
SH3BP2-222ENST00000512014 PTPN23Q9H3S7 1636 aa19.94■□□□□ 0.78
SH3BP2-222ENST00000512014 ZMYM3Q14202 1370 aa19.93■□□□□ 0.78
SH3BP2-222ENST00000512014 FGD6Q6ZV73 1430 aa19.93■□□□□ 0.78
SH3BP2-222ENST00000512014 TSPY4P0CV99 314 aa19.92■□□□□ 0.78
SH3BP2-222ENST00000512014 TSPY10P0CW01 314 aa19.92■□□□□ 0.78
SH3BP2-222ENST00000512014 GGT6Q6P531 493 aa19.92■□□□□ 0.78
SH3BP2-222ENST00000512014 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP19.92■□□□□ 0.78
SH3BP2-222ENST00000512014 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP19.91■□□□□ 0.78
SH3BP2-222ENST00000512014 ABCC5O15440 1437 aa19.91■□□□□ 0.78
SH3BP2-222ENST00000512014 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa19.89■□□□□ 0.77
SH3BP2-222ENST00000512014 PPP6R1Q9UPN7 881 aa19.89■□□□□ 0.77
SH3BP2-222ENST00000512014 CROCC2H7BZ55 1655 aa19.88■□□□□ 0.77
SH3BP2-222ENST00000512014 NPATQ14207 1427 aa19.88■□□□□ 0.77
SH3BP2-222ENST00000512014 KIF3BO15066 747 aa19.88■□□□□ 0.77
SH3BP2-222ENST00000512014 SHANK2Q9UPX8 1470 aa19.86■□□□□ 0.77
SH3BP2-222ENST00000512014 PTPRKQ15262 1439 aa19.86■□□□□ 0.77
SH3BP2-222ENST00000512014 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP19.86■□□□□ 0.77
SH3BP2-222ENST00000512014 STRCQ7RTU9 1775 aa19.85■□□□□ 0.77
SH3BP2-222ENST00000512014 DAPK1P53355 1430 aa19.85■□□□□ 0.77
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