RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000511185.5

SH3BP2-218, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

TSL 2

Gene SH3BP2, Length 1,071 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-218ENST00000511185 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP30.12■■■□□ 2.41
SH3BP2-218ENST00000511185 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa30.1■■■□□ 2.41
SH3BP2-218ENST00000511185 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa30.09■■■□□ 2.41
SH3BP2-218ENST00000511185 ITSN2Q9NZM3 1697 aa30.09■■■□□ 2.41
SH3BP2-218ENST00000511185 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa30.06■■■□□ 2.4
SH3BP2-218ENST00000511185 POGZQ7Z3K3 1410 aa30.06■■■□□ 2.4
SH3BP2-218ENST00000511185 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP30.06■■■□□ 2.4
SH3BP2-218ENST00000511185 TIAM1Q13009 1591 aa30.04■■■□□ 2.4
SH3BP2-218ENST00000511185 ABCC1P33527 1531 aa30.04■■■□□ 2.4
SH3BP2-218ENST00000511185 VPS8Q8N3P4 1428 aa30.04■■■□□ 2.4
SH3BP2-218ENST00000511185 SCAPERQ9BY12 1400 aa30.02■■■□□ 2.4
SH3BP2-218ENST00000511185 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa30.01■■■□□ 2.39
SH3BP2-218ENST00000511185 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa30.01■■■□□ 2.39
SH3BP2-218ENST00000511185 KDM5CP41229 1560 aa29.98■■■□□ 2.39
SH3BP2-218ENST00000511185 YEATS2Q9ULM3 1422 aa29.96■■■□□ 2.39
SH3BP2-218ENST00000511185 BCORL1Q5H9F3 1711 aa29.96■■■□□ 2.39
SH3BP2-218ENST00000511185 MTUS2Q5JR59 1369 aa29.96■■■□□ 2.39
SH3BP2-218ENST00000511185 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa29.95■■■□□ 2.38
SH3BP2-218ENST00000511185 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP29.95■■■□□ 2.38
SH3BP2-218ENST00000511185 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP29.94■■■□□ 2.38
SH3BP2-218ENST00000511185 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa29.94■■■□□ 2.38
SH3BP2-218ENST00000511185 HECW2Q9P2P5 1572 aa29.94■■■□□ 2.38
SH3BP2-218ENST00000511185 ADAMTSL3P82987 1691 aa29.93■■■□□ 2.38
SH3BP2-218ENST00000511185 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa29.91■■■□□ 2.38
SH3BP2-218ENST00000511185 SYCP2Q9BX26 1530 aa29.91■■■□□ 2.38
SH3BP2-218ENST00000511185 ABCA6Q8N139 1617 aa29.9■■■□□ 2.38
SH3BP2-218ENST00000511185 MADDQ8WXG6 1647 aa29.88■■■□□ 2.37
SH3BP2-218ENST00000511185 MAGI2Q86UL8 1455 aa29.87■■■□□ 2.37
SH3BP2-218ENST00000511185 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa29.86■■■□□ 2.37
SH3BP2-218ENST00000511185 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa29.85■■■□□ 2.37
SH3BP2-218ENST00000511185 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa29.84■■■□□ 2.37
SH3BP2-218ENST00000511185 NCOA2Q15596 1464 aa29.83■■■□□ 2.37
SH3BP2-218ENST00000511185 CCNB3Q8WWL7 1395 aa29.82■■■□□ 2.36
SH3BP2-218ENST00000511185 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP29.81■■■□□ 2.36
SH3BP2-218ENST00000511185 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa29.8■■■□□ 2.36
SH3BP2-218ENST00000511185 MAP3K1Q13233 1512 aa29.78■■■□□ 2.36
SH3BP2-218ENST00000511185 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa29.77■■■□□ 2.36
SH3BP2-218ENST00000511185 AFAP1Q8N556 730 aa29.77■■■□□ 2.36
SH3BP2-218ENST00000511185 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP29.76■■■□□ 2.35
SH3BP2-218ENST00000511185 C9orf84Q5VXU9 1444 aa29.75■■■□□ 2.35
SH3BP2-218ENST00000511185 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP29.75■■■□□ 2.35
SH3BP2-218ENST00000511185 MLH3Q9UHC1 1453 aa29.74■■■□□ 2.35
SH3BP2-218ENST00000511185 ATP10AO60312 1499 aa29.73■■■□□ 2.35
SH3BP2-218ENST00000511185 REREQ9P2R6 1566 aa29.72■■■□□ 2.35
SH3BP2-218ENST00000511185 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP29.71■■■□□ 2.35
SH3BP2-218ENST00000511185 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa29.69■■■□□ 2.34
SH3BP2-218ENST00000511185 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP29.69■■■□□ 2.34
SH3BP2-218ENST00000511185 ATP7AQ04656 1500 aa29.68■■■□□ 2.34
SH3BP2-218ENST00000511185 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa29.68■■■□□ 2.34
SH3BP2-218ENST00000511185 PTPRMP28827 1452 aa29.67■■■□□ 2.34
SH3BP2-218ENST00000511185 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa29.66■■■□□ 2.34
SH3BP2-218ENST00000511185 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP29.66■■■□□ 2.34
SH3BP2-218ENST00000511185 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP29.65■■■□□ 2.34
SH3BP2-218ENST00000511185 ADGBQ8N7X0 1667 aa29.63■■■□□ 2.33
SH3BP2-218ENST00000511185 MBD5Q9P267 1494 aa29.62■■■□□ 2.33
SH3BP2-218ENST00000511185 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP29.62■■■□□ 2.33
SH3BP2-218ENST00000511185 PLXNC1O60486 1568 aa29.58■■■□□ 2.33
SH3BP2-218ENST00000511185 MYT1LQ9UL68 1186 aa29.58■■■□□ 2.33
SH3BP2-218ENST00000511185 AGLP35573 1532 aa29.55■■■□□ 2.32
SH3BP2-218ENST00000511185 ARHGEF5Q12774 1597 aa29.55■■■□□ 2.32
SH3BP2-218ENST00000511185 MLECQ14165 292 aa29.54■■■□□ 2.32
SH3BP2-218ENST00000511185 CCDC141Q6ZP82 1450 aa29.53■■■□□ 2.32
SH3BP2-218ENST00000511185 MYOM3Q5VTT5 1437 aa29.53■■■□□ 2.32
SH3BP2-218ENST00000511185 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP29.51■■■□□ 2.32
SH3BP2-218ENST00000511185 CROCC2H7BZ55 1655 aa29.5■■■□□ 2.31
SH3BP2-218ENST00000511185 PTPN23Q9H3S7 1636 aa29.47■■■□□ 2.31
SH3BP2-218ENST00000511185 C3P01024 1663 aa29.47■■■□□ 2.31
SH3BP2-218ENST00000511185 A2MP01023 1474 aa29.43■■■□□ 2.3
SH3BP2-218ENST00000511185 MIA2Q96PC5 1412 aa29.42■■■□□ 2.3
SH3BP2-218ENST00000511185 MAST1Q9Y2H9 1570 aa29.41■■■□□ 2.3
SH3BP2-218ENST00000511185 APLP2Q06481 763 aa29.4■■■□□ 2.3
SH3BP2-218ENST00000511185 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP29.4■■■□□ 2.3
SH3BP2-218ENST00000511185 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa29.38■■■□□ 2.29
SH3BP2-218ENST00000511185 PLPPR3Q6T4P5 718 aa29.38■■■□□ 2.29
SH3BP2-218ENST00000511185 MROH2AA6NES4 1674 aa29.37■■■□□ 2.29
SH3BP2-218ENST00000511185 PREX1Q8TCU6 1659 aa29.37■■■□□ 2.29
SH3BP2-218ENST00000511185 LMTK3Q96Q04 1460 aa29.36■■■□□ 2.29
SH3BP2-218ENST00000511185 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP29.34■■■□□ 2.29
SH3BP2-218ENST00000511185 FGD6Q6ZV73 1430 aa29.34■■■□□ 2.29
SH3BP2-218ENST00000511185 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP29.31■■■□□ 2.28
SH3BP2-218ENST00000511185 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP29.25■■■□□ 2.27
SH3BP2-218ENST00000511185 SHANK2Q9UPX8 1470 aa29.24■■■□□ 2.27
SH3BP2-218ENST00000511185 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP29.23■■■□□ 2.27
SH3BP2-218ENST00000511185 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP29.23■■■□□ 2.27
SH3BP2-218ENST00000511185 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP29.23■■■□□ 2.27
SH3BP2-218ENST00000511185 ABCC5O15440 1437 aa29.22■■■□□ 2.27
SH3BP2-218ENST00000511185 DAPK1P53355 1430 aa29.21■■■□□ 2.27
SH3BP2-218ENST00000511185 CNTLNQ9NXG0 1405 aa29.21■■■□□ 2.27
SH3BP2-218ENST00000511185 RSPH4AQ5TD94 716 aa29.21■■■□□ 2.27
SH3BP2-218ENST00000511185 MROH1Q8NDA8 1641 aa29.19■■■□□ 2.26
SH3BP2-218ENST00000511185 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP29.17■■■□□ 2.26
SH3BP2-218ENST00000511185 CEP152O94986 1710 aa29.16■■■□□ 2.26
SH3BP2-218ENST00000511185 MYO3AQ8NEV4 1616 aa29.15■■■□□ 2.26
SH3BP2-218ENST00000511185 KDM5DQ9BY66 1539 aa29.15■■■□□ 2.26
SH3BP2-218ENST00000511185 TSPY4P0CV99 314 aa29.14■■■□□ 2.26
SH3BP2-218ENST00000511185 TSPY10P0CW01 314 aa29.14■■■□□ 2.26
SH3BP2-218ENST00000511185 GGT6Q6P531 493 aa29.13■■■□□ 2.25
SH3BP2-218ENST00000511185 DUOX2Q9NRD8 1548 aa29.13■■■□□ 2.25
SH3BP2-218ENST00000511185 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP29.12■■■□□ 2.25
SH3BP2-218ENST00000511185 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP29.11■■■□□ 2.25
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