RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000510193.1

SH3BP2-216, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

TSL 3

Gene SH3BP2, Length 407 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-216ENST00000510193 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP20.74■□□□□ 0.91
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SH3BP2-216ENST00000510193 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa20.72■□□□□ 0.91
SH3BP2-216ENST00000510193 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa20.71■□□□□ 0.91
SH3BP2-216ENST00000510193 HECW2Q9P2P5 1572 aa20.71■□□□□ 0.91
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SH3BP2-216ENST00000510193 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa20.42■□□□□ 0.86
SH3BP2-216ENST00000510193 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP20.42■□□□□ 0.86
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SH3BP2-216ENST00000510193 A2MP01023 1474 aa20.28■□□□□ 0.84
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SH3BP2-216ENST00000510193 STRCQ7RTU9 1775 aa20.16■□□□□ 0.82
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SH3BP2-216ENST00000510193 NPATQ14207 1427 aa20.13■□□□□ 0.81
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SH3BP2-216ENST00000510193 FAM135AQ9P2D6 1515 aa20.06■□□□□ 0.8
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SH3BP2-216ENST00000510193 KDM5DQ9BY66 1539 aa20.05■□□□□ 0.8
SH3BP2-216ENST00000510193 CROCC2H7BZ55 1655 aa20.04■□□□□ 0.8
SH3BP2-216ENST00000510193 NCOA1Q15788 1441 aa20.04■□□□□ 0.8
SH3BP2-216ENST00000510193 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP20.04■□□□□ 0.8
SH3BP2-216ENST00000510193 PTPN23Q9H3S7 1636 aa20.04■□□□□ 0.8
SH3BP2-216ENST00000510193 KIF3BO15066 747 aa20.03■□□□□ 0.8
SH3BP2-216ENST00000510193 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP20.03■□□□□ 0.8
SH3BP2-216ENST00000510193 FBXO41Q8TF61 875 aa20.02■□□□□ 0.8
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