RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000509368.6

PDE4D-218, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PDE4D, Length 2,809 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-218ENST00000509368 ZSWIM6Q9HCJ5 1215 aa4.57□□□□□ -1.68
PDE4D-218ENST00000509368 RIOK3O14730 519 aaKnown RBP4.55□□□□□ -1.68
PDE4D-218ENST00000509368 ZNF710Q8N1W2 664 aa4.55□□□□□ -1.68
PDE4D-218ENST00000509368 LAPTM4AQ15012 233 aa4.55□□□□□ -1.68
PDE4D-218ENST00000509368 STK25O00506 426 aa4.54□□□□□ -1.68
PDE4D-218ENST00000509368 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP4.54□□□□□ -1.68
PDE4D-218ENST00000509368 TMEM106CQ9BVX2 250 aa4.54□□□□□ -1.68
PDE4D-218ENST00000509368 PRKCSHP14314 528 aaPredicted RBP4.54□□□□□ -1.68
PDE4D-218ENST00000509368 CFAP44Q96MT7 982 aa4.54□□□□□ -1.68
PDE4D-218ENST00000509368 TPRNQ4KMQ1 711 aa4.53□□□□□ -1.68
PDE4D-218ENST00000509368 PAXIP1Q6ZW49 1069 aaPredicted RBP4.53□□□□□ -1.68
PDE4D-218ENST00000509368 CHRM1P11229 460 aaPredicted RBP4.52□□□□□ -1.69
PDE4D-218ENST00000509368 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa4.52□□□□□ -1.69
PDE4D-218ENST00000509368 HS6ST3Q8IZP7 471 aa4.52□□□□□ -1.69
PDE4D-218ENST00000509368 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa4.52□□□□□ -1.69
PDE4D-218ENST00000509368 STK24Q9Y6E0 443 aa4.52□□□□□ -1.69
PDE4D-218ENST00000509368 SPRYD3Q8NCJ5 442 aa4.51□□□□□ -1.69
PDE4D-218ENST00000509368 TRIM41Q8WV44 630 aa4.51□□□□□ -1.69
PDE4D-218ENST00000509368 PBX2P40425 430 aa4.5□□□□□ -1.69
PDE4D-218ENST00000509368 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa4.5□□□□□ -1.69
PDE4D-218ENST00000509368 VGFO15240 615 aaPredicted RBP4.49□□□□□ -1.69
PDE4D-218ENST00000509368 GTPBP6O43824 516 aaPredicted RBP4.49□□□□□ -1.69
PDE4D-218ENST00000509368 PSEN1P49768 467 aa4.49□□□□□ -1.69
PDE4D-218ENST00000509368 CABP2Q9NPB3 220 aa4.48□□□□□ -1.69
PDE4D-218ENST00000509368 MFRPQ9BY79 579 aa4.47□□□□□ -1.69
PDE4D-218ENST00000509368 PPP1R37O75864 691 aa4.47□□□□□ -1.69
PDE4D-218ENST00000509368 VARS2Q5ST30 1063 aaKnown RBP4.47□□□□□ -1.69
PDE4D-218ENST00000509368 EFCAB3Q8N7B9 438 aa4.47□□□□□ -1.69
PDE4D-218ENST00000509368 G3V3G9 751 aa4.46□□□□□ -1.69
PDE4D-218ENST00000509368 HOXB3P14651 431 aaPredicted RBP4.46□□□□□ -1.7
PDE4D-218ENST00000509368 PDAP1Q13442 181 aaKnown RBP4.46□□□□□ -1.7
PDE4D-218ENST00000509368 NBR1Q14596 966 aa4.46□□□□□ -1.7
PDE4D-218ENST00000509368 ZNF467Q7Z7K2 595 aaPredicted RBP4.46□□□□□ -1.7
PDE4D-218ENST00000509368 ARXQ96QS3 562 aa4.46□□□□□ -1.7
PDE4D-218ENST00000509368 PHF8Q9UPP1 1060 aa4.45□□□□□ -1.7
PDE4D-218ENST00000509368 CADPS2Q86UW7 1296 aa4.45□□□□□ -1.7
PDE4D-218ENST00000509368 MS4A4AQ96JQ5 239 aa4.44□□□□□ -1.7
PDE4D-218ENST00000509368 LSM11P83369 360 aaKnown RBP eCLIP4.44□□□□□ -1.7
PDE4D-218ENST00000509368 Q6ZNB5 142 aa4.43□□□□□ -1.7
PDE4D-218ENST00000509368 ANKRD13DQ6ZTN6 518 aa4.43□□□□□ -1.7
PDE4D-218ENST00000509368 FBXO22Q8NEZ5 403 aa4.43□□□□□ -1.7
PDE4D-218ENST00000509368 A0A0G2JS52 829 aa4.42□□□□□ -1.7
PDE4D-218ENST00000509368 LOC100996750A0A140TA64 210 aa4.42□□□□□ -1.7
PDE4D-218ENST00000509368 DPY19L2Q6NUT2 758 aa4.42□□□□□ -1.7
PDE4D-218ENST00000509368 KRTAP4-6Q9BYQ5 205 aa4.42□□□□□ -1.7
PDE4D-218ENST00000509368 TMEM132AQ24JP5 1023 aa4.4□□□□□ -1.7
PDE4D-218ENST00000509368 MKRN3Q13064 507 aaKnown RBP4.4□□□□□ -1.7
PDE4D-218ENST00000509368 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa4.39□□□□□ -1.71
PDE4D-218ENST00000509368 GOLGA2Q08379 1002 aa4.39□□□□□ -1.71
PDE4D-218ENST00000509368 DAXXQ9UER7 740 aaPredicted RBP4.39□□□□□ -1.71
PDE4D-218ENST00000509368 PDCD7Q8N8D1 485 aaKnown RBP4.38□□□□□ -1.71
PDE4D-218ENST00000509368 RYDENQ9NUL5 291 aaKnown RBP4.38□□□□□ -1.71
PDE4D-218ENST00000509368 TK2O00142 265 aa4.36□□□□□ -1.71
PDE4D-218ENST00000509368 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa4.35□□□□□ -1.71
PDE4D-218ENST00000509368 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP4.35□□□□□ -1.71
PDE4D-218ENST00000509368 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa4.35□□□□□ -1.71
PDE4D-218ENST00000509368 TRAF7Q6Q0C0 670 aa4.35□□□□□ -1.71
PDE4D-218ENST00000509368 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP4.34□□□□□ -1.713e-6■■■■□ 25.8
PDE4D-218ENST00000509368 TULP1O00294 542 aaPredicted RBP4.33□□□□□ -1.72
PDE4D-218ENST00000509368 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP4.33□□□□□ -1.72
PDE4D-218ENST00000509368 P3H3Q8IVL6 736 aa4.33□□□□□ -1.72
PDE4D-218ENST00000509368 SOX12O15370 315 aa4.32□□□□□ -1.72
PDE4D-218ENST00000509368 STK17AQ9UEE5 414 aa4.32□□□□□ -1.72
PDE4D-218ENST00000509368 NLRP6P59044 892 aa4.32□□□□□ -1.72
PDE4D-218ENST00000509368 TMEM92Q6UXU6 159 aa4.32□□□□□ -1.72
PDE4D-218ENST00000509368 HOMEZQ8IX15 550 aa4.31□□□□□ -1.72
PDE4D-218ENST00000509368 STAC3Q96MF2 364 aa4.31□□□□□ -1.72
PDE4D-218ENST00000509368 KCNV2Q8TDN2 545 aa4.31□□□□□ -1.72
PDE4D-218ENST00000509368 BOLA1Q9Y3E2 137 aa4.31□□□□□ -1.72
PDE4D-218ENST00000509368 ZNF787Q6DD87 383 aa4.3□□□□□ -1.72
PDE4D-218ENST00000509368 MICALL2Q8IY33 904 aa4.3□□□□□ -1.72
PDE4D-218ENST00000509368 PSDA5PKW4 1024 aaPredicted RBP4.29□□□□□ -1.72
PDE4D-218ENST00000509368 GPR153Q6NV75 609 aa4.29□□□□□ -1.72
PDE4D-218ENST00000509368 CRISPLD2Q9H0B8 497 aa4.28□□□□□ -1.72
PDE4D-218ENST00000509368 LARP6Q9BRS8 491 aaKnown RBP4.27□□□□□ -1.73
PDE4D-218ENST00000509368 NRG2O14511 850 aaPredicted RBP4.26□□□□□ -1.73
PDE4D-218ENST00000509368 DSG2Q14126 1118 aa4.26□□□□□ -1.73
PDE4D-218ENST00000509368 C2orf72A6NCS6 295 aa4.26□□□□□ -1.73
PDE4D-218ENST00000509368 ADGRD1Q6QNK2 874 aa4.25□□□□□ -1.73
PDE4D-218ENST00000509368 C14orf37Q86TY3 774 aa4.25□□□□□ -1.73
PDE4D-218ENST00000509368 EMILIN3Q9NT22 766 aa4.25□□□□□ -1.73
PDE4D-218ENST00000509368 KIF3CO14782 793 aa4.24□□□□□ -1.73
PDE4D-218ENST00000509368 ARHGAP33O14559 1287 aa4.23□□□□□ -1.73
PDE4D-218ENST00000509368 SEMA3EO15041 775 aa4.23□□□□□ -1.73
PDE4D-218ENST00000509368 DDX27Q96GQ7 796 aaKnown RBP4.22□□□□□ -1.73
PDE4D-218ENST00000509368 GPHNQ9NQX3 736 aaPredicted RBP4.22□□□□□ -1.73
PDE4D-218ENST00000509368 MFSD10Q14728 455 aa4.22□□□□□ -1.73
PDE4D-218ENST00000509368 ZNF775Q96BV0 537 aaPredicted RBP4.22□□□□□ -1.73
PDE4D-218ENST00000509368 PPP1R15BQ5SWA1 713 aa4.22□□□□□ -1.73
PDE4D-218ENST00000509368 DHX30Q7L2E3 1194 aaKnown RBP eCLIP4.22□□□□□ -1.73
PDE4D-218ENST00000509368 E2F4Q16254 413 aa4.21□□□□□ -1.74
PDE4D-218ENST00000509368 WDR70Q9NW82 654 aa4.21□□□□□ -1.74
PDE4D-218ENST00000509368 HRO43593 1189 aa4.21□□□□□ -1.74
PDE4D-218ENST00000509368 DPYSL4O14531 572 aa4.2□□□□□ -1.74
PDE4D-218ENST00000509368 UPF1Q92900 1129 aaKnown RBP eCLIP4.2□□□□□ -1.74
PDE4D-218ENST00000509368 MLLT3P42568 568 aaPredicted RBP4.2□□□□□ -1.74
PDE4D-218ENST00000509368 INSM1Q01101 510 aaPredicted RBP4.2□□□□□ -1.74
PDE4D-218ENST00000509368 LMOD2Q6P5Q4 547 aa4.2□□□□□ -1.74
PDE4D-218ENST00000509368 GFRA3O60609 400 aa4.19□□□□□ -1.74
PDE4D-218ENST00000509368 PDE4AP27815 886 aa4.19□□□□□ -1.74
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