RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000509355.5

PDE4D-217, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PDE4D, Length 847 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-217ENST00000509355 PCDH10Q9P2E7 1040 aa13.75□□□□□ -0.21
PDE4D-217ENST00000509355 GTPBP6O43824 516 aaPredicted RBP13.7□□□□□ -0.22
PDE4D-217ENST00000509355 MARVELD3Q96A59 401 aa13.7□□□□□ -0.22
PDE4D-217ENST00000509355 C2orf72A6NCS6 295 aa13.68□□□□□ -0.22
PDE4D-217ENST00000509355 RYDENQ9NUL5 291 aaKnown RBP13.67□□□□□ -0.22
PDE4D-217ENST00000509355 DOK7Q18PE1 504 aa13.66□□□□□ -0.22
PDE4D-217ENST00000509355 CDAN1Q8IWY9 1227 aa13.66□□□□□ -0.22
PDE4D-217ENST00000509355 DCAF8L2P0C7V8 631 aa13.65□□□□□ -0.22
PDE4D-217ENST00000509355 ZNF710Q8N1W2 664 aa13.64□□□□□ -0.23
PDE4D-217ENST00000509355 HOXB1P14653 301 aaPredicted RBP13.63□□□□□ -0.23
PDE4D-217ENST00000509355 EMP3P54852 163 aa13.61□□□□□ -0.23
PDE4D-217ENST00000509355 GPR153Q6NV75 609 aa13.6□□□□□ -0.23
PDE4D-217ENST00000509355 ZSWIM6Q9HCJ5 1215 aa13.6□□□□□ -0.23
PDE4D-217ENST00000509355 POTEB3A0JP26 581 aa13.58□□□□□ -0.24
PDE4D-217ENST00000509355 POTEBQ6S5H4 581 aa13.58□□□□□ -0.24
PDE4D-217ENST00000509355 TMC2Q8TDI7 906 aa13.57□□□□□ -0.24
PDE4D-217ENST00000509355 GPHNQ9NQX3 736 aaPredicted RBP13.57□□□□□ -0.24
PDE4D-217ENST00000509355 RIMBP2O15034 1052 aa13.55□□□□□ -0.24
PDE4D-217ENST00000509355 FAM205CA6NFA0 338 aa13.54□□□□□ -0.24
PDE4D-217ENST00000509355 SLC34A2O95436 690 aa13.54□□□□□ -0.24
PDE4D-217ENST00000509355 FOXK1P85037 733 aa13.53□□□□□ -0.24
PDE4D-217ENST00000509355 BBXQ8WY36 941 aaPredicted RBP13.53□□□□□ -0.24
PDE4D-217ENST00000509355 CRISPLD2Q9H0B8 497 aa13.52□□□□□ -0.25
PDE4D-217ENST00000509355 HS3ST6Q96QI5 342 aa13.49□□□□□ -0.25
PDE4D-217ENST00000509355 DSG2Q14126 1118 aa13.48□□□□□ -0.25
PDE4D-217ENST00000509355 ARSIQ5FYB1 569 aa13.48□□□□□ -0.25
PDE4D-217ENST00000509355 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa13.47□□□□□ -0.25
PDE4D-217ENST00000509355 PLPP6Q8IY26 295 aa13.45□□□□□ -0.26
PDE4D-217ENST00000509355 KHSRPQ92945 711 aaKnown RBP eCLIP13.45□□□□□ -0.265e-6■□□□□ 9
PDE4D-217ENST00000509355 ERBB3P21860 1342 aa13.44□□□□□ -0.26
PDE4D-217ENST00000509355 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa13.42□□□□□ -0.26
PDE4D-217ENST00000509355 PTCD2Q8WV60 388 aaKnown RBP13.42□□□□□ -0.26
PDE4D-217ENST00000509355 PCDHGA4Q9Y5G9 962 aa13.42□□□□□ -0.26
PDE4D-217ENST00000509355 CADPS2Q86UW7 1296 aa13.4□□□□□ -0.26
PDE4D-217ENST00000509355 PDE4AP27815 886 aa13.39□□□□□ -0.27
PDE4D-217ENST00000509355 KRTAP3-3Q9BYR6 98 aa13.39□□□□□ -0.27
PDE4D-217ENST00000509355 KRTAP3-2Q9BYR7 98 aa13.39□□□□□ -0.27
PDE4D-217ENST00000509355 MFSD10Q14728 455 aa13.37□□□□□ -0.27
PDE4D-217ENST00000509355 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP13.36□□□□□ -0.27
PDE4D-217ENST00000509355 VARS2Q5ST30 1063 aaKnown RBP13.36□□□□□ -0.27
PDE4D-217ENST00000509355 NUDT7P0C024 238 aa13.35□□□□□ -0.27
PDE4D-217ENST00000509355 PPP1R15BQ5SWA1 713 aa13.35□□□□□ -0.27
PDE4D-217ENST00000509355 SPRYD3Q8NCJ5 442 aa13.34□□□□□ -0.27
PDE4D-217ENST00000509355 OXER1Q8TDS5 423 aa13.33□□□□□ -0.28
PDE4D-217ENST00000509355 ZNF687Q8N1G0 1237 aa13.32□□□□□ -0.28
PDE4D-217ENST00000509355 LARP6Q9BRS8 491 aaKnown RBP13.32□□□□□ -0.28
PDE4D-217ENST00000509355 ZBTB4Q9P1Z0 1013 aaPredicted RBP13.31□□□□□ -0.28
PDE4D-217ENST00000509355 SPNS2Q8IVW8 549 aa13.3□□□□□ -0.28
PDE4D-217ENST00000509355 LHX6Q9UPM6 363 aa13.29□□□□□ -0.28
PDE4D-217ENST00000509355 DDX27Q96GQ7 796 aaKnown RBP13.28□□□□□ -0.28
PDE4D-217ENST00000509355 TBC1D12O60347 775 aa13.23□□□□□ -0.29
PDE4D-217ENST00000509355 MMRN1Q13201 1228 aa13.23□□□□□ -0.29
PDE4D-217ENST00000509355 PAXIP1Q6ZW49 1069 aaPredicted RBP13.23□□□□□ -0.29
PDE4D-217ENST00000509355 POTEEQ6S8J3 1075 aa13.21□□□□□ -0.29
PDE4D-217ENST00000509355 UPF1Q92900 1129 aaKnown RBP eCLIP13.2□□□□□ -0.3
PDE4D-217ENST00000509355 EMILIN3Q9NT22 766 aa13.2□□□□□ -0.3
PDE4D-217ENST00000509355 CAMK2BQ13554 666 aa13.19□□□□□ -0.3
PDE4D-217ENST00000509355 CFAP44Q96MT7 982 aa13.19□□□□□ -0.3
PDE4D-217ENST00000509355 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP13.18□□□□□ -0.3
PDE4D-217ENST00000509355 PSDA5PKW4 1024 aaPredicted RBP13.17□□□□□ -0.3
PDE4D-217ENST00000509355 PBX2P40425 430 aa13.12□□□□□ -0.31
PDE4D-217ENST00000509355 ANKRD13DQ6ZTN6 518 aa13.1□□□□□ -0.31
PDE4D-217ENST00000509355 EVI5O60447 810 aa13.09□□□□□ -0.31
PDE4D-217ENST00000509355 FOSBP53539 338 aa13.07□□□□□ -0.32
PDE4D-217ENST00000509355 MAP3K9P80192 1104 aa13.07□□□□□ -0.32
PDE4D-217ENST00000509355 LSM11P83369 360 aaKnown RBP eCLIP13.07□□□□□ -0.32
PDE4D-217ENST00000509355 AXIN2Q9Y2T1 843 aa13.07□□□□□ -0.32
PDE4D-217ENST00000509355 ARHGAP33O14559 1287 aa13.05□□□□□ -0.32
PDE4D-217ENST00000509355 PPP4R3BQ5MIZ7 849 aa13.05□□□□□ -0.32
PDE4D-217ENST00000509355 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa13.02□□□□□ -0.33
PDE4D-217ENST00000509355 JPH4Q96JJ6 628 aa13.01□□□□□ -0.33
PDE4D-217ENST00000509355 DPYSL4O14531 572 aa13□□□□□ -0.33
PDE4D-217ENST00000509355 ZNF454Q8N9F8 522 aa13□□□□□ -0.33
PDE4D-217ENST00000509355 ARIH1Q9Y4X5 557 aaPredicted RBP13□□□□□ -0.33
PDE4D-217ENST00000509355 PSEN2P49810 448 aa12.99□□□□□ -0.33
PDE4D-217ENST00000509355 DMRTA1Q5VZB9 504 aa12.99□□□□□ -0.33
PDE4D-217ENST00000509355 BCL2L12Q9HB09 334 aa12.99□□□□□ -0.33
PDE4D-217ENST00000509355 MYT1LQ9UL68 1186 aa12.98□□□□□ -0.33
PDE4D-217ENST00000509355 E2F4Q16254 413 aa12.97□□□□□ -0.33
PDE4D-217ENST00000509355 PTGER2P43116 358 aa12.96□□□□□ -0.33
PDE4D-217ENST00000509355 RNF166Q96A37 237 aaPredicted RBP12.96□□□□□ -0.33
PDE4D-217ENST00000509355 PCDHGA10Q9Y5H3 936 aa12.96□□□□□ -0.33
PDE4D-217ENST00000509355 TK2O00142 265 aa12.95□□□□□ -0.34
PDE4D-217ENST00000509355 ZDHHC16Q969W1 377 aa12.94□□□□□ -0.34
PDE4D-217ENST00000509355 ADAM33Q9BZ11 813 aa12.94□□□□□ -0.34
PDE4D-217ENST00000509355 ADGRD1Q6QNK2 874 aa12.93□□□□□ -0.34
PDE4D-217ENST00000509355 HRO43593 1189 aa12.92□□□□□ -0.34
PDE4D-217ENST00000509355 PDIA6Q15084 440 aa12.92□□□□□ -0.34
PDE4D-217ENST00000509355 PHF14O94880 888 aa12.91□□□□□ -0.34
PDE4D-217ENST00000509355 KCNK17Q96T54 332 aa12.91□□□□□ -0.34
PDE4D-217ENST00000509355 WDR70Q9NW82 654 aa12.91□□□□□ -0.34
PDE4D-217ENST00000509355 PLCB2Q00722 1185 aa12.9□□□□□ -0.34
PDE4D-217ENST00000509355 SLC4A5Q9BY07 1137 aa12.89□□□□□ -0.35
PDE4D-217ENST00000509355 SPDYE16A6NNV3 312 aaPredicted RBP12.88□□□□□ -0.35
PDE4D-217ENST00000509355 PTPREP23469 700 aa12.87□□□□□ -0.35
PDE4D-217ENST00000509355 TYW1BQ6NUM6 668 aa12.87□□□□□ -0.35
PDE4D-217ENST00000509355 KCNH8Q96L42 1107 aa12.87□□□□□ -0.35
PDE4D-217ENST00000509355 FBXW7Q969H0 707 aa12.86□□□□□ -0.35
PDE4D-217ENST00000509355 VPS9D1Q9Y2B5 631 aa12.86□□□□□ -0.35
PDE4D-217ENST00000509355 EPAS1Q99814 870 aa12.84□□□□□ -0.35
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