RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000503051.1

USP46-AS1-201, USP46 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene USP46-AS1, Length 1,048 nt, Biotype lincRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP46-AS1-201ENST00000503051 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa30.83■■■□□ 2.53
USP46-AS1-201ENST00000503051 PREX2Q70Z35 1606 aa30.83■■■□□ 2.53
USP46-AS1-201ENST00000503051 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa30.79■■■□□ 2.52
USP46-AS1-201ENST00000503051 SCAPERQ9BY12 1400 aa30.79■■■□□ 2.52
USP46-AS1-201ENST00000503051 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa30.78■■■□□ 2.52
USP46-AS1-201ENST00000503051 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa30.78■■■□□ 2.52
USP46-AS1-201ENST00000503051 POGZQ7Z3K3 1410 aa30.78■■■□□ 2.52
USP46-AS1-201ENST00000503051 BCORL1Q5H9F3 1711 aa30.75■■■□□ 2.51
USP46-AS1-201ENST00000503051 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP30.72■■■□□ 2.51
USP46-AS1-201ENST00000503051 ADAMTSL3P82987 1691 aa30.71■■■□□ 2.51
USP46-AS1-201ENST00000503051 MAGI2Q86UL8 1455 aa30.71■■■□□ 2.51
USP46-AS1-201ENST00000503051 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa30.69■■■□□ 2.5
USP46-AS1-201ENST00000503051 ITSN2Q9NZM3 1697 aa30.68■■■□□ 2.5
USP46-AS1-201ENST00000503051 YEATS2Q9ULM3 1422 aa30.66■■■□□ 2.5
USP46-AS1-201ENST00000503051 ABCC1P33527 1531 aa30.66■■■□□ 2.5
USP46-AS1-201ENST00000503051 MTUS2Q5JR59 1369 aa30.66■■■□□ 2.5
USP46-AS1-201ENST00000503051 MADDQ8WXG6 1647 aa30.65■■■□□ 2.5
USP46-AS1-201ENST00000503051 KDM5CP41229 1560 aa30.63■■■□□ 2.49
USP46-AS1-201ENST00000503051 HECW2Q9P2P5 1572 aa30.63■■■□□ 2.49
USP46-AS1-201ENST00000503051 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa30.63■■■□□ 2.49
USP46-AS1-201ENST00000503051 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa30.61■■■□□ 2.49
USP46-AS1-201ENST00000503051 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP30.61■■■□□ 2.49
USP46-AS1-201ENST00000503051 VPS8Q8N3P4 1428 aa30.57■■■□□ 2.48
USP46-AS1-201ENST00000503051 MYT1LQ9UL68 1186 aa30.57■■■□□ 2.48
USP46-AS1-201ENST00000503051 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa30.56■■■□□ 2.48
USP46-AS1-201ENST00000503051 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa30.56■■■□□ 2.48
USP46-AS1-201ENST00000503051 C9orf84Q5VXU9 1444 aa30.56■■■□□ 2.48
USP46-AS1-201ENST00000503051 PTPRMP28827 1452 aa30.55■■■□□ 2.48
USP46-AS1-201ENST00000503051 ATP10AO60312 1499 aa30.54■■■□□ 2.48
USP46-AS1-201ENST00000503051 CCNB3Q8WWL7 1395 aa30.54■■■□□ 2.48
USP46-AS1-201ENST00000503051 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP30.53■■■□□ 2.48
USP46-AS1-201ENST00000503051 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP30.52■■■□□ 2.48
USP46-AS1-201ENST00000503051 AFAP1Q8N556 730 aa30.51■■■□□ 2.47
USP46-AS1-201ENST00000503051 SYCP2Q9BX26 1530 aa30.51■■■□□ 2.47
USP46-AS1-201ENST00000503051 ABCA6Q8N139 1617 aa30.51■■■□□ 2.47
USP46-AS1-201ENST00000503051 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP30.5■■■□□ 2.47
USP46-AS1-201ENST00000503051 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa30.5■■■□□ 2.47
USP46-AS1-201ENST00000503051 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa30.5■■■□□ 2.47
USP46-AS1-201ENST00000503051 TIAM1Q13009 1591 aa30.49■■■□□ 2.47
USP46-AS1-201ENST00000503051 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa30.48■■■□□ 2.47
USP46-AS1-201ENST00000503051 MLH3Q9UHC1 1453 aa30.45■■■□□ 2.47
USP46-AS1-201ENST00000503051 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa30.45■■■□□ 2.46
USP46-AS1-201ENST00000503051 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa30.44■■■□□ 2.46
USP46-AS1-201ENST00000503051 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP30.44■■■□□ 2.46
USP46-AS1-201ENST00000503051 MLECQ14165 292 aa30.43■■■□□ 2.46
USP46-AS1-201ENST00000503051 REREQ9P2R6 1566 aa30.42■■■□□ 2.46
USP46-AS1-201ENST00000503051 NCOA2Q15596 1464 aa30.36■■■□□ 2.45
USP46-AS1-201ENST00000503051 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa30.35■■■□□ 2.45
USP46-AS1-201ENST00000503051 ATP7AQ04656 1500 aa30.33■■■□□ 2.45
USP46-AS1-201ENST00000503051 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP30.33■■■□□ 2.45
USP46-AS1-201ENST00000503051 PLPPR3Q6T4P5 718 aa30.33■■■□□ 2.45
USP46-AS1-201ENST00000503051 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP30.32■■■□□ 2.45
USP46-AS1-201ENST00000503051 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP30.3■■■□□ 2.44
USP46-AS1-201ENST00000503051 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa30.3■■■□□ 2.44
USP46-AS1-201ENST00000503051 MAP3K1Q13233 1512 aa30.29■■■□□ 2.44
USP46-AS1-201ENST00000503051 AGLP35573 1532 aa30.28■■■□□ 2.44
USP46-AS1-201ENST00000503051 ADGBQ8N7X0 1667 aa30.25■■■□□ 2.43
USP46-AS1-201ENST00000503051 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa30.24■■■□□ 2.43
USP46-AS1-201ENST00000503051 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP30.22■■■□□ 2.43
USP46-AS1-201ENST00000503051 LMTK3Q96Q04 1460 aa30.2■■■□□ 2.43
USP46-AS1-201ENST00000503051 PREX1Q8TCU6 1659 aa30.18■■■□□ 2.42
USP46-AS1-201ENST00000503051 MBD5Q9P267 1494 aa30.18■■■□□ 2.42
USP46-AS1-201ENST00000503051 PLXNC1O60486 1568 aa30.17■■■□□ 2.42
USP46-AS1-201ENST00000503051 APLP2Q06481 763 aa30.17■■■□□ 2.42
USP46-AS1-201ENST00000503051 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP30.17■■■□□ 2.42
USP46-AS1-201ENST00000503051 CCDC141Q6ZP82 1450 aa30.17■■■□□ 2.42
USP46-AS1-201ENST00000503051 C3P01024 1663 aa30.17■■■□□ 2.42
USP46-AS1-201ENST00000503051 A2MP01023 1474 aa30.16■■■□□ 2.42
USP46-AS1-201ENST00000503051 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP30.14■■■□□ 2.42
USP46-AS1-201ENST00000503051 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP30.12■■■□□ 2.41
USP46-AS1-201ENST00000503051 ARHGEF5Q12774 1597 aa30.11■■■□□ 2.41
USP46-AS1-201ENST00000503051 MROH2AA6NES4 1674 aa30.11■■■□□ 2.41
USP46-AS1-201ENST00000503051 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa30.09■■■□□ 2.41
USP46-AS1-201ENST00000503051 CNTLNQ9NXG0 1405 aa30.09■■■□□ 2.41
USP46-AS1-201ENST00000503051 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP30.07■■■□□ 2.41
USP46-AS1-201ENST00000503051 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP30.07■■■□□ 2.4
USP46-AS1-201ENST00000503051 MYOM3Q5VTT5 1437 aa30.06■■■□□ 2.4
USP46-AS1-201ENST00000503051 RSPH4AQ5TD94 716 aa30.04■■■□□ 2.4
USP46-AS1-201ENST00000503051 MIA2Q96PC5 1412 aa30.01■■■□□ 2.39
USP46-AS1-201ENST00000503051 HSPA2P54652 639 aa30■■■□□ 2.39
USP46-AS1-201ENST00000503051 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa29.99■■■□□ 2.39
USP46-AS1-201ENST00000503051 MAST1Q9Y2H9 1570 aa29.96■■■□□ 2.39
USP46-AS1-201ENST00000503051 TSPY4P0CV99 314 aa29.96■■■□□ 2.39
USP46-AS1-201ENST00000503051 TSPY10P0CW01 314 aa29.96■■■□□ 2.39
USP46-AS1-201ENST00000503051 PTPN23Q9H3S7 1636 aa29.96■■■□□ 2.39
USP46-AS1-201ENST00000503051 GGT6Q6P531 493 aa29.95■■■□□ 2.39
USP46-AS1-201ENST00000503051 CROCC2H7BZ55 1655 aa29.95■■■□□ 2.38
USP46-AS1-201ENST00000503051 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP29.94■■■□□ 2.38
USP46-AS1-201ENST00000503051 ZMYM3Q14202 1370 aa29.88■■■□□ 2.37
USP46-AS1-201ENST00000503051 NPATQ14207 1427 aa29.87■■■□□ 2.37
USP46-AS1-201ENST00000503051 KIF3BO15066 747 aa29.86■■■□□ 2.37
USP46-AS1-201ENST00000503051 PPP6R1Q9UPN7 881 aa29.85■■■□□ 2.37
USP46-AS1-201ENST00000503051 FGD6Q6ZV73 1430 aa29.84■■■□□ 2.37
USP46-AS1-201ENST00000503051 KDM5DQ9BY66 1539 aa29.84■■■□□ 2.37
USP46-AS1-201ENST00000503051 FAM135AQ9P2D6 1515 aa29.84■■■□□ 2.37
USP46-AS1-201ENST00000503051 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP29.84■■■□□ 2.37
USP46-AS1-201ENST00000503051 MYO3AQ8NEV4 1616 aa29.83■■■□□ 2.37
USP46-AS1-201ENST00000503051 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP29.82■■■□□ 2.36
USP46-AS1-201ENST00000503051 STRCQ7RTU9 1775 aa29.82■■■□□ 2.36
USP46-AS1-201ENST00000503051 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP29.81■■■□□ 2.36
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.4 ms