RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000498454.1

TTYH3-207, Transcript of tweety family member 3, humanhuman

TSL 2

Gene TTYH3, Length 587 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTYH3-207ENST00000498454 ARHGAP5Q13017 1502 aa32.77■■■□□ 2.84
TTYH3-207ENST00000498454 PHLDB1Q86UU1 1377 aa32.75■■■□□ 2.83
TTYH3-207ENST00000498454 MYOM3Q5VTT5 1437 aa32.73■■■□□ 2.83
TTYH3-207ENST00000498454 CFAP74Q9C0B2 1584 aa32.73■■■□□ 2.83
TTYH3-207ENST00000498454 FANCAO15360 1455 aa32.73■■■□□ 2.83
TTYH3-207ENST00000498454 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa32.71■■■□□ 2.83
TTYH3-207ENST00000498454 NEO1Q92859 1461 aa32.7■■■□□ 2.83
TTYH3-207ENST00000498454 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP32.7■■■□□ 2.83
TTYH3-207ENST00000498454 AKNAQ7Z591 1439 aa32.64■■■□□ 2.82
TTYH3-207ENST00000498454 MIA2Q96PC5 1412 aa32.64■■■□□ 2.82
TTYH3-207ENST00000498454 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa32.63■■■□□ 2.81
TTYH3-207ENST00000498454 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP32.62■■■□□ 2.81
TTYH3-207ENST00000498454 FGD6Q6ZV73 1430 aa32.61■■■□□ 2.81
TTYH3-207ENST00000498454 ADGRL1O94910 1474 aa32.58■■■□□ 2.81
TTYH3-207ENST00000498454 ABCC1P33527 1531 aa32.57■■■□□ 2.8
TTYH3-207ENST00000498454 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa32.56■■■□□ 2.8
TTYH3-207ENST00000498454 PTPN23Q9H3S7 1636 aa32.56■■■□□ 2.8
TTYH3-207ENST00000498454 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP32.55■■■□□ 2.8
TTYH3-207ENST00000498454 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa32.54■■■□□ 2.8
TTYH3-207ENST00000498454 SCAPERQ9BY12 1400 aa32.52■■■□□ 2.8
TTYH3-207ENST00000498454 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP32.51■■■□□ 2.79
TTYH3-207ENST00000498454 KDM6BO15054 1643 aa32.51■■■□□ 2.79
TTYH3-207ENST00000498454 SYCP2Q9BX26 1530 aa32.51■■■□□ 2.79
TTYH3-207ENST00000498454 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa32.51■■■□□ 2.79
TTYH3-207ENST00000498454 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa32.5■■■□□ 2.79
TTYH3-207ENST00000498454 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP32.49■■■□□ 2.79
TTYH3-207ENST00000498454 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP32.48■■■□□ 2.79
TTYH3-207ENST00000498454 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP32.47■■■□□ 2.79
TTYH3-207ENST00000498454 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP32.45■■■□□ 2.79
TTYH3-207ENST00000498454 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP32.45■■■□□ 2.795e-6■■□□□ 13.2
TTYH3-207ENST00000498454 RICTORQ6R327 1708 aa32.44■■■□□ 2.78
TTYH3-207ENST00000498454 MBD5Q9P267 1494 aa32.43■■■□□ 2.78
TTYH3-207ENST00000498454 POGZQ7Z3K3 1410 aa32.43■■■□□ 2.78
TTYH3-207ENST00000498454 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa32.42■■■□□ 2.78
TTYH3-207ENST00000498454 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa32.42■■■□□ 2.78
TTYH3-207ENST00000498454 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP32.41■■■□□ 2.78
TTYH3-207ENST00000498454 ARHGEF5Q12774 1597 aa32.41■■■□□ 2.78
TTYH3-207ENST00000498454 RAPGEF3O95398 923 aa32.4■■■□□ 2.78
TTYH3-207ENST00000498454 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa32.38■■■□□ 2.77
TTYH3-207ENST00000498454 CCDC141Q6ZP82 1450 aa32.35■■■□□ 2.77
TTYH3-207ENST00000498454 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP32.35■■■□□ 2.77
TTYH3-207ENST00000498454 AFAP1Q8N556 730 aa32.35■■■□□ 2.77
TTYH3-207ENST00000498454 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP32.34■■■□□ 2.77
TTYH3-207ENST00000498454 KDM5CP41229 1560 aa32.34■■■□□ 2.77
TTYH3-207ENST00000498454 RSPH4AQ5TD94 716 aa32.33■■■□□ 2.77
TTYH3-207ENST00000498454 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa32.31■■■□□ 2.76
TTYH3-207ENST00000498454 ABCC5O15440 1437 aa32.29■■■□□ 2.76
TTYH3-207ENST00000498454 DAPK1P53355 1430 aa32.29■■■□□ 2.76
TTYH3-207ENST00000498454 CROCC2H7BZ55 1655 aa32.28■■■□□ 2.76
TTYH3-207ENST00000498454 HECW2Q9P2P5 1572 aa32.26■■■□□ 2.75
TTYH3-207ENST00000498454 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP32.25■■■□□ 2.75
TTYH3-207ENST00000498454 MLH3Q9UHC1 1453 aa32.23■■■□□ 2.75
TTYH3-207ENST00000498454 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP32.23■■■□□ 2.75
TTYH3-207ENST00000498454 MAST1Q9Y2H9 1570 aa32.23■■■□□ 2.75
TTYH3-207ENST00000498454 TSPY4P0CV99 314 aa32.22■■■□□ 2.75
TTYH3-207ENST00000498454 TSPY10P0CW01 314 aa32.22■■■□□ 2.75
TTYH3-207ENST00000498454 SHANK2Q9UPX8 1470 aa32.22■■■□□ 2.75
TTYH3-207ENST00000498454 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa32.22■■■□□ 2.75
TTYH3-207ENST00000498454 MAGI2Q86UL8 1455 aa32.21■■■□□ 2.75
TTYH3-207ENST00000498454 ATP7AQ04656 1500 aa32.21■■■□□ 2.75
TTYH3-207ENST00000498454 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa32.21■■■□□ 2.75
TTYH3-207ENST00000498454 C9orf84Q5VXU9 1444 aa32.19■■■□□ 2.74
TTYH3-207ENST00000498454 MYT1LQ9UL68 1186 aa32.19■■■□□ 2.74
TTYH3-207ENST00000498454 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa32.18■■■□□ 2.74
TTYH3-207ENST00000498454 ITGAEP38570 1179 aa32.17■■■□□ 2.74
TTYH3-207ENST00000498454 PTPRKQ15262 1439 aa32.17■■■□□ 2.74
TTYH3-207ENST00000498454 YEATS2Q9ULM3 1422 aa32.17■■■□□ 2.74
TTYH3-207ENST00000498454 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa32.15■■■□□ 2.74
TTYH3-207ENST00000498454 ABCA6Q8N139 1617 aa32.13■■■□□ 2.73
TTYH3-207ENST00000498454 ADGBQ8N7X0 1667 aa32.12■■■□□ 2.73
TTYH3-207ENST00000498454 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa32.11■■■□□ 2.73
TTYH3-207ENST00000498454 CHIC2Q9UKJ5 165 aa32.11■■■□□ 2.73
TTYH3-207ENST00000498454 PLXNC1O60486 1568 aa32.09■■■□□ 2.73
TTYH3-207ENST00000498454 ADGRL2O95490 1459 aa32.09■■■□□ 2.73
TTYH3-207ENST00000498454 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa32.05■■■□□ 2.72
TTYH3-207ENST00000498454 ATP10AO60312 1499 aa32.04■■■□□ 2.72
TTYH3-207ENST00000498454 NCOA1Q15788 1441 aa32.02■■■□□ 2.72
TTYH3-207ENST00000498454 ROCK1Q13464 1354 aa32.02■■■□□ 2.72
TTYH3-207ENST00000498454 REREQ9P2R6 1566 aa31.99■■■□□ 2.71
TTYH3-207ENST00000498454 KIF15Q9NS87 1388 aa31.99■■■□□ 2.71
TTYH3-207ENST00000498454 A2MP01023 1474 aa31.98■■■□□ 2.71
TTYH3-207ENST00000498454 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP31.98■■■□□ 2.71
TTYH3-207ENST00000498454 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa31.98■■■□□ 2.71
TTYH3-207ENST00000498454 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa31.97■■■□□ 2.71
TTYH3-207ENST00000498454 DUOX2Q9NRD8 1548 aa31.95■■■□□ 2.71
TTYH3-207ENST00000498454 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa31.94■■■□□ 2.7
TTYH3-207ENST00000498454 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP31.94■■■□□ 2.7
TTYH3-207ENST00000498454 GCC2Q8IWJ2 1684 aa31.89■■■□□ 2.7
TTYH3-207ENST00000498454 AGLP35573 1532 aa31.88■■■□□ 2.69
TTYH3-207ENST00000498454 HFM1A2PYH4 1435 aa31.85■■■□□ 2.69
TTYH3-207ENST00000498454 NAIPQ13075 1403 aa31.85■■■□□ 2.69
TTYH3-207ENST00000498454 ERBINQ96RT1 1412 aa31.85■■■□□ 2.69
TTYH3-207ENST00000498454 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP31.84■■■□□ 2.69
TTYH3-207ENST00000498454 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa31.83■■■□□ 2.69
TTYH3-207ENST00000498454 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP31.82■■■□□ 2.68
TTYH3-207ENST00000498454 BCORL1Q5H9F3 1711 aa31.82■■■□□ 2.68
TTYH3-207ENST00000498454 KIF3BO15066 747 aa31.78■■■□□ 2.68
TTYH3-207ENST00000498454 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP31.74■■■□□ 2.67
TTYH3-207ENST00000498454 SETD5Q9C0A6 1442 aa31.73■■■□□ 2.67
TTYH3-207ENST00000498454 MLECQ14165 292 aa31.71■■■□□ 2.67
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 79 ms