RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000497842.6

TTC19-208, Transcript of tetratricopeptide repeat domain 19, human

TSL 5

Gene TTC19, Length 1,360 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TTC19-208	ENST00000497842	CDC42BPB	Q9Y5S2	1711 aa		43.61	■■■■■ 4.57
TTC19-208	ENST00000497842	RRBP1	Q9P2E9	1410 aa	Known RBP	43.6	■■■■■ 4.57
TTC19-208	ENST00000497842	TRIM26	Q12899	539 aa	Predicted RBP	43.57	■■■■■ 4.57
TTC19-208	ENST00000497842	CFDP1	Q9UEE9	299 aa	Predicted RBP	43.57	■■■■■ 4.57
TTC19-208	ENST00000497842	PLCH2	O75038	1416 aa		43.56	■■■■■ 4.56
TTC19-208	ENST00000497842	PPRC1	Q5VV67	1664 aa	Known RBP	43.55	■■■■■ 4.56
TTC19-208	ENST00000497842	ARAP3	Q8WWN8	1544 aa		43.55	■■■■■ 4.56
TTC19-208	ENST00000497842	PTPN23	Q9H3S7	1636 aa		43.54	■■■■■ 4.56
TTC19-208	ENST00000497842	MAP3K4	Q9Y6R4	1608 aa		43.54	■■■■■ 4.56
TTC19-208	ENST00000497842	ARHGAP5	Q13017	1502 aa		43.52	■■■■■ 4.56
TTC19-208	ENST00000497842	CD109	Q6YHK3	1445 aa		43.52	■■■■■ 4.56
TTC19-208	ENST00000497842	TCOF1	Q13428	1488 aa	Known RBP	43.45	■■■■■ 4.55
TTC19-208	ENST00000497842	FAM50A	Q14320	339 aa	Known RBP	43.43	■■■■■ 4.54
TTC19-208	ENST00000497842	DROSHA	Q9NRR4	1374 aa	Known RBP eCLIP	43.43	■■■■■ 4.54
TTC19-208	ENST00000497842	EFCAB2	Q5VUJ9	269 aa		43.42	■■■■■ 4.54
TTC19-208	ENST00000497842	ZNF777	Q9ULD5	760 aa	Predicted RBP	43.41	■■■■■ 4.54
TTC19-208	ENST00000497842	ADGRL1	O94910	1474 aa		43.4	■■■■■ 4.54
TTC19-208	ENST00000497842	CAMSAP2	Q08AD1	1489 aa		43.4	■■■■■ 4.54
TTC19-208	ENST00000497842	CFAP74	Q9C0B2	1584 aa		43.39	■■■■■ 4.54
TTC19-208	ENST00000497842	COL17A1	Q9UMD9	1497 aa	Predicted RBP	43.37	■■■■■ 4.53
TTC19-208	ENST00000497842	SAMD9L	Q8IVG5	1584 aa		43.37	■■■■■ 4.53
TTC19-208	ENST00000497842	FANCA	O15360	1455 aa		43.36	■■■■■ 4.53
TTC19-208	ENST00000497842	ZNF644	Q9H582	1327 aa	Predicted RBP	43.33	■■■■■ 4.53
TTC19-208	ENST00000497842	PLEKHH2	Q8IVE3	1493 aa		43.32	■■■■■ 4.52
TTC19-208	ENST00000497842	TEX14	Q8IWB6	1497 aa		43.27	■■■■■ 4.52
TTC19-208	ENST00000497842	ILDR1	Q86SU0	546 aa	Predicted RBP	43.27	■■■■■ 4.52
TTC19-208	ENST00000497842	NEO1	Q92859	1461 aa		43.24	■■■■■ 4.51
TTC19-208	ENST00000497842	ABCC1	P33527	1531 aa		43.22	■■■■■ 4.51
TTC19-208	ENST00000497842	KIAA1107	Q9UPP5	1409 aa		43.22	■■■■■ 4.51
TTC19-208	ENST00000497842	DNMT1	P26358	1616 aa	Known RBP	43.2	■■■■■ 4.51
TTC19-208	ENST00000497842	AKNA	Q7Z591	1439 aa		43.2	■■■■■ 4.51
TTC19-208	ENST00000497842	SYCP2	Q9BX26	1530 aa		43.19	■■■■■ 4.5
TTC19-208	ENST00000497842	ARHGEF5	Q12774	1597 aa		43.18	■■■■■ 4.5
TTC19-208	ENST00000497842	PCGF6	Q9BYE7	350 aa		43.17	■■■■■ 4.5
TTC19-208	ENST00000497842	ITGAE	P38570	1179 aa		43.15	■■■■■ 4.5
TTC19-208	ENST00000497842	HNRNPM	P52272	730 aa	Known RBP eCLIP	43.13	■■■■■ 4.49
TTC19-208	ENST00000497842	MBD5	Q9P267	1494 aa		43.12	■■■■■ 4.49
TTC19-208	ENST00000497842	RSPH4A	Q5TD94	716 aa		43.12	■■■■■ 4.49
TTC19-208	ENST00000497842	DAPK1	P53355	1430 aa		43.12	■■■■■ 4.49
TTC19-208	ENST00000497842	CROCC2	H7BZ55	1655 aa		43.11	■■■■■ 4.49
TTC19-208	ENST00000497842	ARHGEF12	Q9NZN5	1544 aa		43.09	■■■■■ 4.49
TTC19-208	ENST00000497842	ABCC5	O15440	1437 aa		43.08	■■■■■ 4.49
TTC19-208	ENST00000497842	SCAPER	Q9BY12	1400 aa		43.08	■■■■■ 4.49
TTC19-208	ENST00000497842	CCDC141	Q6ZP82	1450 aa		43.07	■■■■■ 4.49
TTC19-208	ENST00000497842	HECW2	Q9P2P5	1572 aa		43	■■■■■ 4.47
TTC19-208	ENST00000497842	SHANK2	Q9UPX8	1470 aa		42.99	■■■■■ 4.47
TTC19-208	ENST00000497842	PTPRK	Q15262	1439 aa		42.98	■■■■■ 4.47
TTC19-208	ENST00000497842	TRAPPC8	Q9Y2L5	1435 aa		42.98	■■■■■ 4.47
TTC19-208	ENST00000497842	TSPY4	P0CV99	314 aa		42.97	■■■■■ 4.47
TTC19-208	ENST00000497842	TSPY10	P0CW01	314 aa		42.97	■■■■■ 4.47
TTC19-208	ENST00000497842	ADGB	Q8N7X0	1667 aa		42.96	■■■■■ 4.47
TTC19-208	ENST00000497842	DENND4B	O75064	1496 aa	Predicted RBP	42.95	■■■■■ 4.47
TTC19-208	ENST00000497842	ZNF518A	Q6AHZ1	1483 aa		42.94	■■■■■ 4.46
TTC19-208	ENST00000497842	POGZ	Q7Z3K3	1410 aa		42.93	■■■■■ 4.46
TTC19-208	ENST00000497842	C9orf84	Q5VXU9	1444 aa		42.92	■■■■■ 4.46
TTC19-208	ENST00000497842	MAST1	Q9Y2H9	1570 aa		42.91	■■■■■ 4.46
TTC19-208	ENST00000497842	CHIC2	Q9UKJ5	165 aa		42.9	■■■■■ 4.46
TTC19-208	ENST00000497842	RICTOR	Q6R327	1708 aa		42.88	■■■■■ 4.46
TTC19-208	ENST00000497842	AFAP1	Q8N556	730 aa		42.88	■■■■■ 4.45
TTC19-208	ENST00000497842	ROCK1	Q13464	1354 aa		42.85	■■■■■ 4.45
TTC19-208	ENST00000497842	ADGRL2	O95490	1459 aa		42.83	■■■■■ 4.45
TTC19-208	ENST00000497842	KDM5C	P41229	1560 aa		42.83	■■■■■ 4.45
TTC19-208	ENST00000497842	SPAG9	O60271	1321 aa	Known RBP	42.83	■■■■■ 4.45
TTC19-208	ENST00000497842	ANKRD30A	Q9BXX3	1397 aa		42.81	■■■■■ 4.44
TTC19-208	ENST00000497842	RTEL1-TNFRSF6B	F6WH68	1400 aa		42.79	■■■■■ 4.44
TTC19-208	ENST00000497842	RAPGEF3	O95398	923 aa		42.78	■■■■■ 4.44
TTC19-208	ENST00000497842	INO80	Q9ULG1	1556 aa	Predicted RBP	42.78	■■■■■ 4.44
TTC19-208	ENST00000497842	FRMPD1	Q5SYB0	1578 aa		42.77	■■■■■ 4.44
TTC19-208	ENST00000497842	NCOA1	Q15788	1441 aa		42.76	■■■■■ 4.44
TTC19-208	ENST00000497842	ATP7A	Q04656	1500 aa		42.76	■■■■■ 4.44
TTC19-208	ENST00000497842	ZFYVE16	Q7Z3T8	1539 aa		42.76	■■■■■ 4.44
TTC19-208	ENST00000497842	PLXNC1	O60486	1568 aa		42.75	■■■■■ 4.43
TTC19-208	ENST00000497842	GCC2	Q8IWJ2	1684 aa		42.75	■■■■■ 4.43
TTC19-208	ENST00000497842	HFM1	A2PYH4	1435 aa		42.74	■■■■■ 4.43
TTC19-208	ENST00000497842	RRP7BP	Q9NSQ0	103 aa		42.73	■■■■■ 4.43
TTC19-208	ENST00000497842	MLH3	Q9UHC1	1453 aa		42.71	■■■■■ 4.43
TTC19-208	ENST00000497842	MYT1L	Q9UL68	1186 aa		42.71	■■■■■ 4.43
TTC19-208	ENST00000497842	KIDINS220	Q9ULH0	1771 aa		42.7	■■■■■ 4.43
TTC19-208	ENST00000497842	ZMYM4	Q5VZL5	1548 aa		42.7	■■■■■ 4.43
TTC19-208	ENST00000497842	NAIP	Q13075	1403 aa		42.68	■■■■■ 4.42
TTC19-208	ENST00000497842	SETD5	Q9C0A6	1442 aa		42.68	■■■■■ 4.42
TTC19-208	ENST00000497842	KIF15	Q9NS87	1388 aa		42.65	■■■■■ 4.42
TTC19-208	ENST00000497842	MAGI2	Q86UL8	1455 aa		42.61	■■■■■ 4.41
TTC19-208	ENST00000497842	DUOX2	Q9NRD8	1548 aa		42.57	■■■■■ 4.41
TTC19-208	ENST00000497842	RAB3GAP2	Q9H2M9	1393 aa		42.54	■■■■■ 4.4
TTC19-208	ENST00000497842	ABCA6	Q8N139	1617 aa		42.53	■■■■■ 4.4
TTC19-208	ENST00000497842	ANKRD50	Q9ULJ7	1429 aa		42.51	■■■■■ 4.4
TTC19-208	ENST00000497842	DIP2C	Q9Y2E4	1556 aa		42.49	■■■■■ 4.39
TTC19-208	ENST00000497842	HRC	P23327	699 aa		42.46	■■■■■ 4.39
TTC19-208	ENST00000497842	ERBIN	Q96RT1	1412 aa		42.45	■■■■■ 4.39
TTC19-208	ENST00000497842	YEATS2	Q9ULM3	1422 aa		42.45	■■■■■ 4.39
TTC19-208	ENST00000497842	A2M	P01023	1474 aa		42.43	■■■■■ 4.38
TTC19-208	ENST00000497842	ARHGEF40	Q8TER5	1519 aa		42.41	■■■■■ 4.38
TTC19-208	ENST00000497842	ACIN1	Q9UKV3	1341 aa	Known RBP	42.41	■■■■■ 4.38
TTC19-208	ENST00000497842	DHX29	Q7Z478	1369 aa	Known RBP	42.41	■■■■■ 4.38
TTC19-208	ENST00000497842	ATP10A	O60312	1499 aa		42.38	■■■■■ 4.37
TTC19-208	ENST00000497842	EIF2AK4	Q9P2K8	1649 aa	Known RBP	42.37	■■■■■ 4.37
TTC19-208	ENST00000497842	PTPRM	P28827	1452 aa		42.35	■■■■■ 4.37
TTC19-208	ENST00000497842	ADAMTSL3	P82987	1691 aa		42.33	■■■■■ 4.37
TTC19-208	ENST00000497842	RERE	Q9P2R6	1566 aa		42.31	■■■■■ 4.36

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