RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000497842.6

TTC19-208, Transcript of tetratricopeptide repeat domain 19, humanhuman

TSL 5

Gene TTC19, Length 1,360 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC19-208ENST00000497842 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa43.61■■■■■ 4.57
TTC19-208ENST00000497842 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP43.6■■■■■ 4.57
TTC19-208ENST00000497842 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP43.57■■■■■ 4.57
TTC19-208ENST00000497842 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP43.57■■■■■ 4.57
TTC19-208ENST00000497842 PLCH2O75038 1416 aa43.56■■■■■ 4.56
TTC19-208ENST00000497842 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP43.55■■■■■ 4.56
TTC19-208ENST00000497842 ARAP3Q8WWN8 1544 aa43.55■■■■■ 4.56
TTC19-208ENST00000497842 PTPN23Q9H3S7 1636 aa43.54■■■■■ 4.56
TTC19-208ENST00000497842 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa43.54■■■■■ 4.56
TTC19-208ENST00000497842 ARHGAP5Q13017 1502 aa43.52■■■■■ 4.56
TTC19-208ENST00000497842 CD109Q6YHK3 1445 aa43.52■■■■■ 4.56
TTC19-208ENST00000497842 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP43.45■■■■■ 4.55
TTC19-208ENST00000497842 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP43.43■■■■■ 4.54
TTC19-208ENST00000497842 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP43.43■■■■■ 4.54
TTC19-208ENST00000497842 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa43.42■■■■■ 4.54
TTC19-208ENST00000497842 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP43.41■■■■■ 4.54
TTC19-208ENST00000497842 ADGRL1O94910 1474 aa43.4■■■■■ 4.54
TTC19-208ENST00000497842 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa43.4■■■■■ 4.54
TTC19-208ENST00000497842 CFAP74Q9C0B2 1584 aa43.39■■■■■ 4.54
TTC19-208ENST00000497842 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP43.37■■■■■ 4.53
TTC19-208ENST00000497842 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa43.37■■■■■ 4.53
TTC19-208ENST00000497842 FANCAO15360 1455 aa43.36■■■■■ 4.53
TTC19-208ENST00000497842 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP43.33■■■■■ 4.53
TTC19-208ENST00000497842 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa43.32■■■■■ 4.52
TTC19-208ENST00000497842 TEX14Q8IWB6 1497 aa43.27■■■■■ 4.52
TTC19-208ENST00000497842 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP43.27■■■■■ 4.52
TTC19-208ENST00000497842 NEO1Q92859 1461 aa43.24■■■■■ 4.51
TTC19-208ENST00000497842 ABCC1P33527 1531 aa43.22■■■■■ 4.51
TTC19-208ENST00000497842 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa43.22■■■■■ 4.51
TTC19-208ENST00000497842 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP43.2■■■■■ 4.51
TTC19-208ENST00000497842 AKNAQ7Z591 1439 aa43.2■■■■■ 4.51
TTC19-208ENST00000497842 SYCP2Q9BX26 1530 aa43.19■■■■■ 4.5
TTC19-208ENST00000497842 ARHGEF5Q12774 1597 aa43.18■■■■■ 4.5
TTC19-208ENST00000497842 PCGF6Q9BYE7 350 aa43.17■■■■■ 4.5
TTC19-208ENST00000497842 ITGAEP38570 1179 aa43.15■■■■■ 4.5
TTC19-208ENST00000497842 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP43.13■■■■■ 4.49
TTC19-208ENST00000497842 MBD5Q9P267 1494 aa43.12■■■■■ 4.49
TTC19-208ENST00000497842 RSPH4AQ5TD94 716 aa43.12■■■■■ 4.49
TTC19-208ENST00000497842 DAPK1P53355 1430 aa43.12■■■■■ 4.49
TTC19-208ENST00000497842 CROCC2H7BZ55 1655 aa43.11■■■■■ 4.49
TTC19-208ENST00000497842 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa43.09■■■■■ 4.49
TTC19-208ENST00000497842 ABCC5O15440 1437 aa43.08■■■■■ 4.49
TTC19-208ENST00000497842 SCAPERQ9BY12 1400 aa43.08■■■■■ 4.49
TTC19-208ENST00000497842 CCDC141Q6ZP82 1450 aa43.07■■■■■ 4.49
TTC19-208ENST00000497842 HECW2Q9P2P5 1572 aa43■■■■■ 4.47
TTC19-208ENST00000497842 SHANK2Q9UPX8 1470 aa42.99■■■■■ 4.47
TTC19-208ENST00000497842 PTPRKQ15262 1439 aa42.98■■■■■ 4.47
TTC19-208ENST00000497842 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa42.98■■■■■ 4.47
TTC19-208ENST00000497842 TSPY4P0CV99 314 aa42.97■■■■■ 4.47
TTC19-208ENST00000497842 TSPY10P0CW01 314 aa42.97■■■■■ 4.47
TTC19-208ENST00000497842 ADGBQ8N7X0 1667 aa42.96■■■■■ 4.47
TTC19-208ENST00000497842 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP42.95■■■■■ 4.47
TTC19-208ENST00000497842 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa42.94■■■■■ 4.46
TTC19-208ENST00000497842 POGZQ7Z3K3 1410 aa42.93■■■■■ 4.46
TTC19-208ENST00000497842 C9orf84Q5VXU9 1444 aa42.92■■■■■ 4.46
TTC19-208ENST00000497842 MAST1Q9Y2H9 1570 aa42.91■■■■■ 4.46
TTC19-208ENST00000497842 CHIC2Q9UKJ5 165 aa42.9■■■■■ 4.46
TTC19-208ENST00000497842 RICTORQ6R327 1708 aa42.88■■■■■ 4.46
TTC19-208ENST00000497842 AFAP1Q8N556 730 aa42.88■■■■■ 4.45
TTC19-208ENST00000497842 ROCK1Q13464 1354 aa42.85■■■■■ 4.45
TTC19-208ENST00000497842 ADGRL2O95490 1459 aa42.83■■■■■ 4.45
TTC19-208ENST00000497842 KDM5CP41229 1560 aa42.83■■■■■ 4.45
TTC19-208ENST00000497842 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP42.83■■■■■ 4.45
TTC19-208ENST00000497842 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa42.81■■■■■ 4.44
TTC19-208ENST00000497842 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa42.79■■■■■ 4.44
TTC19-208ENST00000497842 RAPGEF3O95398 923 aa42.78■■■■■ 4.44
TTC19-208ENST00000497842 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP42.78■■■■■ 4.44
TTC19-208ENST00000497842 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa42.77■■■■■ 4.44
TTC19-208ENST00000497842 NCOA1Q15788 1441 aa42.76■■■■■ 4.44
TTC19-208ENST00000497842 ATP7AQ04656 1500 aa42.76■■■■■ 4.44
TTC19-208ENST00000497842 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa42.76■■■■■ 4.44
TTC19-208ENST00000497842 PLXNC1O60486 1568 aa42.75■■■■■ 4.43
TTC19-208ENST00000497842 GCC2Q8IWJ2 1684 aa42.75■■■■■ 4.43
TTC19-208ENST00000497842 HFM1A2PYH4 1435 aa42.74■■■■■ 4.43
TTC19-208ENST00000497842 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa42.73■■■■■ 4.43
TTC19-208ENST00000497842 MLH3Q9UHC1 1453 aa42.71■■■■■ 4.43
TTC19-208ENST00000497842 MYT1LQ9UL68 1186 aa42.71■■■■■ 4.43
TTC19-208ENST00000497842 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa42.7■■■■■ 4.43
TTC19-208ENST00000497842 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa42.7■■■■■ 4.43
TTC19-208ENST00000497842 NAIPQ13075 1403 aa42.68■■■■■ 4.42
TTC19-208ENST00000497842 SETD5Q9C0A6 1442 aa42.68■■■■■ 4.42
TTC19-208ENST00000497842 KIF15Q9NS87 1388 aa42.65■■■■■ 4.42
TTC19-208ENST00000497842 MAGI2Q86UL8 1455 aa42.61■■■■■ 4.41
TTC19-208ENST00000497842 DUOX2Q9NRD8 1548 aa42.57■■■■■ 4.41
TTC19-208ENST00000497842 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa42.54■■■■■ 4.4
TTC19-208ENST00000497842 ABCA6Q8N139 1617 aa42.53■■■■■ 4.4
TTC19-208ENST00000497842 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa42.51■■■■■ 4.4
TTC19-208ENST00000497842 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa42.49■■■■■ 4.39
TTC19-208ENST00000497842 HRCP23327 699 aa42.46■■■■■ 4.39
TTC19-208ENST00000497842 ERBINQ96RT1 1412 aa42.45■■■■■ 4.39
TTC19-208ENST00000497842 YEATS2Q9ULM3 1422 aa42.45■■■■■ 4.39
TTC19-208ENST00000497842 A2MP01023 1474 aa42.43■■■■■ 4.38
TTC19-208ENST00000497842 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa42.41■■■■■ 4.38
TTC19-208ENST00000497842 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP42.41■■■■■ 4.38
TTC19-208ENST00000497842 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP42.41■■■■■ 4.38
TTC19-208ENST00000497842 ATP10AO60312 1499 aa42.38■■■■■ 4.37
TTC19-208ENST00000497842 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP42.37■■■■■ 4.37
TTC19-208ENST00000497842 PTPRMP28827 1452 aa42.35■■■■■ 4.37
TTC19-208ENST00000497842 ADAMTSL3P82987 1691 aa42.33■■■■■ 4.37
TTC19-208ENST00000497842 REREQ9P2R6 1566 aa42.31■■■■■ 4.36
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 14.2 ms