RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495606.5

IMP4-217, Transcript of IMP4, U3 small nucleolar ribonucleoprotein, humanhuman

TSL 4

Gene IMP4, Length 546 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IMP4-217ENST00000495606 PHLDB1Q86UU1 1377 aa22.73■■□□□ 1.23
IMP4-217ENST00000495606 FANCAO15360 1455 aa22.73■■□□□ 1.23
IMP4-217ENST00000495606 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa22.72■■□□□ 1.23
IMP4-217ENST00000495606 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP22.72■■□□□ 1.23
IMP4-217ENST00000495606 MAP3K1Q13233 1512 aa22.72■■□□□ 1.23
IMP4-217ENST00000495606 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP22.71■■□□□ 1.23
IMP4-217ENST00000495606 AKNAQ7Z591 1439 aa22.71■■□□□ 1.23
IMP4-217ENST00000495606 CCNB3Q8WWL7 1395 aa22.7■■□□□ 1.22
IMP4-217ENST00000495606 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP22.7■■□□□ 1.22
IMP4-217ENST00000495606 MYO5CQ9NQX4 1742 aa22.7■■□□□ 1.22
IMP4-217ENST00000495606 ARHGAP5Q13017 1502 aa22.69■■□□□ 1.22
IMP4-217ENST00000495606 NEO1Q92859 1461 aa22.69■■□□□ 1.22
IMP4-217ENST00000495606 LMTK3Q96Q04 1460 aa22.69■■□□□ 1.22
IMP4-217ENST00000495606 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP22.69■■□□□ 1.22
IMP4-217ENST00000495606 NCOA2Q15596 1464 aa22.68■■□□□ 1.22
IMP4-217ENST00000495606 BCORL1Q5H9F3 1711 aa22.66■■□□□ 1.22
IMP4-217ENST00000495606 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa22.66■■□□□ 1.22
IMP4-217ENST00000495606 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa22.65■■□□□ 1.22
IMP4-217ENST00000495606 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP22.65■■□□□ 1.22
IMP4-217ENST00000495606 MADDQ8WXG6 1647 aa22.64■■□□□ 1.22
IMP4-217ENST00000495606 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP22.63■■□□□ 1.21
IMP4-217ENST00000495606 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP22.63■■□□□ 1.21
IMP4-217ENST00000495606 PREX2Q70Z35 1606 aa22.63■■□□□ 1.21
IMP4-217ENST00000495606 SCAPERQ9BY12 1400 aa22.63■■□□□ 1.21
IMP4-217ENST00000495606 HSPA2P54652 639 aa22.62■■□□□ 1.21
IMP4-217ENST00000495606 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP22.6■■□□□ 1.21
IMP4-217ENST00000495606 CFAP74Q9C0B2 1584 aa22.59■■□□□ 1.21
IMP4-217ENST00000495606 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP22.58■■□□□ 1.21
IMP4-217ENST00000495606 AFAP1Q8N556 730 aa22.58■■□□□ 1.21
IMP4-217ENST00000495606 CERKQ8TCT0 537 aa22.58■■□□□ 1.21
IMP4-217ENST00000495606 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa22.57■■□□□ 1.2
IMP4-217ENST00000495606 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa22.57■■□□□ 1.2
IMP4-217ENST00000495606 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP22.55■■□□□ 1.2
IMP4-217ENST00000495606 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa22.55■■□□□ 1.2
IMP4-217ENST00000495606 PLPPR3Q6T4P5 718 aa22.54■■□□□ 1.2
IMP4-217ENST00000495606 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa22.53■■□□□ 1.2
IMP4-217ENST00000495606 POGZQ7Z3K3 1410 aa22.51■■□□□ 1.19
IMP4-217ENST00000495606 ABCC1P33527 1531 aa22.51■■□□□ 1.19
IMP4-217ENST00000495606 RICTORQ6R327 1708 aa22.5■■□□□ 1.19
IMP4-217ENST00000495606 MYOM3Q5VTT5 1437 aa22.49■■□□□ 1.19
IMP4-217ENST00000495606 ITSN2Q9NZM3 1697 aa22.49■■□□□ 1.19
IMP4-217ENST00000495606 ILDR2Q71H61 639 aa22.49■■□□□ 1.19
IMP4-217ENST00000495606 MYT1LQ9UL68 1186 aa22.49■■□□□ 1.19
IMP4-217ENST00000495606 SYCP2Q9BX26 1530 aa22.48■■□□□ 1.19
IMP4-217ENST00000495606 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa22.47■■□□□ 1.19
IMP4-217ENST00000495606 YEATS2Q9ULM3 1422 aa22.45■■□□□ 1.18
IMP4-217ENST00000495606 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa22.45■■□□□ 1.18
IMP4-217ENST00000495606 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa22.43■■□□□ 1.18
IMP4-217ENST00000495606 DISP3Q9P2K9 1392 aa22.43■■□□□ 1.18
IMP4-217ENST00000495606 SOCS7O14512 581 aa22.43■■□□□ 1.18
IMP4-217ENST00000495606 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa22.42■■□□□ 1.18
IMP4-217ENST00000495606 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa22.42■■□□□ 1.18
IMP4-217ENST00000495606 MBD5Q9P267 1494 aa22.41■■□□□ 1.18
IMP4-217ENST00000495606 MIA2Q96PC5 1412 aa22.4■■□□□ 1.18
IMP4-217ENST00000495606 MLECQ14165 292 aa22.4■■□□□ 1.18
IMP4-217ENST00000495606 FGD6Q6ZV73 1430 aa22.4■■□□□ 1.18
IMP4-217ENST00000495606 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP22.39■■□□□ 1.18
IMP4-217ENST00000495606 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa22.39■■□□□ 1.17
IMP4-217ENST00000495606 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa22.37■■□□□ 1.17
IMP4-217ENST00000495606 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa22.37■■□□□ 1.17
IMP4-217ENST00000495606 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP22.37■■□□□ 1.17
IMP4-217ENST00000495606 KDM5CP41229 1560 aa22.37■■□□□ 1.17
IMP4-217ENST00000495606 PTPN23Q9H3S7 1636 aa22.35■■□□□ 1.17
IMP4-217ENST00000495606 MAGI2Q86UL8 1455 aa22.34■■□□□ 1.17
IMP4-217ENST00000495606 MLH3Q9UHC1 1453 aa22.34■■□□□ 1.17
IMP4-217ENST00000495606 CCDC141Q6ZP82 1450 aa22.31■■□□□ 1.16
IMP4-217ENST00000495606 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa22.3■■□□□ 1.16
IMP4-217ENST00000495606 ATP10AO60312 1499 aa22.3■■□□□ 1.16
IMP4-217ENST00000495606 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa22.3■■□□□ 1.16
IMP4-217ENST00000495606 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP22.29■■□□□ 1.16
IMP4-217ENST00000495606 TSPY4P0CV99 314 aa22.29■■□□□ 1.16
IMP4-217ENST00000495606 TSPY10P0CW01 314 aa22.29■■□□□ 1.16
IMP4-217ENST00000495606 RSPH4AQ5TD94 716 aa22.29■■□□□ 1.16
IMP4-217ENST00000495606 ABCA6Q8N139 1617 aa22.28■■□□□ 1.16
IMP4-217ENST00000495606 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP22.28■■□□□ 1.16
IMP4-217ENST00000495606 DMRT2Q9Y5R5 561 aa22.28■■□□□ 1.16
IMP4-217ENST00000495606 ARHGEF5Q12774 1597 aa22.28■■□□□ 1.16
IMP4-217ENST00000495606 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa22.28■■□□□ 1.16
IMP4-217ENST00000495606 ABCC5O15440 1437 aa22.27■■□□□ 1.16
IMP4-217ENST00000495606 CHIC2Q9UKJ5 165 aa22.27■■□□□ 1.16
IMP4-217ENST00000495606 ATP7AQ04656 1500 aa22.26■■□□□ 1.15
IMP4-217ENST00000495606 ITGAEP38570 1179 aa22.25■■□□□ 1.15
IMP4-217ENST00000495606 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP22.25■■□□□ 1.15
IMP4-217ENST00000495606 C9orf84Q5VXU9 1444 aa22.24■■□□□ 1.15
IMP4-217ENST00000495606 PREX1Q8TCU6 1659 aa22.23■■□□□ 1.15
IMP4-217ENST00000495606 DAPK1P53355 1430 aa22.23■■□□□ 1.15
IMP4-217ENST00000495606 STRCQ7RTU9 1775 aa22.22■■□□□ 1.15
IMP4-217ENST00000495606 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa22.21■■□□□ 1.15
IMP4-217ENST00000495606 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP22.18■■□□□ 1.14
IMP4-217ENST00000495606 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa22.18■■□□□ 1.14
IMP4-217ENST00000495606 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP22.18■■□□□ 1.14
IMP4-217ENST00000495606 A2MP01023 1474 aa22.17■■□□□ 1.14
IMP4-217ENST00000495606 PTPRKQ15262 1439 aa22.17■■□□□ 1.14
IMP4-217ENST00000495606 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa22.16■■□□□ 1.14
IMP4-217ENST00000495606 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa22.14■■□□□ 1.14
IMP4-217ENST00000495606 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.14
IMP4-217ENST00000495606 MAST1Q9Y2H9 1570 aa22.14■■□□□ 1.13
IMP4-217ENST00000495606 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP22.13■■□□□ 1.13
IMP4-217ENST00000495606 CROCC2H7BZ55 1655 aa22.12■■□□□ 1.13
IMP4-217ENST00000495606 ADGBQ8N7X0 1667 aa22.12■■□□□ 1.13
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