RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495022.5

TRDMT1-211, Transcript of tRNA aspartic acid methyltransferase 1, humanhuman

TSL 2

Gene TRDMT1, Length 1,374 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRDMT1-211ENST00000495022 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP37.07■■■■□ 3.52
TRDMT1-211ENST00000495022 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP37.07■■■■□ 3.52
TRDMT1-211ENST00000495022 SCAPERQ9BY12 1400 aa37.07■■■■□ 3.52
TRDMT1-211ENST00000495022 YEATS2Q9ULM3 1422 aa37.05■■■■□ 3.52
TRDMT1-211ENST00000495022 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa37.04■■■■□ 3.52
TRDMT1-211ENST00000495022 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP37.04■■■■□ 3.52
TRDMT1-211ENST00000495022 CLIP1P30622 1438 aa37.02■■■■□ 3.52
TRDMT1-211ENST00000495022 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa37.02■■■■□ 3.52
TRDMT1-211ENST00000495022 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP36.96■■■■□ 3.51
TRDMT1-211ENST00000495022 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa36.95■■■■□ 3.5
TRDMT1-211ENST00000495022 CCDC18Q5T9S5 1454 aa36.94■■■■□ 3.5
TRDMT1-211ENST00000495022 ARHGAP5Q13017 1502 aa36.94■■■■□ 3.5
TRDMT1-211ENST00000495022 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa36.92■■■■□ 3.5
TRDMT1-211ENST00000495022 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa36.92■■■■□ 3.5
TRDMT1-211ENST00000495022 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa36.9■■■■□ 3.5
TRDMT1-211ENST00000495022 ATP10AO60312 1499 aa36.89■■■■□ 3.5
TRDMT1-211ENST00000495022 LMTK3Q96Q04 1460 aa36.89■■■■□ 3.5
TRDMT1-211ENST00000495022 KDM5CP41229 1560 aa36.88■■■■□ 3.49
TRDMT1-211ENST00000495022 C9orf84Q5VXU9 1444 aa36.86■■■■□ 3.49
TRDMT1-211ENST00000495022 PREX2Q70Z35 1606 aa36.86■■■■□ 3.49
TRDMT1-211ENST00000495022 FYCO1Q9BQS8 1478 aa36.83■■■■□ 3.49
TRDMT1-211ENST00000495022 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa36.79■■■■□ 3.48
TRDMT1-211ENST00000495022 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa36.77■■■■□ 3.48
TRDMT1-211ENST00000495022 MLECQ14165 292 aa36.77■■■■□ 3.48
TRDMT1-211ENST00000495022 ABCC1P33527 1531 aa36.75■■■■□ 3.47
TRDMT1-211ENST00000495022 ITSN2Q9NZM3 1697 aa36.74■■■■□ 3.47
TRDMT1-211ENST00000495022 AFAP1Q8N556 730 aa36.74■■■■□ 3.47
TRDMT1-211ENST00000495022 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa36.72■■■■□ 3.47
TRDMT1-211ENST00000495022 REREQ9P2R6 1566 aa36.71■■■■□ 3.47
TRDMT1-211ENST00000495022 MLH3Q9UHC1 1453 aa36.69■■■■□ 3.46
TRDMT1-211ENST00000495022 ABCA6Q8N139 1617 aa36.68■■■■□ 3.46
TRDMT1-211ENST00000495022 PLPPR3Q6T4P5 718 aa36.66■■■■□ 3.46
TRDMT1-211ENST00000495022 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa36.63■■■■□ 3.45
TRDMT1-211ENST00000495022 MYT1LQ9UL68 1186 aa36.62■■■■□ 3.45
TRDMT1-211ENST00000495022 PREX1Q8TCU6 1659 aa36.61■■■■□ 3.45
TRDMT1-211ENST00000495022 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa36.59■■■■□ 3.45
TRDMT1-211ENST00000495022 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP36.59■■■■□ 3.45
TRDMT1-211ENST00000495022 HSPA2P54652 639 aa36.58■■■■□ 3.45
TRDMT1-211ENST00000495022 AGLP35573 1532 aa36.56■■■■□ 3.44
TRDMT1-211ENST00000495022 FBXO41Q8TF61 875 aa36.54■■■■□ 3.44
TRDMT1-211ENST00000495022 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa36.54■■■■□ 3.44
TRDMT1-211ENST00000495022 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP36.53■■■■□ 3.44
TRDMT1-211ENST00000495022 SYCP2Q9BX26 1530 aa36.48■■■■□ 3.43
TRDMT1-211ENST00000495022 C3P01024 1663 aa36.46■■■■□ 3.43
TRDMT1-211ENST00000495022 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP36.46■■■■□ 3.43
TRDMT1-211ENST00000495022 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP36.43■■■■□ 3.42
TRDMT1-211ENST00000495022 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa36.41■■■■□ 3.42
TRDMT1-211ENST00000495022 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa36.41■■■■□ 3.42
TRDMT1-211ENST00000495022 MTUS2Q5JR59 1369 aa36.41■■■■□ 3.42
TRDMT1-211ENST00000495022 CCNB3Q8WWL7 1395 aa36.39■■■■□ 3.42
TRDMT1-211ENST00000495022 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa36.37■■■■□ 3.41
TRDMT1-211ENST00000495022 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP36.36■■■■□ 3.41
TRDMT1-211ENST00000495022 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa36.35■■■■□ 3.41
TRDMT1-211ENST00000495022 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP36.35■■■■□ 3.41
TRDMT1-211ENST00000495022 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP36.35■■■■□ 3.41
TRDMT1-211ENST00000495022 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP36.35■■■■□ 3.41
TRDMT1-211ENST00000495022 ATP7AQ04656 1500 aa36.34■■■■□ 3.41
TRDMT1-211ENST00000495022 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP36.34■■■■□ 3.41
TRDMT1-211ENST00000495022 CNTLNQ9NXG0 1405 aa36.34■■■■□ 3.41
TRDMT1-211ENST00000495022 STRCQ7RTU9 1775 aa36.33■■■■□ 3.41
TRDMT1-211ENST00000495022 CEP162Q5TB80 1403 aa36.32■■■■□ 3.41
TRDMT1-211ENST00000495022 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP36.32■■■■□ 3.4
TRDMT1-211ENST00000495022 TIAM1Q13009 1591 aa36.32■■■■□ 3.4
TRDMT1-211ENST00000495022 MROH2AA6NES4 1674 aa36.32■■■■□ 3.4
TRDMT1-211ENST00000495022 PLXNC1O60486 1568 aa36.28■■■■□ 3.4
TRDMT1-211ENST00000495022 ADGBQ8N7X0 1667 aa36.23■■■■□ 3.39
TRDMT1-211ENST00000495022 DMRT2Q9Y5R5 561 aa36.21■■■■□ 3.39
TRDMT1-211ENST00000495022 A2MP01023 1474 aa36.21■■■■□ 3.39
TRDMT1-211ENST00000495022 CERKQ8TCT0 537 aa36.18■■■■□ 3.38
TRDMT1-211ENST00000495022 NPATQ14207 1427 aa36.17■■■■□ 3.38
TRDMT1-211ENST00000495022 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP36.16■■■■□ 3.38
TRDMT1-211ENST00000495022 MBD5Q9P267 1494 aa36.15■■■■□ 3.38
TRDMT1-211ENST00000495022 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP36.13■■■■□ 3.37
TRDMT1-211ENST00000495022 ZMYM3Q14202 1370 aa36.11■■■■□ 3.37
TRDMT1-211ENST00000495022 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa36.09■■■■□ 3.37
TRDMT1-211ENST00000495022 PTPRTO14522 1441 aa36.08■■■■□ 3.37
TRDMT1-211ENST00000495022 NCOA2Q15596 1464 aa36.08■■■■□ 3.37
TRDMT1-211ENST00000495022 NCOA1Q15788 1441 aa36.03■■■■□ 3.36
TRDMT1-211ENST00000495022 PPP6R1Q9UPN7 881 aa36.02■■■■□ 3.36
TRDMT1-211ENST00000495022 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP36.02■■■■□ 3.36
TRDMT1-211ENST00000495022 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa36.01■■■■□ 3.36
TRDMT1-211ENST00000495022 CCDC141Q6ZP82 1450 aa36.01■■■■□ 3.35
TRDMT1-211ENST00000495022 MYO3AQ8NEV4 1616 aa36■■■■□ 3.35
TRDMT1-211ENST00000495022 GGT6Q6P531 493 aa36■■■■□ 3.35
TRDMT1-211ENST00000495022 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa35.98■■■■□ 3.35
TRDMT1-211ENST00000495022 PTPRKQ15262 1439 aa35.97■■■■□ 3.35
TRDMT1-211ENST00000495022 VPS8Q8N3P4 1428 aa35.97■■■■□ 3.35
TRDMT1-211ENST00000495022 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP35.96■■■■□ 3.35
TRDMT1-211ENST00000495022 RSPH4AQ5TD94 716 aa35.94■■■■□ 3.34
TRDMT1-211ENST00000495022 ARHGEF5Q12774 1597 aa35.93■■■■□ 3.34
TRDMT1-211ENST00000495022 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP35.91■■■■□ 3.34
TRDMT1-211ENST00000495022 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa35.91■■■■□ 3.34
TRDMT1-211ENST00000495022 FAM135AQ9P2D6 1515 aa35.89■■■■□ 3.34
TRDMT1-211ENST00000495022 LTBP4Q8N2S1 1624 aa35.87■■■■□ 3.33
TRDMT1-211ENST00000495022 PLA2R1Q13018 1463 aa35.86■■■■□ 3.33
TRDMT1-211ENST00000495022 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa35.86■■■■□ 3.33
TRDMT1-211ENST00000495022 MAP3K1Q13233 1512 aa35.85■■■■□ 3.33
TRDMT1-211ENST00000495022 KDM5DQ9BY66 1539 aa35.82■■■■□ 3.32
TRDMT1-211ENST00000495022 KIF3BO15066 747 aa35.8■■■■□ 3.32
TRDMT1-211ENST00000495022 IQSEC2Q5JU85 1478 aa35.79■■■■□ 3.32
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