RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000493708.5

ASL-209, Transcript of argininosuccinate lyase, human

TSL 3

Gene ASL, Length 885 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ASL-209	ENST00000493708	ARID4B	Q4LE39	1312 aa	Predicted RBP	41.27	■■■■■ 4.2
ASL-209	ENST00000493708	ARHGAP5	Q13017	1502 aa		41.25	■■■■■ 4.19
ASL-209	ENST00000493708	CEP162	Q5TB80	1403 aa		41.23	■■■■■ 4.19
ASL-209	ENST00000493708	MAGI2	Q86UL8	1455 aa		41.22	■■■■■ 4.19
ASL-209	ENST00000493708	YEATS2	Q9ULM3	1422 aa		41.21	■■■■■ 4.19
ASL-209	ENST00000493708	ZFYVE16	Q7Z3T8	1539 aa		41.18	■■■■■ 4.18
ASL-209	ENST00000493708	ADAMTSL3	P82987	1691 aa		41.16	■■■■■ 4.18
ASL-209	ENST00000493708	LOC105371045	A0A1W2PR82	267 aa		41.13	■■■■■ 4.17
ASL-209	ENST00000493708	BCORL1	Q5H9F3	1711 aa		41.12	■■■■■ 4.17
ASL-209	ENST00000493708	CDC42BPB	Q9Y5S2	1711 aa		41.12	■■■■■ 4.17
ASL-209	ENST00000493708	AFAP1	Q8N556	730 aa		41.1	■■■■■ 4.17
ASL-209	ENST00000493708	ZNF518A	Q6AHZ1	1483 aa		41.09	■■■■■ 4.17
ASL-209	ENST00000493708	PREX2	Q70Z35	1606 aa		41.08	■■■■■ 4.17
ASL-209	ENST00000493708	PTPRM	P28827	1452 aa		41.06	■■■■■ 4.16
ASL-209	ENST00000493708	ATP10A	O60312	1499 aa		41.02	■■■■■ 4.16
ASL-209	ENST00000493708	MTUS2	Q5JR59	1369 aa		41.01	■■■■■ 4.16
ASL-209	ENST00000493708	MADD	Q8WXG6	1647 aa		41	■■■■■ 4.15
ASL-209	ENST00000493708	CDC42BPA	Q5VT25	1732 aa		40.99	■■■■■ 4.15
ASL-209	ENST00000493708	KDM5C	P41229	1560 aa		40.99	■■■■■ 4.15
ASL-209	ENST00000493708	HECW2	Q9P2P5	1572 aa		40.99	■■■■■ 4.15
ASL-209	ENST00000493708	ARHGEF12	Q9NZN5	1544 aa		40.98	■■■■■ 4.15
ASL-209	ENST00000493708	GPATCH8	Q9UKJ3	1502 aa	Known RBP	40.98	■■■■■ 4.15
ASL-209	ENST00000493708	ABCC1	P33527	1531 aa		40.98	■■■■■ 4.15
ASL-209	ENST00000493708	SIGLEC1	Q9BZZ2	1709 aa		40.97	■■■■■ 4.15
ASL-209	ENST00000493708	MYT1L	Q9UL68	1186 aa		40.97	■■■■■ 4.15
ASL-209	ENST00000493708	TRAPPC8	Q9Y2L5	1435 aa		40.96	■■■■■ 4.15
ASL-209	ENST00000493708	C9orf84	Q5VXU9	1444 aa		40.95	■■■■■ 4.15
ASL-209	ENST00000493708	ZNF777	Q9ULD5	760 aa	Predicted RBP	40.95	■■■■■ 4.15
ASL-209	ENST00000493708	MLEC	Q14165	292 aa		40.93	■■■■■ 4.14
ASL-209	ENST00000493708	CCNB3	Q8WWL7	1395 aa		40.9	■■■■■ 4.14
ASL-209	ENST00000493708	MLH3	Q9UHC1	1453 aa		40.89	■■■■■ 4.14
ASL-209	ENST00000493708	CFDP1	Q9UEE9	299 aa	Predicted RBP	40.88	■■■■■ 4.13
ASL-209	ENST00000493708	ITSN2	Q9NZM3	1697 aa		40.87	■■■■■ 4.13
ASL-209	ENST00000493708	RIMS1	Q86UR5	1692 aa	Known RBP	40.85	■■■■■ 4.13
ASL-209	ENST00000493708	EHBP1L1	Q8N3D4	1523 aa		40.83	■■■■■ 4.13
ASL-209	ENST00000493708	SAMD9L	Q8IVG5	1584 aa		40.83	■■■■■ 4.13
ASL-209	ENST00000493708	HNRNPM	P52272	730 aa	Known RBP eCLIP	40.81	■■■■■ 4.12
ASL-209	ENST00000493708	DIP2C	Q9Y2E4	1556 aa		40.81	■■■■■ 4.12
ASL-209	ENST00000493708	VPS8	Q8N3P4	1428 aa		40.77	■■■■■ 4.12
ASL-209	ENST00000493708	SYCP2	Q9BX26	1530 aa		40.77	■■■■■ 4.12
ASL-209	ENST00000493708	KIAA1107	Q9UPP5	1409 aa		40.76	■■■■■ 4.11
ASL-209	ENST00000493708	PLPPR3	Q6T4P5	718 aa		40.75	■■■■■ 4.11
ASL-209	ENST00000493708	ABCA6	Q8N139	1617 aa		40.75	■■■■■ 4.11
ASL-209	ENST00000493708	PLEKHH2	Q8IVE3	1493 aa		40.74	■■■■■ 4.11
ASL-209	ENST00000493708	RERE	Q9P2R6	1566 aa		40.72	■■■■■ 4.11
ASL-209	ENST00000493708	TIAM1	Q13009	1591 aa		40.71	■■■■■ 4.11
ASL-209	ENST00000493708	SPAG9	O60271	1321 aa	Known RBP	40.69	■■■■■ 4.11
ASL-209	ENST00000493708	KIDINS220	Q9ULH0	1771 aa		40.69	■■■■■ 4.1
ASL-209	ENST00000493708	FER1L4	A9Z1Z3	1794 aa		40.68	■■■■■ 4.1
ASL-209	ENST00000493708	ZNF644	Q9H582	1327 aa	Predicted RBP	40.67	■■■■■ 4.1
ASL-209	ENST00000493708	NCOA2	Q15596	1464 aa		40.63	■■■■■ 4.09
ASL-209	ENST00000493708	AGL	P35573	1532 aa		40.62	■■■■■ 4.09
ASL-209	ENST00000493708	LMTK3	Q96Q04	1460 aa		40.59	■■■■■ 4.09
ASL-209	ENST00000493708	SUPT6H	Q7KZ85	1726 aa	Known RBP	40.57	■■■■■ 4.09
ASL-209	ENST00000493708	CEBPA	P49715	358 aa	Predicted RBP	40.55	■■■■■ 4.08
ASL-209	ENST00000493708	LRRC9	Q6ZRR7	1453 aa		40.54	■■■■■ 4.08
ASL-209	ENST00000493708	MBD5	Q9P267	1494 aa		40.54	■■■■■ 4.08
ASL-209	ENST00000493708	ATP7A	Q04656	1500 aa		40.53	■■■■■ 4.08
ASL-209	ENST00000493708	KANK4	Q5T7N3	995 aa	Predicted RBP	40.49	■■■■■ 4.07
ASL-209	ENST00000493708	INO80	Q9ULG1	1556 aa	Predicted RBP	40.48	■■■■■ 4.07
ASL-209	ENST00000493708	ESF1	Q9H501	851 aa	Known RBP	40.48	■■■■■ 4.07
ASL-209	ENST00000493708	MAP3K1	Q13233	1512 aa		40.47	■■■■■ 4.07
ASL-209	ENST00000493708	HSPA2	P54652	639 aa		40.45	■■■■■ 4.07
ASL-209	ENST00000493708	A2M	P01023	1474 aa		40.42	■■■■■ 4.06
ASL-209	ENST00000493708	CAMSAP2	Q08AD1	1489 aa		40.41	■■■■■ 4.06
ASL-209	ENST00000493708	RSPH4A	Q5TD94	716 aa		40.38	■■■■■ 4.05
ASL-209	ENST00000493708	RTEL1-TNFRSF6B	F6WH68	1400 aa		40.38	■■■■■ 4.05
ASL-209	ENST00000493708	PLXNC1	O60486	1568 aa		40.35	■■■■■ 4.05
ASL-209	ENST00000493708	CNTLN	Q9NXG0	1405 aa		40.35	■■■■■ 4.05
ASL-209	ENST00000493708	CCDC141	Q6ZP82	1450 aa		40.35	■■■■■ 4.05
ASL-209	ENST00000493708	APLP2	Q06481	763 aa		40.32	■■■■■ 4.05
ASL-209	ENST00000493708	C3	P01024	1663 aa		40.27	■■■■■ 4.04
ASL-209	ENST00000493708	ADGB	Q8N7X0	1667 aa		40.27	■■■■■ 4.04
ASL-209	ENST00000493708	GGT6	Q6P531	493 aa		40.27	■■■■■ 4.04
ASL-209	ENST00000493708	PREX1	Q8TCU6	1659 aa		40.26	■■■■■ 4.04
ASL-209	ENST00000493708	DHX29	Q7Z478	1369 aa	Known RBP	40.25	■■■■■ 4.03
ASL-209	ENST00000493708	SETD1B	Q9UPS6	1966 aa	Known RBP	40.25	■■■■■ 4.03
ASL-209	ENST00000493708	UHRF1BP1	Q6BDS2	1440 aa		40.24	■■■■■ 4.03
ASL-209	ENST00000493708	TSPY4	P0CV99	314 aa		40.23	■■■■■ 4.03
ASL-209	ENST00000493708	TSPY10	P0CW01	314 aa		40.23	■■■■■ 4.03
ASL-209	ENST00000493708	MYOM3	Q5VTT5	1437 aa		40.23	■■■■■ 4.03
ASL-209	ENST00000493708	ARHGEF5	Q12774	1597 aa		40.23	■■■■■ 4.03
ASL-209	ENST00000493708	ILDR1	Q86SU0	546 aa	Predicted RBP	40.22	■■■■■ 4.03
ASL-209	ENST00000493708	ZMYM3	Q14202	1370 aa		40.22	■■■■■ 4.03
ASL-209	ENST00000493708	MIA2	Q96PC5	1412 aa		40.21	■■■■■ 4.03
ASL-209	ENST00000493708	PPP6R1	Q9UPN7	881 aa		40.18	■■■■■ 4.02
ASL-209	ENST00000493708	MROH2A	A6NES4	1674 aa		40.15	■■■■■ 4.02
ASL-209	ENST00000493708	KIF3B	O15066	747 aa		40.12	■■■■■ 4.01
ASL-209	ENST00000493708	NPAT	Q14207	1427 aa		40.1	■■■■■ 4.01
ASL-209	ENST00000493708	CLTC	Q00610	1675 aa	Known RBP	40.1	■■■■■ 4.01
ASL-209	ENST00000493708	MAST1	Q9Y2H9	1570 aa		40.01	■■■■■ 4
ASL-209	ENST00000493708	PTPRK	Q15262	1439 aa		39.99	■■■■□ 3.99
ASL-209	ENST00000493708	DMRT2	Q9Y5R5	561 aa		39.95	■■■■□ 3.99
ASL-209	ENST00000493708	PTPN23	Q9H3S7	1636 aa		39.93	■■■■□ 3.98
ASL-209	ENST00000493708	STRC	Q7RTU9	1775 aa		39.92	■■■■□ 3.98
ASL-209	ENST00000493708	FGD6	Q6ZV73	1430 aa		39.92	■■■■□ 3.98
ASL-209	ENST00000493708	WASHC2C	Q9Y4E1	1318 aa		39.91	■■■■□ 3.98
ASL-209	ENST00000493708	ABCC5	O15440	1437 aa		39.91	■■■■□ 3.98
ASL-209	ENST00000493708	KDM5D	Q9BY66	1539 aa		39.88	■■■■□ 3.97
ASL-209	ENST00000493708	FAM135A	Q9P2D6	1515 aa		39.88	■■■■□ 3.97

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 51.2 ms