RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000493016.1

TSC22D1-208, Transcript of TSC22 domain family member 1, humanhuman

TSL 4

Gene TSC22D1, Length 690 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSC22D1-208ENST00000493016 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP26.59■■□□□ 1.85
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TSC22D1-208ENST00000493016 POGZQ7Z3K3 1410 aa26.56■■□□□ 1.84
TSC22D1-208ENST00000493016 MAGI2Q86UL8 1455 aa26.56■■□□□ 1.84
TSC22D1-208ENST00000493016 PTPRMP28827 1452 aa26.55■■□□□ 1.84
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TSC22D1-208ENST00000493016 YEATS2Q9ULM3 1422 aa26.53■■□□□ 1.84
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TSC22D1-208ENST00000493016 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa26.33■■□□□ 1.81
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TSC22D1-208ENST00000493016 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa26.31■■□□□ 1.8
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TSC22D1-208ENST00000493016 CEP162Q5TB80 1403 aa26.29■■□□□ 1.8
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TSC22D1-208ENST00000493016 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa26.26■■□□□ 1.79
TSC22D1-208ENST00000493016 MTUS2Q5JR59 1369 aa26.24■■□□□ 1.79
TSC22D1-208ENST00000493016 PLPPR3Q6T4P5 718 aa26.24■■□□□ 1.79
TSC22D1-208ENST00000493016 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa26.24■■□□□ 1.79
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TSC22D1-208ENST00000493016 CCNB3Q8WWL7 1395 aa26.2■■□□□ 1.79
TSC22D1-208ENST00000493016 SYCP2Q9BX26 1530 aa26.2■■□□□ 1.79
TSC22D1-208ENST00000493016 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP26.19■■□□□ 1.78
TSC22D1-208ENST00000493016 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP26.18■■□□□ 1.78
TSC22D1-208ENST00000493016 AGLP35573 1532 aa26.18■■□□□ 1.78
TSC22D1-208ENST00000493016 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa26.18■■□□□ 1.78
TSC22D1-208ENST00000493016 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa26.16■■□□□ 1.78
TSC22D1-208ENST00000493016 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa26.15■■□□□ 1.78
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TSC22D1-208ENST00000493016 PREX1Q8TCU6 1659 aa26.12■■□□□ 1.77
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TSC22D1-208ENST00000493016 VPS8Q8N3P4 1428 aa26.01■■□□□ 1.75
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TSC22D1-208ENST00000493016 MBD5Q9P267 1494 aa26■■□□□ 1.75
TSC22D1-208ENST00000493016 ADGBQ8N7X0 1667 aa25.99■■□□□ 1.75
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TSC22D1-208ENST00000493016 A2MP01023 1474 aa25.98■■□□□ 1.75
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TSC22D1-208ENST00000493016 MAP3K1Q13233 1512 aa25.88■■□□□ 1.73
TSC22D1-208ENST00000493016 ZMYM3Q14202 1370 aa25.87■■□□□ 1.73
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TSC22D1-208ENST00000493016 NPATQ14207 1427 aa25.86■■□□□ 1.73
TSC22D1-208ENST00000493016 GGT6Q6P531 493 aa25.85■■□□□ 1.73
TSC22D1-208ENST00000493016 ARHGEF5Q12774 1597 aa25.84■■□□□ 1.73
TSC22D1-208ENST00000493016 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP25.83■■□□□ 1.73
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TSC22D1-208ENST00000493016 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP25.81■■□□□ 1.72
TSC22D1-208ENST00000493016 DMRT2Q9Y5R5 561 aa25.81■■□□□ 1.72
TSC22D1-208ENST00000493016 TSPY4P0CV99 314 aa25.76■■□□□ 1.71
TSC22D1-208ENST00000493016 TSPY10P0CW01 314 aa25.76■■□□□ 1.71
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TSC22D1-208ENST00000493016 MYOM3Q5VTT5 1437 aa25.74■■□□□ 1.71
TSC22D1-208ENST00000493016 CERKQ8TCT0 537 aa25.74■■□□□ 1.71
TSC22D1-208ENST00000493016 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP25.74■■□□□ 1.71
TSC22D1-208ENST00000493016 MYO3AQ8NEV4 1616 aa25.74■■□□□ 1.71
TSC22D1-208ENST00000493016 MIA2Q96PC5 1412 aa25.73■■□□□ 1.71
TSC22D1-208ENST00000493016 KIF3BO15066 747 aa25.73■■□□□ 1.71
TSC22D1-208ENST00000493016 PTPRTO14522 1441 aa25.72■■□□□ 1.71
TSC22D1-208ENST00000493016 NCOA1Q15788 1441 aa25.71■■□□□ 1.71
TSC22D1-208ENST00000493016 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa25.71■■□□□ 1.71
TSC22D1-208ENST00000493016 MAST1Q9Y2H9 1570 aa25.71■■□□□ 1.71
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