RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491660.1

SERP1-208, Transcript of stress associated endoplasmic reticulum protein 1, human

TSL 2 BASIC

Gene SERP1, Length 830 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SERP1-208	ENST00000491660	AKNA	Q7Z591	1439 aa		33.23	■■■□□ 2.91
SERP1-208	ENST00000491660	SUPT6H	Q7KZ85	1726 aa	Known RBP	33.22	■■■□□ 2.91
SERP1-208	ENST00000491660	CDC42BPB	Q9Y5S2	1711 aa		33.22	■■■□□ 2.91
SERP1-208	ENST00000491660	EFCAB2	Q5VUJ9	269 aa		33.22	■■■□□ 2.91
SERP1-208	ENST00000491660	CCNB3	Q8WWL7	1395 aa		33.21	■■■□□ 2.91
SERP1-208	ENST00000491660	NCOA2	Q15596	1464 aa		33.19	■■■□□ 2.9
SERP1-208	ENST00000491660	GPATCH8	Q9UKJ3	1502 aa	Known RBP	33.19	■■■□□ 2.9
SERP1-208	ENST00000491660	ADGRL1	O94910	1474 aa		33.14	■■■□□ 2.9
SERP1-208	ENST00000491660	RAPGEF3	O95398	923 aa		33.12	■■■□□ 2.89
SERP1-208	ENST00000491660	DENND4B	O75064	1496 aa	Predicted RBP	33.11	■■■□□ 2.89
SERP1-208	ENST00000491660	CFDP1	Q9UEE9	299 aa	Predicted RBP	33.1	■■■□□ 2.89
SERP1-208	ENST00000491660	ZNF777	Q9ULD5	760 aa	Predicted RBP	33.1	■■■□□ 2.89
SERP1-208	ENST00000491660	SCAPER	Q9BY12	1400 aa		33.1	■■■□□ 2.89
SERP1-208	ENST00000491660	ITSN2	Q9NZM3	1697 aa		33.09	■■■□□ 2.89
SERP1-208	ENST00000491660	FRMPD1	Q5SYB0	1578 aa		33.06	■■■□□ 2.88
SERP1-208	ENST00000491660	RICTOR	Q6R327	1708 aa		33.03	■■■□□ 2.88
SERP1-208	ENST00000491660	SAMD9L	Q8IVG5	1584 aa		33.03	■■■□□ 2.88
SERP1-208	ENST00000491660	ABCC1	P33527	1531 aa		33.02	■■■□□ 2.88
SERP1-208	ENST00000491660	POGZ	Q7Z3K3	1410 aa		33	■■■□□ 2.87
SERP1-208	ENST00000491660	ARHGEF12	Q9NZN5	1544 aa		32.97	■■■□□ 2.87
SERP1-208	ENST00000491660	ZNF644	Q9H582	1327 aa	Predicted RBP	32.95	■■■□□ 2.86
SERP1-208	ENST00000491660	MYOM3	Q5VTT5	1437 aa		32.94	■■■□□ 2.86
SERP1-208	ENST00000491660	SYCP2	Q9BX26	1530 aa		32.93	■■■□□ 2.86
SERP1-208	ENST00000491660	PLEKHH2	Q8IVE3	1493 aa		32.93	■■■□□ 2.86
SERP1-208	ENST00000491660	PPARGC1B	Q86YN6	1023 aa	Known RBP	32.92	■■■□□ 2.86
SERP1-208	ENST00000491660	AFAP1	Q8N556	730 aa		32.92	■■■□□ 2.86
SERP1-208	ENST00000491660	TRAPPC8	Q9Y2L5	1435 aa		32.92	■■■□□ 2.86
SERP1-208	ENST00000491660	ZNF518A	Q6AHZ1	1483 aa		32.92	■■■□□ 2.86
SERP1-208	ENST00000491660	HNRNPM	P52272	730 aa	Known RBP eCLIP	32.91	■■■□□ 2.86	3e-6	■■■■□ 21.8
SERP1-208	ENST00000491660	ZMYM4	Q5VZL5	1548 aa		32.9	■■■□□ 2.86
SERP1-208	ENST00000491660	KIAA1107	Q9UPP5	1409 aa		32.89	■■■□□ 2.86
SERP1-208	ENST00000491660	CAMSAP2	Q08AD1	1489 aa		32.87	■■■□□ 2.85
SERP1-208	ENST00000491660	KDM5C	P41229	1560 aa		32.85	■■■□□ 2.85
SERP1-208	ENST00000491660	MIA2	Q96PC5	1412 aa		32.85	■■■□□ 2.85
SERP1-208	ENST00000491660	ZFYVE16	Q7Z3T8	1539 aa		32.82	■■■□□ 2.85
SERP1-208	ENST00000491660	MYT1L	Q9UL68	1186 aa		32.82	■■■□□ 2.84
SERP1-208	ENST00000491660	MAGI2	Q86UL8	1455 aa		32.81	■■■□□ 2.84
SERP1-208	ENST00000491660	ARHGEF40	Q8TER5	1519 aa		32.81	■■■□□ 2.84
SERP1-208	ENST00000491660	YEATS2	Q9ULM3	1422 aa		32.8	■■■□□ 2.84
SERP1-208	ENST00000491660	MBD5	Q9P267	1494 aa		32.79	■■■□□ 2.84
SERP1-208	ENST00000491660	HECW2	Q9P2P5	1572 aa		32.79	■■■□□ 2.84
SERP1-208	ENST00000491660	FGD6	Q6ZV73	1430 aa		32.77	■■■□□ 2.84
SERP1-208	ENST00000491660	PTPN23	Q9H3S7	1636 aa		32.75	■■■□□ 2.83
SERP1-208	ENST00000491660	MLH3	Q9UHC1	1453 aa		32.74	■■■□□ 2.83
SERP1-208	ENST00000491660	SPAG9	O60271	1321 aa	Known RBP	32.73	■■■□□ 2.83
SERP1-208	ENST00000491660	CCDC141	Q6ZP82	1450 aa		32.71	■■■□□ 2.83
SERP1-208	ENST00000491660	KIDINS220	Q9ULH0	1771 aa		32.69	■■■□□ 2.82
SERP1-208	ENST00000491660	ARHGEF5	Q12774	1597 aa		32.69	■■■□□ 2.82
SERP1-208	ENST00000491660	ABCA6	Q8N139	1617 aa		32.67	■■■□□ 2.82
SERP1-208	ENST00000491660	RSPH4A	Q5TD94	716 aa		32.67	■■■□□ 2.82
SERP1-208	ENST00000491660	ATP10A	O60312	1499 aa		32.67	■■■□□ 2.82
SERP1-208	ENST00000491660	TCOF1	Q13428	1488 aa	Known RBP	32.67	■■■□□ 2.82
SERP1-208	ENST00000491660	DIP2C	Q9Y2E4	1556 aa		32.66	■■■□□ 2.82
SERP1-208	ENST00000491660	ATP7A	Q04656	1500 aa		32.66	■■■□□ 2.82
SERP1-208	ENST00000491660	INO80	Q9ULG1	1556 aa	Predicted RBP	32.65	■■■□□ 2.82
SERP1-208	ENST00000491660	ARID4B	Q4LE39	1312 aa	Predicted RBP	32.63	■■■□□ 2.81
SERP1-208	ENST00000491660	C9orf84	Q5VXU9	1444 aa		32.62	■■■□□ 2.81
SERP1-208	ENST00000491660	FAM50A	Q14320	339 aa	Known RBP	32.61	■■■□□ 2.81
SERP1-208	ENST00000491660	TSPY4	P0CV99	314 aa		32.6	■■■□□ 2.81
SERP1-208	ENST00000491660	TSPY10	P0CW01	314 aa		32.6	■■■□□ 2.81
SERP1-208	ENST00000491660	SIGLEC1	Q9BZZ2	1709 aa		32.59	■■■□□ 2.81
SERP1-208	ENST00000491660	RTEL1-TNFRSF6B	F6WH68	1400 aa		32.57	■■■□□ 2.8
SERP1-208	ENST00000491660	ABCC5	O15440	1437 aa		32.54	■■■□□ 2.8
SERP1-208	ENST00000491660	DNMT1	P26358	1616 aa	Known RBP	32.54	■■■□□ 2.8
SERP1-208	ENST00000491660	KDM4F	A0A1W2PPD8	638 aa		32.53	■■■□□ 2.8
SERP1-208	ENST00000491660	DAPK1	P53355	1430 aa		32.52	■■■□□ 2.8
SERP1-208	ENST00000491660	RERE	Q9P2R6	1566 aa		32.52	■■■□□ 2.8
SERP1-208	ENST00000491660	MAST1	Q9Y2H9	1570 aa		32.51	■■■□□ 2.79
SERP1-208	ENST00000491660	CROCC2	H7BZ55	1655 aa		32.5	■■■□□ 2.79
SERP1-208	ENST00000491660	ADGB	Q8N7X0	1667 aa		32.48	■■■□□ 2.79
SERP1-208	ENST00000491660	BCORL1	Q5H9F3	1711 aa		32.48	■■■□□ 2.79
SERP1-208	ENST00000491660	A2M	P01023	1474 aa		32.48	■■■□□ 2.79
SERP1-208	ENST00000491660	MLEC	Q14165	292 aa		32.47	■■■□□ 2.79
SERP1-208	ENST00000491660	SHANK2	Q9UPX8	1470 aa		32.46	■■■□□ 2.79
SERP1-208	ENST00000491660	AGL	P35573	1532 aa		32.43	■■■□□ 2.78
SERP1-208	ENST00000491660	PLXNC1	O60486	1568 aa		32.42	■■■□□ 2.78
SERP1-208	ENST00000491660	RRBP1	Q9P2E9	1410 aa	Known RBP	32.42	■■■□□ 2.78
SERP1-208	ENST00000491660	CHIC2	Q9UKJ5	165 aa		32.41	■■■□□ 2.78
SERP1-208	ENST00000491660	ADAMTSL3	P82987	1691 aa		32.4	■■■□□ 2.78
SERP1-208	ENST00000491660	DHX29	Q7Z478	1369 aa	Known RBP	32.38	■■■□□ 2.77
SERP1-208	ENST00000491660	DROSHA	Q9NRR4	1374 aa	Known RBP eCLIP	32.38	■■■□□ 2.77	9e-9	■■■■■ 43.9
SERP1-208	ENST00000491660	MADD	Q8WXG6	1647 aa		32.36	■■■□□ 2.77
SERP1-208	ENST00000491660	ITGAE	P38570	1179 aa		32.35	■■■□□ 2.77
SERP1-208	ENST00000491660	RRP7BP	Q9NSQ0	103 aa		32.34	■■■□□ 2.77
SERP1-208	ENST00000491660	PTPRK	Q15262	1439 aa		32.33	■■■□□ 2.77
SERP1-208	ENST00000491660	ANKRD30A	Q9BXX3	1397 aa		32.32	■■■□□ 2.76
SERP1-208	ENST00000491660	KIF15	Q9NS87	1388 aa		32.32	■■■□□ 2.76
SERP1-208	ENST00000491660	AEBP2	Q6ZN18	517 aa	Predicted RBP	32.31	■■■□□ 2.76
SERP1-208	ENST00000491660	FER1L4	A9Z1Z3	1794 aa		32.29	■■■□□ 2.76
SERP1-208	ENST00000491660	DUOX2	Q9NRD8	1548 aa		32.28	■■■□□ 2.76
SERP1-208	ENST00000491660	ADGRL2	O95490	1459 aa		32.28	■■■□□ 2.76
SERP1-208	ENST00000491660	RIMS1	Q86UR5	1692 aa	Known RBP	32.27	■■■□□ 2.76
SERP1-208	ENST00000491660	NCOA1	Q15788	1441 aa		32.27	■■■□□ 2.76
SERP1-208	ENST00000491660	KIF3B	O15066	747 aa		32.27	■■■□□ 2.76
SERP1-208	ENST00000491660	GGT6	Q6P531	493 aa		32.26	■■■□□ 2.75
SERP1-208	ENST00000491660	PTPRM	P28827	1452 aa		32.22	■■■□□ 2.75
SERP1-208	ENST00000491660	ESF1	Q9H501	851 aa	Known RBP	32.2	■■■□□ 2.75
SERP1-208	ENST00000491660	EIF2AK4	Q9P2K8	1649 aa	Known RBP	32.19	■■■□□ 2.74
SERP1-208	ENST00000491660	ERBIN	Q96RT1	1412 aa		32.18	■■■□□ 2.74
SERP1-208	ENST00000491660	PLPPR3	Q6T4P5	718 aa		32.17	■■■□□ 2.74

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