RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000487547.1

USP34-216, Transcript of ubiquitin specific peptidase 34, humanhuman

TSL 3

Gene USP34, Length 612 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP34-216ENST00000487547 FAM163AQ96GL9 167 aaPredicted RBP15.53■□□□□ 0.08
USP34-216ENST00000487547 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP15.5■□□□□ 0.07
USP34-216ENST00000487547 POTEMA6NI47 508 aa15.47■□□□□ 0.07
USP34-216ENST00000487547 POTEGQ6S5H5 508 aa15.46■□□□□ 0.07
USP34-216ENST00000487547 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa15.45■□□□□ 0.06
USP34-216ENST00000487547 SNPHO15079 494 aa15.43■□□□□ 0.06
USP34-216ENST00000487547 PDE4AP27815 886 aa15.43■□□□□ 0.06
USP34-216ENST00000487547 ST18O60284 1047 aa15.41■□□□□ 0.06
USP34-216ENST00000487547 TMC2Q8TDI7 906 aa15.41■□□□□ 0.06
USP34-216ENST00000487547 TMEM92Q6UXU6 159 aa15.37■□□□□ 0.05
USP34-216ENST00000487547 GPHNQ9NQX3 736 aaPredicted RBP15.37■□□□□ 0.05
USP34-216ENST00000487547 CADPS2Q86UW7 1296 aa15.36■□□□□ 0.05
USP34-216ENST00000487547 VSIG10Q8N0Z9 540 aa15.35■□□□□ 0.05
USP34-216ENST00000487547 CRISPLD2Q9H0B8 497 aa15.34■□□□□ 0.05
USP34-216ENST00000487547 KIF3CO14782 793 aa15.31■□□□□ 0.04
USP34-216ENST00000487547 SLC24A1O60721 1099 aa15.31■□□□□ 0.04
USP34-216ENST00000487547 WDR70Q9NW82 654 aa15.31■□□□□ 0.04
USP34-216ENST00000487547 C2orf72A6NCS6 295 aa15.3■□□□□ 0.04
USP34-216ENST00000487547 LARP6Q9BRS8 491 aaKnown RBP15.3■□□□□ 0.04
USP34-216ENST00000487547 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa15.3■□□□□ 0.04
USP34-216ENST00000487547 HOXB3P14651 431 aaPredicted RBP15.29■□□□□ 0.04
USP34-216ENST00000487547 FOXK1P85037 733 aa15.27■□□□□ 0.04
USP34-216ENST00000487547 DDX27Q96GQ7 796 aaKnown RBP15.27■□□□□ 0.04
USP34-216ENST00000487547 MFSD10Q14728 455 aa15.26■□□□□ 0.03
USP34-216ENST00000487547 PPP1R15BQ5SWA1 713 aa15.22■□□□□ 0.03
USP34-216ENST00000487547 PCDH10Q9P2E7 1040 aa15.22■□□□□ 0.03
USP34-216ENST00000487547 DSG2Q14126 1118 aa15.2■□□□□ 0.02
USP34-216ENST00000487547 DOK7Q18PE1 504 aa15.2■□□□□ 0.02
USP34-216ENST00000487547 PLPP6Q8IY26 295 aa15.19■□□□□ 0.02
USP34-216ENST00000487547 MARVELD3Q96A59 401 aa15.19■□□□□ 0.02
USP34-216ENST00000487547 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa15.16■□□□□ 0.02
USP34-216ENST00000487547 ZNF710Q8N1W2 664 aa15.13■□□□□ 0.01
USP34-216ENST00000487547 EMP3P54852 163 aa15.12■□□□□ 0.01
USP34-216ENST00000487547 E2F4Q16254 413 aa15.12■□□□□ 0.01
USP34-216ENST00000487547 RIMBP2O15034 1052 aa15.11■□□□□ 0.01
USP34-216ENST00000487547 SLC34A2O95436 690 aa15.11■□□□□ 0.01
USP34-216ENST00000487547 HOXB1P14653 301 aaPredicted RBP15.11■□□□□ 0.01
USP34-216ENST00000487547 CDAN1Q8IWY9 1227 aa15.1■□□□□ 0.01
USP34-216ENST00000487547 CAMK2BQ13554 666 aa15.09■□□□□ 0.01
USP34-216ENST00000487547 P3H3Q8IVL6 736 aa15.09■□□□□ 0.01
USP34-216ENST00000487547 ZSWIM6Q9HCJ5 1215 aa15.09■□□□□ 0.01
USP34-216ENST00000487547 TBC1D12O60347 775 aa15.07■□□□□ 0
USP34-216ENST00000487547 GPR153Q6NV75 609 aa15.03■□□□□ -0
USP34-216ENST00000487547 PTCD2Q8WV60 388 aaKnown RBP15.03■□□□□ -0
USP34-216ENST00000487547 POTEB3A0JP26 581 aa15.02■□□□□ -0
USP34-216ENST00000487547 POTEBQ6S5H4 581 aa15.02■□□□□ -0
USP34-216ENST00000487547 FAM205CA6NFA0 338 aa15.01□□□□□ -0.01
USP34-216ENST00000487547 HS3ST6Q96QI5 342 aa15.01□□□□□ -0.01
USP34-216ENST00000487547 ARIH1Q9Y4X5 557 aaPredicted RBP15□□□□□ -0.01
USP34-216ENST00000487547 OXER1Q8TDS5 423 aa14.99□□□□□ -0.01
USP34-216ENST00000487547 ARHGEF1Q92888 912 aaKnown RBP14.98□□□□□ -0.01
USP34-216ENST00000487547 PLSCR2Q9NRY7 297 aa14.98□□□□□ -0.01
USP34-216ENST00000487547 MAP3K9P80192 1104 aa14.97□□□□□ -0.01
USP34-216ENST00000487547 EMILIN3Q9NT22 766 aa14.96□□□□□ -0.01
USP34-216ENST00000487547 ARSIQ5FYB1 569 aa14.95□□□□□ -0.02
USP34-216ENST00000487547 PCDHGA4Q9Y5G9 962 aa14.95□□□□□ -0.02
USP34-216ENST00000487547 KCNV2Q8TDN2 545 aa14.93□□□□□ -0.02
USP34-216ENST00000487547 UPF1Q92900 1129 aaKnown RBP eCLIP14.93□□□□□ -0.02
USP34-216ENST00000487547 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP14.92□□□□□ -0.02
USP34-216ENST00000487547 ERBB3P21860 1342 aa14.92□□□□□ -0.02
USP34-216ENST00000487547 SPDYE16A6NNV3 312 aaPredicted RBP14.9□□□□□ -0.02
USP34-216ENST00000487547 KHSRPQ92945 711 aaKnown RBP eCLIP14.9□□□□□ -0.023e-7■■■■□ 20.6
USP34-216ENST00000487547 DPYSL4O14531 572 aa14.88□□□□□ -0.03
USP34-216ENST00000487547 VARS2Q5ST30 1063 aaKnown RBP14.86□□□□□ -0.03
USP34-216ENST00000487547 KRTAP3-3Q9BYR6 98 aa14.86□□□□□ -0.03
USP34-216ENST00000487547 KRTAP3-2Q9BYR7 98 aa14.86□□□□□ -0.03
USP34-216ENST00000487547 EVI5O60447 810 aa14.83□□□□□ -0.04
USP34-216ENST00000487547 NUDT7P0C024 238 aa14.82□□□□□ -0.04
USP34-216ENST00000487547 PDIA6Q15084 440 aa14.82□□□□□ -0.04
USP34-216ENST00000487547 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP14.82□□□□□ -0.04
USP34-216ENST00000487547 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa14.78□□□□□ -0.04
USP34-216ENST00000487547 PSDA5PKW4 1024 aaPredicted RBP14.77□□□□□ -0.05
USP34-216ENST00000487547 ZNF687Q8N1G0 1237 aa14.76□□□□□ -0.05
USP34-216ENST00000487547 PTGER2P43116 358 aa14.75□□□□□ -0.05
USP34-216ENST00000487547 NBR1Q14596 966 aa14.75□□□□□ -0.05
USP34-216ENST00000487547 SPNS2Q8IVW8 549 aa14.74□□□□□ -0.05
USP34-216ENST00000487547 LHX6Q9UPM6 363 aa14.73□□□□□ -0.05
USP34-216ENST00000487547 SMYD5Q6GMV2 418 aa14.69□□□□□ -0.06
USP34-216ENST00000487547 BCANQ96GW7 911 aa14.67□□□□□ -0.06
USP34-216ENST00000487547 TULP1O00294 542 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
USP34-216ENST00000487547 PHF14O94880 888 aa14.66□□□□□ -0.06
USP34-216ENST00000487547 JPH4Q96JJ6 628 aa14.66□□□□□ -0.06
USP34-216ENST00000487547 EPAS1Q99814 870 aa14.66□□□□□ -0.06
USP34-216ENST00000487547 SEMA3EO15041 775 aa14.65□□□□□ -0.06
USP34-216ENST00000487547 MMRN1Q13201 1228 aa14.64□□□□□ -0.07
USP34-216ENST00000487547 PPP4R3BQ5MIZ7 849 aa14.64□□□□□ -0.07
USP34-216ENST00000487547 TESPA1A2RU30 521 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
USP34-216ENST00000487547 FOSBP53539 338 aa14.63□□□□□ -0.07
USP34-216ENST00000487547 FBXW7Q969H0 707 aa14.63□□□□□ -0.07
USP34-216ENST00000487547 ZNF454Q8N9F8 522 aa14.62□□□□□ -0.07
USP34-216ENST00000487547 DDX12PQ92771 950 aa14.62□□□□□ -0.07
USP34-216ENST00000487547 GRXCR2A6NFK2 248 aa14.61□□□□□ -0.07
USP34-216ENST00000487547 TYW1BQ6NUM6 668 aa14.61□□□□□ -0.07
USP34-216ENST00000487547 PBX2P40425 430 aa14.59□□□□□ -0.07
USP34-216ENST00000487547 ZDHHC16Q969W1 377 aa14.59□□□□□ -0.07
USP34-216ENST00000487547 POTEEQ6S8J3 1075 aa14.58□□□□□ -0.08
USP34-216ENST00000487547 PCDHGA10Q9Y5H3 936 aa14.58□□□□□ -0.08
USP34-216ENST00000487547 MLLT3P42568 568 aaPredicted RBP14.56□□□□□ -0.08
USP34-216ENST00000487547 LSM11P83369 360 aaKnown RBP eCLIP14.54□□□□□ -0.08
USP34-216ENST00000487547 OSBPP22059 807 aa14.53□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22 ms