RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486072.1

MIB2-212, Transcript of mindbomb E3 ubiquitin protein ligase 2, humanhuman

TSL 3

Gene MIB2, Length 568 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MIB2-212ENST00000486072 SCAPERQ9BY12 1400 aa34.88■■■■□ 3.17
MIB2-212ENST00000486072 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa34.86■■■■□ 3.17
MIB2-212ENST00000486072 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa34.85■■■■□ 3.17
MIB2-212ENST00000486072 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP34.84■■■■□ 3.17
MIB2-212ENST00000486072 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP34.83■■■■□ 3.17
MIB2-212ENST00000486072 MAGI2Q86UL8 1455 aa34.83■■■■□ 3.17
MIB2-212ENST00000486072 CLIP1P30622 1438 aa34.79■■■■□ 3.16
MIB2-212ENST00000486072 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP34.79■■■■□ 3.16
MIB2-212ENST00000486072 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa34.78■■■■□ 3.16
MIB2-212ENST00000486072 ARHGAP5Q13017 1502 aa34.76■■■■□ 3.16
MIB2-212ENST00000486072 LMTK3Q96Q04 1460 aa34.73■■■■□ 3.15
MIB2-212ENST00000486072 PLPPR3Q6T4P5 718 aa34.72■■■■□ 3.15
MIB2-212ENST00000486072 MLECQ14165 292 aa34.71■■■■□ 3.15
MIB2-212ENST00000486072 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa34.69■■■■□ 3.14
MIB2-212ENST00000486072 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa34.68■■■■□ 3.14
MIB2-212ENST00000486072 CCDC18Q5T9S5 1454 aa34.67■■■■□ 3.14
MIB2-212ENST00000486072 ATP10AO60312 1499 aa34.66■■■■□ 3.14
MIB2-212ENST00000486072 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa34.66■■■■□ 3.14
MIB2-212ENST00000486072 C9orf84Q5VXU9 1444 aa34.66■■■■□ 3.14
MIB2-212ENST00000486072 KDM5CP41229 1560 aa34.62■■■■□ 3.13
MIB2-212ENST00000486072 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa34.62■■■■□ 3.13
MIB2-212ENST00000486072 PREX2Q70Z35 1606 aa34.62■■■■□ 3.13
MIB2-212ENST00000486072 AFAP1Q8N556 730 aa34.58■■■■□ 3.13
MIB2-212ENST00000486072 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa34.58■■■■□ 3.13
MIB2-212ENST00000486072 FYCO1Q9BQS8 1478 aa34.58■■■■□ 3.13
MIB2-212ENST00000486072 HSPA2P54652 639 aa34.54■■■■□ 3.12
MIB2-212ENST00000486072 MYT1LQ9UL68 1186 aa34.54■■■■□ 3.12
MIB2-212ENST00000486072 ABCC1P33527 1531 aa34.54■■■■□ 3.12
MIB2-212ENST00000486072 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa34.53■■■■□ 3.12
MIB2-212ENST00000486072 ABCA6Q8N139 1617 aa34.5■■■■□ 3.11
MIB2-212ENST00000486072 ITSN2Q9NZM3 1697 aa34.5■■■■□ 3.11
MIB2-212ENST00000486072 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa34.5■■■■□ 3.11
MIB2-212ENST00000486072 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa34.47■■■■□ 3.11
MIB2-212ENST00000486072 MLH3Q9UHC1 1453 aa34.45■■■■□ 3.1
MIB2-212ENST00000486072 REREQ9P2R6 1566 aa34.44■■■■□ 3.1
MIB2-212ENST00000486072 FBXO41Q8TF61 875 aa34.41■■■■□ 3.1
MIB2-212ENST00000486072 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP34.39■■■■□ 3.1
MIB2-212ENST00000486072 PREX1Q8TCU6 1659 aa34.38■■■■□ 3.09
MIB2-212ENST00000486072 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa34.38■■■■□ 3.09
MIB2-212ENST00000486072 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa34.35■■■■□ 3.09
MIB2-212ENST00000486072 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa34.35■■■■□ 3.09
MIB2-212ENST00000486072 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP34.34■■■■□ 3.09
MIB2-212ENST00000486072 SYCP2Q9BX26 1530 aa34.33■■■■□ 3.09
MIB2-212ENST00000486072 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP34.32■■■■□ 3.08
MIB2-212ENST00000486072 AGLP35573 1532 aa34.31■■■■□ 3.08
MIB2-212ENST00000486072 CEP162Q5TB80 1403 aa34.28■■■■□ 3.08
MIB2-212ENST00000486072 C3P01024 1663 aa34.25■■■■□ 3.07
MIB2-212ENST00000486072 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa34.24■■■■□ 3.07
MIB2-212ENST00000486072 MTUS2Q5JR59 1369 aa34.23■■■■□ 3.07
MIB2-212ENST00000486072 CCNB3Q8WWL7 1395 aa34.22■■■■□ 3.07
MIB2-212ENST00000486072 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP34.2■■■■□ 3.07
MIB2-212ENST00000486072 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP34.19■■■■□ 3.06
MIB2-212ENST00000486072 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP34.19■■■■□ 3.06
MIB2-212ENST00000486072 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP34.18■■■■□ 3.06
MIB2-212ENST00000486072 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa34.17■■■■□ 3.06
MIB2-212ENST00000486072 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP34.17■■■■□ 3.06
MIB2-212ENST00000486072 ATP7AQ04656 1500 aa34.16■■■■□ 3.06
MIB2-212ENST00000486072 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP34.15■■■■□ 3.06
MIB2-212ENST00000486072 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa34.14■■■■□ 3.06
MIB2-212ENST00000486072 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa34.14■■■■□ 3.06
MIB2-212ENST00000486072 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP34.13■■■■□ 3.05
MIB2-212ENST00000486072 TIAM1Q13009 1591 aa34.13■■■■□ 3.05
MIB2-212ENST00000486072 CNTLNQ9NXG0 1405 aa34.13■■■■□ 3.05
MIB2-212ENST00000486072 STRCQ7RTU9 1775 aa34.12■■■■□ 3.05
MIB2-212ENST00000486072 PLXNC1O60486 1568 aa34.07■■■■□ 3.05
MIB2-212ENST00000486072 CERKQ8TCT0 537 aa34.07■■■■□ 3.04
MIB2-212ENST00000486072 A2MP01023 1474 aa34.05■■■■□ 3.04
MIB2-212ENST00000486072 MROH2AA6NES4 1674 aa34.05■■■■□ 3.04
MIB2-212ENST00000486072 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP34.03■■■■□ 3.04
MIB2-212ENST00000486072 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP33.99■■■■□ 3.03
MIB2-212ENST00000486072 DMRT2Q9Y5R5 561 aa33.98■■■■□ 3.03
MIB2-212ENST00000486072 ADGBQ8N7X0 1667 aa33.96■■■■□ 3.03
MIB2-212ENST00000486072 NPATQ14207 1427 aa33.96■■■■□ 3.03
MIB2-212ENST00000486072 ZMYM3Q14202 1370 aa33.95■■■■□ 3.02
MIB2-212ENST00000486072 MBD5Q9P267 1494 aa33.95■■■■□ 3.02
MIB2-212ENST00000486072 NCOA2Q15596 1464 aa33.91■■■■□ 3.02
MIB2-212ENST00000486072 PTPRTO14522 1441 aa33.9■■■■□ 3.02
MIB2-212ENST00000486072 NCOA1Q15788 1441 aa33.9■■■■□ 3.02
MIB2-212ENST00000486072 GGT6Q6P531 493 aa33.9■■■■□ 3.02
MIB2-212ENST00000486072 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa33.87■■■■□ 3.01
MIB2-212ENST00000486072 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa33.86■■■■□ 3.01
MIB2-212ENST00000486072 MYO3AQ8NEV4 1616 aa33.86■■■■□ 3.01
MIB2-212ENST00000486072 CCDC141Q6ZP82 1450 aa33.84■■■■□ 3.01
MIB2-212ENST00000486072 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa33.84■■■■□ 3.01
MIB2-212ENST00000486072 VPS8Q8N3P4 1428 aa33.83■■■■□ 3.01
MIB2-212ENST00000486072 PTPRKQ15262 1439 aa33.82■■■■□ 3
MIB2-212ENST00000486072 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP33.81■■■■□ 3
MIB2-212ENST00000486072 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP33.77■■■■□ 3
MIB2-212ENST00000486072 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP33.76■■■■□ 3
MIB2-212ENST00000486072 LTBP4Q8N2S1 1624 aa33.74■■■□□ 2.99
MIB2-212ENST00000486072 PPP6R1Q9UPN7 881 aa33.72■■■□□ 2.99
MIB2-212ENST00000486072 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa33.71■■■□□ 2.99
MIB2-212ENST00000486072 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa33.71■■■□□ 2.99
MIB2-212ENST00000486072 ARHGEF5Q12774 1597 aa33.7■■■□□ 2.99
MIB2-212ENST00000486072 KIF3BO15066 747 aa33.69■■■□□ 2.98
MIB2-212ENST00000486072 PLA2R1Q13018 1463 aa33.68■■■□□ 2.98
MIB2-212ENST00000486072 KDM5DQ9BY66 1539 aa33.67■■■□□ 2.98
MIB2-212ENST00000486072 RSPH4AQ5TD94 716 aa33.64■■■□□ 2.98
MIB2-212ENST00000486072 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP33.63■■■□□ 2.97
MIB2-212ENST00000486072 A2ML1A8K2U0 1454 aa33.62■■■□□ 2.97
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.6 ms