RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000485349.5

SKIV2L-211, Transcript of Ski2 like RNA helicase, humanhuman

TSL 2

Gene SKIV2L, Length 734 nt, Biotype retained intron.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKIV2L-211ENST00000485349 YEATS2Q9ULM3 1422 aa27.87■■■□□ 2.05
SKIV2L-211ENST00000485349 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP27.85■■■□□ 2.05
SKIV2L-211ENST00000485349 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP27.84■■■□□ 2.05
SKIV2L-211ENST00000485349 SCAPERQ9BY12 1400 aa27.84■■■□□ 2.05
SKIV2L-211ENST00000485349 MAGI2Q86UL8 1455 aa27.83■■■□□ 2.05
SKIV2L-211ENST00000485349 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP27.82■■■□□ 2.04
SKIV2L-211ENST00000485349 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP27.8■■■□□ 2.04
SKIV2L-211ENST00000485349 CLIP1P30622 1438 aa27.79■■■□□ 2.04
SKIV2L-211ENST00000485349 ARHGAP5Q13017 1502 aa27.77■■■□□ 2.04
SKIV2L-211ENST00000485349 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa27.75■■■□□ 2.03
SKIV2L-211ENST00000485349 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa27.75■■■□□ 2.03
SKIV2L-211ENST00000485349 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa27.74■■■□□ 2.03
SKIV2L-211ENST00000485349 CCDC18Q5T9S5 1454 aa27.74■■■□□ 2.03
SKIV2L-211ENST00000485349 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa27.73■■■□□ 2.03
SKIV2L-211ENST00000485349 LMTK3Q96Q04 1460 aa27.71■■■□□ 2.03
SKIV2L-211ENST00000485349 PREX2Q70Z35 1606 aa27.71■■■□□ 2.03
SKIV2L-211ENST00000485349 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa27.7■■■□□ 2.03
SKIV2L-211ENST00000485349 KDM5CP41229 1560 aa27.7■■■□□ 2.03
SKIV2L-211ENST00000485349 ATP10AO60312 1499 aa27.68■■■□□ 2.02
SKIV2L-211ENST00000485349 FYCO1Q9BQS8 1478 aa27.68■■■□□ 2.02
SKIV2L-211ENST00000485349 C9orf84Q5VXU9 1444 aa27.67■■■□□ 2.02
SKIV2L-211ENST00000485349 MLECQ14165 292 aa27.65■■■□□ 2.02
SKIV2L-211ENST00000485349 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa27.64■■■□□ 2.01
SKIV2L-211ENST00000485349 ABCC1P33527 1531 aa27.63■■■□□ 2.01
SKIV2L-211ENST00000485349 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa27.63■■■□□ 2.01
SKIV2L-211ENST00000485349 PLPPR3Q6T4P5 718 aa27.62■■■□□ 2.01
SKIV2L-211ENST00000485349 ITSN2Q9NZM3 1697 aa27.62■■■□□ 2.01
SKIV2L-211ENST00000485349 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa27.61■■■□□ 2.01
SKIV2L-211ENST00000485349 AFAP1Q8N556 730 aa27.61■■■□□ 2.01
SKIV2L-211ENST00000485349 ABCA6Q8N139 1617 aa27.6■■■□□ 2.01
SKIV2L-211ENST00000485349 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa27.55■■■□□ 2
SKIV2L-211ENST00000485349 REREQ9P2R6 1566 aa27.55■■■□□ 2
SKIV2L-211ENST00000485349 MLH3Q9UHC1 1453 aa27.54■■■□□ 2
SKIV2L-211ENST00000485349 MYT1LQ9UL68 1186 aa27.51■■□□□ 1.99
SKIV2L-211ENST00000485349 HSPA2P54652 639 aa27.5■■□□□ 1.99
SKIV2L-211ENST00000485349 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa27.5■■□□□ 1.99
SKIV2L-211ENST00000485349 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa27.5■■□□□ 1.99
SKIV2L-211ENST00000485349 PREX1Q8TCU6 1659 aa27.49■■□□□ 1.99
SKIV2L-211ENST00000485349 SYCP2Q9BX26 1530 aa27.46■■□□□ 1.99
SKIV2L-211ENST00000485349 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP27.46■■□□□ 1.99
SKIV2L-211ENST00000485349 AGLP35573 1532 aa27.43■■□□□ 1.98
SKIV2L-211ENST00000485349 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP27.41■■□□□ 1.98
SKIV2L-211ENST00000485349 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP27.4■■□□□ 1.98
SKIV2L-211ENST00000485349 C3P01024 1663 aa27.4■■□□□ 1.98
SKIV2L-211ENST00000485349 FBXO41Q8TF61 875 aa27.37■■□□□ 1.97
SKIV2L-211ENST00000485349 MTUS2Q5JR59 1369 aa27.35■■□□□ 1.97
SKIV2L-211ENST00000485349 CEP162Q5TB80 1403 aa27.34■■□□□ 1.97
SKIV2L-211ENST00000485349 TIAM1Q13009 1591 aa27.34■■□□□ 1.97
SKIV2L-211ENST00000485349 CCNB3Q8WWL7 1395 aa27.34■■□□□ 1.97
SKIV2L-211ENST00000485349 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP27.33■■□□□ 1.97
SKIV2L-211ENST00000485349 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa27.32■■□□□ 1.96
SKIV2L-211ENST00000485349 ATP7AQ04656 1500 aa27.31■■□□□ 1.96
SKIV2L-211ENST00000485349 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP27.31■■□□□ 1.96
SKIV2L-211ENST00000485349 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP27.31■■□□□ 1.96
SKIV2L-211ENST00000485349 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa27.31■■□□□ 1.96
SKIV2L-211ENST00000485349 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP27.3■■□□□ 1.96
SKIV2L-211ENST00000485349 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP27.3■■□□□ 1.96
SKIV2L-211ENST00000485349 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa27.3■■□□□ 1.96
SKIV2L-211ENST00000485349 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa27.3■■□□□ 1.96
SKIV2L-211ENST00000485349 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP27.29■■□□□ 1.96
SKIV2L-211ENST00000485349 STRCQ7RTU9 1775 aa27.29■■□□□ 1.96
SKIV2L-211ENST00000485349 PLXNC1O60486 1568 aa27.27■■□□□ 1.96
SKIV2L-211ENST00000485349 MROH2AA6NES4 1674 aa27.25■■□□□ 1.95
SKIV2L-211ENST00000485349 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP27.24■■□□□ 1.95
SKIV2L-211ENST00000485349 CNTLNQ9NXG0 1405 aa27.24■■□□□ 1.95
SKIV2L-211ENST00000485349 A2MP01023 1474 aa27.2■■□□□ 1.95
SKIV2L-211ENST00000485349 ADGBQ8N7X0 1667 aa27.2■■□□□ 1.94
SKIV2L-211ENST00000485349 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP27.19■■□□□ 1.94
SKIV2L-211ENST00000485349 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP27.19■■□□□ 1.94
SKIV2L-211ENST00000485349 MBD5Q9P267 1494 aa27.17■■□□□ 1.94
SKIV2L-211ENST00000485349 NCOA2Q15596 1464 aa27.13■■□□□ 1.93
SKIV2L-211ENST00000485349 CERKQ8TCT0 537 aa27.12■■□□□ 1.93
SKIV2L-211ENST00000485349 NPATQ14207 1427 aa27.11■■□□□ 1.93
SKIV2L-211ENST00000485349 ZMYM3Q14202 1370 aa27.1■■□□□ 1.93
SKIV2L-211ENST00000485349 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa27.09■■□□□ 1.93
SKIV2L-211ENST00000485349 MYO3AQ8NEV4 1616 aa27.08■■□□□ 1.93
SKIV2L-211ENST00000485349 DMRT2Q9Y5R5 561 aa27.07■■□□□ 1.92
SKIV2L-211ENST00000485349 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa27.06■■□□□ 1.92
SKIV2L-211ENST00000485349 NCOA1Q15788 1441 aa27.06■■□□□ 1.92
SKIV2L-211ENST00000485349 CCDC141Q6ZP82 1450 aa27.06■■□□□ 1.92
SKIV2L-211ENST00000485349 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP27.05■■□□□ 1.92
SKIV2L-211ENST00000485349 VPS8Q8N3P4 1428 aa27.05■■□□□ 1.92
SKIV2L-211ENST00000485349 GGT6Q6P531 493 aa27.04■■□□□ 1.92
SKIV2L-211ENST00000485349 PTPRTO14522 1441 aa27.04■■□□□ 1.92
SKIV2L-211ENST00000485349 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa27.04■■□□□ 1.92
SKIV2L-211ENST00000485349 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa27.02■■□□□ 1.92
SKIV2L-211ENST00000485349 PTPRKQ15262 1439 aa27.01■■□□□ 1.91
SKIV2L-211ENST00000485349 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa27■■□□□ 1.91
SKIV2L-211ENST00000485349 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP26.98■■□□□ 1.91
SKIV2L-211ENST00000485349 ARHGEF5Q12774 1597 aa26.98■■□□□ 1.91
SKIV2L-211ENST00000485349 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP26.98■■□□□ 1.91
SKIV2L-211ENST00000485349 LTBP4Q8N2S1 1624 aa26.94■■□□□ 1.9
SKIV2L-211ENST00000485349 PPP6R1Q9UPN7 881 aa26.93■■□□□ 1.9
SKIV2L-211ENST00000485349 KDM5DQ9BY66 1539 aa26.91■■□□□ 1.9
SKIV2L-211ENST00000485349 MAP3K1Q13233 1512 aa26.9■■□□□ 1.9
SKIV2L-211ENST00000485349 PLA2R1Q13018 1463 aa26.89■■□□□ 1.9
SKIV2L-211ENST00000485349 KIF3BO15066 747 aa26.89■■□□□ 1.9
SKIV2L-211ENST00000485349 RSPH4AQ5TD94 716 aa26.89■■□□□ 1.9
SKIV2L-211ENST00000485349 FAM135AQ9P2D6 1515 aa26.89■■□□□ 1.89
SKIV2L-211ENST00000485349 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa26.88■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.1 ms