RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000482618.5

EPHB1-208, Transcript of EPH receptor B1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene EPHB1, Length 1,496 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHB1-208ENST00000482618 CLIP1P30622 1438 aa26.45■■□□□ 1.82
EPHB1-208ENST00000482618 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP26.45■■□□□ 1.82
EPHB1-208ENST00000482618 POGZQ7Z3K3 1410 aa26.44■■□□□ 1.82
EPHB1-208ENST00000482618 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa26.44■■□□□ 1.82
EPHB1-208ENST00000482618 SCAPERQ9BY12 1400 aa26.44■■□□□ 1.82
EPHB1-208ENST00000482618 YEATS2Q9ULM3 1422 aa26.42■■□□□ 1.82
EPHB1-208ENST00000482618 ARHGAP5Q13017 1502 aa26.41■■□□□ 1.82
EPHB1-208ENST00000482618 MAGI2Q86UL8 1455 aa26.41■■□□□ 1.82
EPHB1-208ENST00000482618 CCDC18Q5T9S5 1454 aa26.41■■□□□ 1.82
EPHB1-208ENST00000482618 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa26.4■■□□□ 1.82
EPHB1-208ENST00000482618 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa26.39■■□□□ 1.81
EPHB1-208ENST00000482618 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa26.38■■□□□ 1.81
EPHB1-208ENST00000482618 PREX2Q70Z35 1606 aa26.36■■□□□ 1.81
EPHB1-208ENST00000482618 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa26.35■■□□□ 1.81
EPHB1-208ENST00000482618 FYCO1Q9BQS8 1478 aa26.35■■□□□ 1.81
EPHB1-208ENST00000482618 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa26.32■■□□□ 1.8
EPHB1-208ENST00000482618 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa26.3■■□□□ 1.8
EPHB1-208ENST00000482618 KDM5CP41229 1560 aa26.3■■□□□ 1.8
EPHB1-208ENST00000482618 C9orf84Q5VXU9 1444 aa26.27■■□□□ 1.8
EPHB1-208ENST00000482618 ATP10AO60312 1499 aa26.27■■□□□ 1.8
EPHB1-208ENST00000482618 ITSN2Q9NZM3 1697 aa26.26■■□□□ 1.79
EPHB1-208ENST00000482618 MLECQ14165 292 aa26.24■■□□□ 1.79
EPHB1-208ENST00000482618 ABCC1P33527 1531 aa26.24■■□□□ 1.79
EPHB1-208ENST00000482618 LMTK3Q96Q04 1460 aa26.23■■□□□ 1.79
EPHB1-208ENST00000482618 PLPPR3Q6T4P5 718 aa26.22■■□□□ 1.79
EPHB1-208ENST00000482618 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP26.22■■□□□ 1.79
EPHB1-208ENST00000482618 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa26.21■■□□□ 1.79
EPHB1-208ENST00000482618 AFAP1Q8N556 730 aa26.2■■□□□ 1.78
EPHB1-208ENST00000482618 MYT1LQ9UL68 1186 aa26.2■■□□□ 1.78
EPHB1-208ENST00000482618 ABCA6Q8N139 1617 aa26.2■■□□□ 1.78
EPHB1-208ENST00000482618 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa26.19■■□□□ 1.78
EPHB1-208ENST00000482618 REREQ9P2R6 1566 aa26.14■■□□□ 1.78
EPHB1-208ENST00000482618 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa26.14■■□□□ 1.78
EPHB1-208ENST00000482618 MLH3Q9UHC1 1453 aa26.14■■□□□ 1.77
EPHB1-208ENST00000482618 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa26.12■■□□□ 1.77
EPHB1-208ENST00000482618 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa26.12■■□□□ 1.77
EPHB1-208ENST00000482618 SYCP2Q9BX26 1530 aa26.09■■□□□ 1.77
EPHB1-208ENST00000482618 PREX1Q8TCU6 1659 aa26.09■■□□□ 1.77
EPHB1-208ENST00000482618 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP26.08■■□□□ 1.77
EPHB1-208ENST00000482618 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP26.07■■□□□ 1.76
EPHB1-208ENST00000482618 MTUS2Q5JR59 1369 aa26.05■■□□□ 1.76
EPHB1-208ENST00000482618 CEP162Q5TB80 1403 aa26.05■■□□□ 1.76
EPHB1-208ENST00000482618 HSPA2P54652 639 aa26.04■■□□□ 1.76
EPHB1-208ENST00000482618 AGLP35573 1532 aa26.03■■□□□ 1.76
EPHB1-208ENST00000482618 CCNB3Q8WWL7 1395 aa26.02■■□□□ 1.76
EPHB1-208ENST00000482618 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa26.02■■□□□ 1.76
EPHB1-208ENST00000482618 C3P01024 1663 aa26.01■■□□□ 1.75
EPHB1-208ENST00000482618 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP26■■□□□ 1.75
EPHB1-208ENST00000482618 TIAM1Q13009 1591 aa25.99■■□□□ 1.75
EPHB1-208ENST00000482618 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa25.99■■□□□ 1.75
EPHB1-208ENST00000482618 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP25.98■■□□□ 1.75
EPHB1-208ENST00000482618 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP25.98■■□□□ 1.75
EPHB1-208ENST00000482618 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP25.98■■□□□ 1.75
EPHB1-208ENST00000482618 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP25.97■■□□□ 1.75
EPHB1-208ENST00000482618 ATP7AQ04656 1500 aa25.97■■□□□ 1.75
EPHB1-208ENST00000482618 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP25.94■■□□□ 1.74
EPHB1-208ENST00000482618 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP25.94■■□□□ 1.74
EPHB1-208ENST00000482618 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa25.94■■□□□ 1.74
EPHB1-208ENST00000482618 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP25.92■■□□□ 1.74
EPHB1-208ENST00000482618 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa25.9■■□□□ 1.74
EPHB1-208ENST00000482618 MROH2AA6NES4 1674 aa25.89■■□□□ 1.73
EPHB1-208ENST00000482618 ADGBQ8N7X0 1667 aa25.89■■□□□ 1.73
EPHB1-208ENST00000482618 PLXNC1O60486 1568 aa25.88■■□□□ 1.73
EPHB1-208ENST00000482618 FBXO41Q8TF61 875 aa25.87■■□□□ 1.73
EPHB1-208ENST00000482618 CNTLNQ9NXG0 1405 aa25.87■■□□□ 1.73
EPHB1-208ENST00000482618 STRCQ7RTU9 1775 aa25.86■■□□□ 1.73
EPHB1-208ENST00000482618 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP25.84■■□□□ 1.73
EPHB1-208ENST00000482618 A2MP01023 1474 aa25.84■■□□□ 1.73
EPHB1-208ENST00000482618 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP25.83■■□□□ 1.73
EPHB1-208ENST00000482618 NCOA2Q15596 1464 aa25.82■■□□□ 1.72
EPHB1-208ENST00000482618 MBD5Q9P267 1494 aa25.79■■□□□ 1.72
EPHB1-208ENST00000482618 VPS8Q8N3P4 1428 aa25.77■■□□□ 1.72
EPHB1-208ENST00000482618 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa25.76■■□□□ 1.71
EPHB1-208ENST00000482618 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa25.75■■□□□ 1.71
EPHB1-208ENST00000482618 CCDC141Q6ZP82 1450 aa25.73■■□□□ 1.71
EPHB1-208ENST00000482618 NPATQ14207 1427 aa25.72■■□□□ 1.71
EPHB1-208ENST00000482618 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa25.72■■□□□ 1.71
EPHB1-208ENST00000482618 ZMYM3Q14202 1370 aa25.71■■□□□ 1.71
EPHB1-208ENST00000482618 GGT6Q6P531 493 aa25.7■■□□□ 1.7
EPHB1-208ENST00000482618 DMRT2Q9Y5R5 561 aa25.7■■□□□ 1.7
EPHB1-208ENST00000482618 MYO3AQ8NEV4 1616 aa25.7■■□□□ 1.7
EPHB1-208ENST00000482618 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa25.7■■□□□ 1.7
EPHB1-208ENST00000482618 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP25.68■■□□□ 1.7
EPHB1-208ENST00000482618 CERKQ8TCT0 537 aa25.67■■□□□ 1.7
EPHB1-208ENST00000482618 ARHGEF5Q12774 1597 aa25.67■■□□□ 1.7
EPHB1-208ENST00000482618 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa25.65■■□□□ 1.7
EPHB1-208ENST00000482618 NCOA1Q15788 1441 aa25.64■■□□□ 1.69
EPHB1-208ENST00000482618 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP25.63■■□□□ 1.69
EPHB1-208ENST00000482618 PTPRTO14522 1441 aa25.62■■□□□ 1.69
EPHB1-208ENST00000482618 MAP3K1Q13233 1512 aa25.62■■□□□ 1.69
EPHB1-208ENST00000482618 PTPRKQ15262 1439 aa25.62■■□□□ 1.69
EPHB1-208ENST00000482618 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP25.61■■□□□ 1.69
EPHB1-208ENST00000482618 RSPH4AQ5TD94 716 aa25.6■■□□□ 1.69
EPHB1-208ENST00000482618 PPP6R1Q9UPN7 881 aa25.6■■□□□ 1.69
EPHB1-208ENST00000482618 KDM5DQ9BY66 1539 aa25.57■■□□□ 1.68
EPHB1-208ENST00000482618 KIF3BO15066 747 aa25.56■■□□□ 1.68
EPHB1-208ENST00000482618 FAM135AQ9P2D6 1515 aa25.55■■□□□ 1.68
EPHB1-208ENST00000482618 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP25.54■■□□□ 1.68
EPHB1-208ENST00000482618 MAST1Q9Y2H9 1570 aa25.54■■□□□ 1.68
EPHB1-208ENST00000482618 TSPY4P0CV99 314 aa25.53■■□□□ 1.68
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