RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000481518.1

PSME4-208, Transcript of proteasome activator subunit 4, humanhuman

TSL 5

Gene PSME4, Length 886 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSME4-208ENST00000481518 ARHGAP5Q13017 1502 aa37.13■■■■□ 3.53
PSME4-208ENST00000481518 POGZQ7Z3K3 1410 aa37.12■■■■□ 3.53
PSME4-208ENST00000481518 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa37.1■■■■□ 3.53
PSME4-208ENST00000481518 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa37.09■■■■□ 3.53
PSME4-208ENST00000481518 PREX2Q70Z35 1606 aa37.08■■■■□ 3.53
PSME4-208ENST00000481518 YEATS2Q9ULM3 1422 aa37.06■■■■□ 3.52
PSME4-208ENST00000481518 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa37.05■■■■□ 3.52
PSME4-208ENST00000481518 MAGI2Q86UL8 1455 aa37.01■■■■□ 3.52
PSME4-208ENST00000481518 ADAMTSL3P82987 1691 aa37.01■■■■□ 3.52
PSME4-208ENST00000481518 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa37.01■■■■□ 3.51
PSME4-208ENST00000481518 BCORL1Q5H9F3 1711 aa36.98■■■■□ 3.51
PSME4-208ENST00000481518 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa36.97■■■■□ 3.51
PSME4-208ENST00000481518 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP36.95■■■■□ 3.51
PSME4-208ENST00000481518 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa36.94■■■■□ 3.5
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PSME4-208ENST00000481518 ABCC1P33527 1531 aa36.93■■■■□ 3.5
PSME4-208ENST00000481518 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa36.91■■■■□ 3.5
PSME4-208ENST00000481518 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP36.9■■■■□ 3.5
PSME4-208ENST00000481518 AFAP1Q8N556 730 aa36.9■■■■□ 3.5
PSME4-208ENST00000481518 MTUS2Q5JR59 1369 aa36.9■■■■□ 3.5
PSME4-208ENST00000481518 MADDQ8WXG6 1647 aa36.88■■■■□ 3.5
PSME4-208ENST00000481518 ITSN2Q9NZM3 1697 aa36.86■■■■□ 3.49
PSME4-208ENST00000481518 PTPRMP28827 1452 aa36.85■■■■□ 3.49
PSME4-208ENST00000481518 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa36.85■■■■□ 3.49
PSME4-208ENST00000481518 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa36.84■■■■□ 3.49
PSME4-208ENST00000481518 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa36.83■■■■□ 3.49
PSME4-208ENST00000481518 HECW2Q9P2P5 1572 aa36.83■■■■□ 3.49
PSME4-208ENST00000481518 ATP10AO60312 1499 aa36.82■■■■□ 3.49
PSME4-208ENST00000481518 C9orf84Q5VXU9 1444 aa36.79■■■■□ 3.48
PSME4-208ENST00000481518 VPS8Q8N3P4 1428 aa36.78■■■■□ 3.48
PSME4-208ENST00000481518 CCNB3Q8WWL7 1395 aa36.78■■■■□ 3.48
PSME4-208ENST00000481518 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP36.77■■■■□ 3.48
PSME4-208ENST00000481518 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa36.76■■■■□ 3.48
PSME4-208ENST00000481518 MLH3Q9UHC1 1453 aa36.75■■■■□ 3.47
PSME4-208ENST00000481518 TIAM1Q13009 1591 aa36.75■■■■□ 3.47
PSME4-208ENST00000481518 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP36.75■■■■□ 3.47
PSME4-208ENST00000481518 SYCP2Q9BX26 1530 aa36.75■■■■□ 3.47
PSME4-208ENST00000481518 ABCA6Q8N139 1617 aa36.74■■■■□ 3.47
PSME4-208ENST00000481518 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP36.71■■■■□ 3.47
PSME4-208ENST00000481518 MLECQ14165 292 aa36.69■■■■□ 3.46
PSME4-208ENST00000481518 MYT1LQ9UL68 1186 aa36.69■■■■□ 3.46
PSME4-208ENST00000481518 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa36.67■■■■□ 3.46
PSME4-208ENST00000481518 REREQ9P2R6 1566 aa36.66■■■■□ 3.46
PSME4-208ENST00000481518 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP36.65■■■■□ 3.463e-13■■■□□ 17.2
PSME4-208ENST00000481518 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa36.64■■■■□ 3.46
PSME4-208ENST00000481518 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa36.63■■■■□ 3.45
PSME4-208ENST00000481518 NCOA2Q15596 1464 aa36.62■■■■□ 3.45
PSME4-208ENST00000481518 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa36.62■■■■□ 3.45
PSME4-208ENST00000481518 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP36.62■■■■□ 3.45
PSME4-208ENST00000481518 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP36.59■■■■□ 3.45
PSME4-208ENST00000481518 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa36.56■■■■□ 3.44
PSME4-208ENST00000481518 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP36.54■■■■□ 3.44
PSME4-208ENST00000481518 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP36.53■■■■□ 3.44
PSME4-208ENST00000481518 AGLP35573 1532 aa36.53■■■■□ 3.44
PSME4-208ENST00000481518 ATP7AQ04656 1500 aa36.52■■■■□ 3.44
PSME4-208ENST00000481518 MAP3K1Q13233 1512 aa36.52■■■■□ 3.44
PSME4-208ENST00000481518 MBD5Q9P267 1494 aa36.5■■■■□ 3.43
PSME4-208ENST00000481518 PLPPR3Q6T4P5 718 aa36.5■■■■□ 3.43
PSME4-208ENST00000481518 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP36.47■■■■□ 3.43
PSME4-208ENST00000481518 LMTK3Q96Q04 1460 aa36.45■■■■□ 3.43
PSME4-208ENST00000481518 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa36.43■■■■□ 3.42
PSME4-208ENST00000481518 PLXNC1O60486 1568 aa36.39■■■■□ 3.42
PSME4-208ENST00000481518 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP36.36■■■■□ 3.41
PSME4-208ENST00000481518 A2MP01023 1474 aa36.36■■■■□ 3.41
PSME4-208ENST00000481518 CCDC141Q6ZP82 1450 aa36.33■■■■□ 3.41
PSME4-208ENST00000481518 ADGBQ8N7X0 1667 aa36.3■■■■□ 3.4
PSME4-208ENST00000481518 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa36.3■■■■□ 3.4
PSME4-208ENST00000481518 C3P01024 1663 aa36.28■■■■□ 3.4
PSME4-208ENST00000481518 ARHGEF5Q12774 1597 aa36.27■■■■□ 3.4
PSME4-208ENST00000481518 MYOM3Q5VTT5 1437 aa36.25■■■■□ 3.39
PSME4-208ENST00000481518 HSPA2P54652 639 aa36.24■■■■□ 3.39
PSME4-208ENST00000481518 PREX1Q8TCU6 1659 aa36.22■■■■□ 3.39
PSME4-208ENST00000481518 APLP2Q06481 763 aa36.21■■■■□ 3.39
PSME4-208ENST00000481518 RSPH4AQ5TD94 716 aa36.21■■■■□ 3.39
PSME4-208ENST00000481518 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP36.21■■■■□ 3.39
PSME4-208ENST00000481518 CNTLNQ9NXG0 1405 aa36.21■■■■□ 3.39
PSME4-208ENST00000481518 MIA2Q96PC5 1412 aa36.2■■■■□ 3.39
PSME4-208ENST00000481518 MROH2AA6NES4 1674 aa36.16■■■■□ 3.38
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PSME4-208ENST00000481518 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP36.13■■■■□ 3.37
PSME4-208ENST00000481518 GGT6Q6P531 493 aa36.12■■■■□ 3.37
PSME4-208ENST00000481518 MAST1Q9Y2H9 1570 aa36.1■■■■□ 3.37
PSME4-208ENST00000481518 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa36.08■■■■□ 3.37
PSME4-208ENST00000481518 ZMYM3Q14202 1370 aa36.08■■■■□ 3.37
PSME4-208ENST00000481518 TSPY4P0CV99 314 aa36.08■■■■□ 3.37
PSME4-208ENST00000481518 TSPY10P0CW01 314 aa36.08■■■■□ 3.37
PSME4-208ENST00000481518 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP36.06■■■■□ 3.36
PSME4-208ENST00000481518 PTPN23Q9H3S7 1636 aa36.05■■■■□ 3.36
PSME4-208ENST00000481518 KIF3BO15066 747 aa36.01■■■■□ 3.36
PSME4-208ENST00000481518 NPATQ14207 1427 aa36■■■■□ 3.35
PSME4-208ENST00000481518 FGD6Q6ZV73 1430 aa36■■■■□ 3.35
PSME4-208ENST00000481518 PPP6R1Q9UPN7 881 aa35.98■■■■□ 3.35
PSME4-208ENST00000481518 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP35.96■■■■□ 3.35
PSME4-208ENST00000481518 CROCC2H7BZ55 1655 aa35.95■■■■□ 3.35
PSME4-208ENST00000481518 ABCC5O15440 1437 aa35.95■■■■□ 3.35
PSME4-208ENST00000481518 PTPRKQ15262 1439 aa35.95■■■■□ 3.35
PSME4-208ENST00000481518 KDM5DQ9BY66 1539 aa35.91■■■■□ 3.34
PSME4-208ENST00000481518 STRCQ7RTU9 1775 aa35.91■■■■□ 3.34
PSME4-208ENST00000481518 SHANK2Q9UPX8 1470 aa35.91■■■■□ 3.34
PSME4-208ENST00000481518 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP35.9■■■■□ 3.34
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