RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000480830.5

SGSM3-210, Transcript of small G protein signaling modulator 3, humanhuman

TSL 5

Gene SGSM3, Length 997 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGSM3-210ENST00000480830 CFAP74Q9C0B2 1584 aa28.44■■■□□ 2.14
SGSM3-210ENST00000480830 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa28.4■■■□□ 2.14
SGSM3-210ENST00000480830 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP28.38■■■□□ 2.13
SGSM3-210ENST00000480830 RICTORQ6R327 1708 aa28.38■■■□□ 2.13
SGSM3-210ENST00000480830 ADGRL1O94910 1474 aa28.37■■■□□ 2.13
SGSM3-210ENST00000480830 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP28.36■■■□□ 2.13
SGSM3-210ENST00000480830 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa28.36■■■□□ 2.13
SGSM3-210ENST00000480830 PHLDB1Q86UU1 1377 aa28.36■■■□□ 2.13
SGSM3-210ENST00000480830 NCOA2Q15596 1464 aa28.35■■■□□ 2.13
SGSM3-210ENST00000480830 CCNB3Q8WWL7 1395 aa28.35■■■□□ 2.13
SGSM3-210ENST00000480830 SCAPERQ9BY12 1400 aa28.35■■■□□ 2.13
SGSM3-210ENST00000480830 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP28.34■■■□□ 2.13
SGSM3-210ENST00000480830 MAP3K1Q13233 1512 aa28.34■■■□□ 2.13
SGSM3-210ENST00000480830 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP28.32■■■□□ 2.12
SGSM3-210ENST00000480830 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa28.31■■■□□ 2.12
SGSM3-210ENST00000480830 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa28.3■■■□□ 2.12
SGSM3-210ENST00000480830 ABCC1P33527 1531 aa28.28■■■□□ 2.12
SGSM3-210ENST00000480830 APLP2Q06481 763 aa28.27■■■□□ 2.12
SGSM3-210ENST00000480830 POGZQ7Z3K3 1410 aa28.26■■■□□ 2.12
SGSM3-210ENST00000480830 ITSN2Q9NZM3 1697 aa28.26■■■□□ 2.12
SGSM3-210ENST00000480830 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP28.24■■■□□ 2.11
SGSM3-210ENST00000480830 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP28.24■■■□□ 2.11
SGSM3-210ENST00000480830 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa28.23■■■□□ 2.11
SGSM3-210ENST00000480830 SYCP2Q9BX26 1530 aa28.23■■■□□ 2.11
SGSM3-210ENST00000480830 AFAP1Q8N556 730 aa28.21■■■□□ 2.11
SGSM3-210ENST00000480830 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa28.2■■■□□ 2.1
SGSM3-210ENST00000480830 YEATS2Q9ULM3 1422 aa28.19■■■□□ 2.1
SGSM3-210ENST00000480830 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP28.18■■■□□ 2.1
SGSM3-210ENST00000480830 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP28.18■■■□□ 2.1
SGSM3-210ENST00000480830 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa28.17■■■□□ 2.1
SGSM3-210ENST00000480830 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa28.14■■■□□ 2.1
SGSM3-210ENST00000480830 KDM5CP41229 1560 aa28.14■■■□□ 2.1
SGSM3-210ENST00000480830 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa28.14■■■□□ 2.09
SGSM3-210ENST00000480830 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa28.13■■■□□ 2.09
SGSM3-210ENST00000480830 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa28.12■■■□□ 2.09
SGSM3-210ENST00000480830 MYOM3Q5VTT5 1437 aa28.09■■■□□ 2.09
SGSM3-210ENST00000480830 HECW2Q9P2P5 1572 aa28.09■■■□□ 2.09
SGSM3-210ENST00000480830 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa28.07■■■□□ 2.08
SGSM3-210ENST00000480830 MYT1LQ9UL68 1186 aa28.07■■■□□ 2.08
SGSM3-210ENST00000480830 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa28.06■■■□□ 2.08
SGSM3-210ENST00000480830 ABCA6Q8N139 1617 aa28.06■■■□□ 2.08
SGSM3-210ENST00000480830 MBD5Q9P267 1494 aa28.05■■■□□ 2.08
SGSM3-210ENST00000480830 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa28.05■■■□□ 2.08
SGSM3-210ENST00000480830 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa28.05■■■□□ 2.08
SGSM3-210ENST00000480830 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa28.03■■■□□ 2.08
SGSM3-210ENST00000480830 MAGI2Q86UL8 1455 aa28.02■■■□□ 2.08
SGSM3-210ENST00000480830 MLH3Q9UHC1 1453 aa28■■■□□ 2.07
SGSM3-210ENST00000480830 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP27.98■■■□□ 2.07
SGSM3-210ENST00000480830 PTPN23Q9H3S7 1636 aa27.98■■■□□ 2.07
SGSM3-210ENST00000480830 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP27.98■■■□□ 2.07
SGSM3-210ENST00000480830 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP27.97■■■□□ 2.07
SGSM3-210ENST00000480830 ATP10AO60312 1499 aa27.96■■■□□ 2.07
SGSM3-210ENST00000480830 FGD6Q6ZV73 1430 aa27.96■■■□□ 2.07
SGSM3-210ENST00000480830 MIA2Q96PC5 1412 aa27.96■■■□□ 2.07
SGSM3-210ENST00000480830 ATP7AQ04656 1500 aa27.96■■■□□ 2.07
SGSM3-210ENST00000480830 CCDC141Q6ZP82 1450 aa27.94■■■□□ 2.06
SGSM3-210ENST00000480830 C9orf84Q5VXU9 1444 aa27.93■■■□□ 2.06
SGSM3-210ENST00000480830 BCORL1Q5H9F3 1711 aa27.92■■■□□ 2.06
SGSM3-210ENST00000480830 ARHGEF5Q12774 1597 aa27.91■■■□□ 2.06
SGSM3-210ENST00000480830 MLECQ14165 292 aa27.9■■■□□ 2.06
SGSM3-210ENST00000480830 ADAMTSL3P82987 1691 aa27.87■■■□□ 2.05
SGSM3-210ENST00000480830 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP27.87■■■□□ 2.05
SGSM3-210ENST00000480830 MADDQ8WXG6 1647 aa27.85■■■□□ 2.05
SGSM3-210ENST00000480830 ADGBQ8N7X0 1667 aa27.85■■■□□ 2.05
SGSM3-210ENST00000480830 REREQ9P2R6 1566 aa27.82■■■□□ 2.04
SGSM3-210ENST00000480830 CROCC2H7BZ55 1655 aa27.82■■■□□ 2.04
SGSM3-210ENST00000480830 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP27.82■■■□□ 2.04
SGSM3-210ENST00000480830 ABCC5O15440 1437 aa27.81■■■□□ 2.04
SGSM3-210ENST00000480830 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP27.8■■■□□ 2.04
SGSM3-210ENST00000480830 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP27.8■■■□□ 2.04
SGSM3-210ENST00000480830 A2MP01023 1474 aa27.78■■■□□ 2.04
SGSM3-210ENST00000480830 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa27.78■■■□□ 2.04
SGSM3-210ENST00000480830 PLXNC1O60486 1568 aa27.77■■■□□ 2.04
SGSM3-210ENST00000480830 DAPK1P53355 1430 aa27.77■■■□□ 2.04
SGSM3-210ENST00000480830 MAST1Q9Y2H9 1570 aa27.77■■■□□ 2.04
SGSM3-210ENST00000480830 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa27.76■■■□□ 2.03
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SGSM3-210ENST00000480830 TSPY10P0CW01 314 aa27.75■■■□□ 2.03
SGSM3-210ENST00000480830 AGLP35573 1532 aa27.74■■■□□ 2.03
SGSM3-210ENST00000480830 RSPH4AQ5TD94 716 aa27.74■■■□□ 2.03
SGSM3-210ENST00000480830 CHIC2Q9UKJ5 165 aa27.73■■■□□ 2.03
SGSM3-210ENST00000480830 PLPPR3Q6T4P5 718 aa27.72■■■□□ 2.03
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SGSM3-210ENST00000480830 SHANK2Q9UPX8 1470 aa27.68■■■□□ 2.02
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SGSM3-210ENST00000480830 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP27.66■■■□□ 2.02
SGSM3-210ENST00000480830 ITGAEP38570 1179 aa27.64■■■□□ 2.02
SGSM3-210ENST00000480830 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa27.64■■■□□ 2.02
SGSM3-210ENST00000480830 GGT6Q6P531 493 aa27.62■■■□□ 2.01
SGSM3-210ENST00000480830 KIF15Q9NS87 1388 aa27.6■■■□□ 2.01
SGSM3-210ENST00000480830 KIF3BO15066 747 aa27.6■■■□□ 2.01
SGSM3-210ENST00000480830 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP27.59■■■□□ 2.01
SGSM3-210ENST00000480830 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP27.58■■■□□ 2.01
SGSM3-210ENST00000480830 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP27.57■■■□□ 2
SGSM3-210ENST00000480830 DUOX2Q9NRD8 1548 aa27.56■■■□□ 2
SGSM3-210ENST00000480830 ADGRL2O95490 1459 aa27.54■■■□□ 2
SGSM3-210ENST00000480830 C3P01024 1663 aa27.54■■■□□ 2
SGSM3-210ENST00000480830 NCOA1Q15788 1441 aa27.54■■■□□ 2
SGSM3-210ENST00000480830 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa27.53■■■□□ 2
SGSM3-210ENST00000480830 MROH1Q8NDA8 1641 aa27.5■■□□□ 1.99
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