RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000478298.5

ABTB1-210, Transcript of ankyrin repeat and BTB domain containing 1, humanhuman

TSL 5

Gene ABTB1, Length 818 nt, Biotype retained intron.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABTB1-210ENST00000478298 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa29.21■■■□□ 2.27
ABTB1-210ENST00000478298 CFAP74Q9C0B2 1584 aa29.21■■■□□ 2.27
ABTB1-210ENST00000478298 ARHGAP5Q13017 1502 aa29.2■■■□□ 2.27
ABTB1-210ENST00000478298 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP29.2■■■□□ 2.26
ABTB1-210ENST00000478298 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa29.2■■■□□ 2.26
ABTB1-210ENST00000478298 AKNAQ7Z591 1439 aa29.2■■■□□ 2.26
ABTB1-210ENST00000478298 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa29.18■■■□□ 2.26
ABTB1-210ENST00000478298 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP29.12■■■□□ 2.25
ABTB1-210ENST00000478298 ADGRL1O94910 1474 aa29.11■■■□□ 2.25
ABTB1-210ENST00000478298 ITSN2Q9NZM3 1697 aa29.11■■■□□ 2.25
ABTB1-210ENST00000478298 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP29.07■■■□□ 2.24
ABTB1-210ENST00000478298 SCAPERQ9BY12 1400 aa29.07■■■□□ 2.24
ABTB1-210ENST00000478298 MYOM3Q5VTT5 1437 aa29.05■■■□□ 2.24
ABTB1-210ENST00000478298 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP29.05■■■□□ 2.24
ABTB1-210ENST00000478298 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa29.04■■■□□ 2.24
ABTB1-210ENST00000478298 ABCC1P33527 1531 aa29.04■■■□□ 2.24
ABTB1-210ENST00000478298 RAPGEF3O95398 923 aa29.03■■■□□ 2.24
ABTB1-210ENST00000478298 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa29.01■■■□□ 2.24
ABTB1-210ENST00000478298 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa29.01■■■□□ 2.23
ABTB1-210ENST00000478298 POGZQ7Z3K3 1410 aa29.01■■■□□ 2.23
ABTB1-210ENST00000478298 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa29■■■□□ 2.23
ABTB1-210ENST00000478298 MIA2Q96PC5 1412 aa29■■■□□ 2.23
ABTB1-210ENST00000478298 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa28.99■■■□□ 2.23
ABTB1-210ENST00000478298 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP28.98■■■□□ 2.23
ABTB1-210ENST00000478298 RICTORQ6R327 1708 aa28.97■■■□□ 2.23
ABTB1-210ENST00000478298 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP28.97■■■□□ 2.23
ABTB1-210ENST00000478298 SYCP2Q9BX26 1530 aa28.95■■■□□ 2.23
ABTB1-210ENST00000478298 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa28.94■■■□□ 2.22
ABTB1-210ENST00000478298 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa28.94■■■□□ 2.22
ABTB1-210ENST00000478298 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa28.94■■■□□ 2.22
ABTB1-210ENST00000478298 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa28.92■■■□□ 2.22
ABTB1-210ENST00000478298 FGD6Q6ZV73 1430 aa28.92■■■□□ 2.22
ABTB1-210ENST00000478298 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP28.91■■■□□ 2.22
ABTB1-210ENST00000478298 AFAP1Q8N556 730 aa28.9■■■□□ 2.22
ABTB1-210ENST00000478298 MBD5Q9P267 1494 aa28.9■■■□□ 2.22
ABTB1-210ENST00000478298 KDM5CP41229 1560 aa28.89■■■□□ 2.22
ABTB1-210ENST00000478298 MAGI2Q86UL8 1455 aa28.85■■■□□ 2.21
ABTB1-210ENST00000478298 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP28.85■■■□□ 2.21
ABTB1-210ENST00000478298 PTPN23Q9H3S7 1636 aa28.84■■■□□ 2.21
ABTB1-210ENST00000478298 MLH3Q9UHC1 1453 aa28.82■■■□□ 2.2
ABTB1-210ENST00000478298 ARHGEF5Q12774 1597 aa28.81■■■□□ 2.2
ABTB1-210ENST00000478298 RSPH4AQ5TD94 716 aa28.81■■■□□ 2.2
ABTB1-210ENST00000478298 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa28.8■■■□□ 2.2
ABTB1-210ENST00000478298 CCDC141Q6ZP82 1450 aa28.8■■■□□ 2.2
ABTB1-210ENST00000478298 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa28.79■■■□□ 2.2
ABTB1-210ENST00000478298 HECW2Q9P2P5 1572 aa28.79■■■□□ 2.2
ABTB1-210ENST00000478298 YEATS2Q9ULM3 1422 aa28.78■■■□□ 2.2
ABTB1-210ENST00000478298 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP28.76■■■□□ 2.19
ABTB1-210ENST00000478298 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP28.72■■■□□ 2.19
ABTB1-210ENST00000478298 MYT1LQ9UL68 1186 aa28.72■■■□□ 2.19
ABTB1-210ENST00000478298 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa28.71■■■□□ 2.19
ABTB1-210ENST00000478298 ATP7AQ04656 1500 aa28.71■■■□□ 2.19
ABTB1-210ENST00000478298 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa28.7■■■□□ 2.19
ABTB1-210ENST00000478298 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP28.7■■■□□ 2.18
ABTB1-210ENST00000478298 ATP10AO60312 1499 aa28.69■■■□□ 2.18
ABTB1-210ENST00000478298 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa28.69■■■□□ 2.18
ABTB1-210ENST00000478298 ABCC5O15440 1437 aa28.69■■■□□ 2.18
ABTB1-210ENST00000478298 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP28.69■■■□□ 2.18
ABTB1-210ENST00000478298 TSPY4P0CV99 314 aa28.68■■■□□ 2.18
ABTB1-210ENST00000478298 TSPY10P0CW01 314 aa28.68■■■□□ 2.18
ABTB1-210ENST00000478298 ABCA6Q8N139 1617 aa28.68■■■□□ 2.18
ABTB1-210ENST00000478298 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP28.67■■■□□ 2.18
ABTB1-210ENST00000478298 DAPK1P53355 1430 aa28.67■■■□□ 2.18
ABTB1-210ENST00000478298 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP28.66■■■□□ 2.18
ABTB1-210ENST00000478298 C9orf84Q5VXU9 1444 aa28.65■■■□□ 2.18
ABTB1-210ENST00000478298 MAST1Q9Y2H9 1570 aa28.65■■■□□ 2.18
ABTB1-210ENST00000478298 SHANK2Q9UPX8 1470 aa28.65■■■□□ 2.18
ABTB1-210ENST00000478298 REREQ9P2R6 1566 aa28.61■■■□□ 2.17
ABTB1-210ENST00000478298 CROCC2H7BZ55 1655 aa28.61■■■□□ 2.17
ABTB1-210ENST00000478298 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa28.56■■■□□ 2.16
ABTB1-210ENST00000478298 A2MP01023 1474 aa28.55■■■□□ 2.16
ABTB1-210ENST00000478298 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP28.54■■■□□ 2.16
ABTB1-210ENST00000478298 PLXNC1O60486 1568 aa28.54■■■□□ 2.16
ABTB1-210ENST00000478298 ADGBQ8N7X0 1667 aa28.53■■■□□ 2.16
ABTB1-210ENST00000478298 AGLP35573 1532 aa28.53■■■□□ 2.16
ABTB1-210ENST00000478298 PTPRKQ15262 1439 aa28.52■■■□□ 2.16
ABTB1-210ENST00000478298 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP28.5■■■□□ 2.15
ABTB1-210ENST00000478298 CHIC2Q9UKJ5 165 aa28.5■■■□□ 2.15
ABTB1-210ENST00000478298 ADGRL2O95490 1459 aa28.49■■■□□ 2.15
ABTB1-210ENST00000478298 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa28.48■■■□□ 2.15
ABTB1-210ENST00000478298 NCOA1Q15788 1441 aa28.46■■■□□ 2.15
ABTB1-210ENST00000478298 KIF15Q9NS87 1388 aa28.46■■■□□ 2.15
ABTB1-210ENST00000478298 BCORL1Q5H9F3 1711 aa28.45■■■□□ 2.14
ABTB1-210ENST00000478298 ITGAEP38570 1179 aa28.44■■■□□ 2.14
ABTB1-210ENST00000478298 DUOX2Q9NRD8 1548 aa28.43■■■□□ 2.14
ABTB1-210ENST00000478298 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa28.43■■■□□ 2.14
ABTB1-210ENST00000478298 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa28.43■■■□□ 2.14
ABTB1-210ENST00000478298 ROCK1Q13464 1354 aa28.42■■■□□ 2.14
ABTB1-210ENST00000478298 MLECQ14165 292 aa28.4■■■□□ 2.14
ABTB1-210ENST00000478298 ADAMTSL3P82987 1691 aa28.39■■■□□ 2.14
ABTB1-210ENST00000478298 ERBINQ96RT1 1412 aa28.37■■■□□ 2.13
ABTB1-210ENST00000478298 KIF3BO15066 747 aa28.34■■■□□ 2.13
ABTB1-210ENST00000478298 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP28.33■■■□□ 2.13
ABTB1-210ENST00000478298 MADDQ8WXG6 1647 aa28.32■■■□□ 2.12
ABTB1-210ENST00000478298 GGT6Q6P531 493 aa28.3■■■□□ 2.12
ABTB1-210ENST00000478298 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa28.29■■■□□ 2.12
ABTB1-210ENST00000478298 PPP6R1Q9UPN7 881 aa28.27■■■□□ 2.12
ABTB1-210ENST00000478298 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP28.26■■■□□ 2.11
ABTB1-210ENST00000478298 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa28.25■■■□□ 2.11
ABTB1-210ENST00000478298 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP28.22■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 57.8 ms