RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000474250.5

NCK1-AS1-203, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene NCK1-AS1, Length 827 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCK1-AS1-203ENST00000474250 PLCH2O75038 1416 aa22.59■■□□□ 1.21
NCK1-AS1-203ENST00000474250 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa22.59■■□□□ 1.21
NCK1-AS1-203ENST00000474250 POGZQ7Z3K3 1410 aa22.57■■□□□ 1.2
NCK1-AS1-203ENST00000474250 SCAPERQ9BY12 1400 aa22.57■■□□□ 1.2
NCK1-AS1-203ENST00000474250 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP22.56■■□□□ 1.2
NCK1-AS1-203ENST00000474250 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa22.55■■□□□ 1.2
NCK1-AS1-203ENST00000474250 MAGI2Q86UL8 1455 aa22.54■■□□□ 1.2
NCK1-AS1-203ENST00000474250 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP22.52■■□□□ 1.2
NCK1-AS1-203ENST00000474250 ARHGAP5Q13017 1502 aa22.52■■□□□ 1.19
NCK1-AS1-203ENST00000474250 LMTK3Q96Q04 1460 aa22.51■■□□□ 1.19
NCK1-AS1-203ENST00000474250 PLPPR3Q6T4P5 718 aa22.5■■□□□ 1.19
NCK1-AS1-203ENST00000474250 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP22.5■■□□□ 1.19
NCK1-AS1-203ENST00000474250 CLIP1P30622 1438 aa22.48■■□□□ 1.19
NCK1-AS1-203ENST00000474250 PREX2Q70Z35 1606 aa22.48■■□□□ 1.19
NCK1-AS1-203ENST00000474250 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa22.46■■□□□ 1.19
NCK1-AS1-203ENST00000474250 MLECQ14165 292 aa22.46■■□□□ 1.19
NCK1-AS1-203ENST00000474250 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa22.46■■□□□ 1.19
NCK1-AS1-203ENST00000474250 KDM5CP41229 1560 aa22.45■■□□□ 1.18
NCK1-AS1-203ENST00000474250 C9orf84Q5VXU9 1444 aa22.44■■□□□ 1.18
NCK1-AS1-203ENST00000474250 ITSN2Q9NZM3 1697 aa22.44■■□□□ 1.18
NCK1-AS1-203ENST00000474250 ATP10AO60312 1499 aa22.43■■□□□ 1.18
NCK1-AS1-203ENST00000474250 CCDC18Q5T9S5 1454 aa22.43■■□□□ 1.18
NCK1-AS1-203ENST00000474250 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa22.43■■□□□ 1.18
NCK1-AS1-203ENST00000474250 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa22.43■■□□□ 1.18
NCK1-AS1-203ENST00000474250 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa22.41■■□□□ 1.18
NCK1-AS1-203ENST00000474250 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa22.41■■□□□ 1.18
NCK1-AS1-203ENST00000474250 ABCA6Q8N139 1617 aa22.4■■□□□ 1.18
NCK1-AS1-203ENST00000474250 ABCC1P33527 1531 aa22.39■■□□□ 1.17
NCK1-AS1-203ENST00000474250 PREX1Q8TCU6 1659 aa22.37■■□□□ 1.17
NCK1-AS1-203ENST00000474250 HSPA2P54652 639 aa22.37■■□□□ 1.17
NCK1-AS1-203ENST00000474250 AFAP1Q8N556 730 aa22.37■■□□□ 1.17
NCK1-AS1-203ENST00000474250 FYCO1Q9BQS8 1478 aa22.36■■□□□ 1.17
NCK1-AS1-203ENST00000474250 MYT1LQ9UL68 1186 aa22.34■■□□□ 1.17
NCK1-AS1-203ENST00000474250 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa22.33■■□□□ 1.17
NCK1-AS1-203ENST00000474250 REREQ9P2R6 1566 aa22.32■■□□□ 1.16
NCK1-AS1-203ENST00000474250 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa22.31■■□□□ 1.16
NCK1-AS1-203ENST00000474250 C3P01024 1663 aa22.3■■□□□ 1.16
NCK1-AS1-203ENST00000474250 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa22.29■■□□□ 1.16
NCK1-AS1-203ENST00000474250 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP22.29■■□□□ 1.16
NCK1-AS1-203ENST00000474250 MLH3Q9UHC1 1453 aa22.28■■□□□ 1.16
NCK1-AS1-203ENST00000474250 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP22.27■■□□□ 1.16
NCK1-AS1-203ENST00000474250 FBXO41Q8TF61 875 aa22.27■■□□□ 1.16
NCK1-AS1-203ENST00000474250 SYCP2Q9BX26 1530 aa22.25■■□□□ 1.15
NCK1-AS1-203ENST00000474250 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP22.23■■□□□ 1.15
NCK1-AS1-203ENST00000474250 STRCQ7RTU9 1775 aa22.22■■□□□ 1.15
NCK1-AS1-203ENST00000474250 AGLP35573 1532 aa22.21■■□□□ 1.15
NCK1-AS1-203ENST00000474250 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP22.21■■□□□ 1.15
NCK1-AS1-203ENST00000474250 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP22.21■■□□□ 1.15
NCK1-AS1-203ENST00000474250 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa22.15■■□□□ 1.14
NCK1-AS1-203ENST00000474250 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP22.15■■□□□ 1.14
NCK1-AS1-203ENST00000474250 ATP7AQ04656 1500 aa22.15■■□□□ 1.14
NCK1-AS1-203ENST00000474250 MROH2AA6NES4 1674 aa22.14■■□□□ 1.13
NCK1-AS1-203ENST00000474250 TIAM1Q13009 1591 aa22.13■■□□□ 1.13
NCK1-AS1-203ENST00000474250 MTUS2Q5JR59 1369 aa22.12■■□□□ 1.13
NCK1-AS1-203ENST00000474250 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP22.12■■□□□ 1.13
NCK1-AS1-203ENST00000474250 CCNB3Q8WWL7 1395 aa22.12■■□□□ 1.13
NCK1-AS1-203ENST00000474250 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
NCK1-AS1-203ENST00000474250 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa22.11■■□□□ 1.13
NCK1-AS1-203ENST00000474250 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP22.1■■□□□ 1.13
NCK1-AS1-203ENST00000474250 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP22.09■■□□□ 1.13
NCK1-AS1-203ENST00000474250 PLXNC1O60486 1568 aa22.09■■□□□ 1.13
NCK1-AS1-203ENST00000474250 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa22.09■■□□□ 1.13
NCK1-AS1-203ENST00000474250 ADGBQ8N7X0 1667 aa22.08■■□□□ 1.13
NCK1-AS1-203ENST00000474250 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP22.08■■□□□ 1.13
NCK1-AS1-203ENST00000474250 CEP162Q5TB80 1403 aa22.07■■□□□ 1.12
NCK1-AS1-203ENST00000474250 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa22.07■■□□□ 1.12
NCK1-AS1-203ENST00000474250 CNTLNQ9NXG0 1405 aa22.06■■□□□ 1.12
NCK1-AS1-203ENST00000474250 CERKQ8TCT0 537 aa22.05■■□□□ 1.12
NCK1-AS1-203ENST00000474250 A2MP01023 1474 aa22.03■■□□□ 1.12
NCK1-AS1-203ENST00000474250 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP22.01■■□□□ 1.11
NCK1-AS1-203ENST00000474250 MYO3AQ8NEV4 1616 aa22■■□□□ 1.11
NCK1-AS1-203ENST00000474250 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP21.98■■□□□ 1.11
NCK1-AS1-203ENST00000474250 MBD5Q9P267 1494 aa21.97■■□□□ 1.11
NCK1-AS1-203ENST00000474250 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa21.97■■□□□ 1.11
NCK1-AS1-203ENST00000474250 ZMYM3Q14202 1370 aa21.97■■□□□ 1.11
NCK1-AS1-203ENST00000474250 DMRT2Q9Y5R5 561 aa21.96■■□□□ 1.11
NCK1-AS1-203ENST00000474250 NPATQ14207 1427 aa21.96■■□□□ 1.11
NCK1-AS1-203ENST00000474250 NCOA1Q15788 1441 aa21.95■■□□□ 1.1
NCK1-AS1-203ENST00000474250 PTPRTO14522 1441 aa21.94■■□□□ 1.1
NCK1-AS1-203ENST00000474250 NCOA2Q15596 1464 aa21.94■■□□□ 1.1
NCK1-AS1-203ENST00000474250 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa21.93■■□□□ 1.1
NCK1-AS1-203ENST00000474250 GGT6Q6P531 493 aa21.93■■□□□ 1.1
NCK1-AS1-203ENST00000474250 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP21.91■■□□□ 1.1
NCK1-AS1-203ENST00000474250 CCDC141Q6ZP82 1450 aa21.9■■□□□ 1.1
NCK1-AS1-203ENST00000474250 LTBP4Q8N2S1 1624 aa21.89■■□□□ 1.09
NCK1-AS1-203ENST00000474250 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa21.89■■□□□ 1.09
NCK1-AS1-203ENST00000474250 PTPRKQ15262 1439 aa21.89■■□□□ 1.09
NCK1-AS1-203ENST00000474250 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP21.84■■□□□ 1.09
NCK1-AS1-203ENST00000474250 ARHGEF5Q12774 1597 aa21.83■■□□□ 1.09
NCK1-AS1-203ENST00000474250 VPS8Q8N3P4 1428 aa21.83■■□□□ 1.09
NCK1-AS1-203ENST00000474250 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa21.82■■□□□ 1.08
NCK1-AS1-203ENST00000474250 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP21.82■■□□□ 1.08
NCK1-AS1-203ENST00000474250 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa21.81■■□□□ 1.08
NCK1-AS1-203ENST00000474250 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP21.81■■□□□ 1.08
NCK1-AS1-203ENST00000474250 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa21.81■■□□□ 1.08
NCK1-AS1-203ENST00000474250 KDM5DQ9BY66 1539 aa21.8■■□□□ 1.08
NCK1-AS1-203ENST00000474250 PLA2R1Q13018 1463 aa21.8■■□□□ 1.08
NCK1-AS1-203ENST00000474250 KIF3BO15066 747 aa21.78■■□□□ 1.08
NCK1-AS1-203ENST00000474250 PPP6R1Q9UPN7 881 aa21.78■■□□□ 1.08
NCK1-AS1-203ENST00000474250 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP21.78■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 11.9 ms