RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000474040.5

HOXB-AS3-206, HOXB cluster antisense RNA 3, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene HOXB-AS3, Length 741 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB-AS3-206ENST00000474040 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa22.06■■□□□ 1.12
HOXB-AS3-206ENST00000474040 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP22.04■■□□□ 1.12
HOXB-AS3-206ENST00000474040 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP22.03■■□□□ 1.12
HOXB-AS3-206ENST00000474040 ARHGAP5Q13017 1502 aa22.03■■□□□ 1.12
HOXB-AS3-206ENST00000474040 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP22.01■■□□□ 1.11
HOXB-AS3-206ENST00000474040 PTPN23Q9H3S7 1636 aa22.01■■□□□ 1.11
HOXB-AS3-206ENST00000474040 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa22■■□□□ 1.11
HOXB-AS3-206ENST00000474040 FANCAO15360 1455 aa22■■□□□ 1.11
HOXB-AS3-206ENST00000474040 CFAP74Q9C0B2 1584 aa21.99■■□□□ 1.11
HOXB-AS3-206ENST00000474040 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP21.98■■□□□ 1.11
HOXB-AS3-206ENST00000474040 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa21.98■■□□□ 1.11
HOXB-AS3-206ENST00000474040 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa21.97■■□□□ 1.11
HOXB-AS3-206ENST00000474040 NEO1Q92859 1461 aa21.97■■□□□ 1.11
HOXB-AS3-206ENST00000474040 TEX14Q8IWB6 1497 aa21.96■■□□□ 1.11
HOXB-AS3-206ENST00000474040 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa21.96■■□□□ 1.11
HOXB-AS3-206ENST00000474040 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa21.95■■□□□ 1.1
HOXB-AS3-206ENST00000474040 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP21.94■■□□□ 1.1
HOXB-AS3-206ENST00000474040 ABCC1P33527 1531 aa21.93■■□□□ 1.1
HOXB-AS3-206ENST00000474040 AKNAQ7Z591 1439 aa21.92■■□□□ 1.1
HOXB-AS3-206ENST00000474040 TRHP20396 242 aaPredicted RBP21.92■■□□□ 1.1
HOXB-AS3-206ENST00000474040 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP21.91■■□□□ 1.1
HOXB-AS3-206ENST00000474040 MBD5Q9P267 1494 aa21.9■■□□□ 1.1
HOXB-AS3-206ENST00000474040 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP21.9■■□□□ 1.1
HOXB-AS3-206ENST00000474040 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP21.89■■□□□ 1.09
HOXB-AS3-206ENST00000474040 ARHGEF5Q12774 1597 aa21.89■■□□□ 1.09
HOXB-AS3-206ENST00000474040 TSPOAP1O95153 1857 aa21.89■■□□□ 1.09
HOXB-AS3-206ENST00000474040 ADGRL1O94910 1474 aa21.89■■□□□ 1.09
HOXB-AS3-206ENST00000474040 SYCP2Q9BX26 1530 aa21.88■■□□□ 1.09
HOXB-AS3-206ENST00000474040 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa21.88■■□□□ 1.09
HOXB-AS3-206ENST00000474040 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP21.86■■□□□ 1.09
HOXB-AS3-206ENST00000474040 SCAPERQ9BY12 1400 aa21.84■■□□□ 1.09
HOXB-AS3-206ENST00000474040 RSPH4AQ5TD94 716 aa21.84■■□□□ 1.09
HOXB-AS3-206ENST00000474040 ABCC5O15440 1437 aa21.83■■□□□ 1.09
HOXB-AS3-206ENST00000474040 DAPK1P53355 1430 aa21.83■■□□□ 1.09
HOXB-AS3-206ENST00000474040 CCDC141Q6ZP82 1450 aa21.83■■□□□ 1.08
HOXB-AS3-206ENST00000474040 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP21.82■■□□□ 1.08
HOXB-AS3-206ENST00000474040 POGZQ7Z3K3 1410 aa21.8■■□□□ 1.08
HOXB-AS3-206ENST00000474040 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa21.8■■□□□ 1.08
HOXB-AS3-206ENST00000474040 CROCC2H7BZ55 1655 aa21.8■■□□□ 1.08
HOXB-AS3-206ENST00000474040 SHANK2Q9UPX8 1470 aa21.8■■□□□ 1.08
HOXB-AS3-206ENST00000474040 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP21.79■■□□□ 1.08
HOXB-AS3-206ENST00000474040 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa21.78■■□□□ 1.08
HOXB-AS3-206ENST00000474040 PTPRKQ15262 1439 aa21.78■■□□□ 1.08
HOXB-AS3-206ENST00000474040 KDM5CP41229 1560 aa21.77■■□□□ 1.08
HOXB-AS3-206ENST00000474040 MAST1Q9Y2H9 1570 aa21.77■■□□□ 1.08
HOXB-AS3-206ENST00000474040 RICTORQ6R327 1708 aa21.75■■□□□ 1.07
HOXB-AS3-206ENST00000474040 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa21.75■■□□□ 1.07
HOXB-AS3-206ENST00000474040 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP21.74■■□□□ 1.07
HOXB-AS3-206ENST00000474040 C9orf84Q5VXU9 1444 aa21.73■■□□□ 1.07
HOXB-AS3-206ENST00000474040 AFAP1Q8N556 730 aa21.73■■□□□ 1.07
HOXB-AS3-206ENST00000474040 ADGRL2O95490 1459 aa21.72■■□□□ 1.07
HOXB-AS3-206ENST00000474040 ROCK1Q13464 1354 aa21.72■■□□□ 1.07
HOXB-AS3-206ENST00000474040 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa21.72■■□□□ 1.07
HOXB-AS3-206ENST00000474040 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa21.71■■□□□ 1.07
HOXB-AS3-206ENST00000474040 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP21.71■■□□□ 1.07
HOXB-AS3-206ENST00000474040 TSPY4P0CV99 314 aa21.71■■□□□ 1.07
HOXB-AS3-206ENST00000474040 TSPY10P0CW01 314 aa21.71■■□□□ 1.07
HOXB-AS3-206ENST00000474040 ITGAEP38570 1179 aa21.71■■□□□ 1.07
HOXB-AS3-206ENST00000474040 MLH3Q9UHC1 1453 aa21.71■■□□□ 1.07
HOXB-AS3-206ENST00000474040 RAPGEF3O95398 923 aa21.7■■□□□ 1.06
HOXB-AS3-206ENST00000474040 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa21.7■■□□□ 1.06
HOXB-AS3-206ENST00000474040 ADGBQ8N7X0 1667 aa21.69■■□□□ 1.06
HOXB-AS3-206ENST00000474040 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP21.68■■□□□ 1.06
HOXB-AS3-206ENST00000474040 PLXNC1O60486 1568 aa21.67■■□□□ 1.06
HOXB-AS3-206ENST00000474040 HECW2Q9P2P5 1572 aa21.67■■□□□ 1.06
HOXB-AS3-206ENST00000474040 ATP7AQ04656 1500 aa21.67■■□□□ 1.06
HOXB-AS3-206ENST00000474040 NCOA1Q15788 1441 aa21.67■■□□□ 1.06
HOXB-AS3-206ENST00000474040 KDM6BO15054 1643 aa21.66■■□□□ 1.06
HOXB-AS3-206ENST00000474040 MAGI2Q86UL8 1455 aa21.66■■□□□ 1.06
HOXB-AS3-206ENST00000474040 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa21.65■■□□□ 1.06
HOXB-AS3-206ENST00000474040 PCGF6Q9BYE7 350 aa21.65■■□□□ 1.06
HOXB-AS3-206ENST00000474040 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa21.64■■□□□ 1.06
HOXB-AS3-206ENST00000474040 CHIC2Q9UKJ5 165 aa21.64■■□□□ 1.05
HOXB-AS3-206ENST00000474040 HFM1A2PYH4 1435 aa21.63■■□□□ 1.05
HOXB-AS3-206ENST00000474040 NAIPQ13075 1403 aa21.6■■□□□ 1.05
HOXB-AS3-206ENST00000474040 GCC2Q8IWJ2 1684 aa21.6■■□□□ 1.05
HOXB-AS3-206ENST00000474040 KIF15Q9NS87 1388 aa21.59■■□□□ 1.05
HOXB-AS3-206ENST00000474040 ABCA6Q8N139 1617 aa21.58■■□□□ 1.04
HOXB-AS3-206ENST00000474040 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa21.57■■□□□ 1.04
HOXB-AS3-206ENST00000474040 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa21.57■■□□□ 1.04
HOXB-AS3-206ENST00000474040 YEATS2Q9ULM3 1422 aa21.56■■□□□ 1.04
HOXB-AS3-206ENST00000474040 DUOX2Q9NRD8 1548 aa21.56■■□□□ 1.04
HOXB-AS3-206ENST00000474040 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa21.55■■□□□ 1.04
HOXB-AS3-206ENST00000474040 SETD5Q9C0A6 1442 aa21.55■■□□□ 1.04
HOXB-AS3-206ENST00000474040 ERBINQ96RT1 1412 aa21.53■■□□□ 1.04
HOXB-AS3-206ENST00000474040 REREQ9P2R6 1566 aa21.53■■□□□ 1.04
HOXB-AS3-206ENST00000474040 MYT1LQ9UL68 1186 aa21.52■■□□□ 1.04
HOXB-AS3-206ENST00000474040 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa21.52■■□□□ 1.04
HOXB-AS3-206ENST00000474040 A2MP01023 1474 aa21.52■■□□□ 1.03
HOXB-AS3-206ENST00000474040 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP21.51■■□□□ 1.03
HOXB-AS3-206ENST00000474040 ATP10AO60312 1499 aa21.51■■□□□ 1.03
HOXB-AS3-206ENST00000474040 HRCP23327 699 aa21.49■■□□□ 1.03
HOXB-AS3-206ENST00000474040 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa21.48■■□□□ 1.03
HOXB-AS3-206ENST00000474040 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP21.47■■□□□ 1.03
HOXB-AS3-206ENST00000474040 BCORL1Q5H9F3 1711 aa21.46■■□□□ 1.03
HOXB-AS3-206ENST00000474040 AGLP35573 1532 aa21.45■■□□□ 1.02
HOXB-AS3-206ENST00000474040 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP21.44■■□□□ 1.02
HOXB-AS3-206ENST00000474040 DEPDC5O75140 1603 aa21.4■■□□□ 1.02
HOXB-AS3-206ENST00000474040 UNC13BO14795 1591 aa21.4■■□□□ 1.02
HOXB-AS3-206ENST00000474040 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP21.39■■□□□ 1.01
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