RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000469137.5

LIN7B-204, Transcript of lin-7 homolog B, crumbs cell polarity complex component, humanhuman

TSL 2

Gene LIN7B, Length 1,057 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIN7B-204ENST00000469137 SCAPERQ9BY12 1400 aa46.37■■■■■ 5.01
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LIN7B-204ENST00000469137 POGZQ7Z3K3 1410 aa46.36■■■■■ 5.01
LIN7B-204ENST00000469137 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa46.32■■■■■ 5.01
LIN7B-204ENST00000469137 YEATS2Q9ULM3 1422 aa46.3■■■■■ 5
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LIN7B-204ENST00000469137 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP46.26■■■■■ 5
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LIN7B-204ENST00000469137 CCDC18Q5T9S5 1454 aa46.25■■■■■ 4.99
LIN7B-204ENST00000469137 ARHGAP5Q13017 1502 aa46.23■■■■■ 4.99
LIN7B-204ENST00000469137 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa46.2■■■■■ 4.99
LIN7B-204ENST00000469137 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa46.15■■■■■ 4.98
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LIN7B-204ENST00000469137 FYCO1Q9BQS8 1478 aa46.11■■■■■ 4.97
LIN7B-204ENST00000469137 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa46.1■■■■■ 4.97
LIN7B-204ENST00000469137 C9orf84Q5VXU9 1444 aa46.08■■■■■ 4.97
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LIN7B-204ENST00000469137 KDM5CP41229 1560 aa46.07■■■■■ 4.97
LIN7B-204ENST00000469137 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa46.06■■■■■ 4.96
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LIN7B-204ENST00000469137 AFAP1Q8N556 730 aa45.96■■■■■ 4.95
LIN7B-204ENST00000469137 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa45.95■■■■■ 4.95
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LIN7B-204ENST00000469137 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa45.92■■■■■ 4.94
LIN7B-204ENST00000469137 ITSN2Q9NZM3 1697 aa45.89■■■■■ 4.94
LIN7B-204ENST00000469137 MYT1LQ9UL68 1186 aa45.89■■■■■ 4.94
LIN7B-204ENST00000469137 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa45.88■■■■■ 4.94
LIN7B-204ENST00000469137 PLPPR3Q6T4P5 718 aa45.88■■■■■ 4.94
LIN7B-204ENST00000469137 MLH3Q9UHC1 1453 aa45.87■■■■■ 4.93
LIN7B-204ENST00000469137 REREQ9P2R6 1566 aa45.85■■■■■ 4.93
LIN7B-204ENST00000469137 ABCA6Q8N139 1617 aa45.81■■■■■ 4.92
LIN7B-204ENST00000469137 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa45.81■■■■■ 4.92
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LIN7B-204ENST00000469137 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa45.69■■■■■ 4.9
LIN7B-204ENST00000469137 AGLP35573 1532 aa45.68■■■■■ 4.9
LIN7B-204ENST00000469137 PREX1Q8TCU6 1659 aa45.68■■■■■ 4.9
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LIN7B-204ENST00000469137 SYCP2Q9BX26 1530 aa45.62■■■■■ 4.89
LIN7B-204ENST00000469137 MTUS2Q5JR59 1369 aa45.61■■■■■ 4.89
LIN7B-204ENST00000469137 CCNB3Q8WWL7 1395 aa45.58■■■■■ 4.89
LIN7B-204ENST00000469137 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa45.57■■■■■ 4.89
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LIN7B-204ENST00000469137 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP45.54■■■■■ 4.88
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LIN7B-204ENST00000469137 C3P01024 1663 aa45.5■■■■■ 4.87
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LIN7B-204ENST00000469137 A2MP01023 1474 aa45.29■■■■■ 4.84
LIN7B-204ENST00000469137 STRCQ7RTU9 1775 aa45.28■■■■■ 4.84
LIN7B-204ENST00000469137 ADGBQ8N7X0 1667 aa45.26■■■■■ 4.84
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LIN7B-204ENST00000469137 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP45.23■■■■■ 4.83
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LIN7B-204ENST00000469137 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa45.14■■■■■ 4.82
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LIN7B-204ENST00000469137 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP44.86■■■■■ 4.77
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LIN7B-204ENST00000469137 TSPY4P0CV99 314 aa44.8■■■■■ 4.76
LIN7B-204ENST00000469137 TSPY10P0CW01 314 aa44.8■■■■■ 4.76
LIN7B-204ENST00000469137 PLA2R1Q13018 1463 aa44.79■■■■■ 4.76
LIN7B-204ENST00000469137 KDM5DQ9BY66 1539 aa44.79■■■■■ 4.76
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