RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000468915.5

SLC13A3-209, Transcript of solute carrier family 13 member 3, humanhuman

TSL 5

Gene SLC13A3, Length 1,597 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC13A3-209ENST00000468915 TSPOAP1O95153 1857 aa22.95■■□□□ 1.27
SLC13A3-209ENST00000468915 MIA2Q96PC5 1412 aa22.95■■□□□ 1.26
SLC13A3-209ENST00000468915 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP22.94■■□□□ 1.26
SLC13A3-209ENST00000468915 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa22.94■■□□□ 1.26
SLC13A3-209ENST00000468915 ARHGAP5Q13017 1502 aa22.92■■□□□ 1.26
SLC13A3-209ENST00000468915 PTPN23Q9H3S7 1636 aa22.92■■□□□ 1.26
SLC13A3-209ENST00000468915 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP22.91■■□□□ 1.26
SLC13A3-209ENST00000468915 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP22.91■■□□□ 1.26
SLC13A3-209ENST00000468915 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP22.9■■□□□ 1.26
SLC13A3-209ENST00000468915 FANCAO15360 1455 aa22.9■■□□□ 1.26
SLC13A3-209ENST00000468915 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa22.88■■□□□ 1.25
SLC13A3-209ENST00000468915 TRHP20396 242 aaPredicted RBP22.87■■□□□ 1.25
SLC13A3-209ENST00000468915 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa22.86■■□□□ 1.25
SLC13A3-209ENST00000468915 NEO1Q92859 1461 aa22.85■■□□□ 1.25
SLC13A3-209ENST00000468915 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa22.85■■□□□ 1.25
SLC13A3-209ENST00000468915 ABCC1P33527 1531 aa22.85■■□□□ 1.25
SLC13A3-209ENST00000468915 CFAP74Q9C0B2 1584 aa22.84■■□□□ 1.25
SLC13A3-209ENST00000468915 MBD5Q9P267 1494 aa22.83■■□□□ 1.25
SLC13A3-209ENST00000468915 AKNAQ7Z591 1439 aa22.83■■□□□ 1.25
SLC13A3-209ENST00000468915 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP22.82■■□□□ 1.24
SLC13A3-209ENST00000468915 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP22.82■■□□□ 1.24
SLC13A3-209ENST00000468915 SYCP2Q9BX26 1530 aa22.81■■□□□ 1.24
SLC13A3-209ENST00000468915 TEX14Q8IWB6 1497 aa22.81■■□□□ 1.24
SLC13A3-209ENST00000468915 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa22.8■■□□□ 1.24
SLC13A3-209ENST00000468915 ADGRL1O94910 1474 aa22.78■■□□□ 1.24
SLC13A3-209ENST00000468915 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP22.77■■□□□ 1.24
SLC13A3-209ENST00000468915 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP22.77■■□□□ 1.24
SLC13A3-209ENST00000468915 ARHGEF5Q12774 1597 aa22.77■■□□□ 1.24
SLC13A3-209ENST00000468915 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa22.76■■□□□ 1.23
SLC13A3-209ENST00000468915 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa22.76■■□□□ 1.23
SLC13A3-209ENST00000468915 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP22.76■■□□□ 1.233e-6■■■■□ 21.2
SLC13A3-209ENST00000468915 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP22.76■■□□□ 1.23
SLC13A3-209ENST00000468915 SCAPERQ9BY12 1400 aa22.75■■□□□ 1.23
SLC13A3-209ENST00000468915 PTPRKQ15262 1439 aa22.74■■□□□ 1.23
SLC13A3-209ENST00000468915 ABCC5O15440 1437 aa22.74■■□□□ 1.23
SLC13A3-209ENST00000468915 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa22.73■■□□□ 1.23
SLC13A3-209ENST00000468915 RICTORQ6R327 1708 aa22.73■■□□□ 1.23
SLC13A3-209ENST00000468915 CROCC2H7BZ55 1655 aa22.73■■□□□ 1.23
SLC13A3-209ENST00000468915 DAPK1P53355 1430 aa22.71■■□□□ 1.23
SLC13A3-209ENST00000468915 POGZQ7Z3K3 1410 aa22.7■■□□□ 1.22
SLC13A3-209ENST00000468915 CCDC141Q6ZP82 1450 aa22.69■■□□□ 1.22
SLC13A3-209ENST00000468915 KDM5CP41229 1560 aa22.69■■□□□ 1.22
SLC13A3-209ENST00000468915 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP22.68■■□□□ 1.22
SLC13A3-209ENST00000468915 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP22.68■■□□□ 1.22
SLC13A3-209ENST00000468915 AFAP1Q8N556 730 aa22.67■■□□□ 1.22
SLC13A3-209ENST00000468915 RAPGEF3O95398 923 aa22.66■■□□□ 1.22
SLC13A3-209ENST00000468915 MAST1Q9Y2H9 1570 aa22.65■■□□□ 1.22
SLC13A3-209ENST00000468915 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa22.64■■□□□ 1.22
SLC13A3-209ENST00000468915 SHANK2Q9UPX8 1470 aa22.64■■□□□ 1.22
SLC13A3-209ENST00000468915 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP22.63■■□□□ 1.21
SLC13A3-209ENST00000468915 RSPH4AQ5TD94 716 aa22.63■■□□□ 1.21
SLC13A3-209ENST00000468915 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa22.62■■□□□ 1.21
SLC13A3-209ENST00000468915 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa22.61■■□□□ 1.21
SLC13A3-209ENST00000468915 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa22.61■■□□□ 1.21
SLC13A3-209ENST00000468915 KDM6BO15054 1643 aa22.61■■□□□ 1.21
SLC13A3-209ENST00000468915 ITGAEP38570 1179 aa22.6■■□□□ 1.21
SLC13A3-209ENST00000468915 C9orf84Q5VXU9 1444 aa22.6■■□□□ 1.21
SLC13A3-209ENST00000468915 ADGRL2O95490 1459 aa22.59■■□□□ 1.21
SLC13A3-209ENST00000468915 ADGBQ8N7X0 1667 aa22.58■■□□□ 1.21
SLC13A3-209ENST00000468915 MLH3Q9UHC1 1453 aa22.58■■□□□ 1.21
SLC13A3-209ENST00000468915 HECW2Q9P2P5 1572 aa22.58■■□□□ 1.2
SLC13A3-209ENST00000468915 ATP7AQ04656 1500 aa22.57■■□□□ 1.2
SLC13A3-209ENST00000468915 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa22.56■■□□□ 1.2
SLC13A3-209ENST00000468915 CHIC2Q9UKJ5 165 aa22.56■■□□□ 1.2
SLC13A3-209ENST00000468915 NCOA1Q15788 1441 aa22.56■■□□□ 1.2
SLC13A3-209ENST00000468915 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP22.54■■□□□ 1.2
SLC13A3-209ENST00000468915 PLXNC1O60486 1568 aa22.54■■□□□ 1.2
SLC13A3-209ENST00000468915 ABCA6Q8N139 1617 aa22.54■■□□□ 1.2
SLC13A3-209ENST00000468915 ROCK1Q13464 1354 aa22.53■■□□□ 1.2
SLC13A3-209ENST00000468915 TSPY4P0CV99 314 aa22.53■■□□□ 1.2
SLC13A3-209ENST00000468915 TSPY10P0CW01 314 aa22.53■■□□□ 1.2
SLC13A3-209ENST00000468915 YEATS2Q9ULM3 1422 aa22.52■■□□□ 1.2
SLC13A3-209ENST00000468915 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa22.5■■□□□ 1.19
SLC13A3-209ENST00000468915 MAGI2Q86UL8 1455 aa22.5■■□□□ 1.19
SLC13A3-209ENST00000468915 PCGF6Q9BYE7 350 aa22.5■■□□□ 1.19
SLC13A3-209ENST00000468915 NAIPQ13075 1403 aa22.49■■□□□ 1.19
SLC13A3-209ENST00000468915 GCC2Q8IWJ2 1684 aa22.48■■□□□ 1.19
SLC13A3-209ENST00000468915 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa22.47■■□□□ 1.19
SLC13A3-209ENST00000468915 HFM1A2PYH4 1435 aa22.47■■□□□ 1.19
SLC13A3-209ENST00000468915 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa22.47■■□□□ 1.19
SLC13A3-209ENST00000468915 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa22.46■■□□□ 1.19
SLC13A3-209ENST00000468915 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa22.45■■□□□ 1.18
SLC13A3-209ENST00000468915 KIF15Q9NS87 1388 aa22.44■■□□□ 1.18
SLC13A3-209ENST00000468915 DUOX2Q9NRD8 1548 aa22.42■■□□□ 1.18
SLC13A3-209ENST00000468915 REREQ9P2R6 1566 aa22.4■■□□□ 1.18
SLC13A3-209ENST00000468915 ATP10AO60312 1499 aa22.39■■□□□ 1.18
SLC13A3-209ENST00000468915 A2MP01023 1474 aa22.39■■□□□ 1.17
SLC13A3-209ENST00000468915 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP22.38■■□□□ 1.17
SLC13A3-209ENST00000468915 SETD5Q9C0A6 1442 aa22.37■■□□□ 1.17
SLC13A3-209ENST00000468915 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa22.37■■□□□ 1.17
SLC13A3-209ENST00000468915 MYT1LQ9UL68 1186 aa22.36■■□□□ 1.17
SLC13A3-209ENST00000468915 BCORL1Q5H9F3 1711 aa22.35■■□□□ 1.17
SLC13A3-209ENST00000468915 ERBINQ96RT1 1412 aa22.35■■□□□ 1.17
SLC13A3-209ENST00000468915 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa22.34■■□□□ 1.17
SLC13A3-209ENST00000468915 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP22.33■■□□□ 1.17
SLC13A3-209ENST00000468915 AGLP35573 1532 aa22.31■■□□□ 1.16
SLC13A3-209ENST00000468915 MROH1Q8NDA8 1641 aa22.31■■□□□ 1.16
SLC13A3-209ENST00000468915 DEPDC5O75140 1603 aa22.29■■□□□ 1.16
SLC13A3-209ENST00000468915 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP22.29■■□□□ 1.16
SLC13A3-209ENST00000468915 UNC13BO14795 1591 aa22.28■■□□□ 1.16
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