RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000468347.1

SHQ1-204, Transcript of SHQ1, H/ACA ribonucleoprotein assembly factor, humanhuman

TSL 5

Gene SHQ1, Length 134 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHQ1-204ENST00000468347 CHRM1P11229 460 aaPredicted RBP9.13□□□□□ -0.95
SHQ1-204ENST00000468347 A0A0G2JS52 829 aa9.11□□□□□ -0.95
SHQ1-204ENST00000468347 MICALL2Q8IY33 904 aa9.11□□□□□ -0.95
SHQ1-204ENST00000468347 GSE1Q14687 1217 aa9.08□□□□□ -0.96
SHQ1-204ENST00000468347 KCTD12Q96CX2 325 aaKnown RBP9.08□□□□□ -0.96
SHQ1-204ENST00000468347 HRO43593 1189 aa9.06□□□□□ -0.96
SHQ1-204ENST00000468347 TK2O00142 265 aa9.03□□□□□ -0.96
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SHQ1-204ENST00000468347 ARHGAP33O14559 1287 aa9.02□□□□□ -0.97
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SHQ1-204ENST00000468347 ITGBL1O95965 494 aaPredicted RBP8.74□□□□□ -1.01
SHQ1-204ENST00000468347 PHF8Q9UPP1 1060 aa8.73□□□□□ -1.01
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SHQ1-204ENST00000468347 PPP4R3BQ5MIZ7 849 aa8.69□□□□□ -1.02
SHQ1-204ENST00000468347 KCNK17Q96T54 332 aa8.69□□□□□ -1.02
SHQ1-204ENST00000468347 BHMG1C9JSJ3 638 aaPredicted RBP8.67□□□□□ -1.02
SHQ1-204ENST00000468347 KCNH8Q96L42 1107 aa8.67□□□□□ -1.02
SHQ1-204ENST00000468347 GOLGA8CPA6NN73 597 aa8.66□□□□□ -1.02
SHQ1-204ENST00000468347 NRG2O14511 850 aaPredicted RBP8.66□□□□□ -1.02
SHQ1-204ENST00000468347 SLC4A5Q9BY07 1137 aa8.64□□□□□ -1.03
SHQ1-204ENST00000468347 CIZ1Q9ULV3 898 aaPredicted RBP8.64□□□□□ -1.03
SHQ1-204ENST00000468347 FBXO3Q9UK99 471 aa8.63□□□□□ -1.03
SHQ1-204ENST00000468347 MRPL50Q8N5N7 158 aaKnown RBP8.59□□□□□ -1.03
SHQ1-204ENST00000468347 VASPP50552 380 aaPredicted RBP8.57□□□□□ -1.04
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SHQ1-204ENST00000468347 FBXO22Q8NEZ5 403 aa8.56□□□□□ -1.04
SHQ1-204ENST00000468347 TMC2Q8TDI7 906 aa8.54□□□□□ -1.04
SHQ1-204ENST00000468347 ZFP91-CNTFA0A0A6YYC7 529 aaPredicted RBP8.5□□□□□ -1.05
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SHQ1-204ENST00000468347 NBPF3Q9H094 633 aa8.5□□□□□ -1.05
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SHQ1-204ENST00000468347 BCL2L12Q9HB09 334 aa8.49□□□□□ -1.05
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SHQ1-204ENST00000468347 NYAP1Q6ZVC0 841 aa8.47□□□□□ -1.05
SHQ1-204ENST00000468347 TRIM41Q8WV44 630 aa8.47□□□□□ -1.05
SHQ1-204ENST00000468347 TREML4Q6UXN2 200 aa8.46□□□□□ -1.06
SHQ1-204ENST00000468347 ANKK1Q8NFD2 765 aa8.45□□□□□ -1.06
SHQ1-204ENST00000468347 BCAMP50895 628 aa8.43□□□□□ -1.06
SHQ1-204ENST00000468347 STK17AQ9UEE5 414 aa8.43□□□□□ -1.06
SHQ1-204ENST00000468347 RIOK3O14730 519 aaKnown RBP8.42□□□□□ -1.06
SHQ1-204ENST00000468347 PTPREP23469 700 aa8.42□□□□□ -1.06
SHQ1-204ENST00000468347 PDZRN3Q9UPQ7 1066 aa8.42□□□□□ -1.06
SHQ1-204ENST00000468347 V9GY48 417 aaPredicted RBP8.42□□□□□ -1.06
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SHQ1-204ENST00000468347 SOWAHBA6NEL2 793 aa8.39□□□□□ -1.07
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SHQ1-204ENST00000468347 RABGEF1Q9UJ41 708 aa8.32□□□□□ -1.08
SHQ1-204ENST00000468347 MYT1Q01538 1121 aa8.29□□□□□ -1.08
SHQ1-204ENST00000468347 LAPTM4BQ86VI4 370 aa8.29□□□□□ -1.08
SHQ1-204ENST00000468347 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP8.29□□□□□ -1.08
SHQ1-204ENST00000468347 PPP1R18Q6NYC8 613 aa8.28□□□□□ -1.08
SHQ1-204ENST00000468347 ZFRQ96KR1 1074 aaKnown RBP8.28□□□□□ -1.08
SHQ1-204ENST00000468347 INSM1Q01101 510 aaPredicted RBP8.25□□□□□ -1.09
SHQ1-204ENST00000468347 ADAM33Q9BZ11 813 aa8.25□□□□□ -1.09
SHQ1-204ENST00000468347 PROX2Q3B8N5 592 aa8.24□□□□□ -1.09
SHQ1-204ENST00000468347 WIPF1O43516 503 aa8.23□□□□□ -1.09
SHQ1-204ENST00000468347 WFS1O76024 890 aa8.23□□□□□ -1.09
SHQ1-204ENST00000468347 DSG2Q14126 1118 aa8.23□□□□□ -1.09
SHQ1-204ENST00000468347 SUZ12Q15022 739 aaKnown RBP8.23□□□□□ -1.09
SHQ1-204ENST00000468347 PKDCCQ504Y2 493 aa8.23□□□□□ -1.09
SHQ1-204ENST00000468347 OXER1Q8TDS5 423 aa8.23□□□□□ -1.09
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