RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000467497.6

GLIS3-208, Transcript of GLIS family zinc finger 3, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene GLIS3, Length 1,585 nt, Biotype retained intron.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLIS3-208ENST00000467497 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP22.89■■□□□ 1.25
GLIS3-208ENST00000467497 ADGRL1O94910 1474 aa22.88■■□□□ 1.25
GLIS3-208ENST00000467497 ITSN2Q9NZM3 1697 aa22.86■■□□□ 1.25
GLIS3-208ENST00000467497 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP22.86■■□□□ 1.25
GLIS3-208ENST00000467497 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa22.84■■□□□ 1.25
GLIS3-208ENST00000467497 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa22.84■■□□□ 1.25
GLIS3-208ENST00000467497 RAPGEF3O95398 923 aa22.82■■□□□ 1.24
GLIS3-208ENST00000467497 MAP3K1Q13233 1512 aa22.81■■□□□ 1.24
GLIS3-208ENST00000467497 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa22.81■■□□□ 1.24
GLIS3-208ENST00000467497 POGZQ7Z3K3 1410 aa22.8■■□□□ 1.24
GLIS3-208ENST00000467497 SCAPERQ9BY12 1400 aa22.8■■□□□ 1.24
GLIS3-208ENST00000467497 ABCC1P33527 1531 aa22.8■■□□□ 1.24
GLIS3-208ENST00000467497 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP22.77■■□□□ 1.24
GLIS3-208ENST00000467497 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa22.76■■□□□ 1.23
GLIS3-208ENST00000467497 CCNB3Q8WWL7 1395 aa22.76■■□□□ 1.23
GLIS3-208ENST00000467497 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa22.75■■□□□ 1.23
GLIS3-208ENST00000467497 KDM5CP41229 1560 aa22.75■■□□□ 1.23
GLIS3-208ENST00000467497 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa22.74■■□□□ 1.23
GLIS3-208ENST00000467497 MAGI2Q86UL8 1455 aa22.74■■□□□ 1.23
GLIS3-208ENST00000467497 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa22.74■■□□□ 1.23
GLIS3-208ENST00000467497 HECW2Q9P2P5 1572 aa22.72■■□□□ 1.23
GLIS3-208ENST00000467497 NCOA2Q15596 1464 aa22.71■■□□□ 1.23
GLIS3-208ENST00000467497 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP22.69■■□□□ 1.22
GLIS3-208ENST00000467497 SYCP2Q9BX26 1530 aa22.69■■□□□ 1.22
GLIS3-208ENST00000467497 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa22.69■■□□□ 1.22
GLIS3-208ENST00000467497 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa22.67■■□□□ 1.22
GLIS3-208ENST00000467497 APLP2Q06481 763 aa22.66■■□□□ 1.22
GLIS3-208ENST00000467497 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP22.66■■□□□ 1.22
GLIS3-208ENST00000467497 YEATS2Q9ULM3 1422 aa22.65■■□□□ 1.22
GLIS3-208ENST00000467497 BCORL1Q5H9F3 1711 aa22.65■■□□□ 1.22
GLIS3-208ENST00000467497 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa22.64■■□□□ 1.22
GLIS3-208ENST00000467497 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP22.64■■□□□ 1.22
GLIS3-208ENST00000467497 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa22.63■■□□□ 1.21
GLIS3-208ENST00000467497 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa22.63■■□□□ 1.21
GLIS3-208ENST00000467497 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa22.63■■□□□ 1.21
GLIS3-208ENST00000467497 ABCA6Q8N139 1617 aa22.62■■□□□ 1.21
GLIS3-208ENST00000467497 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa22.62■■□□□ 1.21
GLIS3-208ENST00000467497 MLH3Q9UHC1 1453 aa22.62■■□□□ 1.21
GLIS3-208ENST00000467497 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa22.61■■□□□ 1.21
GLIS3-208ENST00000467497 ADAMTSL3P82987 1691 aa22.61■■□□□ 1.21
GLIS3-208ENST00000467497 AFAP1Q8N556 730 aa22.6■■□□□ 1.21
GLIS3-208ENST00000467497 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP22.59■■□□□ 1.21
GLIS3-208ENST00000467497 C9orf84Q5VXU9 1444 aa22.58■■□□□ 1.21
GLIS3-208ENST00000467497 ATP10AO60312 1499 aa22.58■■□□□ 1.21
GLIS3-208ENST00000467497 REREQ9P2R6 1566 aa22.58■■□□□ 1.2
GLIS3-208ENST00000467497 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP22.57■■□□□ 1.2
GLIS3-208ENST00000467497 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa22.57■■□□□ 1.2
GLIS3-208ENST00000467497 MYT1LQ9UL68 1186 aa22.55■■□□□ 1.2
GLIS3-208ENST00000467497 ATP7AQ04656 1500 aa22.54■■□□□ 1.2
GLIS3-208ENST00000467497 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP22.54■■□□□ 1.2
GLIS3-208ENST00000467497 MADDQ8WXG6 1647 aa22.54■■□□□ 1.2
GLIS3-208ENST00000467497 MYOM3Q5VTT5 1437 aa22.53■■□□□ 1.2
GLIS3-208ENST00000467497 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa22.53■■□□□ 1.2
GLIS3-208ENST00000467497 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP22.52■■□□□ 1.2
GLIS3-208ENST00000467497 MBD5Q9P267 1494 aa22.51■■□□□ 1.19
GLIS3-208ENST00000467497 ARHGEF5Q12774 1597 aa22.51■■□□□ 1.19
GLIS3-208ENST00000467497 ADGBQ8N7X0 1667 aa22.51■■□□□ 1.19
GLIS3-208ENST00000467497 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP22.5■■□□□ 1.19
GLIS3-208ENST00000467497 MIA2Q96PC5 1412 aa22.5■■□□□ 1.19
GLIS3-208ENST00000467497 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP22.5■■□□□ 1.19
GLIS3-208ENST00000467497 CCDC141Q6ZP82 1450 aa22.49■■□□□ 1.19
GLIS3-208ENST00000467497 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP22.48■■□□□ 1.19
GLIS3-208ENST00000467497 PTPN23Q9H3S7 1636 aa22.46■■□□□ 1.19
GLIS3-208ENST00000467497 AGLP35573 1532 aa22.46■■□□□ 1.19
GLIS3-208ENST00000467497 PLXNC1O60486 1568 aa22.43■■□□□ 1.18
GLIS3-208ENST00000467497 CROCC2H7BZ55 1655 aa22.43■■□□□ 1.18
GLIS3-208ENST00000467497 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa22.42■■□□□ 1.18
GLIS3-208ENST00000467497 RSPH4AQ5TD94 716 aa22.42■■□□□ 1.18
GLIS3-208ENST00000467497 PTPRMP28827 1452 aa22.41■■□□□ 1.18
GLIS3-208ENST00000467497 MAST1Q9Y2H9 1570 aa22.4■■□□□ 1.18
GLIS3-208ENST00000467497 FGD6Q6ZV73 1430 aa22.39■■□□□ 1.17
GLIS3-208ENST00000467497 A2MP01023 1474 aa22.39■■□□□ 1.17
GLIS3-208ENST00000467497 MLECQ14165 292 aa22.37■■□□□ 1.17
GLIS3-208ENST00000467497 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP22.36■■□□□ 1.17
GLIS3-208ENST00000467497 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP22.36■■□□□ 1.17
GLIS3-208ENST00000467497 TSPY4P0CV99 314 aa22.33■■□□□ 1.16
GLIS3-208ENST00000467497 TSPY10P0CW01 314 aa22.33■■□□□ 1.16
GLIS3-208ENST00000467497 SHANK2Q9UPX8 1470 aa22.32■■□□□ 1.16
GLIS3-208ENST00000467497 MROH2AA6NES4 1674 aa22.31■■□□□ 1.16
GLIS3-208ENST00000467497 C3P01024 1663 aa22.29■■□□□ 1.16
GLIS3-208ENST00000467497 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP22.26■■□□□ 1.15
GLIS3-208ENST00000467497 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP22.26■■□□□ 1.15
GLIS3-208ENST00000467497 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP22.26■■□□□ 1.15
GLIS3-208ENST00000467497 DAPK1P53355 1430 aa22.26■■□□□ 1.15
GLIS3-208ENST00000467497 CNTLNQ9NXG0 1405 aa22.25■■□□□ 1.15
GLIS3-208ENST00000467497 ABCC5O15440 1437 aa22.24■■□□□ 1.15
GLIS3-208ENST00000467497 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP22.24■■□□□ 1.15
GLIS3-208ENST00000467497 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP22.23■■□□□ 1.15
GLIS3-208ENST00000467497 PREX1Q8TCU6 1659 aa22.23■■□□□ 1.15
GLIS3-208ENST00000467497 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP22.21■■□□□ 1.15
GLIS3-208ENST00000467497 DUOX2Q9NRD8 1548 aa22.21■■□□□ 1.15
GLIS3-208ENST00000467497 FAM135AQ9P2D6 1515 aa22.21■■□□□ 1.15
GLIS3-208ENST00000467497 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP22.17■■□□□ 1.14
GLIS3-208ENST00000467497 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP22.16■■□□□ 1.14
GLIS3-208ENST00000467497 PLPPR3Q6T4P5 718 aa22.16■■□□□ 1.14
GLIS3-208ENST00000467497 GGT6Q6P531 493 aa22.16■■□□□ 1.14
GLIS3-208ENST00000467497 KDM5DQ9BY66 1539 aa22.15■■□□□ 1.14
GLIS3-208ENST00000467497 KIF15Q9NS87 1388 aa22.15■■□□□ 1.14
GLIS3-208ENST00000467497 KIF3BO15066 747 aa22.15■■□□□ 1.14
GLIS3-208ENST00000467497 PPP6R1Q9UPN7 881 aa22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.5 ms