RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000466097.1

SH3BP1-205, Transcript of SH3 domain binding protein 1, humanhuman

TSL 2

Gene SH3BP1, Length 777 nt, Biotype retained intron.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1-205ENST00000466097 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa23.46■■□□□ 1.35
SH3BP1-205ENST00000466097 ADGRL1O94910 1474 aa23.45■■□□□ 1.34
SH3BP1-205ENST00000466097 MTUS2Q5JR59 1369 aa23.45■■□□□ 1.34
SH3BP1-205ENST00000466097 RAPGEF3O95398 923 aa23.45■■□□□ 1.34
SH3BP1-205ENST00000466097 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa23.43■■□□□ 1.34
SH3BP1-205ENST00000466097 SCAPERQ9BY12 1400 aa23.4■■□□□ 1.34
SH3BP1-205ENST00000466097 TIAM1Q13009 1591 aa23.39■■□□□ 1.33
SH3BP1-205ENST00000466097 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa23.38■■□□□ 1.33
SH3BP1-205ENST00000466097 POGZQ7Z3K3 1410 aa23.36■■□□□ 1.33
SH3BP1-205ENST00000466097 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa23.34■■□□□ 1.33
SH3BP1-205ENST00000466097 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP23.34■■□□□ 1.33
SH3BP1-205ENST00000466097 ITSN2Q9NZM3 1697 aa23.34■■□□□ 1.33
SH3BP1-205ENST00000466097 CCNB3Q8WWL7 1395 aa23.33■■□□□ 1.33
SH3BP1-205ENST00000466097 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP23.33■■□□□ 1.32
SH3BP1-205ENST00000466097 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa23.31■■□□□ 1.32
SH3BP1-205ENST00000466097 MAGI2Q86UL8 1455 aa23.31■■□□□ 1.32
SH3BP1-205ENST00000466097 ABCC1P33527 1531 aa23.31■■□□□ 1.32
SH3BP1-205ENST00000466097 MAP3K1Q13233 1512 aa23.3■■□□□ 1.32
SH3BP1-205ENST00000466097 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa23.3■■□□□ 1.32
SH3BP1-205ENST00000466097 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP23.3■■□□□ 1.32
SH3BP1-205ENST00000466097 KDM5CP41229 1560 aa23.27■■□□□ 1.32
SH3BP1-205ENST00000466097 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa23.27■■□□□ 1.32
SH3BP1-205ENST00000466097 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP23.26■■□□□ 1.31
SH3BP1-205ENST00000466097 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa23.25■■□□□ 1.31
SH3BP1-205ENST00000466097 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP23.25■■□□□ 1.31
SH3BP1-205ENST00000466097 NCOA2Q15596 1464 aa23.24■■□□□ 1.31
SH3BP1-205ENST00000466097 HECW2Q9P2P5 1572 aa23.24■■□□□ 1.31
SH3BP1-205ENST00000466097 APLP2Q06481 763 aa23.24■■□□□ 1.31
SH3BP1-205ENST00000466097 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa23.24■■□□□ 1.31
SH3BP1-205ENST00000466097 YEATS2Q9ULM3 1422 aa23.23■■□□□ 1.31
SH3BP1-205ENST00000466097 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa23.22■■□□□ 1.31
SH3BP1-205ENST00000466097 AFAP1Q8N556 730 aa23.21■■□□□ 1.31
SH3BP1-205ENST00000466097 SYCP2Q9BX26 1530 aa23.21■■□□□ 1.31
SH3BP1-205ENST00000466097 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP23.2■■□□□ 1.3
SH3BP1-205ENST00000466097 BCORL1Q5H9F3 1711 aa23.19■■□□□ 1.3
SH3BP1-205ENST00000466097 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa23.19■■□□□ 1.3
SH3BP1-205ENST00000466097 MYT1LQ9UL68 1186 aa23.19■■□□□ 1.3
SH3BP1-205ENST00000466097 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa23.18■■□□□ 1.3
SH3BP1-205ENST00000466097 ATP10AO60312 1499 aa23.17■■□□□ 1.3
SH3BP1-205ENST00000466097 MLH3Q9UHC1 1453 aa23.17■■□□□ 1.3
SH3BP1-205ENST00000466097 ADAMTSL3P82987 1691 aa23.16■■□□□ 1.3
SH3BP1-205ENST00000466097 C9orf84Q5VXU9 1444 aa23.15■■□□□ 1.3
SH3BP1-205ENST00000466097 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa23.14■■□□□ 1.3
SH3BP1-205ENST00000466097 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP23.14■■□□□ 1.29
SH3BP1-205ENST00000466097 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa23.14■■□□□ 1.29
SH3BP1-205ENST00000466097 ABCA6Q8N139 1617 aa23.13■■□□□ 1.29
SH3BP1-205ENST00000466097 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP23.13■■□□□ 1.29
SH3BP1-205ENST00000466097 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa23.13■■□□□ 1.29
SH3BP1-205ENST00000466097 REREQ9P2R6 1566 aa23.1■■□□□ 1.29
SH3BP1-205ENST00000466097 MADDQ8WXG6 1647 aa23.09■■□□□ 1.29
SH3BP1-205ENST00000466097 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa23.09■■□□□ 1.29
SH3BP1-205ENST00000466097 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP23.08■■□□□ 1.28
SH3BP1-205ENST00000466097 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP23.08■■□□□ 1.28
SH3BP1-205ENST00000466097 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP23.07■■□□□ 1.28
SH3BP1-205ENST00000466097 ATP7AQ04656 1500 aa23.07■■□□□ 1.28
SH3BP1-205ENST00000466097 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa23.05■■□□□ 1.28
SH3BP1-205ENST00000466097 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP23.05■■□□□ 1.28
SH3BP1-205ENST00000466097 MYOM3Q5VTT5 1437 aa23.05■■□□□ 1.28
SH3BP1-205ENST00000466097 MBD5Q9P267 1494 aa23.05■■□□□ 1.28
SH3BP1-205ENST00000466097 MIA2Q96PC5 1412 aa23.02■■□□□ 1.28
SH3BP1-205ENST00000466097 CCDC141Q6ZP82 1450 aa23.02■■□□□ 1.28
SH3BP1-205ENST00000466097 PTPRMP28827 1452 aa23.01■■□□□ 1.27
SH3BP1-205ENST00000466097 MLECQ14165 292 aa23.01■■□□□ 1.27
SH3BP1-205ENST00000466097 RSPH4AQ5TD94 716 aa23.01■■□□□ 1.27
SH3BP1-205ENST00000466097 ARHGEF5Q12774 1597 aa23.01■■□□□ 1.27
SH3BP1-205ENST00000466097 ADGBQ8N7X0 1667 aa23■■□□□ 1.27
SH3BP1-205ENST00000466097 AGLP35573 1532 aa23■■□□□ 1.27
SH3BP1-205ENST00000466097 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa22.97■■□□□ 1.27
SH3BP1-205ENST00000466097 PTPN23Q9H3S7 1636 aa22.94■■□□□ 1.26
SH3BP1-205ENST00000466097 A2MP01023 1474 aa22.94■■□□□ 1.26
SH3BP1-205ENST00000466097 PLXNC1O60486 1568 aa22.93■■□□□ 1.26
SH3BP1-205ENST00000466097 TSPY4P0CV99 314 aa22.92■■□□□ 1.26
SH3BP1-205ENST00000466097 TSPY10P0CW01 314 aa22.92■■□□□ 1.26
SH3BP1-205ENST00000466097 FGD6Q6ZV73 1430 aa22.9■■□□□ 1.26
SH3BP1-205ENST00000466097 MAST1Q9Y2H9 1570 aa22.89■■□□□ 1.26
SH3BP1-205ENST00000466097 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP22.87■■□□□ 1.25
SH3BP1-205ENST00000466097 CROCC2H7BZ55 1655 aa22.87■■□□□ 1.25
SH3BP1-205ENST00000466097 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP22.85■■□□□ 1.25
SH3BP1-205ENST00000466097 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP22.83■■□□□ 1.25
SH3BP1-205ENST00000466097 PLPPR3Q6T4P5 718 aa22.83■■□□□ 1.25
SH3BP1-205ENST00000466097 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP22.83■■□□□ 1.25
SH3BP1-205ENST00000466097 CNTLNQ9NXG0 1405 aa22.82■■□□□ 1.24
SH3BP1-205ENST00000466097 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP22.81■■□□□ 1.24
SH3BP1-205ENST00000466097 MROH2AA6NES4 1674 aa22.81■■□□□ 1.24
SH3BP1-205ENST00000466097 C3P01024 1663 aa22.81■■□□□ 1.24
SH3BP1-205ENST00000466097 SHANK2Q9UPX8 1470 aa22.8■■□□□ 1.24
SH3BP1-205ENST00000466097 DAPK1P53355 1430 aa22.78■■□□□ 1.24
SH3BP1-205ENST00000466097 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP22.77■■□□□ 1.24
SH3BP1-205ENST00000466097 ABCC5O15440 1437 aa22.77■■□□□ 1.24
SH3BP1-205ENST00000466097 GGT6Q6P531 493 aa22.76■■□□□ 1.23
SH3BP1-205ENST00000466097 FBXO41Q8TF61 875 aa22.76■■□□□ 1.23
SH3BP1-205ENST00000466097 PREX1Q8TCU6 1659 aa22.75■■□□□ 1.23
SH3BP1-205ENST00000466097 PPP6R1Q9UPN7 881 aa22.75■■□□□ 1.23
SH3BP1-205ENST00000466097 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP22.75■■□□□ 1.23
SH3BP1-205ENST00000466097 KIF3BO15066 747 aa22.74■■□□□ 1.23
SH3BP1-205ENST00000466097 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP22.74■■□□□ 1.23
SH3BP1-205ENST00000466097 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP22.73■■□□□ 1.23
SH3BP1-205ENST00000466097 DUOX2Q9NRD8 1548 aa22.72■■□□□ 1.23
SH3BP1-205ENST00000466097 LMTK3Q96Q04 1460 aa22.72■■□□□ 1.23
SH3BP1-205ENST00000466097 FAM135AQ9P2D6 1515 aa22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17.4 ms